Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SSJ8

Protein Details
Accession R7SSJ8    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MLRTVKPKNARSKRALQAREPKEHydrophilic
253-278ADPEMWKRAMKRPKLRKQDVEKGVGKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-281KRAMKRPKLRKQDVEKGVGKKRK
341-348RSRKKRRA
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG dsq:DICSQDRAFT_149385  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MLRTVKPKNARSKRALQAREPKEVEDPRVAIFVKGTHAGEKVTAVMKELMALKRPHAISFSKKNAVRPFEDATSLEFWAQKNDASLFVVGQSTKKRPDGLTFVRMYDHRVLDMCEVGVEGWKSMADFRTPKATPGHKPLLHFASELFDTHPRFIQLKSMLMDFFNGEVIDAIHLAGLEHVISISLGPTPPSPNAATSTLQATGAPNEDLLSLPKVHVRSYMIRLLASGTRVPRVELTPMGPSLDLTLRRHTDADPEMWKRAMKRPKLRKQDVEKGVGKKRKNLDVDEMGDLRGRIHVGKQDLGKLQTRKMKGLKPGREEAVGDDENEGESGRDSEGEDEGRSRKKRRAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.82
3 0.81
4 0.81
5 0.77
6 0.79
7 0.71
8 0.63
9 0.62
10 0.6
11 0.55
12 0.5
13 0.45
14 0.37
15 0.39
16 0.37
17 0.28
18 0.25
19 0.21
20 0.18
21 0.21
22 0.21
23 0.19
24 0.19
25 0.19
26 0.19
27 0.18
28 0.17
29 0.17
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.15
34 0.17
35 0.22
36 0.21
37 0.24
38 0.25
39 0.25
40 0.31
41 0.32
42 0.3
43 0.29
44 0.31
45 0.34
46 0.43
47 0.49
48 0.5
49 0.52
50 0.58
51 0.62
52 0.63
53 0.57
54 0.53
55 0.5
56 0.43
57 0.43
58 0.36
59 0.31
60 0.28
61 0.25
62 0.21
63 0.19
64 0.17
65 0.18
66 0.18
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.16
71 0.15
72 0.15
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.13
78 0.17
79 0.2
80 0.24
81 0.26
82 0.29
83 0.29
84 0.34
85 0.4
86 0.41
87 0.44
88 0.4
89 0.39
90 0.38
91 0.37
92 0.36
93 0.32
94 0.26
95 0.2
96 0.19
97 0.2
98 0.18
99 0.19
100 0.14
101 0.09
102 0.08
103 0.07
104 0.09
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.1
113 0.12
114 0.13
115 0.21
116 0.22
117 0.24
118 0.29
119 0.34
120 0.34
121 0.41
122 0.48
123 0.42
124 0.44
125 0.45
126 0.42
127 0.37
128 0.33
129 0.25
130 0.19
131 0.17
132 0.16
133 0.13
134 0.14
135 0.14
136 0.15
137 0.15
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.19
142 0.17
143 0.19
144 0.19
145 0.19
146 0.17
147 0.16
148 0.16
149 0.11
150 0.09
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.02
166 0.02
167 0.02
168 0.02
169 0.02
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.05
175 0.07
176 0.07
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.14
181 0.16
182 0.16
183 0.15
184 0.16
185 0.14
186 0.14
187 0.13
188 0.11
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.13
204 0.16
205 0.18
206 0.22
207 0.26
208 0.24
209 0.23
210 0.23
211 0.23
212 0.2
213 0.18
214 0.16
215 0.13
216 0.16
217 0.16
218 0.17
219 0.17
220 0.17
221 0.18
222 0.16
223 0.17
224 0.17
225 0.17
226 0.17
227 0.15
228 0.13
229 0.13
230 0.15
231 0.17
232 0.17
233 0.23
234 0.24
235 0.25
236 0.27
237 0.25
238 0.27
239 0.26
240 0.28
241 0.3
242 0.31
243 0.32
244 0.32
245 0.34
246 0.31
247 0.38
248 0.42
249 0.45
250 0.53
251 0.62
252 0.71
253 0.8
254 0.86
255 0.87
256 0.87
257 0.88
258 0.84
259 0.81
260 0.78
261 0.75
262 0.75
263 0.72
264 0.66
265 0.63
266 0.63
267 0.63
268 0.61
269 0.58
270 0.57
271 0.56
272 0.57
273 0.53
274 0.47
275 0.39
276 0.35
277 0.3
278 0.22
279 0.16
280 0.14
281 0.11
282 0.13
283 0.18
284 0.21
285 0.25
286 0.27
287 0.32
288 0.35
289 0.38
290 0.42
291 0.4
292 0.44
293 0.47
294 0.48
295 0.51
296 0.54
297 0.57
298 0.59
299 0.66
300 0.68
301 0.67
302 0.71
303 0.66
304 0.61
305 0.55
306 0.49
307 0.46
308 0.38
309 0.31
310 0.25
311 0.22
312 0.2
313 0.19
314 0.16
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.11
322 0.14
323 0.15
324 0.16
325 0.19
326 0.24
327 0.33
328 0.4
329 0.44