Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q9Y7T7

Protein Details
Accession Q9Y7T7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-134QRYMGIKPPVVKKRRRNADKKFVFDWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-43VKEEKAARPKFLSKAERARLALERR
119-125VKKRRRN
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 1, plas 1, pero 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005682  C:U5 snRNP  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0000354  P:cis assembly of pre-catalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG spo:SPCC63.11  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17945  DEADc_DDX23  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MTAQDSIPSLEQLVQQKRVKEEKAARPKFLSKAERARLALERRQKEVEEAKAKQNDKLLDLRKRTFTNHLENNELADDEKKSQVSSVSSNNSGTESSATDEAFSMTIRQRYMGIKPPVVKKRRRNADKKFVFDWDATDDTMKDAETSASPEATIAVFGRGKLGGFDDQSIRKAKSNSGLIQRLLQGTEQDKARAHELIQLQEKRAKKIDWDDVPWREKPLEAMKPRDWRILKEDYNISIKGDDLPNPLRNWEEAGLPSEMLKVLKKVNYKEPSSIQRAAIPVLLQRKDLIGIAETGSGKTAAFIIPLIIAISKLPPLTESNMHLGPYAVVLAPTRELAQQIQVEGNKFAEPLGFRCVSVVGGHAFEEQSFQMSQGAHIVVATPGRLLDCLERRLFVLSQCTYVVMDEADRMLDMGFEDDVNKILSSLPSSNASEKDGSILATANSSSSRRQTIMFSATLPPRVANLAKSYLIEPVMLTIGNIGQAVDRVEQRVEMISDDSKKWRRVEEILESNRFSPPIIIFVNLKRNIEAIAKQLNAIGWHAVTLHGSKSQEQRERAIEQLRNKTADILVATDIAGRGIDIPNVSLVLNYNMAKSIEDYTHRIGRTGRAGKSGTAITFLGPEDTDVYYDLRVLLSRSAKAHIPDELRNHEAAFVRHAAITQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.43
3 0.48
4 0.54
5 0.6
6 0.58
7 0.59
8 0.63
9 0.65
10 0.72
11 0.74
12 0.72
13 0.7
14 0.73
15 0.7
16 0.69
17 0.66
18 0.64
19 0.68
20 0.7
21 0.71
22 0.66
23 0.63
24 0.62
25 0.62
26 0.61
27 0.6
28 0.57
29 0.55
30 0.58
31 0.54
32 0.54
33 0.53
34 0.55
35 0.54
36 0.54
37 0.58
38 0.62
39 0.62
40 0.58
41 0.57
42 0.49
43 0.44
44 0.5
45 0.5
46 0.51
47 0.57
48 0.59
49 0.6
50 0.6
51 0.6
52 0.6
53 0.59
54 0.6
55 0.61
56 0.59
57 0.57
58 0.54
59 0.52
60 0.44
61 0.36
62 0.27
63 0.21
64 0.19
65 0.17
66 0.2
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.21
71 0.22
72 0.24
73 0.28
74 0.3
75 0.32
76 0.32
77 0.32
78 0.3
79 0.27
80 0.23
81 0.17
82 0.13
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.14
93 0.17
94 0.17
95 0.18
96 0.2
97 0.23
98 0.28
99 0.34
100 0.36
101 0.38
102 0.44
103 0.53
104 0.6
105 0.66
106 0.71
107 0.71
108 0.76
109 0.82
110 0.87
111 0.88
112 0.88
113 0.91
114 0.89
115 0.86
116 0.78
117 0.71
118 0.63
119 0.53
120 0.44
121 0.38
122 0.31
123 0.25
124 0.23
125 0.19
126 0.16
127 0.16
128 0.14
129 0.09
130 0.08
131 0.09
132 0.08
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.11
139 0.09
140 0.1
141 0.07
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.13
150 0.12
151 0.13
152 0.15
153 0.18
154 0.19
155 0.22
156 0.26
157 0.25
158 0.26
159 0.27
160 0.29
161 0.32
162 0.37
163 0.39
164 0.44
165 0.46
166 0.43
167 0.44
168 0.42
169 0.36
170 0.3
171 0.25
172 0.2
173 0.17
174 0.2
175 0.19
176 0.19
177 0.2
178 0.2
179 0.22
180 0.2
181 0.19
182 0.21
183 0.22
184 0.25
185 0.32
186 0.32
187 0.33
188 0.37
189 0.39
190 0.37
191 0.39
192 0.34
193 0.31
194 0.36
195 0.43
196 0.42
197 0.45
198 0.49
199 0.51
200 0.54
201 0.5
202 0.45
203 0.36
204 0.32
205 0.3
206 0.31
207 0.34
208 0.35
209 0.41
210 0.45
211 0.53
212 0.55
213 0.59
214 0.52
215 0.46
216 0.46
217 0.48
218 0.44
219 0.41
220 0.41
221 0.36
222 0.38
223 0.35
224 0.3
225 0.21
226 0.19
227 0.17
228 0.16
229 0.15
230 0.16
231 0.2
232 0.23
233 0.23
234 0.24
235 0.22
236 0.21
237 0.21
238 0.17
239 0.15
240 0.12
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.13
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.11
251 0.16
252 0.2
253 0.23
254 0.32
255 0.38
256 0.4
257 0.41
258 0.44
259 0.46
260 0.47
261 0.47
262 0.38
263 0.34
264 0.32
265 0.29
266 0.25
267 0.18
268 0.15
269 0.19
270 0.19
271 0.16
272 0.16
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.13
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.07
304 0.1
305 0.11
306 0.13
307 0.15
308 0.16
309 0.16
310 0.15
311 0.14
312 0.11
313 0.09
314 0.08
315 0.05
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.12
329 0.12
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.1
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.12
340 0.12
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.1
375 0.13
376 0.17
377 0.17
378 0.18
379 0.18
380 0.2
381 0.2
382 0.17
383 0.2
384 0.16
385 0.17
386 0.17
387 0.17
388 0.15
389 0.14
390 0.13
391 0.07
392 0.06
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.09
413 0.1
414 0.11
415 0.13
416 0.15
417 0.17
418 0.17
419 0.19
420 0.17
421 0.16
422 0.16
423 0.14
424 0.12
425 0.11
426 0.1
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.07
431 0.08
432 0.09
433 0.11
434 0.13
435 0.16
436 0.16
437 0.17
438 0.19
439 0.22
440 0.24
441 0.23
442 0.22
443 0.25
444 0.26
445 0.27
446 0.25
447 0.2
448 0.17
449 0.2
450 0.19
451 0.15
452 0.17
453 0.18
454 0.18
455 0.19
456 0.19
457 0.18
458 0.17
459 0.15
460 0.12
461 0.09
462 0.09
463 0.08
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.05
470 0.04
471 0.05
472 0.07
473 0.09
474 0.09
475 0.1
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.12
480 0.11
481 0.1
482 0.12
483 0.14
484 0.17
485 0.19
486 0.26
487 0.31
488 0.36
489 0.38
490 0.39
491 0.41
492 0.43
493 0.47
494 0.49
495 0.52
496 0.54
497 0.55
498 0.52
499 0.49
500 0.45
501 0.38
502 0.29
503 0.21
504 0.15
505 0.16
506 0.16
507 0.16
508 0.18
509 0.23
510 0.32
511 0.32
512 0.33
513 0.28
514 0.28
515 0.28
516 0.29
517 0.26
518 0.22
519 0.25
520 0.24
521 0.24
522 0.24
523 0.23
524 0.2
525 0.2
526 0.16
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.1
533 0.1
534 0.13
535 0.15
536 0.19
537 0.27
538 0.35
539 0.41
540 0.43
541 0.47
542 0.48
543 0.5
544 0.51
545 0.51
546 0.48
547 0.49
548 0.56
549 0.56
550 0.53
551 0.5
552 0.47
553 0.39
554 0.36
555 0.28
556 0.2
557 0.16
558 0.14
559 0.14
560 0.13
561 0.12
562 0.09
563 0.08
564 0.06
565 0.07
566 0.08
567 0.09
568 0.08
569 0.09
570 0.09
571 0.1
572 0.1
573 0.09
574 0.09
575 0.1
576 0.14
577 0.14
578 0.14
579 0.16
580 0.16
581 0.16
582 0.17
583 0.18
584 0.18
585 0.21
586 0.26
587 0.29
588 0.35
589 0.34
590 0.35
591 0.33
592 0.35
593 0.42
594 0.45
595 0.42
596 0.42
597 0.44
598 0.42
599 0.44
600 0.41
601 0.31
602 0.27
603 0.24
604 0.18
605 0.19
606 0.18
607 0.16
608 0.12
609 0.13
610 0.12
611 0.12
612 0.13
613 0.12
614 0.13
615 0.12
616 0.12
617 0.12
618 0.1
619 0.11
620 0.12
621 0.17
622 0.2
623 0.23
624 0.25
625 0.27
626 0.31
627 0.33
628 0.34
629 0.35
630 0.36
631 0.39
632 0.44
633 0.48
634 0.47
635 0.45
636 0.42
637 0.4
638 0.38
639 0.33
640 0.31
641 0.27
642 0.25