Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P47979

Protein Details
Accession P47979    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
353-376NQELKEPPRHPKYKSERCRSFMMYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1905762  F:CCR4-NOT complex binding  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0044692  F:exoribonuclease activator activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0035925  F:mRNA 3'-UTR AU-rich region binding  
GO:0062104  F:pumilio-response element binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0140610  F:RNA sequestering activity  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0031138  P:negative regulation of conjugation with cellular fusion  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:0031139  P:positive regulation of conjugation with cellular fusion  
GO:0060213  P:positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0110044  P:regulation of cell cycle switching, mitotic to meiotic cell cycle  
KEGG spo:SPBC1718.07c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MVYSPMSRPQVPLAFRQWPPYNYKSDPLVNSKLSQSTTSVNAGPSLISPSFLDSYANSSSLLHKPSTNLGSLKTSSLLASDEVFPSSVMPQLRPLDSSLSVSPEMDGWPWHHNSSSNPQGYAWTPSLLSSNATSYLHSGSSPHGNTSNHPSPISSLESLPSRSSTGSGSLDFSGLANLHDDSKSLAMSLNMAGVPVSVDENSQTSFPFVHGQPESTMSRKPKLCVQSKSMTNIRNSVAKPSLVRQSHSAGVIPIKPTASNASIRNAPSNLSKQFSPSGNSPLTEASKPFVPQPSAAGDFRQAKGSASHPHGSGSSNGVAPNGKRALYKTEPCKNWQISGTCRYGSKCQFAHGNQELKEPPRHPKYKSERCRSFMMYGYCPYGLRCCFLHDESNAQKSATIKQSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.48
3 0.55
4 0.55
5 0.52
6 0.57
7 0.56
8 0.56
9 0.52
10 0.55
11 0.52
12 0.52
13 0.53
14 0.53
15 0.54
16 0.49
17 0.48
18 0.46
19 0.45
20 0.39
21 0.35
22 0.3
23 0.27
24 0.27
25 0.28
26 0.26
27 0.23
28 0.22
29 0.2
30 0.18
31 0.16
32 0.17
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.16
37 0.17
38 0.17
39 0.17
40 0.12
41 0.17
42 0.18
43 0.18
44 0.15
45 0.15
46 0.19
47 0.23
48 0.25
49 0.22
50 0.21
51 0.23
52 0.29
53 0.31
54 0.3
55 0.27
56 0.26
57 0.29
58 0.29
59 0.29
60 0.23
61 0.21
62 0.17
63 0.17
64 0.15
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.13
75 0.12
76 0.12
77 0.17
78 0.2
79 0.21
80 0.22
81 0.22
82 0.22
83 0.22
84 0.25
85 0.2
86 0.2
87 0.19
88 0.18
89 0.17
90 0.14
91 0.14
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.15
96 0.17
97 0.18
98 0.18
99 0.19
100 0.23
101 0.3
102 0.36
103 0.33
104 0.32
105 0.31
106 0.32
107 0.32
108 0.32
109 0.25
110 0.17
111 0.15
112 0.15
113 0.16
114 0.15
115 0.14
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.17
128 0.17
129 0.17
130 0.2
131 0.2
132 0.22
133 0.31
134 0.34
135 0.3
136 0.29
137 0.28
138 0.25
139 0.28
140 0.29
141 0.21
142 0.15
143 0.16
144 0.17
145 0.19
146 0.17
147 0.15
148 0.13
149 0.12
150 0.13
151 0.11
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.1
195 0.09
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.15
200 0.18
201 0.19
202 0.17
203 0.21
204 0.19
205 0.26
206 0.27
207 0.27
208 0.3
209 0.38
210 0.44
211 0.44
212 0.47
213 0.49
214 0.5
215 0.54
216 0.53
217 0.48
218 0.41
219 0.4
220 0.35
221 0.34
222 0.31
223 0.3
224 0.27
225 0.24
226 0.24
227 0.24
228 0.31
229 0.27
230 0.28
231 0.25
232 0.27
233 0.27
234 0.27
235 0.24
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.17
240 0.14
241 0.13
242 0.12
243 0.13
244 0.15
245 0.15
246 0.17
247 0.18
248 0.2
249 0.24
250 0.25
251 0.26
252 0.23
253 0.23
254 0.23
255 0.27
256 0.27
257 0.25
258 0.24
259 0.25
260 0.28
261 0.28
262 0.27
263 0.24
264 0.28
265 0.26
266 0.26
267 0.25
268 0.23
269 0.25
270 0.23
271 0.21
272 0.16
273 0.18
274 0.19
275 0.21
276 0.22
277 0.21
278 0.2
279 0.22
280 0.25
281 0.26
282 0.26
283 0.24
284 0.25
285 0.27
286 0.27
287 0.29
288 0.24
289 0.21
290 0.23
291 0.27
292 0.28
293 0.29
294 0.31
295 0.27
296 0.28
297 0.28
298 0.28
299 0.25
300 0.22
301 0.18
302 0.17
303 0.17
304 0.16
305 0.18
306 0.17
307 0.22
308 0.21
309 0.2
310 0.2
311 0.22
312 0.3
313 0.35
314 0.43
315 0.45
316 0.53
317 0.55
318 0.58
319 0.66
320 0.6
321 0.56
322 0.54
323 0.51
324 0.48
325 0.51
326 0.51
327 0.43
328 0.43
329 0.42
330 0.44
331 0.44
332 0.46
333 0.4
334 0.4
335 0.46
336 0.45
337 0.52
338 0.51
339 0.52
340 0.45
341 0.5
342 0.51
343 0.47
344 0.53
345 0.47
346 0.49
347 0.53
348 0.59
349 0.57
350 0.63
351 0.7
352 0.73
353 0.81
354 0.82
355 0.81
356 0.78
357 0.82
358 0.76
359 0.69
360 0.66
361 0.61
362 0.54
363 0.48
364 0.47
365 0.41
366 0.36
367 0.33
368 0.33
369 0.28
370 0.26
371 0.24
372 0.25
373 0.3
374 0.33
375 0.38
376 0.33
377 0.4
378 0.44
379 0.49
380 0.45
381 0.39
382 0.38
383 0.34
384 0.4