Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q9HDY4

Protein Details
Accession Q9HDY4    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-104ILIDVPKEERQKRKQELKDQLLKENEGSISSKKKKRLDKYIENKLKKEEHydrophilic
201-221ITPNIKVLPPKKKKNASWGKMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-92KKKKRL
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011709  DEAD-box_helicase_OB_fold  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR002464  DNA/RNA_helicase_DEAH_CS  
IPR007502  Helicase-assoc_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG spo:SPAPB1A10.06c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF04408  HA2  
PF00271  Helicase_C  
PF07717  OB_NTP_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00690  DEAH_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17982  DEXHc_DHX37  
cd18791  SF2_C_RHA  
Amino Acid Sequences MGRLRKRFNEKGRQSGIQKMLNLKRARLHRSVREQESSSEVHANPEPDNQDSNAEILIDVPKEERQKRKQELKDQLLKENEGSISSKKKKRLDKYIENKLKKEEVASLIAKLAEERIDTSLLSSSKNLGKQATAKEKLKKSLLEEKLGLPLSDADSRLYKVVDVETTTTKSSTAETNAPEKYSTRSGFGFGFSTGTNESEITPNIKVLPPKKKKNASWGKMLNEDPEYDSAEEDYLSTDSEEFSEDSDNSSEENKDTNEPSTKDAEKTVPEDVVNLRSEQKLQPSFGHPEFENEDFDLETSEDDSSDDATERASRFKSWANKQILGADVGEKSHDVAPDNKIDNPDADMVRAQRMPRKLKMREEDVEPTADDIEIKGRKTTYTIINRPPEIQESRLALPIVAEEQRIMEQIFANDVVIICGATGSGKTTQLPQFLFEAGFSSPESENPGMIAITQPRRVAAVSIAKRVSEELTGFSSKVSYQIRFDSTINPDTAIKFMTDGILLRELSSDFLLTAYSAVIVDEAHERSVNTDILLGLLSRIVRLRREMSKSDQKVKPLKLIIMSATLRVTDFSENKLLFSVPPPIIKIDARQYPVSIHFNRTTKPDYLQDAFDKVCLIHKRLPAGSILVFLTGQQEVEQLCQMLRKRFVRSFRPLKSRARIVVSRKTMSVENEDLQSETEDIDQVPTSSSSSVTYDDESEPMYVLPLYSLLTTEDQMKVFDSSPEGHRMCIVATNVAETSITIPNIRYVVDCGKAKERVYNEKTSVQKFEVRWISKANADQRAGRAGRTGPGHCYRLYSSAVFDSSFPLHSLPEILRTPVESIVLQMKNMNIDNIANFPFPTSPGRSRLEKSLKLLSNLGAIDSEGVLTKLGEQMSLFPLSPRFSKMLIIGQQHGCLPYVIALVSALSINQLFVSKQSLLYDAHDKNSRSEETDLIDDDEIKQKEEYKNRMRGYFNAISRFQAIDPDAPALSLLSAVCAYDYASDKRKFCKENYLREKALEEVTNLRKQIIGLLKRYMVRVEKEFFKLQLKPPTSVQIKALRQFIASAYIDQVALYDKEKRGYVTLFPSGSEVVQFVPDRTYNIDSEYVVYLSLHESRSGRVYMSPLTEISPEHLARLAKNTTLLSYSKPLSYPPIRYLDNATKRECWVIPILSANIGTGSPSWNLPAVQIIQKRINGRWVNC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.75
3 0.72
4 0.66
5 0.62
6 0.61
7 0.61
8 0.62
9 0.61
10 0.56
11 0.55
12 0.59
13 0.62
14 0.62
15 0.64
16 0.65
17 0.73
18 0.79
19 0.78
20 0.76
21 0.71
22 0.64
23 0.6
24 0.52
25 0.44
26 0.4
27 0.33
28 0.31
29 0.32
30 0.31
31 0.28
32 0.32
33 0.32
34 0.28
35 0.31
36 0.28
37 0.27
38 0.26
39 0.25
40 0.19
41 0.17
42 0.13
43 0.12
44 0.14
45 0.12
46 0.12
47 0.13
48 0.17
49 0.26
50 0.35
51 0.43
52 0.5
53 0.61
54 0.71
55 0.79
56 0.84
57 0.86
58 0.89
59 0.89
60 0.89
61 0.83
62 0.8
63 0.74
64 0.66
65 0.57
66 0.49
67 0.39
68 0.32
69 0.31
70 0.28
71 0.33
72 0.41
73 0.47
74 0.52
75 0.6
76 0.68
77 0.75
78 0.81
79 0.81
80 0.83
81 0.87
82 0.89
83 0.92
84 0.88
85 0.82
86 0.77
87 0.71
88 0.61
89 0.53
90 0.48
91 0.41
92 0.41
93 0.39
94 0.33
95 0.3
96 0.29
97 0.26
98 0.2
99 0.17
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.18
108 0.17
109 0.18
110 0.17
111 0.19
112 0.24
113 0.27
114 0.29
115 0.25
116 0.28
117 0.33
118 0.42
119 0.48
120 0.51
121 0.55
122 0.61
123 0.66
124 0.69
125 0.68
126 0.63
127 0.6
128 0.62
129 0.61
130 0.58
131 0.53
132 0.48
133 0.48
134 0.45
135 0.38
136 0.28
137 0.24
138 0.22
139 0.22
140 0.22
141 0.17
142 0.18
143 0.19
144 0.2
145 0.19
146 0.15
147 0.14
148 0.16
149 0.15
150 0.15
151 0.17
152 0.2
153 0.22
154 0.22
155 0.21
156 0.19
157 0.18
158 0.18
159 0.18
160 0.19
161 0.21
162 0.23
163 0.29
164 0.3
165 0.31
166 0.31
167 0.28
168 0.29
169 0.32
170 0.3
171 0.27
172 0.27
173 0.28
174 0.28
175 0.28
176 0.24
177 0.17
178 0.17
179 0.14
180 0.15
181 0.14
182 0.14
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.15
191 0.16
192 0.19
193 0.24
194 0.3
195 0.4
196 0.47
197 0.57
198 0.67
199 0.74
200 0.77
201 0.82
202 0.85
203 0.79
204 0.79
205 0.76
206 0.7
207 0.67
208 0.62
209 0.55
210 0.45
211 0.41
212 0.33
213 0.27
214 0.25
215 0.19
216 0.18
217 0.15
218 0.14
219 0.12
220 0.1
221 0.1
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.1
232 0.1
233 0.12
234 0.13
235 0.12
236 0.12
237 0.13
238 0.14
239 0.12
240 0.14
241 0.14
242 0.17
243 0.18
244 0.22
245 0.26
246 0.27
247 0.29
248 0.32
249 0.33
250 0.31
251 0.32
252 0.31
253 0.28
254 0.29
255 0.28
256 0.24
257 0.21
258 0.22
259 0.21
260 0.22
261 0.2
262 0.19
263 0.19
264 0.18
265 0.21
266 0.22
267 0.28
268 0.28
269 0.29
270 0.31
271 0.33
272 0.39
273 0.37
274 0.39
275 0.3
276 0.31
277 0.32
278 0.3
279 0.27
280 0.21
281 0.2
282 0.16
283 0.16
284 0.13
285 0.1
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.06
296 0.07
297 0.11
298 0.11
299 0.15
300 0.15
301 0.16
302 0.18
303 0.25
304 0.33
305 0.38
306 0.46
307 0.49
308 0.51
309 0.51
310 0.51
311 0.45
312 0.37
313 0.3
314 0.22
315 0.16
316 0.13
317 0.13
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.12
322 0.12
323 0.15
324 0.18
325 0.23
326 0.25
327 0.25
328 0.25
329 0.25
330 0.23
331 0.22
332 0.23
333 0.17
334 0.16
335 0.16
336 0.16
337 0.18
338 0.2
339 0.2
340 0.22
341 0.29
342 0.35
343 0.41
344 0.5
345 0.53
346 0.6
347 0.65
348 0.66
349 0.62
350 0.6
351 0.58
352 0.5
353 0.44
354 0.35
355 0.29
356 0.22
357 0.18
358 0.13
359 0.08
360 0.13
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.15
365 0.16
366 0.18
367 0.22
368 0.25
369 0.32
370 0.39
371 0.45
372 0.5
373 0.51
374 0.5
375 0.48
376 0.44
377 0.37
378 0.32
379 0.28
380 0.26
381 0.26
382 0.27
383 0.25
384 0.19
385 0.16
386 0.15
387 0.14
388 0.11
389 0.09
390 0.07
391 0.08
392 0.08
393 0.09
394 0.09
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.09
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.05
412 0.06
413 0.07
414 0.08
415 0.13
416 0.16
417 0.19
418 0.2
419 0.19
420 0.19
421 0.19
422 0.19
423 0.14
424 0.13
425 0.09
426 0.1
427 0.08
428 0.1
429 0.09
430 0.09
431 0.14
432 0.13
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.09
437 0.09
438 0.1
439 0.11
440 0.14
441 0.16
442 0.16
443 0.16
444 0.17
445 0.17
446 0.16
447 0.15
448 0.21
449 0.21
450 0.26
451 0.26
452 0.25
453 0.25
454 0.25
455 0.22
456 0.14
457 0.13
458 0.1
459 0.12
460 0.13
461 0.13
462 0.12
463 0.12
464 0.1
465 0.15
466 0.16
467 0.15
468 0.16
469 0.19
470 0.21
471 0.23
472 0.24
473 0.23
474 0.25
475 0.26
476 0.24
477 0.22
478 0.2
479 0.18
480 0.18
481 0.14
482 0.1
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.06
488 0.07
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.09
493 0.08
494 0.09
495 0.08
496 0.07
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.04
509 0.06
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.08
515 0.11
516 0.1
517 0.08
518 0.08
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.06
523 0.04
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.07
528 0.08
529 0.09
530 0.12
531 0.16
532 0.21
533 0.26
534 0.29
535 0.34
536 0.43
537 0.47
538 0.53
539 0.52
540 0.53
541 0.55
542 0.54
543 0.51
544 0.43
545 0.4
546 0.32
547 0.3
548 0.24
549 0.21
550 0.2
551 0.15
552 0.14
553 0.12
554 0.11
555 0.11
556 0.11
557 0.1
558 0.1
559 0.11
560 0.16
561 0.15
562 0.16
563 0.16
564 0.14
565 0.12
566 0.12
567 0.16
568 0.12
569 0.13
570 0.13
571 0.13
572 0.15
573 0.15
574 0.16
575 0.16
576 0.19
577 0.21
578 0.21
579 0.2
580 0.2
581 0.24
582 0.28
583 0.24
584 0.23
585 0.25
586 0.27
587 0.27
588 0.3
589 0.29
590 0.25
591 0.26
592 0.25
593 0.25
594 0.25
595 0.27
596 0.24
597 0.22
598 0.21
599 0.18
600 0.15
601 0.11
602 0.15
603 0.15
604 0.17
605 0.2
606 0.22
607 0.25
608 0.25
609 0.26
610 0.21
611 0.2
612 0.17
613 0.13
614 0.11
615 0.09
616 0.08
617 0.07
618 0.08
619 0.06
620 0.06
621 0.05
622 0.06
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.06
627 0.06
628 0.1
629 0.12
630 0.15
631 0.21
632 0.24
633 0.29
634 0.34
635 0.4
636 0.45
637 0.52
638 0.58
639 0.59
640 0.64
641 0.64
642 0.67
643 0.66
644 0.63
645 0.57
646 0.53
647 0.52
648 0.49
649 0.53
650 0.5
651 0.46
652 0.41
653 0.39
654 0.35
655 0.31
656 0.3
657 0.23
658 0.19
659 0.19
660 0.19
661 0.17
662 0.16
663 0.14
664 0.1
665 0.08
666 0.07
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.07
677 0.07
678 0.08
679 0.1
680 0.1
681 0.1
682 0.12
683 0.12
684 0.12
685 0.12
686 0.11
687 0.09
688 0.08
689 0.08
690 0.06
691 0.05
692 0.05
693 0.04
694 0.05
695 0.04
696 0.05
697 0.06
698 0.07
699 0.07
700 0.09
701 0.1
702 0.1
703 0.11
704 0.11
705 0.11
706 0.11
707 0.11
708 0.11
709 0.12
710 0.13
711 0.2
712 0.2
713 0.18
714 0.18
715 0.18
716 0.17
717 0.18
718 0.16
719 0.11
720 0.1
721 0.11
722 0.11
723 0.11
724 0.1
725 0.07
726 0.09
727 0.09
728 0.1
729 0.09
730 0.09
731 0.11
732 0.11
733 0.11
734 0.09
735 0.1
736 0.13
737 0.17
738 0.18
739 0.19
740 0.24
741 0.27
742 0.27
743 0.3
744 0.31
745 0.37
746 0.41
747 0.44
748 0.43
749 0.46
750 0.5
751 0.48
752 0.47
753 0.39
754 0.39
755 0.34
756 0.39
757 0.41
758 0.38
759 0.37
760 0.37
761 0.36
762 0.33
763 0.38
764 0.36
765 0.34
766 0.34
767 0.34
768 0.33
769 0.38
770 0.35
771 0.3
772 0.26
773 0.21
774 0.23
775 0.25
776 0.25
777 0.24
778 0.28
779 0.3
780 0.28
781 0.3
782 0.27
783 0.27
784 0.28
785 0.22
786 0.19
787 0.18
788 0.19
789 0.16
790 0.15
791 0.14
792 0.13
793 0.13
794 0.12
795 0.11
796 0.1
797 0.1
798 0.12
799 0.09
800 0.13
801 0.13
802 0.14
803 0.13
804 0.14
805 0.16
806 0.14
807 0.15
808 0.1
809 0.11
810 0.17
811 0.17
812 0.17
813 0.16
814 0.16
815 0.18
816 0.18
817 0.17
818 0.1
819 0.11
820 0.11
821 0.12
822 0.14
823 0.11
824 0.11
825 0.11
826 0.11
827 0.12
828 0.16
829 0.19
830 0.21
831 0.27
832 0.31
833 0.34
834 0.36
835 0.44
836 0.49
837 0.47
838 0.48
839 0.51
840 0.49
841 0.47
842 0.46
843 0.37
844 0.32
845 0.28
846 0.24
847 0.14
848 0.12
849 0.1
850 0.08
851 0.08
852 0.05
853 0.05
854 0.05
855 0.05
856 0.05
857 0.08
858 0.08
859 0.08
860 0.08
861 0.1
862 0.12
863 0.13
864 0.13
865 0.11
866 0.14
867 0.16
868 0.17
869 0.18
870 0.18
871 0.17
872 0.19
873 0.2
874 0.24
875 0.28
876 0.3
877 0.32
878 0.3
879 0.31
880 0.3
881 0.28
882 0.22
883 0.16
884 0.13
885 0.1
886 0.09
887 0.08
888 0.07
889 0.06
890 0.06
891 0.06
892 0.06
893 0.04
894 0.04
895 0.05
896 0.05
897 0.05
898 0.06
899 0.06
900 0.07
901 0.11
902 0.11
903 0.12
904 0.13
905 0.15
906 0.15
907 0.18
908 0.26
909 0.23
910 0.28
911 0.32
912 0.33
913 0.33
914 0.37
915 0.36
916 0.31
917 0.31
918 0.28
919 0.25
920 0.26
921 0.25
922 0.21
923 0.2
924 0.17
925 0.16
926 0.22
927 0.2
928 0.19
929 0.19
930 0.24
931 0.31
932 0.39
933 0.47
934 0.49
935 0.58
936 0.61
937 0.66
938 0.62
939 0.58
940 0.59
941 0.57
942 0.52
943 0.48
944 0.45
945 0.41
946 0.4
947 0.38
948 0.29
949 0.25
950 0.23
951 0.19
952 0.19
953 0.19
954 0.17
955 0.15
956 0.15
957 0.11
958 0.09
959 0.08
960 0.06
961 0.06
962 0.06
963 0.06
964 0.06
965 0.06
966 0.06
967 0.08
968 0.12
969 0.16
970 0.24
971 0.3
972 0.33
973 0.39
974 0.47
975 0.49
976 0.48
977 0.56
978 0.56
979 0.62
980 0.69
981 0.71
982 0.65
983 0.62
984 0.6
985 0.51
986 0.47
987 0.37
988 0.29
989 0.29
990 0.34
991 0.37
992 0.35
993 0.33
994 0.29
995 0.27
996 0.32
997 0.33
998 0.33
999 0.32
1000 0.35
1001 0.39
1002 0.4
1003 0.41
1004 0.39
1005 0.35
1006 0.35
1007 0.37
1008 0.38
1009 0.39
1010 0.43
1011 0.45
1012 0.42
1013 0.43
1014 0.44
1015 0.46
1016 0.51
1017 0.49
1018 0.46
1019 0.46
1020 0.53
1021 0.5
1022 0.47
1023 0.45
1024 0.45
1025 0.47
1026 0.5
1027 0.51
1028 0.42
1029 0.39
1030 0.38
1031 0.33
1032 0.3
1033 0.25
1034 0.2
1035 0.18
1036 0.18
1037 0.17
1038 0.16
1039 0.16
1040 0.12
1041 0.12
1042 0.13
1043 0.18
1044 0.19
1045 0.22
1046 0.24
1047 0.25
1048 0.26
1049 0.28
1050 0.31
1051 0.3
1052 0.35
1053 0.32
1054 0.31
1055 0.31
1056 0.28
1057 0.26
1058 0.21
1059 0.15
1060 0.1
1061 0.14
1062 0.15
1063 0.13
1064 0.17
1065 0.17
1066 0.19
1067 0.23
1068 0.25
1069 0.21
1070 0.24
1071 0.25
1072 0.21
1073 0.23
1074 0.22
1075 0.18
1076 0.15
1077 0.14
1078 0.12
1079 0.13
1080 0.16
1081 0.15
1082 0.16
1083 0.17
1084 0.19
1085 0.23
1086 0.23
1087 0.22
1088 0.2
1089 0.23
1090 0.23
1091 0.26
1092 0.25
1093 0.22
1094 0.23
1095 0.23
1096 0.21
1097 0.21
1098 0.24
1099 0.21
1100 0.2
1101 0.24
1102 0.23
1103 0.24
1104 0.3
1105 0.29
1106 0.24
1107 0.27
1108 0.27
1109 0.24
1110 0.26
1111 0.26
1112 0.24
1113 0.27
1114 0.28
1115 0.27
1116 0.26
1117 0.26
1118 0.32
1119 0.38
1120 0.39
1121 0.4
1122 0.45
1123 0.44
1124 0.46
1125 0.52
1126 0.54
1127 0.57
1128 0.57
1129 0.55
1130 0.51
1131 0.52
1132 0.55
1133 0.47
1134 0.41
1135 0.37
1136 0.33
1137 0.31
1138 0.32
1139 0.31
1140 0.27
1141 0.26
1142 0.23
1143 0.17
1144 0.15
1145 0.14
1146 0.1
1147 0.12
1148 0.11
1149 0.12
1150 0.13
1151 0.14
1152 0.15
1153 0.14
1154 0.18
1155 0.2
1156 0.26
1157 0.31
1158 0.35
1159 0.39
1160 0.43
1161 0.47
1162 0.46
1163 0.52