Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O74978

Protein Details
Accession O74978    Localization Confidence High Confidence Score 23.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MSKAKSPIKSSKKSVNQPKSVLREKKHydrophilic
216-247SKEKADKLITRHNRKLKLKKRKLKELGITLESHydrophilic
253-276KAASPVASKKSSKKKNKKVLAAHKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
214-239PLSKEKADKLITRHNRKLKLKKRKLK
256-276SPVASKKSSKKKNKKVLAAHK
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG spo:SPCC1827.05c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MSKAKSPIKSSKKSVNQPKSVLREKKVKDAEKAEHISLQGHVDNSDEEGQDKEFFPGFGSSDDDEEDSPNALVNTSRQIMDLGEDAEKTIKKKVSENKNLQKKKGVLYVGRLPHGFYEKQMRMYFSQFGPVLRLRMSRNRKTGSSKHYAFIEFESLDVANVVAETMHNYLLYGKLLQCKVIPEDQVHENMFKGADVPFKRIPHATIARLQHEKPLSKEKADKLITRHNRKLKLKKRKLKELGITLESDVSHPKAASPVASKKSSKKKNKKVLAAHK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.84
3 0.82
4 0.81
5 0.83
6 0.81
7 0.81
8 0.79
9 0.74
10 0.74
11 0.69
12 0.73
13 0.73
14 0.7
15 0.68
16 0.68
17 0.68
18 0.67
19 0.68
20 0.59
21 0.51
22 0.46
23 0.39
24 0.32
25 0.29
26 0.21
27 0.17
28 0.16
29 0.14
30 0.14
31 0.16
32 0.17
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.15
37 0.16
38 0.16
39 0.15
40 0.13
41 0.13
42 0.14
43 0.14
44 0.14
45 0.13
46 0.16
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.11
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.12
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.17
77 0.19
78 0.2
79 0.27
80 0.36
81 0.45
82 0.54
83 0.63
84 0.68
85 0.75
86 0.79
87 0.74
88 0.72
89 0.64
90 0.58
91 0.53
92 0.48
93 0.39
94 0.39
95 0.44
96 0.39
97 0.38
98 0.34
99 0.28
100 0.25
101 0.27
102 0.21
103 0.16
104 0.22
105 0.22
106 0.28
107 0.28
108 0.29
109 0.27
110 0.29
111 0.3
112 0.21
113 0.24
114 0.19
115 0.18
116 0.19
117 0.18
118 0.16
119 0.15
120 0.17
121 0.16
122 0.25
123 0.33
124 0.37
125 0.43
126 0.45
127 0.47
128 0.51
129 0.56
130 0.53
131 0.53
132 0.48
133 0.43
134 0.42
135 0.4
136 0.34
137 0.28
138 0.23
139 0.14
140 0.12
141 0.11
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.02
150 0.02
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.08
161 0.13
162 0.14
163 0.15
164 0.15
165 0.16
166 0.18
167 0.2
168 0.2
169 0.16
170 0.2
171 0.21
172 0.23
173 0.22
174 0.2
175 0.17
176 0.16
177 0.15
178 0.11
179 0.1
180 0.08
181 0.14
182 0.15
183 0.21
184 0.25
185 0.26
186 0.29
187 0.29
188 0.29
189 0.31
190 0.35
191 0.32
192 0.34
193 0.37
194 0.41
195 0.44
196 0.42
197 0.4
198 0.41
199 0.41
200 0.39
201 0.45
202 0.43
203 0.44
204 0.51
205 0.49
206 0.53
207 0.54
208 0.53
209 0.49
210 0.57
211 0.62
212 0.65
213 0.7
214 0.69
215 0.74
216 0.81
217 0.86
218 0.86
219 0.87
220 0.88
221 0.89
222 0.9
223 0.92
224 0.9
225 0.89
226 0.87
227 0.85
228 0.81
229 0.73
230 0.65
231 0.54
232 0.46
233 0.37
234 0.29
235 0.22
236 0.17
237 0.16
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.17
242 0.2
243 0.24
244 0.31
245 0.36
246 0.42
247 0.46
248 0.53
249 0.63
250 0.7
251 0.74
252 0.77
253 0.82
254 0.86
255 0.92
256 0.93