Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O60141

Protein Details
Accession O60141    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
160-185VSSQRLRKQFRERKKIEKKQEAKDLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-179RKQFRERKKIEKKQ
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG spo:SPBC18H10.10c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MQGFNMGKYIPPEGPNAKRKFDKLRNVIRFEMPFPVWCNNCENIIQQGTRFNAVKKEIGSYYTTKIWSFSLKCHLCSNPIDVHTDPKNTEYIVASGGRRKIEPQDINERPAKAENDEKVPSDAIEALETQLTQQKSEKHNSSVINFIYEKNERLWSDPFVSSQRLRKQFRERKKIEKKQEAKDLSLKNRAALDIDILPPSSSDKDKALLLLDNELGKNKFIRKLDYRRTLMPSSRTFSTFAKFAETSFAKKDPFARKFVPSEKLRSEQRKFPTENLKGEKILEDNSVSLVNYEVSDDEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.51
3 0.53
4 0.57
5 0.59
6 0.64
7 0.69
8 0.71
9 0.72
10 0.72
11 0.78
12 0.8
13 0.8
14 0.77
15 0.72
16 0.65
17 0.56
18 0.52
19 0.42
20 0.36
21 0.34
22 0.37
23 0.32
24 0.31
25 0.34
26 0.29
27 0.3
28 0.29
29 0.27
30 0.25
31 0.29
32 0.27
33 0.24
34 0.27
35 0.27
36 0.3
37 0.3
38 0.26
39 0.28
40 0.3
41 0.32
42 0.28
43 0.3
44 0.27
45 0.28
46 0.29
47 0.26
48 0.27
49 0.27
50 0.28
51 0.24
52 0.24
53 0.23
54 0.26
55 0.25
56 0.25
57 0.32
58 0.33
59 0.35
60 0.38
61 0.38
62 0.35
63 0.36
64 0.36
65 0.31
66 0.29
67 0.31
68 0.27
69 0.32
70 0.31
71 0.32
72 0.28
73 0.24
74 0.24
75 0.2
76 0.21
77 0.16
78 0.14
79 0.13
80 0.14
81 0.14
82 0.17
83 0.2
84 0.2
85 0.19
86 0.2
87 0.23
88 0.3
89 0.33
90 0.34
91 0.42
92 0.43
93 0.47
94 0.49
95 0.44
96 0.36
97 0.35
98 0.31
99 0.24
100 0.27
101 0.25
102 0.27
103 0.28
104 0.27
105 0.25
106 0.24
107 0.21
108 0.15
109 0.14
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.12
121 0.19
122 0.23
123 0.3
124 0.32
125 0.3
126 0.35
127 0.36
128 0.35
129 0.33
130 0.28
131 0.25
132 0.22
133 0.2
134 0.19
135 0.19
136 0.18
137 0.16
138 0.19
139 0.16
140 0.19
141 0.2
142 0.18
143 0.2
144 0.19
145 0.19
146 0.18
147 0.21
148 0.21
149 0.26
150 0.32
151 0.38
152 0.41
153 0.47
154 0.56
155 0.63
156 0.71
157 0.75
158 0.72
159 0.75
160 0.82
161 0.85
162 0.84
163 0.85
164 0.83
165 0.8
166 0.84
167 0.76
168 0.68
169 0.66
170 0.62
171 0.57
172 0.56
173 0.49
174 0.41
175 0.38
176 0.35
177 0.28
178 0.22
179 0.18
180 0.12
181 0.13
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.09
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.12
190 0.13
191 0.14
192 0.15
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.14
201 0.16
202 0.15
203 0.14
204 0.16
205 0.18
206 0.23
207 0.24
208 0.31
209 0.38
210 0.48
211 0.57
212 0.64
213 0.64
214 0.63
215 0.67
216 0.65
217 0.61
218 0.57
219 0.52
220 0.47
221 0.46
222 0.42
223 0.39
224 0.36
225 0.33
226 0.29
227 0.24
228 0.26
229 0.23
230 0.22
231 0.27
232 0.27
233 0.27
234 0.29
235 0.32
236 0.27
237 0.29
238 0.37
239 0.4
240 0.42
241 0.45
242 0.46
243 0.48
244 0.54
245 0.59
246 0.6
247 0.54
248 0.57
249 0.57
250 0.6
251 0.63
252 0.66
253 0.65
254 0.64
255 0.68
256 0.69
257 0.67
258 0.67
259 0.69
260 0.66
261 0.7
262 0.69
263 0.65
264 0.57
265 0.55
266 0.5
267 0.41
268 0.36
269 0.29
270 0.23
271 0.2
272 0.2
273 0.19
274 0.16
275 0.14
276 0.13
277 0.11
278 0.1
279 0.1