Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q09873

Protein Details
Accession Q09873    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-57TPSSNIYTKERLKRGKRFNNISKERTKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-57RLKRGKRFNNISKERTKG
Subcellular Location(s) nucl 15, mito_nucl 11.166, cyto_nucl 10.666, cyto_mito 6.166, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0080008  C:Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0070913  C:Ddb1-Wdr21 complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006283  P:transcription-coupled nucleotide-excision repair  
KEGG spo:SPAC12G12.10  -  
Amino Acid Sequences MSGLPFHIPGYYYNSEKKRYFRIISSGQSTPSSNIYTKERLKRGKRFNNISKERTKGKGGNPVFNFSTYLFDRQFSQYPYSCNDDRDYLCAKNLKKINLRQLPVGTELQKIGWLREVNTIILTSKNGDILGCCLTPEDKSGVANEKYTSEGSIQDFSLSRIGLSNNPISSLVCNAMQIFWSTSPSLQNEGQFHISTYNQLLGESNNYRWGSLKLLKTPLCAESIGEMGFAVGGTSKIAIINREGKLTQSLQSKGDVFSLKYLGDNLVIAGCRNKSVLVYDLRTKKECVQRFYHGSSICSMQNLDFSQPKLLVSGLESKISLYDCRFLQSKKRPQSIMSYMGHSNLLERNLALMKNENGSIFSSAGDDYVLRFWKTDCSLPFKEMRVDDGKYLCRDGSWVKAMNGTGWVLPYGRGLLIYEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.47
3 0.51
4 0.55
5 0.56
6 0.61
7 0.62
8 0.59
9 0.62
10 0.62
11 0.64
12 0.64
13 0.57
14 0.5
15 0.47
16 0.43
17 0.36
18 0.32
19 0.29
20 0.25
21 0.27
22 0.3
23 0.37
24 0.44
25 0.52
26 0.57
27 0.63
28 0.72
29 0.78
30 0.84
31 0.86
32 0.87
33 0.88
34 0.89
35 0.9
36 0.89
37 0.87
38 0.83
39 0.79
40 0.75
41 0.68
42 0.66
43 0.62
44 0.6
45 0.63
46 0.6
47 0.62
48 0.59
49 0.59
50 0.53
51 0.47
52 0.42
53 0.32
54 0.33
55 0.25
56 0.28
57 0.24
58 0.23
59 0.25
60 0.28
61 0.32
62 0.29
63 0.33
64 0.31
65 0.32
66 0.35
67 0.39
68 0.36
69 0.34
70 0.33
71 0.33
72 0.31
73 0.33
74 0.34
75 0.28
76 0.31
77 0.35
78 0.34
79 0.36
80 0.4
81 0.43
82 0.48
83 0.54
84 0.6
85 0.63
86 0.64
87 0.6
88 0.57
89 0.51
90 0.46
91 0.43
92 0.34
93 0.27
94 0.25
95 0.21
96 0.22
97 0.2
98 0.17
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.23
103 0.25
104 0.22
105 0.22
106 0.21
107 0.16
108 0.16
109 0.15
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.12
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.12
124 0.12
125 0.1
126 0.1
127 0.13
128 0.19
129 0.19
130 0.2
131 0.19
132 0.18
133 0.19
134 0.19
135 0.17
136 0.12
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.14
145 0.11
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.11
150 0.14
151 0.16
152 0.14
153 0.15
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.11
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.12
171 0.13
172 0.15
173 0.15
174 0.18
175 0.18
176 0.19
177 0.21
178 0.18
179 0.17
180 0.16
181 0.14
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.12
190 0.13
191 0.13
192 0.16
193 0.16
194 0.16
195 0.17
196 0.18
197 0.18
198 0.23
199 0.25
200 0.22
201 0.28
202 0.29
203 0.29
204 0.3
205 0.26
206 0.21
207 0.19
208 0.16
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.08
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.03
218 0.02
219 0.02
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.04
224 0.05
225 0.06
226 0.09
227 0.15
228 0.16
229 0.17
230 0.17
231 0.17
232 0.2
233 0.2
234 0.22
235 0.21
236 0.23
237 0.22
238 0.24
239 0.24
240 0.22
241 0.24
242 0.2
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.14
247 0.13
248 0.13
249 0.1
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.1
263 0.14
264 0.16
265 0.19
266 0.26
267 0.32
268 0.36
269 0.37
270 0.38
271 0.4
272 0.45
273 0.49
274 0.47
275 0.46
276 0.5
277 0.54
278 0.56
279 0.54
280 0.46
281 0.41
282 0.37
283 0.34
284 0.27
285 0.22
286 0.19
287 0.13
288 0.15
289 0.15
290 0.17
291 0.17
292 0.17
293 0.19
294 0.19
295 0.19
296 0.16
297 0.15
298 0.12
299 0.11
300 0.19
301 0.17
302 0.18
303 0.18
304 0.17
305 0.18
306 0.19
307 0.19
308 0.13
309 0.16
310 0.15
311 0.18
312 0.22
313 0.23
314 0.32
315 0.41
316 0.49
317 0.55
318 0.62
319 0.61
320 0.6
321 0.67
322 0.63
323 0.61
324 0.53
325 0.47
326 0.4
327 0.39
328 0.37
329 0.28
330 0.24
331 0.19
332 0.18
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.17
337 0.18
338 0.17
339 0.18
340 0.18
341 0.2
342 0.21
343 0.19
344 0.17
345 0.19
346 0.19
347 0.15
348 0.14
349 0.13
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.09
354 0.08
355 0.12
356 0.15
357 0.14
358 0.15
359 0.16
360 0.22
361 0.26
362 0.31
363 0.3
364 0.36
365 0.39
366 0.42
367 0.47
368 0.43
369 0.46
370 0.41
371 0.43
372 0.39
373 0.39
374 0.4
375 0.4
376 0.43
377 0.39
378 0.4
379 0.34
380 0.29
381 0.3
382 0.28
383 0.3
384 0.31
385 0.33
386 0.31
387 0.35
388 0.36
389 0.33
390 0.33
391 0.26
392 0.21
393 0.17
394 0.17
395 0.14
396 0.14
397 0.14
398 0.13
399 0.12
400 0.12