Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O74400

Protein Details
Accession O74400    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-112TDQNKAVKKTIRQDNRPRLIIRHydrophilic
605-636IENIQVVKRRQEKEKSFRQKAKQLKQQEDEDNHydrophilic
651-674AKEKQAKVARIIQRKRMKRRSRKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
514-518LKRGK
653-674EKQAKVARIIQRKRMKRRSRKN
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034805  Nop4_RRM1  
IPR034806  Nop4_RRM2  
IPR034809  Nop4_RRM4  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0048255  P:mRNA stabilization  
GO:0000381  P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG spo:SPBC4F6.14  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12674  RRM1_Nop4p  
cd12675  RRM2_Nop4p  
cd12676  RRM3_Nop4p  
cd12677  RRM4_Nop4p  
Amino Acid Sequences MNSNSTLFVRNLAFQTKQDDLTNFFSDVGPIKHAVVVTNPETGENRGYGFVTFSMLEDAQRAAKELKNKKLHGRILRLDFATPRKRSEVDTDQNKAVKKTIRQDNRPRLIIRNLPWSIKKPQHLEPHFSKFGKVREIKIPTKGGGRMCGFAFVWMKDRKAAEEAMNSLNGTEIDGRPIAVDWAVSKDAFEATTLKDASSEEENKEFVSDEGHSIVTEDASADSESEEEVDGHSEGKELAGESEEEGSNVDDVEDSGDSSSDKNSINHEIRDNEGLEDTVFVRNLLFECTEQELYNHFRQFGPLAYAKLVKDPATDRSLGRGFIKFRYEKDCQNCLEMASQLPTQEPTEAEKRFLPSVLVDEGIDTDSVSSRFLLHGRLLKVTSAVTRKEASDINQKSLQERKQKMGKGVDRRHLFLLNEGKIAADHPLFNSLSETDKTLRSQSIAQRKKLLEKNPTLHLSLNRLSIRNISRHIDPKILAMLGRQAIRGFMDDVSKGLRANITEEEENLDKGHRLKRGKSGGVLKQAKVETEKAGAGRSKGFGFMQFISHKYALMALRWLNGREITVKKIIDAEIEWARKHKIPEPQLPNIDYNDRPRRLIVEFAIENIQVVKRRQEKEKSFRQKAKQLKQQEDEDNLKRKRSESDVEDNEAKEKQAKVARIIQRKRMKRRSRKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.33
3 0.33
4 0.34
5 0.34
6 0.33
7 0.33
8 0.37
9 0.37
10 0.32
11 0.3
12 0.27
13 0.25
14 0.27
15 0.23
16 0.2
17 0.18
18 0.18
19 0.19
20 0.19
21 0.18
22 0.18
23 0.23
24 0.22
25 0.24
26 0.24
27 0.24
28 0.25
29 0.27
30 0.26
31 0.2
32 0.2
33 0.17
34 0.18
35 0.16
36 0.16
37 0.14
38 0.14
39 0.13
40 0.12
41 0.14
42 0.14
43 0.14
44 0.13
45 0.14
46 0.15
47 0.15
48 0.17
49 0.17
50 0.2
51 0.29
52 0.37
53 0.46
54 0.52
55 0.58
56 0.65
57 0.71
58 0.78
59 0.77
60 0.78
61 0.76
62 0.73
63 0.74
64 0.65
65 0.58
66 0.54
67 0.54
68 0.54
69 0.48
70 0.46
71 0.45
72 0.45
73 0.46
74 0.5
75 0.51
76 0.51
77 0.57
78 0.58
79 0.58
80 0.61
81 0.59
82 0.52
83 0.48
84 0.44
85 0.43
86 0.48
87 0.53
88 0.6
89 0.68
90 0.77
91 0.83
92 0.84
93 0.83
94 0.76
95 0.71
96 0.69
97 0.66
98 0.59
99 0.58
100 0.53
101 0.52
102 0.53
103 0.52
104 0.53
105 0.53
106 0.56
107 0.51
108 0.57
109 0.62
110 0.63
111 0.66
112 0.64
113 0.66
114 0.66
115 0.61
116 0.56
117 0.5
118 0.5
119 0.52
120 0.49
121 0.44
122 0.46
123 0.54
124 0.54
125 0.56
126 0.55
127 0.47
128 0.48
129 0.48
130 0.41
131 0.4
132 0.38
133 0.33
134 0.3
135 0.3
136 0.25
137 0.25
138 0.25
139 0.19
140 0.24
141 0.25
142 0.26
143 0.27
144 0.28
145 0.26
146 0.26
147 0.28
148 0.24
149 0.24
150 0.27
151 0.24
152 0.24
153 0.22
154 0.19
155 0.17
156 0.13
157 0.11
158 0.11
159 0.09
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.11
165 0.1
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.2
186 0.21
187 0.19
188 0.2
189 0.2
190 0.2
191 0.2
192 0.18
193 0.12
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.08
203 0.07
204 0.06
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.13
251 0.21
252 0.23
253 0.25
254 0.27
255 0.26
256 0.26
257 0.28
258 0.25
259 0.18
260 0.16
261 0.14
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.09
275 0.12
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.14
280 0.18
281 0.22
282 0.21
283 0.19
284 0.18
285 0.19
286 0.19
287 0.17
288 0.17
289 0.14
290 0.14
291 0.14
292 0.17
293 0.16
294 0.17
295 0.17
296 0.13
297 0.14
298 0.14
299 0.17
300 0.17
301 0.19
302 0.16
303 0.2
304 0.21
305 0.2
306 0.2
307 0.2
308 0.19
309 0.2
310 0.26
311 0.23
312 0.24
313 0.29
314 0.3
315 0.34
316 0.38
317 0.41
318 0.36
319 0.36
320 0.34
321 0.29
322 0.27
323 0.21
324 0.15
325 0.12
326 0.11
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.11
334 0.16
335 0.16
336 0.18
337 0.18
338 0.2
339 0.19
340 0.19
341 0.16
342 0.1
343 0.12
344 0.11
345 0.1
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.07
351 0.05
352 0.04
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.07
360 0.09
361 0.1
362 0.15
363 0.16
364 0.17
365 0.17
366 0.17
367 0.17
368 0.16
369 0.17
370 0.16
371 0.16
372 0.17
373 0.17
374 0.17
375 0.19
376 0.2
377 0.19
378 0.26
379 0.26
380 0.28
381 0.31
382 0.31
383 0.31
384 0.37
385 0.4
386 0.4
387 0.41
388 0.44
389 0.48
390 0.51
391 0.54
392 0.57
393 0.57
394 0.58
395 0.63
396 0.64
397 0.59
398 0.58
399 0.54
400 0.48
401 0.4
402 0.36
403 0.36
404 0.29
405 0.27
406 0.24
407 0.22
408 0.19
409 0.19
410 0.15
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.11
415 0.12
416 0.12
417 0.13
418 0.11
419 0.13
420 0.13
421 0.15
422 0.13
423 0.15
424 0.16
425 0.17
426 0.17
427 0.16
428 0.21
429 0.27
430 0.36
431 0.41
432 0.43
433 0.48
434 0.49
435 0.56
436 0.57
437 0.58
438 0.56
439 0.57
440 0.58
441 0.57
442 0.58
443 0.51
444 0.47
445 0.42
446 0.38
447 0.32
448 0.35
449 0.3
450 0.28
451 0.28
452 0.31
453 0.32
454 0.3
455 0.32
456 0.28
457 0.31
458 0.37
459 0.38
460 0.35
461 0.32
462 0.3
463 0.28
464 0.26
465 0.21
466 0.15
467 0.17
468 0.16
469 0.17
470 0.15
471 0.13
472 0.14
473 0.14
474 0.15
475 0.12
476 0.1
477 0.11
478 0.11
479 0.12
480 0.13
481 0.13
482 0.12
483 0.11
484 0.12
485 0.1
486 0.13
487 0.15
488 0.18
489 0.18
490 0.18
491 0.21
492 0.2
493 0.2
494 0.17
495 0.15
496 0.13
497 0.18
498 0.23
499 0.26
500 0.31
501 0.35
502 0.44
503 0.52
504 0.53
505 0.55
506 0.58
507 0.58
508 0.63
509 0.64
510 0.55
511 0.52
512 0.5
513 0.45
514 0.39
515 0.35
516 0.26
517 0.24
518 0.25
519 0.2
520 0.23
521 0.23
522 0.22
523 0.22
524 0.22
525 0.2
526 0.2
527 0.2
528 0.18
529 0.2
530 0.19
531 0.22
532 0.22
533 0.23
534 0.27
535 0.26
536 0.24
537 0.2
538 0.24
539 0.2
540 0.19
541 0.22
542 0.17
543 0.21
544 0.23
545 0.24
546 0.21
547 0.2
548 0.21
549 0.23
550 0.25
551 0.25
552 0.29
553 0.28
554 0.26
555 0.29
556 0.28
557 0.23
558 0.21
559 0.22
560 0.24
561 0.26
562 0.26
563 0.26
564 0.3
565 0.31
566 0.34
567 0.35
568 0.38
569 0.44
570 0.54
571 0.59
572 0.64
573 0.67
574 0.66
575 0.62
576 0.56
577 0.53
578 0.46
579 0.48
580 0.5
581 0.46
582 0.45
583 0.43
584 0.44
585 0.41
586 0.42
587 0.34
588 0.32
589 0.3
590 0.31
591 0.32
592 0.27
593 0.25
594 0.21
595 0.22
596 0.19
597 0.21
598 0.28
599 0.35
600 0.41
601 0.5
602 0.59
603 0.66
604 0.71
605 0.81
606 0.83
607 0.84
608 0.88
609 0.89
610 0.88
611 0.88
612 0.89
613 0.87
614 0.86
615 0.85
616 0.83
617 0.81
618 0.79
619 0.76
620 0.73
621 0.72
622 0.72
623 0.66
624 0.65
625 0.59
626 0.54
627 0.53
628 0.52
629 0.52
630 0.5
631 0.57
632 0.56
633 0.6
634 0.62
635 0.56
636 0.52
637 0.44
638 0.38
639 0.33
640 0.28
641 0.3
642 0.33
643 0.36
644 0.39
645 0.48
646 0.56
647 0.62
648 0.68
649 0.71
650 0.74
651 0.81
652 0.86
653 0.87
654 0.89