Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O13826

Protein Details
Accession O13826    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-74SFPSSPVLSPRRRRMNRRRNERSRNFPSNHLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-65RRRRMNRRRNER
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.333, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038886  E3_SLX5/Rfp1  
IPR009078  Ferritin-like_SF  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0035861  C:site of double-strand break  
GO:0033768  C:SUMO-targeted ubiquitin ligase complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0140082  F:SUMO-ubiquitin ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0120290  P:stalled replication fork localization to nuclear periphery  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG spo:SPAC19A8.10  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MQFNGSNGIDESSVIDLTRSPSPPVETSISSTNIIDLDAIPDDSFPSSPVLSPRRRRMNRRRNERSRNFPSNHLSYLEDMIYLGPQVSTRRSSSRRDLMGMIARTFPEFSSVNSLSPSLFQLIVNRMRFDAIHPEWTNGSDDEYFSNHFEESYDDFTSSLENIKQSYKPPGPPKSGFTRSFNNDTLMVCPRCQEPLGTSKSKEKSALWATKCGHVYCGSCAKVLKTSKRSQSKCLVNDCGRYLNTKNAMWELFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.1
4 0.13
5 0.18
6 0.18
7 0.19
8 0.21
9 0.26
10 0.27
11 0.3
12 0.31
13 0.28
14 0.3
15 0.31
16 0.31
17 0.28
18 0.26
19 0.23
20 0.18
21 0.17
22 0.14
23 0.1
24 0.09
25 0.09
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.09
30 0.1
31 0.1
32 0.09
33 0.1
34 0.1
35 0.11
36 0.18
37 0.26
38 0.34
39 0.43
40 0.52
41 0.61
42 0.69
43 0.79
44 0.83
45 0.86
46 0.87
47 0.9
48 0.91
49 0.91
50 0.94
51 0.92
52 0.91
53 0.9
54 0.89
55 0.8
56 0.75
57 0.71
58 0.64
59 0.56
60 0.48
61 0.39
62 0.31
63 0.3
64 0.23
65 0.16
66 0.12
67 0.1
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.04
72 0.05
73 0.07
74 0.09
75 0.12
76 0.14
77 0.22
78 0.26
79 0.31
80 0.38
81 0.44
82 0.43
83 0.43
84 0.41
85 0.37
86 0.4
87 0.36
88 0.29
89 0.22
90 0.2
91 0.18
92 0.18
93 0.14
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.16
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.09
109 0.13
110 0.19
111 0.19
112 0.19
113 0.18
114 0.17
115 0.17
116 0.16
117 0.2
118 0.16
119 0.22
120 0.22
121 0.23
122 0.23
123 0.24
124 0.24
125 0.16
126 0.17
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.11
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.14
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.11
146 0.1
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.12
151 0.14
152 0.16
153 0.24
154 0.26
155 0.33
156 0.41
157 0.47
158 0.52
159 0.53
160 0.55
161 0.56
162 0.59
163 0.56
164 0.51
165 0.52
166 0.5
167 0.53
168 0.5
169 0.43
170 0.36
171 0.33
172 0.32
173 0.31
174 0.27
175 0.22
176 0.22
177 0.21
178 0.22
179 0.21
180 0.19
181 0.16
182 0.23
183 0.29
184 0.32
185 0.33
186 0.4
187 0.43
188 0.45
189 0.44
190 0.37
191 0.39
192 0.45
193 0.51
194 0.45
195 0.49
196 0.48
197 0.52
198 0.54
199 0.46
200 0.39
201 0.34
202 0.33
203 0.3
204 0.36
205 0.31
206 0.3
207 0.31
208 0.3
209 0.34
210 0.4
211 0.45
212 0.45
213 0.53
214 0.61
215 0.71
216 0.73
217 0.73
218 0.75
219 0.74
220 0.73
221 0.72
222 0.72
223 0.67
224 0.68
225 0.64
226 0.6
227 0.51
228 0.49
229 0.44
230 0.44
231 0.44
232 0.4
233 0.4
234 0.38