Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O74862

Protein Details
Accession O74862    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-230GTEDSAPKANKKRKGPKGPNPLSIKKRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-231PKANKKRKGPKGPNPLSIKKRSS
252-260RKKHRRKRK
Subcellular Location(s) mito 17.5, mito_nucl 13.833, nucl 9, cyto_nucl 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG spo:SPCC18.12c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRQKRAKNYRKLMHTYQLLFGFREPYQVLVDADFLKDLSQQKIDIQAALARTVQGAIKPMITQCCIRQLYSKSDELKQEIRIAKSFERRRCGHIDEALSPSECIQSVVNINGRNKHRYVVATQDPELRQALRSVPGVPLIYMKRSVVILEPASRATLLEKHNKESVQMGMSKEEKLLLSGKKRSANELAIDDQDTKESTDLAGTEDSAPKANKKRKGPKGPNPLSIKKRSSKNHTTDEPTLPVNIIGDVGERKKHRRKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.69
3 0.64
4 0.6
5 0.52
6 0.45
7 0.39
8 0.34
9 0.26
10 0.28
11 0.23
12 0.2
13 0.2
14 0.21
15 0.2
16 0.16
17 0.19
18 0.15
19 0.15
20 0.13
21 0.11
22 0.1
23 0.14
24 0.16
25 0.17
26 0.18
27 0.19
28 0.2
29 0.27
30 0.27
31 0.23
32 0.21
33 0.2
34 0.19
35 0.19
36 0.18
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.1
42 0.12
43 0.11
44 0.12
45 0.12
46 0.15
47 0.17
48 0.18
49 0.19
50 0.18
51 0.26
52 0.26
53 0.26
54 0.31
55 0.32
56 0.37
57 0.4
58 0.44
59 0.38
60 0.41
61 0.43
62 0.41
63 0.4
64 0.35
65 0.37
66 0.36
67 0.35
68 0.33
69 0.34
70 0.35
71 0.42
72 0.48
73 0.47
74 0.5
75 0.5
76 0.53
77 0.55
78 0.54
79 0.48
80 0.45
81 0.41
82 0.36
83 0.36
84 0.32
85 0.27
86 0.22
87 0.18
88 0.14
89 0.11
90 0.09
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.11
95 0.14
96 0.17
97 0.18
98 0.24
99 0.27
100 0.29
101 0.28
102 0.27
103 0.26
104 0.24
105 0.25
106 0.26
107 0.28
108 0.27
109 0.27
110 0.31
111 0.29
112 0.28
113 0.27
114 0.2
115 0.15
116 0.13
117 0.14
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.09
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.11
142 0.09
143 0.14
144 0.16
145 0.24
146 0.26
147 0.29
148 0.32
149 0.32
150 0.31
151 0.28
152 0.26
153 0.19
154 0.21
155 0.18
156 0.19
157 0.2
158 0.2
159 0.18
160 0.17
161 0.14
162 0.13
163 0.17
164 0.18
165 0.24
166 0.29
167 0.34
168 0.39
169 0.4
170 0.43
171 0.43
172 0.41
173 0.37
174 0.35
175 0.32
176 0.27
177 0.28
178 0.24
179 0.19
180 0.17
181 0.15
182 0.12
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.11
192 0.13
193 0.13
194 0.16
195 0.17
196 0.22
197 0.32
198 0.39
199 0.46
200 0.54
201 0.65
202 0.72
203 0.82
204 0.87
205 0.87
206 0.91
207 0.9
208 0.89
209 0.86
210 0.85
211 0.82
212 0.79
213 0.77
214 0.73
215 0.75
216 0.75
217 0.76
218 0.77
219 0.77
220 0.77
221 0.77
222 0.77
223 0.73
224 0.69
225 0.62
226 0.53
227 0.46
228 0.37
229 0.3
230 0.22
231 0.16
232 0.12
233 0.09
234 0.1
235 0.14
236 0.16
237 0.23
238 0.27
239 0.37
240 0.48