Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O42923

Protein Details
Accession O42923    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
287-309EKVEKAKKRQAEERRRKQQYKMFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-303WKRQLPAAEREKVEKAKKRQAEERRRK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034186  PIN4-like_RRM  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0034599  P:cellular response to oxidative stress  
GO:2000815  P:regulation of mRNA stability involved in response to oxidative stress  
KEGG spo:SPBC16A3.18  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12253  RRM_PIN4_like  
Amino Acid Sequences MPNEIFPWKIRVDESRGLAGNSGTKKSNHEALSRLQSPLNSPKLQPIGSPQASRKTSGSGSSAPLYPKWSGALSLASSRAASPAPSDSFPTFGYSQLGGLENSSKGSALFNSANSIGTPYLSSRNSNSANEASAMAFHNVSPPSGAESSSESKSFSASGKGNKADTSAEPSLDAFNSTQIKAGSTANSNSTPVEPGEDTIPTAIVVKNIPFSLEKDTLLDHFKQLGIPRPYAFNYHYDNGIFRGLAFANFYRPEEAQVVVQTLNGYEINGRRLRVEWKRQLPAAEREKVEKAKKRQAEERRRKQQYKMFEVSFTDQGLNLNDTGTLETYSRLLLFAHQCIPSREITFETTSKDGNLLNAIRIFCLYFDLDYYARPNGEVLKLVVTHPNKKNTSVSQSQPASPNLRFNMPAPLATRFLQEHSLNGTKSAPITPPPSFAVPLTNQLRSIDDKIYGNESPLQKASTLSSPFNSKNDNDASTSASKQSFGVSHF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.43
4 0.41
5 0.39
6 0.34
7 0.33
8 0.3
9 0.3
10 0.27
11 0.27
12 0.32
13 0.36
14 0.43
15 0.4
16 0.4
17 0.41
18 0.45
19 0.53
20 0.5
21 0.47
22 0.41
23 0.37
24 0.4
25 0.45
26 0.45
27 0.39
28 0.37
29 0.43
30 0.46
31 0.46
32 0.41
33 0.39
34 0.42
35 0.43
36 0.48
37 0.44
38 0.48
39 0.49
40 0.51
41 0.45
42 0.39
43 0.37
44 0.36
45 0.36
46 0.29
47 0.31
48 0.31
49 0.33
50 0.3
51 0.29
52 0.29
53 0.25
54 0.23
55 0.22
56 0.2
57 0.17
58 0.17
59 0.18
60 0.16
61 0.18
62 0.18
63 0.17
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.13
68 0.12
69 0.11
70 0.15
71 0.17
72 0.18
73 0.22
74 0.21
75 0.23
76 0.23
77 0.25
78 0.21
79 0.19
80 0.2
81 0.17
82 0.16
83 0.16
84 0.16
85 0.12
86 0.12
87 0.14
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.1
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.12
96 0.14
97 0.13
98 0.16
99 0.16
100 0.16
101 0.15
102 0.16
103 0.12
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.15
108 0.17
109 0.19
110 0.19
111 0.26
112 0.29
113 0.29
114 0.31
115 0.27
116 0.26
117 0.25
118 0.23
119 0.16
120 0.15
121 0.15
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.1
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.11
134 0.15
135 0.19
136 0.2
137 0.2
138 0.17
139 0.16
140 0.17
141 0.17
142 0.14
143 0.15
144 0.17
145 0.22
146 0.27
147 0.29
148 0.29
149 0.28
150 0.28
151 0.25
152 0.22
153 0.25
154 0.2
155 0.18
156 0.18
157 0.18
158 0.18
159 0.15
160 0.16
161 0.08
162 0.11
163 0.13
164 0.13
165 0.15
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.16
170 0.14
171 0.14
172 0.15
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.12
180 0.13
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.08
187 0.08
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.09
195 0.08
196 0.1
197 0.09
198 0.1
199 0.15
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.16
204 0.17
205 0.19
206 0.18
207 0.13
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.14
212 0.21
213 0.21
214 0.22
215 0.21
216 0.23
217 0.23
218 0.25
219 0.24
220 0.2
221 0.21
222 0.21
223 0.21
224 0.19
225 0.19
226 0.17
227 0.16
228 0.12
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.09
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.13
241 0.12
242 0.13
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.08
249 0.06
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.13
256 0.15
257 0.15
258 0.14
259 0.16
260 0.24
261 0.3
262 0.39
263 0.43
264 0.48
265 0.51
266 0.52
267 0.54
268 0.51
269 0.52
270 0.49
271 0.45
272 0.4
273 0.39
274 0.42
275 0.45
276 0.48
277 0.47
278 0.48
279 0.52
280 0.56
281 0.58
282 0.64
283 0.68
284 0.72
285 0.75
286 0.78
287 0.8
288 0.85
289 0.84
290 0.82
291 0.77
292 0.76
293 0.73
294 0.68
295 0.59
296 0.5
297 0.49
298 0.44
299 0.39
300 0.3
301 0.22
302 0.16
303 0.15
304 0.15
305 0.13
306 0.1
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.1
321 0.12
322 0.14
323 0.18
324 0.2
325 0.21
326 0.23
327 0.25
328 0.23
329 0.22
330 0.21
331 0.19
332 0.2
333 0.22
334 0.21
335 0.22
336 0.22
337 0.21
338 0.2
339 0.19
340 0.16
341 0.13
342 0.17
343 0.14
344 0.15
345 0.18
346 0.18
347 0.16
348 0.16
349 0.16
350 0.11
351 0.13
352 0.11
353 0.08
354 0.09
355 0.12
356 0.11
357 0.12
358 0.15
359 0.14
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.14
364 0.15
365 0.15
366 0.14
367 0.14
368 0.15
369 0.16
370 0.23
371 0.25
372 0.33
373 0.37
374 0.46
375 0.45
376 0.48
377 0.53
378 0.51
379 0.55
380 0.52
381 0.5
382 0.5
383 0.51
384 0.51
385 0.5
386 0.48
387 0.46
388 0.41
389 0.44
390 0.37
391 0.37
392 0.35
393 0.32
394 0.36
395 0.31
396 0.33
397 0.28
398 0.29
399 0.29
400 0.29
401 0.31
402 0.23
403 0.24
404 0.27
405 0.25
406 0.24
407 0.28
408 0.32
409 0.29
410 0.29
411 0.28
412 0.22
413 0.24
414 0.24
415 0.2
416 0.2
417 0.26
418 0.26
419 0.28
420 0.3
421 0.31
422 0.29
423 0.28
424 0.29
425 0.25
426 0.33
427 0.34
428 0.33
429 0.32
430 0.31
431 0.34
432 0.32
433 0.34
434 0.28
435 0.27
436 0.27
437 0.28
438 0.32
439 0.3
440 0.27
441 0.3
442 0.3
443 0.3
444 0.3
445 0.29
446 0.24
447 0.25
448 0.26
449 0.28
450 0.3
451 0.28
452 0.3
453 0.36
454 0.39
455 0.41
456 0.43
457 0.37
458 0.4
459 0.42
460 0.41
461 0.37
462 0.35
463 0.36
464 0.35
465 0.36
466 0.34
467 0.29
468 0.28
469 0.25
470 0.28