FuNGI

O13620

Protein Details

Accession

O13620

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
118-137	LEEEKAKKKKDANLKRKFLD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
121-134	EKAKKKKDANLKRK

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034482 Mrd1_RRM3 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0016607 C:nuclear speck GO:0005730 C:nucleolus GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0006364 P:rRNA processing GO:0034462 P:small-subunit processome assembly
KEGG	spo:SPBP22H7.02c -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12565 RRM1_MRD1 cd12566 RRM2_MRD1 cd12568 RRM3_MRD1 cd12319 RRM4_MRD1 cd12570 RRM5_MRD1

Amino Acid Sequences

MSRIIIKNIPRYYDKEKLSTYLKSLPQLDAEITDVSVAKTKEGVSRRFAFIGFKNEEDADKAIRYLNKSYVETSRIEVHRALDYRSANEKLRPYSKYASKNIELKLQKKEKEEELRNLEEEKAKKKKDANLKRKFLDTLDPKAREFLKLSSSISNSRSWENEEVFDTEITNPVIPADEDDDEYQDLPAAKRHEGDSIKSTEHDSTLDSGVVIDGREKSSSELHEEESEQAAEGDTAKNSGTDAQAPLSDDEWLRLHRTRIKEKQPEEEVSVVGDELKSFDKENNDEHLERVTNDKIADASMLQKAENNVSEQERNIQLISETKRLFLRNLTYSCAEDDLKSLFGPFGQLEQVHMPIDKKTNNPKGFAYIDFHDADDAVRAYLELDAKPFQGRLLHVLPAKARSSILLDDYALSKLPLKKQRELKRKNTAASSTFSWNSLYMNADAVVTSLASRLGVKKTDILDPTSSDSAVKQALTETHVIQETKNFFEEHGVDLDAFKNAARSDNVLLVKNFPYGTSAEELTSLFSPFGELGRILIPPAGTIAIIEFLNAPDCRQAFSKLAYTRIKSSILYLEKAPRDVFTTSFKQSGKPELAQKVNAVEATTSEKVGTEDIESLDTATIYVKNLNFSTKQEEFQKVFKPLEGYLSAVIRAKPDPKRPGKYLSMGFGFVEFKDKASAVAAMHAMNGFVLDGHKLEIKLSHQGVDAAAEVRKQDSSKPKGTKILIKNLPFEATKKDVQSLLGAYGQLRSVRVPKKFDRSARGFAFAEFVTAREAANAMRALKNTHLLGRHLVLQYASNATMDDMQHAIEKMAKEANAEAAAPSITGKRLIETD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.54
3	0.53
4	0.53
5	0.54
6	0.51
7	0.48
8	0.48
9	0.47
10	0.47
11	0.47
12	0.43
13	0.4
14	0.38
15	0.34
16	0.27
17	0.25
18	0.19
19	0.16
20	0.15
21	0.13
22	0.12
23	0.16
24	0.15
25	0.13
26	0.15
27	0.17
28	0.24
29	0.31
30	0.35
31	0.37
32	0.42
33	0.46
34	0.45
35	0.44
36	0.43
37	0.4
38	0.44
39	0.41
40	0.36
41	0.35
42	0.35
43	0.35
44	0.32
45	0.29
46	0.23
47	0.2
48	0.2
49	0.22
50	0.25
51	0.28
52	0.29
53	0.34
54	0.36
55	0.37
56	0.4
57	0.41
58	0.4
59	0.38
60	0.36
61	0.38
62	0.34
63	0.35
64	0.33
65	0.3
66	0.34
67	0.34
68	0.34
69	0.32
70	0.32
71	0.34
72	0.38
73	0.41
74	0.37
75	0.41
76	0.44
77	0.45
78	0.5
79	0.48
80	0.49
81	0.53
82	0.59
83	0.62
84	0.63
85	0.63
86	0.63
87	0.67
88	0.63
89	0.63
90	0.61
91	0.58
92	0.61
93	0.62
94	0.61
95	0.6
96	0.63
97	0.63
98	0.67
99	0.69
100	0.68
101	0.66
102	0.65
103	0.61
104	0.57
105	0.51
106	0.47
107	0.44
108	0.44
109	0.46
110	0.45
111	0.5
112	0.55
113	0.6
114	0.65
115	0.71
116	0.73
117	0.74
118	0.8
119	0.77
120	0.75
121	0.68
122	0.6
123	0.58
124	0.54
125	0.53
126	0.53
127	0.52
128	0.48
129	0.51
130	0.49
131	0.42
132	0.38
133	0.32
134	0.28
135	0.28
136	0.3
137	0.3
138	0.32
139	0.34
140	0.34
141	0.35
142	0.31
143	0.31
144	0.31
145	0.31
146	0.33
147	0.3
148	0.29
149	0.27
150	0.27
151	0.26
152	0.24
153	0.2
154	0.15
155	0.16
156	0.15
157	0.12
158	0.11
159	0.09
160	0.1
161	0.09
162	0.1
163	0.11
164	0.11
165	0.13
166	0.13
167	0.15
168	0.14
169	0.15
170	0.13
171	0.12
172	0.12
173	0.11
174	0.15
175	0.17
176	0.17
177	0.19
178	0.2
179	0.25
180	0.26
181	0.29
182	0.3
183	0.3
184	0.3
185	0.29
186	0.31
187	0.24
188	0.23
189	0.2
190	0.16
191	0.15
192	0.15
193	0.14
194	0.12
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.09
202	0.1
203	0.11
204	0.12
205	0.16
206	0.17
207	0.2
208	0.21
209	0.21
210	0.22
211	0.23
212	0.23
213	0.2
214	0.19
215	0.14
216	0.12
217	0.1
218	0.09
219	0.09
220	0.08
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.09
227	0.09
228	0.1
229	0.11
230	0.11
231	0.12
232	0.14
233	0.14
234	0.13
235	0.13
236	0.11
237	0.12
238	0.13
239	0.13
240	0.16
241	0.17
242	0.21
243	0.26
244	0.33
245	0.42
246	0.49
247	0.59
248	0.64
249	0.65
250	0.7
251	0.69
252	0.65
253	0.58
254	0.5
255	0.39
256	0.3
257	0.27
258	0.18
259	0.12
260	0.09
261	0.06
262	0.06
263	0.07
264	0.08
265	0.08
266	0.11
267	0.15
268	0.17
269	0.2
270	0.24
271	0.27
272	0.26
273	0.26
274	0.27
275	0.23
276	0.22
277	0.23
278	0.18
279	0.16
280	0.15
281	0.15
282	0.12
283	0.12
284	0.12
285	0.08
286	0.1
287	0.1
288	0.11
289	0.1
290	0.12
291	0.12
292	0.14
293	0.15
294	0.14
295	0.14
296	0.16
297	0.17
298	0.16
299	0.19
300	0.17
301	0.17
302	0.16
303	0.13
304	0.11
305	0.16
306	0.2
307	0.22
308	0.21
309	0.22
310	0.25
311	0.26
312	0.26
313	0.24
314	0.26
315	0.26
316	0.27
317	0.28
318	0.27
319	0.27
320	0.26
321	0.25
322	0.2
323	0.14
324	0.14
325	0.12
326	0.11
327	0.1
328	0.1
329	0.07
330	0.07
331	0.08
332	0.06
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.09
338	0.1
339	0.09
340	0.1
341	0.1
342	0.11
343	0.15
344	0.16
345	0.2
346	0.29
347	0.39
348	0.4
349	0.42
350	0.41
351	0.41
352	0.41
353	0.37
354	0.3
355	0.22
356	0.23
357	0.21
358	0.2
359	0.16
360	0.14
361	0.12
362	0.1
363	0.08
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.06
369	0.07
370	0.06
371	0.08
372	0.09
373	0.09
374	0.1
375	0.09
376	0.09
377	0.09
378	0.1
379	0.13
380	0.14
381	0.17
382	0.17
383	0.19
384	0.19
385	0.2
386	0.2
387	0.16
388	0.14
389	0.12
390	0.13
391	0.12
392	0.12
393	0.1
394	0.09
395	0.09
396	0.1
397	0.1
398	0.08
399	0.07
400	0.09
401	0.11
402	0.18
403	0.26
404	0.29
405	0.36
406	0.45
407	0.55
408	0.63
409	0.69
410	0.72
411	0.74
412	0.75
413	0.72
414	0.66
415	0.59
416	0.5
417	0.45
418	0.37
419	0.3
420	0.26
421	0.23
422	0.2
423	0.17
424	0.15
425	0.13
426	0.12
427	0.08
428	0.08
429	0.08
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.05
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.03
438	0.04
439	0.04
440	0.06
441	0.08
442	0.09
443	0.1
444	0.13
445	0.15
446	0.19
447	0.2
448	0.2
449	0.2
450	0.2
451	0.22
452	0.19
453	0.17
454	0.13
455	0.12
456	0.11
457	0.11
458	0.1
459	0.07
460	0.07
461	0.08
462	0.1
463	0.11
464	0.1
465	0.11
466	0.13
467	0.13
468	0.12
469	0.16
470	0.16
471	0.16
472	0.17
473	0.15
474	0.13
475	0.16
476	0.17
477	0.13
478	0.12
479	0.11
480	0.1
481	0.11
482	0.11
483	0.09
484	0.08
485	0.06
486	0.07
487	0.07
488	0.09
489	0.09
490	0.11
491	0.12
492	0.17
493	0.19
494	0.19
495	0.19
496	0.2
497	0.2
498	0.19
499	0.18
500	0.13
501	0.12
502	0.11
503	0.12
504	0.12
505	0.11
506	0.1
507	0.11
508	0.11
509	0.11
510	0.11
511	0.09
512	0.07
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.06
518	0.05
519	0.06
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.06
526	0.07
527	0.06
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.09
537	0.09
538	0.09
539	0.11
540	0.11
541	0.13
542	0.14
543	0.17
544	0.16
545	0.18
546	0.25
547	0.24
548	0.31
549	0.34
550	0.35
551	0.36
552	0.36
553	0.36
554	0.28
555	0.29
556	0.29
557	0.27
558	0.27
559	0.25
560	0.3
561	0.29
562	0.31
563	0.29
564	0.22
565	0.23
566	0.22
567	0.22
568	0.21
569	0.24
570	0.25
571	0.3
572	0.29
573	0.3
574	0.31
575	0.36
576	0.35
577	0.34
578	0.38
579	0.4
580	0.43
581	0.4
582	0.39
583	0.34
584	0.3
585	0.27
586	0.2
587	0.13
588	0.11
589	0.16
590	0.15
591	0.14
592	0.13
593	0.13
594	0.13
595	0.13
596	0.13
597	0.08
598	0.09
599	0.09
600	0.1
601	0.09
602	0.1
603	0.09
604	0.08
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.11
610	0.11
611	0.14
612	0.15
613	0.18
614	0.19
615	0.21
616	0.28
617	0.26
618	0.3
619	0.32
620	0.38
621	0.37
622	0.4
623	0.44
624	0.41
625	0.4
626	0.38
627	0.35
628	0.29
629	0.31
630	0.27
631	0.22
632	0.19
633	0.19
634	0.19
635	0.18
636	0.18
637	0.16
638	0.18
639	0.24
640	0.29
641	0.38
642	0.47
643	0.54
644	0.61
645	0.63
646	0.68
647	0.66
648	0.66
649	0.61
650	0.56
651	0.48
652	0.41
653	0.37
654	0.31
655	0.26
656	0.19
657	0.21
658	0.16
659	0.14
660	0.15
661	0.15
662	0.14
663	0.14
664	0.17
665	0.11
666	0.14
667	0.14
668	0.12
669	0.13
670	0.12
671	0.11
672	0.08
673	0.08
674	0.05
675	0.04
676	0.05
677	0.05
678	0.06
679	0.07
680	0.1
681	0.1
682	0.11
683	0.13
684	0.15
685	0.22
686	0.23
687	0.23
688	0.21
689	0.22
690	0.22
691	0.2
692	0.18
693	0.13
694	0.12
695	0.12
696	0.12
697	0.12
698	0.14
699	0.14
700	0.21
701	0.29
702	0.36
703	0.45
704	0.52
705	0.55
706	0.61
707	0.66
708	0.68
709	0.65
710	0.68
711	0.67
712	0.64
713	0.63
714	0.56
715	0.55
716	0.46
717	0.41
718	0.36
719	0.33
720	0.34
721	0.32
722	0.33
723	0.31
724	0.3
725	0.31
726	0.26
727	0.23
728	0.2
729	0.19
730	0.16
731	0.16
732	0.17
733	0.16
734	0.15
735	0.16
736	0.23
737	0.3
738	0.36
739	0.43
740	0.48
741	0.57
742	0.65
743	0.7
744	0.71
745	0.71
746	0.74
747	0.7
748	0.67
749	0.58
750	0.49
751	0.45
752	0.35
753	0.3
754	0.21
755	0.18
756	0.15
757	0.15
758	0.14
759	0.11
760	0.12
761	0.09
762	0.14
763	0.16
764	0.16
765	0.19
766	0.21
767	0.23
768	0.25
769	0.31
770	0.28
771	0.31
772	0.31
773	0.31
774	0.34
775	0.33
776	0.36
777	0.32
778	0.31
779	0.27
780	0.25
781	0.25
782	0.24
783	0.22
784	0.15
785	0.15
786	0.15
787	0.18
788	0.16
789	0.16
790	0.13
791	0.13
792	0.16
793	0.16
794	0.16
795	0.16
796	0.16
797	0.17
798	0.21
799	0.2
800	0.2
801	0.2
802	0.24
803	0.21
804	0.2
805	0.18
806	0.15
807	0.14
808	0.13
809	0.13
810	0.11
811	0.11
812	0.14
813	0.15

O13620

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer