Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O42914

Protein Details
Accession O42914    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-84STTSRKRDPNQPTPRERTVNKKADQPRRRRQAPQGNEHydrophilic
242-261TFTARPARGGRPNRAPRRGPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-78RTVNKKADQPRRRRQ
112-118RNARARR
220-234ASQKKSAAKESKPKK
247-259PARGGRPNRAPRR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0051880  F:G-quadruplex DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0043555  P:regulation of translation in response to stress  
GO:0031929  P:TOR signaling  
KEGG spo:SPBC16A3.08c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVASKNLFDLLGEETPAATTTEKKTAASRDKKRSDSPPVPRELVAQSTTSRKRDPNQPTPRERTVNKKADQPRRRRQAPQGNEAFAREGKEARANNAAHPVDATGAPSNRRNARARRGREFDRHSQTGRVDTKKATERGWGDLVNSAANPDVAENEGNTPSGAQTPAAEEENVKTLDEYLSERKSAAKPVGRTVEKLENATKVEKSAPEELFASLKKSASQKKSAAKESKPKKVLLDIEQTFTARPARGGRPNRAPRRGPSETASKTQQAPPTLSETDFPALA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.13
4 0.14
5 0.13
6 0.09
7 0.12
8 0.16
9 0.23
10 0.24
11 0.25
12 0.29
13 0.37
14 0.47
15 0.54
16 0.6
17 0.64
18 0.72
19 0.77
20 0.79
21 0.78
22 0.78
23 0.77
24 0.78
25 0.75
26 0.72
27 0.69
28 0.62
29 0.57
30 0.49
31 0.43
32 0.34
33 0.28
34 0.24
35 0.31
36 0.37
37 0.37
38 0.39
39 0.4
40 0.45
41 0.53
42 0.6
43 0.62
44 0.67
45 0.73
46 0.77
47 0.79
48 0.81
49 0.78
50 0.71
51 0.71
52 0.7
53 0.7
54 0.63
55 0.65
56 0.68
57 0.72
58 0.78
59 0.78
60 0.78
61 0.79
62 0.83
63 0.81
64 0.82
65 0.82
66 0.79
67 0.78
68 0.73
69 0.65
70 0.6
71 0.53
72 0.45
73 0.35
74 0.3
75 0.21
76 0.16
77 0.15
78 0.21
79 0.2
80 0.21
81 0.27
82 0.25
83 0.25
84 0.33
85 0.31
86 0.25
87 0.24
88 0.21
89 0.16
90 0.15
91 0.15
92 0.1
93 0.11
94 0.14
95 0.16
96 0.22
97 0.24
98 0.3
99 0.35
100 0.39
101 0.48
102 0.55
103 0.59
104 0.62
105 0.65
106 0.65
107 0.67
108 0.67
109 0.66
110 0.64
111 0.6
112 0.53
113 0.5
114 0.45
115 0.44
116 0.43
117 0.36
118 0.31
119 0.28
120 0.32
121 0.35
122 0.36
123 0.29
124 0.29
125 0.27
126 0.29
127 0.3
128 0.25
129 0.19
130 0.19
131 0.18
132 0.13
133 0.11
134 0.08
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.12
167 0.14
168 0.15
169 0.15
170 0.16
171 0.19
172 0.2
173 0.23
174 0.27
175 0.27
176 0.28
177 0.34
178 0.42
179 0.4
180 0.4
181 0.4
182 0.42
183 0.38
184 0.39
185 0.35
186 0.29
187 0.3
188 0.31
189 0.27
190 0.2
191 0.21
192 0.2
193 0.22
194 0.26
195 0.25
196 0.24
197 0.24
198 0.24
199 0.24
200 0.22
201 0.21
202 0.16
203 0.16
204 0.18
205 0.24
206 0.32
207 0.36
208 0.43
209 0.47
210 0.54
211 0.62
212 0.68
213 0.69
214 0.68
215 0.72
216 0.74
217 0.77
218 0.73
219 0.68
220 0.61
221 0.61
222 0.59
223 0.55
224 0.56
225 0.47
226 0.46
227 0.45
228 0.42
229 0.35
230 0.3
231 0.27
232 0.17
233 0.19
234 0.21
235 0.28
236 0.37
237 0.45
238 0.52
239 0.6
240 0.7
241 0.77
242 0.8
243 0.78
244 0.75
245 0.77
246 0.75
247 0.68
248 0.62
249 0.62
250 0.58
251 0.58
252 0.56
253 0.5
254 0.48
255 0.5
256 0.52
257 0.45
258 0.43
259 0.4
260 0.42
261 0.4
262 0.37
263 0.32
264 0.3