FuNGI

O59801

Protein Details

Accession

O59801

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
48-71	KPSPALSKDWIRKLQKKWDREITY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
499-513	KDNKNSARGRGAARG

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, E.R. 3, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005730 C:nucleolus GO:0055087 C:Ski complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0030968 P:endoplasmic reticulum unfolded protein response GO:0070478 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay GO:0070481 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, non-stop decay
KEGG	spo:SPCC550.03c -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MSSKLVDAINEVAVSNKDKIELDGIKDDSFDGHLSITEATYDVDTFLKPSPALSKDWIRKLQKKWDREITYKGLYEYPETLARTQIRFQRHGLEGKIMGYKEVPELIEDLNSKNSSSFLRKPSSKNEFVRGSTSNIPFLADDSDVDAIAGEPSVKMALYGEDGLLQVPPGFSRGLSMTATSTTDNLNDEFDPEKWDTKKVKSSNRNFVTIHELNEHLKNVNSKHSEIDDLLPDKRSIVSLPPSTLNLHKQPDYAHVVDSSAPIENFQQLVPEMALDFPFELDNFQKEAIYHLEMGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAQKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFKHKFEDVGILTGDVQVNPEGSCLLMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPPHVTLILLSATVPNTKEFASWVGRTKKKNIYVISTLKRPVPLEHYLWVKQNMFKIVDQHGRFLMDGYKSANDALKKPDKPVIAKDNKNSARGRGAARGRGVQTNMMRGRGSAKSVERRDANTWVHLIGHLHKQNLLPVIVFVFSKKRCEEYVDTLTNRDLNNHQEKSEVHVVIEKAVARLKKEDRLLPQIGRMREMLSRGLAVHHGGLLPIIKEIVEILFQRGLVKVLFATETFAMGVNMPAKSVVFSGTQKHDGRNFRDLLPGEYTQCSGRAGRRGLDVTGTVIILSRSELPDTASLRHMIMGPSSKLISQFRLTYNMILNLLRVETLRIEDMIKRSFSENVNQTLVPQHEEKIKSFEEKLSALKKEMSDVDLKEIKSCLLSSESFKEYTKKMHFRAITTANGKRIFKDGRVIVFQQLDFTRTVGVLLGTSIRTNASDCTLEVAYLNPQNNLKRPSDLLAFADAFNDVYDNAIFDESNQFKYGLINLSGIERVCNTILRIDSGGIRDRRGGAFRKLSEQFASIKKFSDLLFEEVNWSKVRDFEFCEAFEKRNFLQNKLSGNPIISTPNFLTHFALAYQEYELESNIDNLSSYISDQNLELLPDYEQRIKVLQELGYIDAERTVLLKGRVACEINSTSELVLTELILENSLADFSCEETIALLSAFVFDEKTEVEPTISPHLQKGKEMILSVAEKVNQIQEHYQVLYFNEGNDFESQPRFGLMEVCYEWARGMSFNRITDLTDVLEGSIVRTIIRLDEVLRECRGAARVVGDSSMYTKMEECQNLIRRNIVFCPSLYM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.19
3	0.17
4	0.18
5	0.18
6	0.2
7	0.26
8	0.27
9	0.28
10	0.33
11	0.34
12	0.32
13	0.32
14	0.31
15	0.24
16	0.22
17	0.18
18	0.12
19	0.1
20	0.1
21	0.12
22	0.12
23	0.11
24	0.09
25	0.09
26	0.09
27	0.1
28	0.1
29	0.09
30	0.1
31	0.1
32	0.12
33	0.14
34	0.16
35	0.15
36	0.16
37	0.22
38	0.24
39	0.28
40	0.32
41	0.39
42	0.45
43	0.55
44	0.62
45	0.65
46	0.71
47	0.76
48	0.81
49	0.8
50	0.79
51	0.8
52	0.81
53	0.79
54	0.77
55	0.76
56	0.72
57	0.69
58	0.63
59	0.56
60	0.48
61	0.42
62	0.39
63	0.33
64	0.29
65	0.28
66	0.28
67	0.27
68	0.31
69	0.34
70	0.33
71	0.37
72	0.4
73	0.43
74	0.44
75	0.46
76	0.47
77	0.48
78	0.51
79	0.47
80	0.47
81	0.4
82	0.39
83	0.42
84	0.33
85	0.29
86	0.24
87	0.23
88	0.19
89	0.2
90	0.17
91	0.13
92	0.15
93	0.15
94	0.18
95	0.18
96	0.18
97	0.21
98	0.22
99	0.21
100	0.19
101	0.21
102	0.22
103	0.28
104	0.34
105	0.36
106	0.44
107	0.51
108	0.56
109	0.64
110	0.69
111	0.7
112	0.68
113	0.69
114	0.66
115	0.62
116	0.61
117	0.53
118	0.49
119	0.48
120	0.44
121	0.39
122	0.33
123	0.31
124	0.26
125	0.25
126	0.22
127	0.14
128	0.13
129	0.12
130	0.13
131	0.11
132	0.11
133	0.1
134	0.08
135	0.07
136	0.07
137	0.05
138	0.04
139	0.05
140	0.06
141	0.05
142	0.05
143	0.05
144	0.06
145	0.08
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.1
150	0.1
151	0.09
152	0.09
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.08
158	0.07
159	0.1
160	0.11
161	0.13
162	0.13
163	0.14
164	0.14
165	0.15
166	0.16
167	0.15
168	0.14
169	0.12
170	0.13
171	0.14
172	0.13
173	0.14
174	0.13
175	0.15
176	0.16
177	0.15
178	0.19
179	0.19
180	0.25
181	0.24
182	0.32
183	0.35
184	0.4
185	0.5
186	0.53
187	0.62
188	0.67
189	0.75
190	0.78
191	0.77
192	0.75
193	0.66
194	0.6
195	0.59
196	0.5
197	0.43
198	0.35
199	0.33
200	0.3
201	0.32
202	0.31
203	0.22
204	0.23
205	0.25
206	0.25
207	0.32
208	0.32
209	0.31
210	0.33
211	0.33
212	0.33
213	0.3
214	0.31
215	0.28
216	0.27
217	0.27
218	0.26
219	0.24
220	0.22
221	0.21
222	0.19
223	0.14
224	0.17
225	0.22
226	0.23
227	0.26
228	0.27
229	0.28
230	0.29
231	0.32
232	0.33
233	0.32
234	0.34
235	0.33
236	0.33
237	0.33
238	0.36
239	0.39
240	0.33
241	0.28
242	0.24
243	0.23
244	0.23
245	0.22
246	0.17
247	0.12
248	0.11
249	0.11
250	0.11
251	0.12
252	0.12
253	0.11
254	0.11
255	0.1
256	0.11
257	0.1
258	0.09
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.07
263	0.07
264	0.06
265	0.07
266	0.06
267	0.08
268	0.09
269	0.11
270	0.11
271	0.12
272	0.12
273	0.12
274	0.14
275	0.16
276	0.16
277	0.15
278	0.13
279	0.13
280	0.13
281	0.13
282	0.1
283	0.07
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.08
304	0.07
305	0.07
306	0.09
307	0.1
308	0.11
309	0.12
310	0.12
311	0.12
312	0.13
313	0.17
314	0.23
315	0.23
316	0.25
317	0.26
318	0.29
319	0.29
320	0.33
321	0.38
322	0.39
323	0.47
324	0.48
325	0.52
326	0.55
327	0.56
328	0.63
329	0.56
330	0.53
331	0.51
332	0.53
333	0.46
334	0.42
335	0.46
336	0.35
337	0.33
338	0.28
339	0.2
340	0.16
341	0.16
342	0.15
343	0.09
344	0.09
345	0.07
346	0.08
347	0.07
348	0.07
349	0.06
350	0.05
351	0.06
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.07
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.09
363	0.11
364	0.1
365	0.09
366	0.1
367	0.11
368	0.11
369	0.11
370	0.11
371	0.09
372	0.1
373	0.1
374	0.08
375	0.07
376	0.08
377	0.09
378	0.07
379	0.06
380	0.09
381	0.08
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.07
386	0.09
387	0.09
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.05
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.04
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.06
413	0.08
414	0.09
415	0.08
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.12
421	0.15
422	0.17
423	0.24
424	0.32
425	0.38
426	0.41
427	0.47
428	0.51
429	0.54
430	0.58
431	0.53
432	0.5
433	0.52
434	0.57
435	0.54
436	0.5
437	0.46
438	0.4
439	0.4
440	0.35
441	0.29
442	0.27
443	0.27
444	0.25
445	0.27
446	0.3
447	0.29
448	0.32
449	0.33
450	0.29
451	0.27
452	0.28
453	0.28
454	0.25
455	0.24
456	0.25
457	0.27
458	0.33
459	0.31
460	0.3
461	0.27
462	0.26
463	0.25
464	0.22
465	0.19
466	0.12
467	0.12
468	0.13
469	0.12
470	0.12
471	0.13
472	0.15
473	0.13
474	0.14
475	0.21
476	0.27
477	0.28
478	0.29
479	0.34
480	0.34
481	0.36
482	0.4
483	0.44
484	0.45
485	0.48
486	0.5
487	0.55
488	0.55
489	0.58
490	0.52
491	0.44
492	0.39
493	0.38
494	0.36
495	0.33
496	0.34
497	0.32
498	0.32
499	0.34
500	0.31
501	0.3
502	0.29
503	0.26
504	0.24
505	0.28
506	0.27
507	0.25
508	0.24
509	0.21
510	0.24
511	0.2
512	0.21
513	0.17
514	0.21
515	0.28
516	0.3
517	0.35
518	0.33
519	0.35
520	0.36
521	0.39
522	0.35
523	0.28
524	0.27
525	0.22
526	0.2
527	0.17
528	0.16
529	0.12
530	0.18
531	0.18
532	0.18
533	0.2
534	0.2
535	0.21
536	0.22
537	0.2
538	0.12
539	0.1
540	0.11
541	0.09
542	0.09
543	0.07
544	0.11
545	0.12
546	0.16
547	0.16
548	0.18
549	0.18
550	0.24
551	0.27
552	0.28
553	0.35
554	0.35
555	0.35
556	0.34
557	0.33
558	0.31
559	0.27
560	0.22
561	0.16
562	0.19
563	0.26
564	0.26
565	0.26
566	0.25
567	0.25
568	0.29
569	0.33
570	0.27
571	0.19
572	0.21
573	0.21
574	0.19
575	0.2
576	0.15
577	0.1
578	0.12
579	0.13
580	0.11
581	0.16
582	0.18
583	0.22
584	0.24
585	0.28
586	0.29
587	0.35
588	0.37
589	0.33
590	0.36
591	0.36
592	0.33
593	0.31
594	0.27
595	0.22
596	0.2
597	0.21
598	0.16
599	0.11
600	0.11
601	0.1
602	0.1
603	0.09
604	0.08
605	0.07
606	0.06
607	0.06
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.05
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.03
616	0.04
617	0.04
618	0.05
619	0.05
620	0.06
621	0.07
622	0.07
623	0.08
624	0.08
625	0.08
626	0.07
627	0.07
628	0.05
629	0.05
630	0.06
631	0.05
632	0.07
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.07
640	0.07
641	0.07
642	0.06
643	0.06
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.07
648	0.08
649	0.09
650	0.12
651	0.15
652	0.22
653	0.23
654	0.25
655	0.3
656	0.34
657	0.37
658	0.4
659	0.39
660	0.33
661	0.37
662	0.35
663	0.31
664	0.29
665	0.25
666	0.21
667	0.2
668	0.2
669	0.15
670	0.15
671	0.13
672	0.11
673	0.14
674	0.18
675	0.19
676	0.19
677	0.22
678	0.22
679	0.21
680	0.2
681	0.17
682	0.12
683	0.12
684	0.1
685	0.07
686	0.06
687	0.06
688	0.05
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.07
693	0.07
694	0.08
695	0.11
696	0.13
697	0.14
698	0.14
699	0.14
700	0.14
701	0.14
702	0.14
703	0.11
704	0.11
705	0.12
706	0.11
707	0.12
708	0.12
709	0.12
710	0.14
711	0.15
712	0.16
713	0.15
714	0.18
715	0.18
716	0.23
717	0.23
718	0.22
719	0.22
720	0.21
721	0.2
722	0.17
723	0.15
724	0.11
725	0.1
726	0.09
727	0.07
728	0.07
729	0.06
730	0.07
731	0.07
732	0.07
733	0.08
734	0.11
735	0.14
736	0.16
737	0.16
738	0.16
739	0.17
740	0.2
741	0.2
742	0.24
743	0.25
744	0.26
745	0.27
746	0.26
747	0.25
748	0.25
749	0.25
750	0.21
751	0.17
752	0.16
753	0.2
754	0.22
755	0.23
756	0.24
757	0.24
758	0.25
759	0.25
760	0.25
761	0.22
762	0.22
763	0.25
764	0.26
765	0.26
766	0.24
767	0.26
768	0.24
769	0.24
770	0.23
771	0.2
772	0.19
773	0.18
774	0.23
775	0.24
776	0.24
777	0.23
778	0.22
779	0.2
780	0.17
781	0.16
782	0.12
783	0.11
784	0.12
785	0.14
786	0.18
787	0.2
788	0.21
789	0.22
790	0.23
791	0.22
792	0.29
793	0.35
794	0.37
795	0.38
796	0.44
797	0.46
798	0.45
799	0.5
800	0.46
801	0.44
802	0.42
803	0.43
804	0.41
805	0.44
806	0.42
807	0.36
808	0.38
809	0.34
810	0.3
811	0.34
812	0.31
813	0.3
814	0.33
815	0.33
816	0.3
817	0.3
818	0.28
819	0.25
820	0.22
821	0.2
822	0.17
823	0.15
824	0.13
825	0.1
826	0.11
827	0.08
828	0.07
829	0.05
830	0.05
831	0.06
832	0.06
833	0.06
834	0.07
835	0.07
836	0.07
837	0.08
838	0.08
839	0.1
840	0.1
841	0.1
842	0.13
843	0.13
844	0.12
845	0.12
846	0.12
847	0.13
848	0.16
849	0.17
850	0.15
851	0.19
852	0.23
853	0.28
854	0.32
855	0.3
856	0.29
857	0.3
858	0.31
859	0.3
860	0.28
861	0.24
862	0.23
863	0.22
864	0.19
865	0.18
866	0.15
867	0.12
868	0.1
869	0.09
870	0.05
871	0.05
872	0.05
873	0.05
874	0.06
875	0.06
876	0.06
877	0.07
878	0.14
879	0.15
880	0.17
881	0.18
882	0.17
883	0.17
884	0.18
885	0.2
886	0.15
887	0.15
888	0.14
889	0.13
890	0.14
891	0.15
892	0.15
893	0.13
894	0.1
895	0.11
896	0.11
897	0.12
898	0.11
899	0.13
900	0.14
901	0.15
902	0.15
903	0.14
904	0.16
905	0.17
906	0.24
907	0.22
908	0.23
909	0.23
910	0.24
911	0.26
912	0.29
913	0.31
914	0.31
915	0.38
916	0.38
917	0.44
918	0.44
919	0.44
920	0.4
921	0.37
922	0.35
923	0.33
924	0.37
925	0.3
926	0.3
927	0.28
928	0.28
929	0.26
930	0.28
931	0.24
932	0.22
933	0.23
934	0.21
935	0.25
936	0.25
937	0.27
938	0.21
939	0.19
940	0.16
941	0.18
942	0.2
943	0.18
944	0.22
945	0.25
946	0.27
947	0.27
948	0.31
949	0.3
950	0.3
951	0.29
952	0.29
953	0.25
954	0.31
955	0.32
956	0.31
957	0.37
958	0.39
959	0.42
960	0.4
961	0.43
962	0.35
963	0.34
964	0.32
965	0.25
966	0.25
967	0.2
968	0.22
969	0.19
970	0.24
971	0.24
972	0.25
973	0.25
974	0.21
975	0.21
976	0.17
977	0.19
978	0.13
979	0.13
980	0.12
981	0.11
982	0.11
983	0.1
984	0.1
985	0.09
986	0.09
987	0.1
988	0.09
989	0.09
990	0.08
991	0.08
992	0.09
993	0.08
994	0.09
995	0.1
996	0.1
997	0.11
998	0.11
999	0.13
1000	0.12
1001	0.12
1002	0.12
1003	0.1
1004	0.11
1005	0.14
1006	0.17
1007	0.2
1008	0.19
1009	0.2
1010	0.22
1011	0.22
1012	0.23
1013	0.24
1014	0.21
1015	0.2
1016	0.21
1017	0.21
1018	0.21
1019	0.2
1020	0.17
1021	0.14
1022	0.13
1023	0.1
1024	0.09
1025	0.09
1026	0.11
1027	0.11
1028	0.15
1029	0.17
1030	0.19
1031	0.24
1032	0.24
1033	0.24
1034	0.25
1035	0.27
1036	0.25
1037	0.25
1038	0.23
1039	0.19
1040	0.18
1041	0.18
1042	0.13
1043	0.11
1044	0.08
1045	0.08
1046	0.08
1047	0.08
1048	0.08
1049	0.07
1050	0.07
1051	0.07
1052	0.07
1053	0.06
1054	0.06
1055	0.06
1056	0.07
1057	0.08
1058	0.08
1059	0.08
1060	0.08
1061	0.09
1062	0.08
1063	0.08
1064	0.06
1065	0.05
1066	0.06
1067	0.06
1068	0.06
1069	0.06
1070	0.05
1071	0.07
1072	0.08
1073	0.1
1074	0.11
1075	0.11
1076	0.13
1077	0.14
1078	0.17
1079	0.24
1080	0.26
1081	0.24
1082	0.28
1083	0.35
1084	0.35
1085	0.36
1086	0.37
1087	0.34
1088	0.34
1089	0.34
1090	0.3
1091	0.27
1092	0.27
1093	0.26
1094	0.25
1095	0.21
1096	0.19
1097	0.2
1098	0.24
1099	0.2
1100	0.22
1101	0.22
1102	0.23
1103	0.25
1104	0.26
1105	0.26
1106	0.22
1107	0.22
1108	0.24
1109	0.22
1110	0.19
1111	0.19
1112	0.18
1113	0.19
1114	0.2
1115	0.21
1116	0.18
1117	0.2
1118	0.2
1119	0.18
1120	0.19
1121	0.17
1122	0.15
1123	0.17
1124	0.15
1125	0.18
1126	0.19
1127	0.21
1128	0.21
1129	0.21
1130	0.2
1131	0.17
1132	0.17
1133	0.14
1134	0.16
1135	0.22
1136	0.26
1137	0.27
1138	0.3
1139	0.29
1140	0.3
1141	0.29
1142	0.28
1143	0.21
1144	0.17
1145	0.16
1146	0.13
1147	0.14
1148	0.12
1149	0.11
1150	0.12
1151	0.1
1152	0.09
1153	0.1
1154	0.1
1155	0.1
1156	0.12
1157	0.12
1158	0.11
1159	0.2
1160	0.24
1161	0.28
1162	0.29
1163	0.28
1164	0.27
1165	0.29
1166	0.3
1167	0.23
1168	0.21
1169	0.2
1170	0.21
1171	0.22
1172	0.22
1173	0.19
1174	0.17
1175	0.18
1176	0.2
1177	0.17
1178	0.15
1179	0.15
1180	0.18
1181	0.25
1182	0.26
1183	0.27
1184	0.33
1185	0.42
1186	0.47
1187	0.48
1188	0.5
1189	0.45
1190	0.47
1191	0.48
1192	0.43
1193	0.36

O59801

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer