FuNGI

Q09904

Protein Details

Accession

Q09904

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-25	VSKNTRTSSKTVKKPYDPPQGS	Hydrophilic
105-128	VHTNTFEPRKPKQKQDYTNSPTLF	Hydrophilic
198-218	NPTCEKRKPSRSPSPMLSKKK	Hydrophilic
258-285	VSAKNHVPHRSSRRRRRHQRLIPIIYET	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
267-275	RSSRRRRRH
1147-1159	GRKIAVPRSRRKR

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito_nucl 13.833, cyto_nucl 10.333, mito 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026054 Nucleoporin IPR018892 Retro-transposon_transp_CS
Gene Ontology	GO:0140599 C:mitotic nuclear bridge midzone membrane domain GO:0005635 C:nuclear envelope GO:0005643 C:nuclear pore GO:0008139 F:nuclear localization sequence binding GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0006606 P:protein import into nucleus GO:0000054 P:ribosomal subunit export from nucleus GO:0006405 P:RNA export from nucleus
KEGG	spo:SPAC30D11.04c -
Pfam	View protein in Pfam PF10599 Nup_retrotrp_bd

Amino Acid Sequences

MPPVSKNTRTSSKTVKKPYDPPQGSSRPFFTVLKRAFSSVLHPFTSGLDEKASGTASKDRKSGRAGTKSLLTPELTPHYLGKSPRIIRVSNRSHVRTIDGIEEKVHTNTFEPRKPKQKQDYTNSPTLFKRHDELSLKSLNSLHPSSALSKKLGSTSQHQIATPKSSASLLNILRSLHDEQKNTLNISSVKQDRITEANPTCEKRKPSRSPSPMLSKKKSVARASENEPSAKQNKSFSGNDSHKSLTDIRDKENGETEVSAKNHVPHRSSRRRRRHQRLIPIIYETLEQMDLRKPVLVNAEVQTDSNPGNTMFIDKQDIYHRLSTPTSRKRQTLEKGHIKAFSAVDEDLDEIFACEDDVHYTALPKQNPKSERILEPIIASPKDNTSDKGLLTKSAPTFEELQASITPKPVKTSPNDTALTLANAEDNKTFEHQPLSKDTEAPKSQFSSSPTKESTTRKSEVEPPSPSKEIKSSHFSVPEFKFEPKTEATTDKKLNVPKFEFKPTATADVQTNRLKENEPKPTFFAQLPSKTQETPSITENKPSFFSQLSPKREETEKKDNAPSAPASTSGFSFGGFAPKTLEEKEETKAPTFNFSLNNASSTQDTTKPTLQFNFGSSFGKPTSNIFNDKKTSENGLASSTVASESKPSAPESKPSSGFGNTAGSSPFSFNLTKESKEVPPTNSFSFAKKGKDEANDSLSAKASTPFSFAKPNTENVTTTAPQFSFNFTKPNTDAKTNLLPEKTFNEEAVKQKETEKEVPPTGPKASEIKDSVSSNNAVPSSTFNFVSPFAAVSEKTNENNIPNDTTKTNGNATKRTLEQTEDAKPFAFSFGSTTEQANKKASTSNETTKPQLDTSSKTDGVTANAPFSFASAFNAPKPSTNTADGKDSASNLTTPSPAFSFGNNSGVKASSNNNPSTNSSTAPFSFGTSNKPAFSFGSATSKTTSEGTAPAASASAPAPTTSAFSFGASNSSMNKEENTPMAKDAGDTAPASGFKSGFSFGANNSPQPASMFGTSTPAPSSAFAFGNQSGTNPAAPAGFGGITNTATNNPPSTGFTFTPSNAGSTAAPMFGAGNTPNPSGSINNASQAFAFGSGEPSNPASNPPSTGFSFGAATPSAFNASASQSPAPNGIQFNLGSSNSQTNAPPGRKIAVPRSRRKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.78
3	0.76
4	0.82
5	0.85
6	0.86
7	0.79
8	0.74
9	0.74
10	0.74
11	0.7
12	0.66
13	0.59
14	0.52
15	0.52
16	0.5
17	0.46
18	0.46
19	0.45
20	0.47
21	0.45
22	0.43
23	0.4
24	0.38
25	0.39
26	0.38
27	0.38
28	0.32
29	0.31
30	0.3
31	0.29
32	0.34
33	0.29
34	0.21
35	0.18
36	0.18
37	0.18
38	0.19
39	0.19
40	0.15
41	0.16
42	0.24
43	0.28
44	0.32
45	0.37
46	0.39
47	0.43
48	0.49
49	0.55
50	0.57
51	0.59
52	0.59
53	0.57
54	0.59
55	0.57
56	0.54
57	0.48
58	0.39
59	0.31
60	0.33
61	0.35
62	0.3
63	0.29
64	0.27
65	0.28
66	0.31
67	0.32
68	0.33
69	0.37
70	0.39
71	0.45
72	0.48
73	0.47
74	0.5
75	0.59
76	0.61
77	0.6
78	0.65
79	0.62
80	0.61
81	0.59
82	0.55
83	0.48
84	0.42
85	0.41
86	0.36
87	0.32
88	0.3
89	0.31
90	0.28
91	0.27
92	0.25
93	0.18
94	0.17
95	0.26
96	0.32
97	0.38
98	0.43
99	0.5
100	0.6
101	0.67
102	0.75
103	0.77
104	0.79
105	0.82
106	0.85
107	0.88
108	0.84
109	0.85
110	0.77
111	0.69
112	0.62
113	0.57
114	0.51
115	0.43
116	0.4
117	0.33
118	0.4
119	0.41
120	0.42
121	0.43
122	0.45
123	0.42
124	0.4
125	0.4
126	0.34
127	0.34
128	0.32
129	0.26
130	0.22
131	0.23
132	0.27
133	0.3
134	0.31
135	0.26
136	0.27
137	0.28
138	0.3
139	0.32
140	0.31
141	0.31
142	0.37
143	0.42
144	0.43
145	0.42
146	0.42
147	0.4
148	0.42
149	0.37
150	0.29
151	0.23
152	0.23
153	0.22
154	0.22
155	0.26
156	0.22
157	0.24
158	0.25
159	0.24
160	0.23
161	0.27
162	0.28
163	0.29
164	0.33
165	0.32
166	0.33
167	0.4
168	0.43
169	0.4
170	0.37
171	0.32
172	0.28
173	0.29
174	0.34
175	0.31
176	0.3
177	0.31
178	0.32
179	0.31
180	0.34
181	0.33
182	0.34
183	0.32
184	0.38
185	0.4
186	0.43
187	0.44
188	0.45
189	0.51
190	0.52
191	0.6
192	0.63
193	0.67
194	0.75
195	0.78
196	0.79
197	0.8
198	0.81
199	0.81
200	0.8
201	0.76
202	0.71
203	0.7
204	0.7
205	0.71
206	0.65
207	0.64
208	0.62
209	0.62
210	0.62
211	0.63
212	0.58
213	0.52
214	0.47
215	0.45
216	0.41
217	0.38
218	0.35
219	0.32
220	0.34
221	0.38
222	0.38
223	0.36
224	0.42
225	0.43
226	0.44
227	0.43
228	0.4
229	0.34
230	0.36
231	0.35
232	0.31
233	0.35
234	0.35
235	0.35
236	0.41
237	0.42
238	0.4
239	0.42
240	0.37
241	0.29
242	0.27
243	0.25
244	0.24
245	0.24
246	0.24
247	0.2
248	0.24
249	0.29
250	0.32
251	0.34
252	0.37
253	0.48
254	0.57
255	0.66
256	0.73
257	0.78
258	0.85
259	0.93
260	0.95
261	0.95
262	0.93
263	0.94
264	0.94
265	0.89
266	0.8
267	0.73
268	0.62
269	0.51
270	0.42
271	0.31
272	0.21
273	0.15
274	0.12
275	0.1
276	0.13
277	0.14
278	0.14
279	0.15
280	0.14
281	0.16
282	0.2
283	0.19
284	0.18
285	0.19
286	0.21
287	0.19
288	0.2
289	0.18
290	0.15
291	0.15
292	0.12
293	0.12
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.12
298	0.11
299	0.12
300	0.16
301	0.15
302	0.17
303	0.22
304	0.25
305	0.25
306	0.28
307	0.28
308	0.27
309	0.29
310	0.34
311	0.38
312	0.45
313	0.51
314	0.52
315	0.54
316	0.55
317	0.62
318	0.65
319	0.65
320	0.66
321	0.67
322	0.66
323	0.66
324	0.64
325	0.56
326	0.49
327	0.39
328	0.3
329	0.22
330	0.17
331	0.15
332	0.13
333	0.12
334	0.09
335	0.09
336	0.07
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.08
348	0.12
349	0.18
350	0.2
351	0.24
352	0.28
353	0.35
354	0.37
355	0.41
356	0.44
357	0.43
358	0.44
359	0.43
360	0.42
361	0.35
362	0.34
363	0.33
364	0.29
365	0.25
366	0.22
367	0.18
368	0.17
369	0.2
370	0.2
371	0.18
372	0.2
373	0.21
374	0.21
375	0.25
376	0.24
377	0.22
378	0.22
379	0.25
380	0.2
381	0.2
382	0.21
383	0.18
384	0.21
385	0.2
386	0.21
387	0.17
388	0.18
389	0.17
390	0.19
391	0.17
392	0.18
393	0.19
394	0.16
395	0.2
396	0.21
397	0.24
398	0.26
399	0.34
400	0.34
401	0.38
402	0.39
403	0.36
404	0.35
405	0.31
406	0.27
407	0.19
408	0.15
409	0.1
410	0.09
411	0.1
412	0.09
413	0.09
414	0.1
415	0.12
416	0.13
417	0.12
418	0.17
419	0.19
420	0.2
421	0.25
422	0.29
423	0.27
424	0.3
425	0.31
426	0.34
427	0.34
428	0.34
429	0.31
430	0.27
431	0.28
432	0.28
433	0.3
434	0.31
435	0.3
436	0.34
437	0.33
438	0.33
439	0.37
440	0.4
441	0.43
442	0.4
443	0.41
444	0.37
445	0.38
446	0.45
447	0.46
448	0.48
449	0.46
450	0.43
451	0.46
452	0.47
453	0.44
454	0.37
455	0.35
456	0.31
457	0.3
458	0.32
459	0.31
460	0.32
461	0.35
462	0.34
463	0.37
464	0.35
465	0.36
466	0.32
467	0.3
468	0.3
469	0.26
470	0.3
471	0.24
472	0.25
473	0.22
474	0.27
475	0.29
476	0.32
477	0.33
478	0.32
479	0.35
480	0.38
481	0.39
482	0.39
483	0.39
484	0.4
485	0.42
486	0.45
487	0.43
488	0.38
489	0.39
490	0.34
491	0.35
492	0.28
493	0.26
494	0.22
495	0.23
496	0.28
497	0.26
498	0.25
499	0.21
500	0.21
501	0.22
502	0.27
503	0.32
504	0.37
505	0.37
506	0.38
507	0.41
508	0.42
509	0.42
510	0.35
511	0.33
512	0.28
513	0.3
514	0.31
515	0.3
516	0.29
517	0.28
518	0.28
519	0.28
520	0.26
521	0.23
522	0.23
523	0.27
524	0.26
525	0.31
526	0.31
527	0.27
528	0.26
529	0.25
530	0.24
531	0.17
532	0.19
533	0.23
534	0.31
535	0.34
536	0.36
537	0.36
538	0.37
539	0.41
540	0.44
541	0.42
542	0.45
543	0.44
544	0.44
545	0.46
546	0.45
547	0.41
548	0.38
549	0.31
550	0.23
551	0.18
552	0.16
553	0.13
554	0.12
555	0.12
556	0.11
557	0.1
558	0.08
559	0.09
560	0.08
561	0.12
562	0.11
563	0.11
564	0.11
565	0.11
566	0.13
567	0.12
568	0.13
569	0.11
570	0.13
571	0.14
572	0.17
573	0.18
574	0.18
575	0.2
576	0.19
577	0.2
578	0.19
579	0.2
580	0.17
581	0.17
582	0.2
583	0.17
584	0.19
585	0.16
586	0.16
587	0.14
588	0.14
589	0.14
590	0.14
591	0.16
592	0.18
593	0.21
594	0.22
595	0.23
596	0.23
597	0.24
598	0.21
599	0.21
600	0.2
601	0.17
602	0.17
603	0.15
604	0.16
605	0.15
606	0.15
607	0.13
608	0.13
609	0.18
610	0.19
611	0.26
612	0.25
613	0.29
614	0.3
615	0.31
616	0.31
617	0.26
618	0.27
619	0.22
620	0.22
621	0.18
622	0.16
623	0.16
624	0.14
625	0.13
626	0.09
627	0.08
628	0.07
629	0.06
630	0.06
631	0.07
632	0.09
633	0.1
634	0.11
635	0.16
636	0.16
637	0.22
638	0.26
639	0.29
640	0.29
641	0.3
642	0.31
643	0.26
644	0.26
645	0.22
646	0.19
647	0.15
648	0.14
649	0.13
650	0.11
651	0.11
652	0.11
653	0.1
654	0.1
655	0.1
656	0.1
657	0.16
658	0.18
659	0.18
660	0.19
661	0.22
662	0.22
663	0.28
664	0.31
665	0.28
666	0.31
667	0.34
668	0.33
669	0.34
670	0.33
671	0.28
672	0.31
673	0.31
674	0.29
675	0.27
676	0.28
677	0.28
678	0.31
679	0.34
680	0.32
681	0.32
682	0.32
683	0.31
684	0.29
685	0.25
686	0.21
687	0.17
688	0.15
689	0.13
690	0.11
691	0.14
692	0.14
693	0.15
694	0.21
695	0.21
696	0.27
697	0.27
698	0.3
699	0.3
700	0.31
701	0.3
702	0.25
703	0.3
704	0.23
705	0.22
706	0.22
707	0.18
708	0.18
709	0.18
710	0.2
711	0.19
712	0.19
713	0.23
714	0.21
715	0.26
716	0.26
717	0.33
718	0.31
719	0.3
720	0.3
721	0.3
722	0.36
723	0.34
724	0.35
725	0.3
726	0.27
727	0.27
728	0.28
729	0.29
730	0.23
731	0.21
732	0.22
733	0.24
734	0.3
735	0.33
736	0.32
737	0.27
738	0.3
739	0.34
740	0.36
741	0.38
742	0.36
743	0.36
744	0.37
745	0.38
746	0.37
747	0.36
748	0.31
749	0.26
750	0.24
751	0.23
752	0.23
753	0.25
754	0.24
755	0.23
756	0.26
757	0.26
758	0.25
759	0.24
760	0.23
761	0.19
762	0.2
763	0.17
764	0.13
765	0.13
766	0.15
767	0.16
768	0.17
769	0.17
770	0.14
771	0.15
772	0.16
773	0.17
774	0.13
775	0.1
776	0.09
777	0.1
778	0.1
779	0.11
780	0.15
781	0.16
782	0.17
783	0.19
784	0.2
785	0.21
786	0.23
787	0.23
788	0.23
789	0.22
790	0.24
791	0.22
792	0.22
793	0.22
794	0.21
795	0.24
796	0.25
797	0.27
798	0.29
799	0.31
800	0.34
801	0.34
802	0.35
803	0.31
804	0.29
805	0.29
806	0.29
807	0.34
808	0.31
809	0.3
810	0.27
811	0.26
812	0.23
813	0.21
814	0.16
815	0.09
816	0.09
817	0.11
818	0.14
819	0.15
820	0.16
821	0.22
822	0.25
823	0.27
824	0.28
825	0.27
826	0.25
827	0.28
828	0.29
829	0.28
830	0.31
831	0.36
832	0.4
833	0.42
834	0.43
835	0.41
836	0.42
837	0.36
838	0.36
839	0.31
840	0.29
841	0.31
842	0.35
843	0.33
844	0.31
845	0.32
846	0.27
847	0.27
848	0.26
849	0.21
850	0.17
851	0.16
852	0.16
853	0.14
854	0.14
855	0.13
856	0.09
857	0.11
858	0.12
859	0.13
860	0.15
861	0.2
862	0.2
863	0.22
864	0.27
865	0.28
866	0.29
867	0.33
868	0.35
869	0.32
870	0.37
871	0.34
872	0.32
873	0.29
874	0.26
875	0.22
876	0.19
877	0.17
878	0.14
879	0.14
880	0.13
881	0.12
882	0.13
883	0.12
884	0.14
885	0.14
886	0.14
887	0.18
888	0.19
889	0.26
890	0.24
891	0.24
892	0.23
893	0.23
894	0.22
895	0.19
896	0.2
897	0.2
898	0.26
899	0.29
900	0.29
901	0.31
902	0.35
903	0.38
904	0.37
905	0.31
906	0.27
907	0.27
908	0.25
909	0.26
910	0.22
911	0.19
912	0.2
913	0.2
914	0.24
915	0.26
916	0.28
917	0.26
918	0.27
919	0.27
920	0.24
921	0.26
922	0.22
923	0.19
924	0.25
925	0.25
926	0.26
927	0.26
928	0.25
929	0.24
930	0.22
931	0.21
932	0.14
933	0.15
934	0.16
935	0.15
936	0.15
937	0.13
938	0.12
939	0.11
940	0.11
941	0.09
942	0.08
943	0.07
944	0.07
945	0.08
946	0.08
947	0.11
948	0.1
949	0.13
950	0.12
951	0.12
952	0.13
953	0.13
954	0.15
955	0.14
956	0.14
957	0.14
958	0.17
959	0.18
960	0.18
961	0.19
962	0.2
963	0.21
964	0.25
965	0.26
966	0.24
967	0.23
968	0.24
969	0.22
970	0.2
971	0.21
972	0.17
973	0.16
974	0.15
975	0.14
976	0.15
977	0.15
978	0.16
979	0.14
980	0.13
981	0.11
982	0.13
983	0.14
984	0.12
985	0.13
986	0.14
987	0.13
988	0.22
989	0.23
990	0.22
991	0.24
992	0.24
993	0.23
994	0.23
995	0.24
996	0.18
997	0.18
998	0.18
999	0.15
1000	0.2
1001	0.19
1002	0.2
1003	0.18
1004	0.15
1005	0.15
1006	0.15
1007	0.17
1008	0.16
1009	0.16
1010	0.15
1011	0.18
1012	0.18
1013	0.2
1014	0.19
1015	0.18
1016	0.17
1017	0.18
1018	0.17
1019	0.14
1020	0.13
1021	0.1
1022	0.1
1023	0.1
1024	0.09
1025	0.08
1026	0.07
1027	0.08
1028	0.09
1029	0.1
1030	0.11
1031	0.11
1032	0.12
1033	0.14
1034	0.16
1035	0.16
1036	0.16
1037	0.17
1038	0.2
1039	0.22
1040	0.26
1041	0.25
1042	0.27
1043	0.28
1044	0.27
1045	0.31
1046	0.27
1047	0.26
1048	0.2
1049	0.21
1050	0.17
1051	0.17
1052	0.17
1053	0.13
1054	0.12
1055	0.11
1056	0.11
1057	0.09
1058	0.11
1059	0.09
1060	0.14
1061	0.17
1062	0.18
1063	0.18
1064	0.18
1065	0.2
1066	0.19
1067	0.22
1068	0.23
1069	0.22
1070	0.26
1071	0.27
1072	0.26
1073	0.25
1074	0.25
1075	0.21
1076	0.15
1077	0.15
1078	0.1
1079	0.14
1080	0.14
1081	0.15
1082	0.15
1083	0.17
1084	0.18
1085	0.17
1086	0.2
1087	0.2
1088	0.21
1089	0.24
1090	0.25
1091	0.27
1092	0.27
1093	0.31
1094	0.28
1095	0.25
1096	0.25
1097	0.22
1098	0.22
1099	0.18
1100	0.17
1101	0.14
1102	0.14
1103	0.15
1104	0.14
1105	0.14
1106	0.13
1107	0.17
1108	0.19
1109	0.21
1110	0.22
1111	0.21
1112	0.22
1113	0.25
1114	0.25
1115	0.25
1116	0.24
1117	0.22
1118	0.23
1119	0.21
1120	0.22
1121	0.23
1122	0.23
1123	0.2
1124	0.21
1125	0.25
1126	0.23
1127	0.25
1128	0.23
1129	0.26
1130	0.34
1131	0.36
1132	0.37
1133	0.36
1134	0.38
1135	0.4
1136	0.46
1137	0.5
1138	0.51
1139	0.58

Q09904

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer