Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q9HFE6

Protein Details
Accession Q9HFE6    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-162SDVRKDPPRKGWKKGPYGRABasic
446-478SENRLFLTRDYKRKRKDAVKRQRRAHEKRIRLVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-156PRKGWKK
457-476KRKRKDAVKRQRRAHEKRIR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034138  NOP8_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG spo:SPBP16F5.06  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12226  RRM_NOL8  
Amino Acid Sequences MELEKRIYVGGLSSSIESSDLESRFSRFGSVSNLEIINKSTPVGTIQRFAYLNFRTDEDKWQKCKSYLSNATFKGSKLRIEEARPYYLVKLQQEKKIADLQSTNNDEKNEDHSSKVDLEDPVFHGEIIVPGKHSKNMQVVTDSDVRKDPPRKGWKKGPYGRAIVVLRMYNKNTKKTRFFYPLGKNCLQKLWGRVETNMDNTTAFYDSDHDEYVSYGGKRASRDKIRMQAKLGIKASTQKDDNDFELLNNTTGEIEVTKELNEEQLDALRKKDKDTAASVLAELFGSENTEEIDTVSKTSGVLELDNDSTNNFQKEGLDEQDNLQKEESVHIDVPAEFEAFDERTAVVNVDNLKEMFSSNAQDTSKFSLFGNENGVGEESEMESEIDDRNYETMEEEADGETPLAIVKASSGTKGWPKMFTLPNPSSLFQPGNEDYTSREALESWWSENRLFLTRDYKRKRKDAVKRQRRAHEKRIRLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.13
4 0.12
5 0.13
6 0.18
7 0.17
8 0.19
9 0.2
10 0.22
11 0.23
12 0.23
13 0.23
14 0.17
15 0.19
16 0.24
17 0.25
18 0.24
19 0.26
20 0.27
21 0.26
22 0.26
23 0.26
24 0.21
25 0.19
26 0.18
27 0.14
28 0.14
29 0.17
30 0.23
31 0.22
32 0.24
33 0.25
34 0.29
35 0.29
36 0.3
37 0.34
38 0.29
39 0.31
40 0.28
41 0.29
42 0.28
43 0.3
44 0.39
45 0.41
46 0.47
47 0.5
48 0.55
49 0.59
50 0.57
51 0.63
52 0.59
53 0.61
54 0.62
55 0.62
56 0.64
57 0.6
58 0.63
59 0.56
60 0.5
61 0.48
62 0.4
63 0.38
64 0.33
65 0.38
66 0.39
67 0.42
68 0.5
69 0.46
70 0.48
71 0.44
72 0.42
73 0.38
74 0.37
75 0.37
76 0.34
77 0.39
78 0.41
79 0.46
80 0.51
81 0.49
82 0.48
83 0.5
84 0.45
85 0.38
86 0.37
87 0.34
88 0.36
89 0.42
90 0.4
91 0.36
92 0.36
93 0.33
94 0.31
95 0.33
96 0.32
97 0.27
98 0.27
99 0.25
100 0.27
101 0.27
102 0.27
103 0.24
104 0.18
105 0.18
106 0.19
107 0.19
108 0.2
109 0.18
110 0.17
111 0.14
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.12
116 0.11
117 0.14
118 0.15
119 0.18
120 0.19
121 0.21
122 0.26
123 0.28
124 0.28
125 0.27
126 0.27
127 0.29
128 0.35
129 0.31
130 0.25
131 0.25
132 0.25
133 0.31
134 0.36
135 0.37
136 0.4
137 0.51
138 0.56
139 0.63
140 0.71
141 0.72
142 0.77
143 0.8
144 0.78
145 0.73
146 0.71
147 0.63
148 0.6
149 0.51
150 0.41
151 0.35
152 0.29
153 0.26
154 0.25
155 0.27
156 0.29
157 0.33
158 0.4
159 0.45
160 0.5
161 0.55
162 0.55
163 0.61
164 0.6
165 0.59
166 0.6
167 0.63
168 0.64
169 0.63
170 0.63
171 0.57
172 0.51
173 0.49
174 0.42
175 0.34
176 0.31
177 0.31
178 0.32
179 0.32
180 0.32
181 0.34
182 0.33
183 0.34
184 0.3
185 0.23
186 0.17
187 0.16
188 0.17
189 0.13
190 0.11
191 0.07
192 0.09
193 0.09
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.13
205 0.15
206 0.2
207 0.27
208 0.31
209 0.36
210 0.4
211 0.47
212 0.51
213 0.51
214 0.48
215 0.48
216 0.44
217 0.45
218 0.41
219 0.33
220 0.28
221 0.32
222 0.31
223 0.27
224 0.26
225 0.2
226 0.22
227 0.23
228 0.24
229 0.19
230 0.17
231 0.14
232 0.15
233 0.14
234 0.11
235 0.1
236 0.09
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.1
252 0.13
253 0.13
254 0.16
255 0.2
256 0.2
257 0.21
258 0.27
259 0.26
260 0.26
261 0.29
262 0.3
263 0.27
264 0.27
265 0.25
266 0.19
267 0.17
268 0.13
269 0.09
270 0.06
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.09
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.11
296 0.13
297 0.13
298 0.11
299 0.1
300 0.11
301 0.13
302 0.16
303 0.17
304 0.17
305 0.17
306 0.18
307 0.23
308 0.24
309 0.22
310 0.19
311 0.17
312 0.15
313 0.17
314 0.17
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.15
319 0.14
320 0.15
321 0.13
322 0.11
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.08
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.13
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.12
342 0.11
343 0.11
344 0.13
345 0.12
346 0.17
347 0.17
348 0.18
349 0.2
350 0.25
351 0.24
352 0.22
353 0.21
354 0.23
355 0.24
356 0.25
357 0.28
358 0.22
359 0.21
360 0.21
361 0.22
362 0.15
363 0.14
364 0.13
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.08
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.08
395 0.09
396 0.11
397 0.11
398 0.16
399 0.23
400 0.3
401 0.32
402 0.31
403 0.33
404 0.4
405 0.46
406 0.48
407 0.5
408 0.46
409 0.51
410 0.52
411 0.5
412 0.44
413 0.42
414 0.38
415 0.29
416 0.34
417 0.28
418 0.28
419 0.27
420 0.25
421 0.24
422 0.28
423 0.28
424 0.22
425 0.2
426 0.17
427 0.18
428 0.24
429 0.23
430 0.22
431 0.25
432 0.27
433 0.27
434 0.29
435 0.3
436 0.29
437 0.29
438 0.29
439 0.35
440 0.42
441 0.52
442 0.61
443 0.67
444 0.71
445 0.79
446 0.84
447 0.85
448 0.87
449 0.88
450 0.89
451 0.9
452 0.91
453 0.92
454 0.92
455 0.93
456 0.91
457 0.91
458 0.9