Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q09907

Protein Details
Accession Q09907    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-262GITITKRKVKTIKRVKKRPASESPPLHydrophilic
319-346FHSTTKETRSLRRSKRVAKKSSQYFSQQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
242-255KRKVKTIKRVKKRP
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR004036  Endonuclease-III-like_CS2  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR000445  HhH_motif  
IPR030841  NTH1  
Gene Ontology GO:0005759  C:mitochondrial matrix  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0051539  F:4 iron, 4 sulfur cluster binding  
GO:0034042  F:5-formyluracil DNA N-glycosylase activity  
GO:0034043  F:5-hydroxymethyluracil DNA N-glycosylase activity  
GO:0034039  F:8-oxo-7,8-dihydroguanine DNA N-glycosylase activity  
GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003906  F:DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0008534  F:oxidized purine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0000703  F:oxidized pyrimidine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006284  P:base-excision repair  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
GO:0043504  P:mitochondrial DNA repair  
KEGG spo:SPAC30D11.07  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00633  HHH  
PF00730  HhH-GPD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01155  ENDONUCLEASE_III_2  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MSKDYGTPPENWREVYDEICKMKAKVVAPVDVQGCHTLGERNDPKKFRFQTLVALMLSSQTKDIVLGPTMRNLKEKLAGGLCLEDIQNIDEVSLNKLIEKVGFHNRKTIYLKQMARILSEKFQGDIPDTVEDLMTLPGVGPKMGYLCMSIAWNKTVGIGVDVHVHRICNLLHWCNTKTEEQTRAALQSWLPKELWFELNHTLVGFGQTICLPRGRRCDMCTLSSKGLCPSAFKEKSGITITKRKVKTIKRVKKRPASESPPLSPLSLPTDDLYYQSIEDKSLIKLEDLDPVDSISHMNEPLKKEPAADIDVDQKPPVAFHSTTKETRSLRRSKRVAKKSSQYFSQQSLQDIEDLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.38
4 0.36
5 0.35
6 0.37
7 0.38
8 0.34
9 0.36
10 0.37
11 0.32
12 0.34
13 0.35
14 0.37
15 0.36
16 0.4
17 0.37
18 0.32
19 0.32
20 0.26
21 0.22
22 0.18
23 0.18
24 0.17
25 0.16
26 0.26
27 0.33
28 0.39
29 0.47
30 0.51
31 0.53
32 0.59
33 0.63
34 0.59
35 0.57
36 0.51
37 0.52
38 0.52
39 0.52
40 0.42
41 0.38
42 0.31
43 0.27
44 0.26
45 0.17
46 0.13
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.16
54 0.16
55 0.23
56 0.27
57 0.28
58 0.3
59 0.29
60 0.29
61 0.3
62 0.31
63 0.29
64 0.26
65 0.26
66 0.23
67 0.22
68 0.2
69 0.15
70 0.14
71 0.1
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.09
78 0.1
79 0.12
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.13
87 0.15
88 0.23
89 0.3
90 0.3
91 0.37
92 0.37
93 0.43
94 0.47
95 0.48
96 0.45
97 0.47
98 0.49
99 0.46
100 0.5
101 0.44
102 0.4
103 0.37
104 0.32
105 0.26
106 0.27
107 0.23
108 0.19
109 0.2
110 0.18
111 0.18
112 0.16
113 0.15
114 0.13
115 0.13
116 0.12
117 0.11
118 0.1
119 0.08
120 0.07
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.12
148 0.12
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.16
157 0.16
158 0.2
159 0.23
160 0.24
161 0.24
162 0.27
163 0.24
164 0.25
165 0.26
166 0.27
167 0.25
168 0.26
169 0.24
170 0.23
171 0.22
172 0.19
173 0.16
174 0.18
175 0.18
176 0.18
177 0.17
178 0.16
179 0.17
180 0.18
181 0.2
182 0.14
183 0.16
184 0.17
185 0.17
186 0.17
187 0.15
188 0.13
189 0.1
190 0.11
191 0.09
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.08
196 0.08
197 0.12
198 0.13
199 0.17
200 0.24
201 0.29
202 0.31
203 0.32
204 0.4
205 0.39
206 0.41
207 0.42
208 0.39
209 0.38
210 0.36
211 0.34
212 0.27
213 0.28
214 0.24
215 0.21
216 0.21
217 0.28
218 0.28
219 0.28
220 0.29
221 0.26
222 0.3
223 0.32
224 0.32
225 0.27
226 0.35
227 0.39
228 0.46
229 0.46
230 0.48
231 0.53
232 0.57
233 0.63
234 0.66
235 0.71
236 0.73
237 0.83
238 0.87
239 0.88
240 0.87
241 0.85
242 0.84
243 0.81
244 0.8
245 0.75
246 0.68
247 0.62
248 0.55
249 0.47
250 0.37
251 0.31
252 0.27
253 0.21
254 0.2
255 0.17
256 0.18
257 0.17
258 0.18
259 0.18
260 0.13
261 0.12
262 0.14
263 0.14
264 0.12
265 0.13
266 0.14
267 0.13
268 0.16
269 0.16
270 0.13
271 0.15
272 0.15
273 0.21
274 0.21
275 0.21
276 0.18
277 0.18
278 0.18
279 0.16
280 0.16
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.14
285 0.18
286 0.23
287 0.28
288 0.32
289 0.31
290 0.3
291 0.31
292 0.33
293 0.31
294 0.27
295 0.24
296 0.28
297 0.31
298 0.31
299 0.28
300 0.25
301 0.22
302 0.21
303 0.23
304 0.2
305 0.18
306 0.22
307 0.3
308 0.35
309 0.39
310 0.42
311 0.47
312 0.45
313 0.53
314 0.58
315 0.6
316 0.64
317 0.71
318 0.77
319 0.8
320 0.87
321 0.88
322 0.88
323 0.88
324 0.88
325 0.88
326 0.85
327 0.81
328 0.78
329 0.73
330 0.69
331 0.66
332 0.58
333 0.51
334 0.47
335 0.41