FuNGI

A0A0D1YP04

Protein Details

Accession

A0A0D1YP04

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
562-584	MERNMPANKRRRMDRSRVPGGKQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011993 PH-like_dom_sf IPR027079 Tfb1/GTF2H1 IPR013876 TFIIH_BTF_p62_N
Gene Ontology	GO:0000439 C:transcription factor TFIIH core complex GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0006289 P:nucleotide-excision repair
Pfam	View protein in Pfam PF08567 PH_TFIIH
CDD	cd13229 PH_TFIIH

Amino Acid Sequences

MALPRAKGAAQYKKQDGELSLSSDGKMITWSPNTPGSISNVTIATEQLTNLQQTPATSAKAVLKLFVQASGTAAPETFNFTFSSATTARDEMNAFIAPLKKIMEAQRAGTVSSLVTPSPAPTPGGQGQADSISIAQAASHVNKETSQDSFPDAELLSNVAFQKALTEQNPSLRERLAQAMRDKPASMTSGQLSRQFWSSRIHLLRAYAAEQAQKKGEYNVIADIKPVRHPDGIVRYDFTPAKFRMIFTQYPFMVKIHNELFKKKVFTKEEEFWSDWVNSRLYKKMKGEKIKEQDYEHPHFDRYLDLVETGSRPKHFTVDHIPRFLDMEGNEQNHSQKFGNAPDFTMQPGFNGRNPILSTLNNMSERLLVNVAPSDNDAHGPVGMDEETYNELMLRDLQRNDKDNRVLLNISDHRHIAPSDGANGAVHLRPGDVLKALGHVRENLKVEPNLPVELEDNDERQALKATTSMMKSIKLRASHTTPDQIAQKNVSNKVKEAAVMAHGTTVDFLHYFWGAYLSGDVTRAEDVKFLVETLQNSKGRFDAVADQAEQERQAQLEQIQEMERNMPANKRRRMDRSRVPGGKQAVYEMLASTQQAVSFAQDEYRRAFAKQAAQQMNSVTTYP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.58
3	0.51
4	0.46
5	0.41
6	0.37
7	0.34
8	0.31
9	0.29
10	0.27
11	0.25
12	0.18
13	0.17
14	0.14
15	0.16
16	0.19
17	0.21
18	0.23
19	0.28
20	0.29
21	0.29
22	0.29
23	0.29
24	0.29
25	0.28
26	0.27
27	0.23
28	0.22
29	0.21
30	0.2
31	0.16
32	0.13
33	0.12
34	0.13
35	0.15
36	0.16
37	0.16
38	0.17
39	0.16
40	0.16
41	0.21
42	0.2
43	0.2
44	0.18
45	0.21
46	0.25
47	0.29
48	0.29
49	0.25
50	0.23
51	0.25
52	0.25
53	0.24
54	0.2
55	0.14
56	0.16
57	0.16
58	0.16
59	0.13
60	0.12
61	0.11
62	0.1
63	0.17
64	0.15
65	0.15
66	0.15
67	0.15
68	0.16
69	0.16
70	0.21
71	0.15
72	0.17
73	0.18
74	0.19
75	0.19
76	0.2
77	0.21
78	0.16
79	0.18
80	0.15
81	0.13
82	0.16
83	0.18
84	0.16
85	0.17
86	0.18
87	0.15
88	0.2
89	0.26
90	0.31
91	0.3
92	0.31
93	0.35
94	0.34
95	0.34
96	0.3
97	0.24
98	0.16
99	0.16
100	0.14
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.1
105	0.12
106	0.13
107	0.13
108	0.12
109	0.19
110	0.21
111	0.25
112	0.24
113	0.22
114	0.22
115	0.21
116	0.2
117	0.14
118	0.11
119	0.07
120	0.07
121	0.06
122	0.05
123	0.05
124	0.07
125	0.09
126	0.11
127	0.12
128	0.12
129	0.14
130	0.16
131	0.17
132	0.18
133	0.17
134	0.17
135	0.19
136	0.19
137	0.18
138	0.17
139	0.16
140	0.13
141	0.12
142	0.12
143	0.09
144	0.1
145	0.1
146	0.09
147	0.08
148	0.08
149	0.09
150	0.11
151	0.15
152	0.13
153	0.18
154	0.2
155	0.26
156	0.3
157	0.3
158	0.29
159	0.26
160	0.26
161	0.23
162	0.3
163	0.27
164	0.28
165	0.32
166	0.36
167	0.38
168	0.38
169	0.37
170	0.29
171	0.28
172	0.25
173	0.2
174	0.17
175	0.16
176	0.19
177	0.2
178	0.24
179	0.23
180	0.22
181	0.26
182	0.24
183	0.24
184	0.25
185	0.25
186	0.29
187	0.3
188	0.31
189	0.28
190	0.28
191	0.28
192	0.25
193	0.24
194	0.18
195	0.17
196	0.2
197	0.2
198	0.21
199	0.21
200	0.2
201	0.19
202	0.19
203	0.2
204	0.17
205	0.16
206	0.2
207	0.21
208	0.2
209	0.2
210	0.21
211	0.2
212	0.22
213	0.23
214	0.2
215	0.18
216	0.19
217	0.23
218	0.3
219	0.31
220	0.28
221	0.28
222	0.25
223	0.29
224	0.29
225	0.25
226	0.23
227	0.21
228	0.24
229	0.23
230	0.23
231	0.25
232	0.29
233	0.3
234	0.27
235	0.32
236	0.27
237	0.28
238	0.29
239	0.23
240	0.2
241	0.18
242	0.19
243	0.17
244	0.23
245	0.23
246	0.25
247	0.28
248	0.29
249	0.33
250	0.32
251	0.37
252	0.35
253	0.39
254	0.43
255	0.44
256	0.46
257	0.46
258	0.44
259	0.36
260	0.34
261	0.29
262	0.25
263	0.21
264	0.17
265	0.15
266	0.16
267	0.22
268	0.23
269	0.27
270	0.32
271	0.39
272	0.46
273	0.53
274	0.57
275	0.6
276	0.65
277	0.65
278	0.62
279	0.56
280	0.56
281	0.54
282	0.52
283	0.46
284	0.39
285	0.33
286	0.31
287	0.28
288	0.21
289	0.15
290	0.12
291	0.09
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.09
296	0.09
297	0.1
298	0.1
299	0.11
300	0.11
301	0.14
302	0.13
303	0.16
304	0.24
305	0.33
306	0.35
307	0.36
308	0.35
309	0.32
310	0.33
311	0.3
312	0.22
313	0.12
314	0.14
315	0.15
316	0.17
317	0.17
318	0.16
319	0.18
320	0.17
321	0.19
322	0.14
323	0.13
324	0.14
325	0.17
326	0.22
327	0.2
328	0.2
329	0.19
330	0.19
331	0.18
332	0.18
333	0.14
334	0.1
335	0.13
336	0.14
337	0.14
338	0.17
339	0.16
340	0.18
341	0.18
342	0.2
343	0.18
344	0.17
345	0.19
346	0.17
347	0.21
348	0.19
349	0.19
350	0.17
351	0.16
352	0.16
353	0.14
354	0.12
355	0.09
356	0.08
357	0.09
358	0.09
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.05
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.1
381	0.11
382	0.14
383	0.16
384	0.22
385	0.26
386	0.31
387	0.34
388	0.37
389	0.37
390	0.35
391	0.35
392	0.32
393	0.29
394	0.24
395	0.29
396	0.27
397	0.26
398	0.25
399	0.24
400	0.22
401	0.23
402	0.22
403	0.16
404	0.15
405	0.13
406	0.14
407	0.13
408	0.13
409	0.12
410	0.12
411	0.12
412	0.09
413	0.09
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.09
419	0.07
420	0.08
421	0.08
422	0.11
423	0.12
424	0.12
425	0.13
426	0.15
427	0.17
428	0.21
429	0.23
430	0.22
431	0.26
432	0.25
433	0.25
434	0.27
435	0.27
436	0.23
437	0.2
438	0.2
439	0.16
440	0.16
441	0.19
442	0.15
443	0.14
444	0.14
445	0.15
446	0.14
447	0.13
448	0.16
449	0.12
450	0.11
451	0.11
452	0.13
453	0.17
454	0.18
455	0.21
456	0.19
457	0.23
458	0.24
459	0.29
460	0.32
461	0.3
462	0.33
463	0.35
464	0.39
465	0.41
466	0.43
467	0.43
468	0.39
469	0.4
470	0.43
471	0.4
472	0.37
473	0.35
474	0.37
475	0.37
476	0.44
477	0.47
478	0.43
479	0.41
480	0.41
481	0.38
482	0.33
483	0.28
484	0.22
485	0.18
486	0.17
487	0.16
488	0.14
489	0.13
490	0.12
491	0.11
492	0.09
493	0.08
494	0.07
495	0.07
496	0.08
497	0.08
498	0.08
499	0.08
500	0.09
501	0.08
502	0.08
503	0.09
504	0.08
505	0.09
506	0.1
507	0.1
508	0.09
509	0.1
510	0.11
511	0.11
512	0.11
513	0.11
514	0.12
515	0.12
516	0.11
517	0.12
518	0.13
519	0.15
520	0.19
521	0.27
522	0.28
523	0.29
524	0.3
525	0.28
526	0.27
527	0.25
528	0.23
529	0.22
530	0.23
531	0.26
532	0.25
533	0.26
534	0.26
535	0.27
536	0.25
537	0.19
538	0.16
539	0.13
540	0.13
541	0.14
542	0.15
543	0.18
544	0.18
545	0.18
546	0.19
547	0.2
548	0.21
549	0.2
550	0.19
551	0.19
552	0.21
553	0.27
554	0.34
555	0.42
556	0.5
557	0.55
558	0.62
559	0.7
560	0.76
561	0.79
562	0.8
563	0.81
564	0.83
565	0.83
566	0.78
567	0.76
568	0.72
569	0.66
570	0.55
571	0.48
572	0.39
573	0.33
574	0.3
575	0.23
576	0.19
577	0.15
578	0.15
579	0.14
580	0.13
581	0.11
582	0.12
583	0.12
584	0.12
585	0.13
586	0.13
587	0.17
588	0.19
589	0.22
590	0.24
591	0.29
592	0.28
593	0.28
594	0.32
595	0.32
596	0.38
597	0.42
598	0.49
599	0.5
600	0.5
601	0.51
602	0.49
603	0.47

A0A0D1YP04

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer