Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1Y3S8

Protein Details
Accession A0A0D1Y3S8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
425-452ALKSGKRSAYWKKRRRWERVKNIVDSTRHydrophilic
581-604KGQRVEAKGKFSKKRKTEASMVTCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
426-443LKSGKRSAYWKKRRRWER
588-596KGKFSKKRK
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 8.5, cyto_nucl 8.5, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MQSYVLPNTNVVLRLQNGQYKVAPVTADTTISIPKYGSFSANLLIGRPYYVTYELVEKQDEGDSKKKITLLRAVPAAELHAETLSNDTFTPAESRDEKATGSLANESFDLVTDEGEVLIRNNRLTIDDPSRQALSHEEIEALKKASAGSGKEIIAKIMAAHSALGEKTEFSLAKYTLRKSKKYMKRFTVLPTDVNVLTKIWIEKDPSRIMELREETLGLMMSWGNVHYHAEDHDEGGSDVDLGKGRYLVIDDTCGLVVAAMAEKMGILHASPENEEQEANIATKCGLADEDAEMNDTLSSAKRRLDSNSLSQGNDSTHRMDEDDATRTNPSPGPWPTKRAVQSSAKSNSITVVHANTQPNMSLLETFGYDPDKPDPKHPLFTHLRTLSWLQLLEPSLDPLYQEPPVPEPADAEEANLPLNKRLSALKSGKRSAYWKKRRRWERVKNIVDSTRAGEFDALIVATTMDPIGILKHLVPLVRGGGNVVVYHPSVEPLTQIMDLYSRDRRAGYVKMLQQADDQGRAPAVDEEDFPVDPTLLLNPMLQTARAREWQILPMRTHPVMTSRGGSEGYIFSATRVVPIKGQRVEAKGKFSKKRKTEASMVTC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.28
3 0.32
4 0.31
5 0.33
6 0.33
7 0.33
8 0.32
9 0.28
10 0.24
11 0.2
12 0.21
13 0.19
14 0.19
15 0.16
16 0.17
17 0.18
18 0.18
19 0.18
20 0.15
21 0.15
22 0.18
23 0.19
24 0.19
25 0.18
26 0.19
27 0.19
28 0.23
29 0.21
30 0.18
31 0.18
32 0.16
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.13
37 0.15
38 0.15
39 0.15
40 0.2
41 0.23
42 0.25
43 0.25
44 0.22
45 0.22
46 0.25
47 0.27
48 0.27
49 0.31
50 0.32
51 0.33
52 0.36
53 0.38
54 0.37
55 0.39
56 0.43
57 0.41
58 0.44
59 0.45
60 0.43
61 0.4
62 0.36
63 0.32
64 0.24
65 0.19
66 0.13
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.12
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.13
78 0.12
79 0.17
80 0.18
81 0.21
82 0.23
83 0.24
84 0.24
85 0.22
86 0.22
87 0.18
88 0.17
89 0.19
90 0.16
91 0.16
92 0.16
93 0.15
94 0.14
95 0.13
96 0.13
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.12
109 0.13
110 0.15
111 0.18
112 0.23
113 0.26
114 0.29
115 0.31
116 0.33
117 0.33
118 0.31
119 0.29
120 0.26
121 0.23
122 0.21
123 0.19
124 0.18
125 0.18
126 0.2
127 0.21
128 0.19
129 0.14
130 0.13
131 0.12
132 0.13
133 0.16
134 0.15
135 0.18
136 0.2
137 0.2
138 0.23
139 0.23
140 0.21
141 0.18
142 0.16
143 0.13
144 0.1
145 0.1
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.15
159 0.14
160 0.21
161 0.25
162 0.28
163 0.34
164 0.4
165 0.43
166 0.46
167 0.56
168 0.6
169 0.67
170 0.72
171 0.71
172 0.7
173 0.7
174 0.69
175 0.68
176 0.6
177 0.51
178 0.42
179 0.38
180 0.33
181 0.3
182 0.25
183 0.15
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.12
189 0.16
190 0.19
191 0.24
192 0.27
193 0.27
194 0.29
195 0.29
196 0.29
197 0.31
198 0.3
199 0.25
200 0.22
201 0.21
202 0.18
203 0.16
204 0.15
205 0.08
206 0.06
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.02
255 0.04
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.06
286 0.07
287 0.08
288 0.1
289 0.12
290 0.14
291 0.17
292 0.22
293 0.24
294 0.28
295 0.35
296 0.34
297 0.33
298 0.31
299 0.29
300 0.24
301 0.23
302 0.19
303 0.13
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.13
310 0.14
311 0.13
312 0.14
313 0.15
314 0.15
315 0.16
316 0.15
317 0.13
318 0.17
319 0.2
320 0.28
321 0.29
322 0.33
323 0.33
324 0.38
325 0.41
326 0.38
327 0.4
328 0.39
329 0.41
330 0.44
331 0.46
332 0.42
333 0.38
334 0.35
335 0.3
336 0.24
337 0.22
338 0.15
339 0.13
340 0.13
341 0.18
342 0.18
343 0.17
344 0.17
345 0.16
346 0.15
347 0.14
348 0.12
349 0.08
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.1
358 0.14
359 0.2
360 0.21
361 0.25
362 0.34
363 0.35
364 0.42
365 0.41
366 0.46
367 0.45
368 0.48
369 0.52
370 0.44
371 0.42
372 0.36
373 0.37
374 0.3
375 0.25
376 0.22
377 0.13
378 0.15
379 0.15
380 0.15
381 0.13
382 0.13
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.1
387 0.11
388 0.1
389 0.11
390 0.11
391 0.12
392 0.15
393 0.16
394 0.15
395 0.13
396 0.14
397 0.17
398 0.16
399 0.15
400 0.13
401 0.13
402 0.14
403 0.15
404 0.13
405 0.12
406 0.13
407 0.12
408 0.13
409 0.16
410 0.18
411 0.25
412 0.33
413 0.38
414 0.44
415 0.48
416 0.48
417 0.48
418 0.53
419 0.55
420 0.58
421 0.62
422 0.64
423 0.7
424 0.78
425 0.85
426 0.89
427 0.89
428 0.89
429 0.9
430 0.91
431 0.89
432 0.84
433 0.8
434 0.73
435 0.64
436 0.54
437 0.45
438 0.36
439 0.28
440 0.23
441 0.17
442 0.13
443 0.11
444 0.1
445 0.08
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.04
452 0.03
453 0.03
454 0.04
455 0.04
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.08
460 0.1
461 0.11
462 0.11
463 0.12
464 0.14
465 0.14
466 0.14
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.12
471 0.11
472 0.1
473 0.09
474 0.11
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.09
481 0.11
482 0.1
483 0.1
484 0.09
485 0.1
486 0.12
487 0.16
488 0.21
489 0.2
490 0.22
491 0.22
492 0.24
493 0.27
494 0.3
495 0.32
496 0.34
497 0.37
498 0.43
499 0.44
500 0.42
501 0.39
502 0.41
503 0.38
504 0.32
505 0.28
506 0.22
507 0.21
508 0.2
509 0.2
510 0.15
511 0.15
512 0.13
513 0.13
514 0.15
515 0.17
516 0.17
517 0.17
518 0.15
519 0.13
520 0.12
521 0.12
522 0.11
523 0.1
524 0.11
525 0.1
526 0.1
527 0.13
528 0.14
529 0.15
530 0.15
531 0.18
532 0.22
533 0.26
534 0.28
535 0.28
536 0.3
537 0.37
538 0.43
539 0.44
540 0.42
541 0.43
542 0.47
543 0.44
544 0.42
545 0.36
546 0.32
547 0.31
548 0.31
549 0.29
550 0.24
551 0.26
552 0.25
553 0.24
554 0.21
555 0.18
556 0.17
557 0.16
558 0.15
559 0.13
560 0.16
561 0.16
562 0.18
563 0.2
564 0.2
565 0.23
566 0.3
567 0.38
568 0.39
569 0.44
570 0.45
571 0.49
572 0.57
573 0.55
574 0.59
575 0.58
576 0.65
577 0.69
578 0.73
579 0.77
580 0.76
581 0.82
582 0.82
583 0.81
584 0.81