Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1XBP9

Protein Details
Accession A0A0D1XBP9    Localization Confidence Low Confidence Score 6.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-35TECIFAKKWTPRPTPKGARPQSDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 9, cyto_nucl 8.333, nucl 6.5, cyto_pero 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR007233  TRAPPC  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:0030008  C:TRAPP complex  
GO:0006888  P:endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04099  Sybindin  
CDD cd14855  TRAPPC1_MUM2  
Amino Acid Sequences MVVYSFYIFDRHTECIFAKKWTPRPTPKGARPQSDASTTLNGEAGLKQLSAADDAKLIFGVIFSLRNMVKKIGGEDNNFISYRTGEYKLHYLETPTRLKFVMLTDTKTSNLRLQLHQIWSMLYVEYVVKNPLSPVEHPGGLGVVNELFEASLDRFVMVSLMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.27
3 0.28
4 0.3
5 0.35
6 0.4
7 0.48
8 0.55
9 0.64
10 0.67
11 0.72
12 0.78
13 0.81
14 0.81
15 0.83
16 0.81
17 0.78
18 0.73
19 0.71
20 0.64
21 0.57
22 0.5
23 0.41
24 0.37
25 0.3
26 0.25
27 0.2
28 0.16
29 0.14
30 0.12
31 0.11
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.05
46 0.04
47 0.05
48 0.04
49 0.05
50 0.05
51 0.08
52 0.08
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.12
58 0.15
59 0.19
60 0.22
61 0.22
62 0.22
63 0.23
64 0.24
65 0.23
66 0.21
67 0.15
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.12
73 0.14
74 0.17
75 0.18
76 0.19
77 0.17
78 0.17
79 0.18
80 0.23
81 0.27
82 0.24
83 0.24
84 0.23
85 0.23
86 0.22
87 0.19
88 0.22
89 0.18
90 0.21
91 0.22
92 0.23
93 0.25
94 0.25
95 0.25
96 0.2
97 0.25
98 0.25
99 0.24
100 0.29
101 0.33
102 0.34
103 0.34
104 0.31
105 0.25
106 0.23
107 0.22
108 0.16
109 0.1
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.13
119 0.15
120 0.16
121 0.2
122 0.22
123 0.22
124 0.22
125 0.22
126 0.19
127 0.15
128 0.14
129 0.1
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.07
137 0.07
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.1