FuNGI

A0A0D2A4J1

Protein Details

Accession

A0A0D2A4J1

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
184-210	AMEPAKKKPDKVKSKDREKRDKLYQYC	Basic
394-416	DRPATPPKDKPRKPPLKPSKIVT	Basic
524-547	MKEPRWRACKRSWKMDLRNESSQH	Hydrophilic
565-584	SQVPCARCRVKMKCRPGGIV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
188-203	AKKKPDKVKSKDREKR
400-414	PKDKPRKPPLKPSKI

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MAPAAKRKQAGVEEQSPISASKNGIKRQKTSISDPTDSIETPPPTPKPATAAKARKPTAAKNATLNGSHSAPNGVAVAGADDVSSGDYAPAVDSPAALMAERNAAREDGDVEGDSGHGGEQSKSTAKLQASTDKPAKTSGSGAQNVFPNGAEASRQGSTRDAMPSTAQLSDSQTIRPTIEQPPAMEPAKKKPDKVKSKDREKRDKLYQYCLKKKPVGEIFSLKELQQANVADDDQDLLDLCQSLVTHFLFTVMTLNRGVLYKTRSYDVAKKLAGFSDNHILIYSLIESSGRAGVWMRPLEIKSGLHTAIVRKAVRELVSAKVVQEIKSAETSKKTYISADVKPDERHIGGGFMDEGKFDEGMINILTYVVTQFLTEKSWAKQDIRISDDALEEDRPATPPKDKPRKPPLKPSKIVTGSADAAAGKPGAKGKATQDRGEIYVAPPPPRERNLYPAWTRNRQALIPQHPHYYSKYPTSIDVMLEINEKKVIKDIVLTLKDTEQLLSKMEFDGYIERIRDYDGNLNMKEPRWRACKRSWKMDLRNESSQHFGSLEPDTKGWLPGNGLSQVPCARCRVKMKCRPGGIVSPEGCVYLDDWLKF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.47
3	0.41
4	0.36
5	0.29
6	0.24
7	0.2
8	0.23
9	0.31
10	0.39
11	0.47
12	0.52
13	0.55
14	0.6
15	0.67
16	0.65
17	0.65
18	0.67
19	0.66
20	0.63
21	0.59
22	0.54
23	0.48
24	0.42
25	0.37
26	0.35
27	0.3
28	0.29
29	0.35
30	0.34
31	0.36
32	0.38
33	0.36
34	0.34
35	0.39
36	0.43
37	0.47
38	0.54
39	0.58
40	0.66
41	0.66
42	0.67
43	0.65
44	0.66
45	0.66
46	0.64
47	0.58
48	0.54
49	0.58
50	0.54
51	0.51
52	0.45
53	0.38
54	0.33
55	0.31
56	0.25
57	0.21
58	0.18
59	0.17
60	0.15
61	0.11
62	0.09
63	0.08
64	0.08
65	0.07
66	0.06
67	0.05
68	0.05
69	0.05
70	0.06
71	0.06
72	0.05
73	0.04
74	0.05
75	0.05
76	0.06
77	0.06
78	0.07
79	0.07
80	0.06
81	0.07
82	0.08
83	0.08
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.14
88	0.14
89	0.15
90	0.15
91	0.15
92	0.16
93	0.16
94	0.17
95	0.12
96	0.13
97	0.12
98	0.11
99	0.1
100	0.1
101	0.09
102	0.07
103	0.06
104	0.06
105	0.07
106	0.07
107	0.08
108	0.11
109	0.14
110	0.15
111	0.17
112	0.21
113	0.2
114	0.24
115	0.27
116	0.33
117	0.34
118	0.4
119	0.44
120	0.4
121	0.4
122	0.39
123	0.37
124	0.3
125	0.3
126	0.28
127	0.3
128	0.33
129	0.33
130	0.33
131	0.34
132	0.33
133	0.3
134	0.24
135	0.17
136	0.13
137	0.13
138	0.1
139	0.08
140	0.11
141	0.12
142	0.13
143	0.13
144	0.14
145	0.15
146	0.17
147	0.19
148	0.16
149	0.16
150	0.17
151	0.17
152	0.17
153	0.17
154	0.15
155	0.13
156	0.15
157	0.17
158	0.17
159	0.17
160	0.17
161	0.17
162	0.18
163	0.18
164	0.18
165	0.2
166	0.24
167	0.24
168	0.24
169	0.26
170	0.3
171	0.3
172	0.3
173	0.27
174	0.32
175	0.41
176	0.42
177	0.44
178	0.49
179	0.58
180	0.65
181	0.72
182	0.73
183	0.73
184	0.82
185	0.86
186	0.87
187	0.87
188	0.84
189	0.83
190	0.82
191	0.82
192	0.74
193	0.76
194	0.73
195	0.72
196	0.75
197	0.72
198	0.68
199	0.63
200	0.61
201	0.6
202	0.6
203	0.53
204	0.47
205	0.46
206	0.42
207	0.41
208	0.4
209	0.31
210	0.28
211	0.25
212	0.21
213	0.2
214	0.18
215	0.15
216	0.15
217	0.15
218	0.11
219	0.1
220	0.1
221	0.06
222	0.06
223	0.05
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.05
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.08
236	0.07
237	0.07
238	0.11
239	0.09
240	0.1
241	0.1
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.11
246	0.1
247	0.13
248	0.14
249	0.16
250	0.17
251	0.18
252	0.21
253	0.28
254	0.3
255	0.32
256	0.3
257	0.29
258	0.29
259	0.28
260	0.26
261	0.19
262	0.17
263	0.18
264	0.17
265	0.16
266	0.16
267	0.15
268	0.13
269	0.13
270	0.11
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.07
281	0.11
282	0.11
283	0.11
284	0.12
285	0.13
286	0.14
287	0.15
288	0.14
289	0.12
290	0.14
291	0.13
292	0.12
293	0.12
294	0.12
295	0.14
296	0.19
297	0.17
298	0.15
299	0.16
300	0.18
301	0.18
302	0.18
303	0.17
304	0.14
305	0.16
306	0.16
307	0.15
308	0.17
309	0.18
310	0.16
311	0.16
312	0.15
313	0.14
314	0.17
315	0.18
316	0.15
317	0.17
318	0.19
319	0.19
320	0.21
321	0.2
322	0.17
323	0.22
324	0.26
325	0.26
326	0.29
327	0.3
328	0.3
329	0.3
330	0.31
331	0.27
332	0.22
333	0.2
334	0.15
335	0.13
336	0.11
337	0.11
338	0.09
339	0.08
340	0.08
341	0.06
342	0.07
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.05
360	0.06
361	0.08
362	0.09
363	0.12
364	0.12
365	0.17
366	0.2
367	0.21
368	0.24
369	0.27
370	0.3
371	0.32
372	0.32
373	0.29
374	0.27
375	0.26
376	0.22
377	0.19
378	0.14
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.12
384	0.13
385	0.17
386	0.24
387	0.35
388	0.46
389	0.5
390	0.59
391	0.68
392	0.77
393	0.78
394	0.82
395	0.83
396	0.82
397	0.82
398	0.76
399	0.75
400	0.67
401	0.63
402	0.53
403	0.46
404	0.36
405	0.31
406	0.28
407	0.17
408	0.14
409	0.13
410	0.11
411	0.07
412	0.07
413	0.1
414	0.11
415	0.12
416	0.14
417	0.2
418	0.3
419	0.34
420	0.35
421	0.35
422	0.35
423	0.36
424	0.35
425	0.29
426	0.2
427	0.22
428	0.23
429	0.22
430	0.23
431	0.25
432	0.29
433	0.32
434	0.38
435	0.35
436	0.39
437	0.44
438	0.48
439	0.49
440	0.53
441	0.57
442	0.57
443	0.56
444	0.55
445	0.51
446	0.44
447	0.46
448	0.47
449	0.49
450	0.5
451	0.51
452	0.51
453	0.49
454	0.51
455	0.48
456	0.45
457	0.4
458	0.37
459	0.38
460	0.34
461	0.35
462	0.36
463	0.33
464	0.27
465	0.25
466	0.2
467	0.17
468	0.2
469	0.18
470	0.15
471	0.17
472	0.17
473	0.15
474	0.19
475	0.19
476	0.15
477	0.17
478	0.22
479	0.27
480	0.29
481	0.3
482	0.28
483	0.28
484	0.3
485	0.27
486	0.23
487	0.17
488	0.16
489	0.17
490	0.16
491	0.16
492	0.15
493	0.15
494	0.14
495	0.12
496	0.14
497	0.15
498	0.18
499	0.18
500	0.18
501	0.18
502	0.2
503	0.2
504	0.2
505	0.25
506	0.27
507	0.32
508	0.32
509	0.35
510	0.36
511	0.37
512	0.41
513	0.37
514	0.39
515	0.42
516	0.48
517	0.52
518	0.59
519	0.68
520	0.68
521	0.76
522	0.78
523	0.79
524	0.83
525	0.87
526	0.87
527	0.83
528	0.83
529	0.75
530	0.67
531	0.62
532	0.52
533	0.44
534	0.34
535	0.27
536	0.22
537	0.24
538	0.26
539	0.23
540	0.22
541	0.24
542	0.24
543	0.27
544	0.25
545	0.21
546	0.2
547	0.21
548	0.25
549	0.24
550	0.24
551	0.22
552	0.26
553	0.29
554	0.29
555	0.28
556	0.31
557	0.31
558	0.38
559	0.47
560	0.53
561	0.59
562	0.67
563	0.75
564	0.78
565	0.8
566	0.79
567	0.75
568	0.73
569	0.68
570	0.66
571	0.57
572	0.5
573	0.45
574	0.39
575	0.34
576	0.25
577	0.2
578	0.17

A0A0D2A4J1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer