Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P87143

Protein Details
Accession P87143    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
336-359QFKPIEVNKKPKKEKRARSSNYIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
344-353KKPKKEKRAR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR001876  Znf_RanBP2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0031445  P:regulation of heterochromatin formation  
GO:0048024  P:regulation of mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG spo:SPAC57A7.13  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS50102  RRM  
PS01358  ZF_RANBP2_1  
PS50199  ZF_RANBP2_2  
CDD cd12313  RRM1_RRM2_RBM5_like  
Amino Acid Sequences MKDYYSENGFEEIFEEKGSTSSNISDNCASRDYDVNISSDNPRLLDSYRPKGNYGRDRNSPLSRHIGVPNQEIILQGLTPEILEEHIELALYATGAKVSTVTLIREKETQKSRCFAFAKFVSLQDSKDWMEANFPTLVIDGIDVSVRFSRAAREQIEGWCCQNCDILNYSYRESCFKCRVPRNQASIAIGNHKISKRNGDMDVSDVPSVYLILRNLDRSLSEETLWKGLSKLEIDVQRVFMIRYKFNDAFCGYAILEFKDVDESAKALMKARTYPGKGFTLASRKVSVDYIHDGVLIPAYTESARWQFPTKTGYLVYWDPELYCSIYVPEGIDTDQFKPIEVNKKPKKEKRARSSNYIDVPASKKVATSLQRWNDAQKELKDNIPDLSEEEEKLLLHFVWKSALICVLCERKFQSWGHVVKHITQSIMHNNNLKNHELVSSAELLMHRVRQTESVDYRDRATERRIVPAASSDTIVEAKKSSQGSSFHSTSNVSMKMLNSMGWNKGSGLGTNENGIKEAIQPTMYLPGVGLGNKGSKIQINMTPVDRVKDRARSLYFQNDKNNNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.1
4 0.11
5 0.13
6 0.13
7 0.13
8 0.15
9 0.2
10 0.21
11 0.25
12 0.29
13 0.29
14 0.3
15 0.31
16 0.29
17 0.26
18 0.3
19 0.29
20 0.3
21 0.29
22 0.27
23 0.26
24 0.28
25 0.28
26 0.28
27 0.26
28 0.21
29 0.2
30 0.21
31 0.22
32 0.29
33 0.34
34 0.38
35 0.44
36 0.46
37 0.48
38 0.52
39 0.61
40 0.62
41 0.64
42 0.63
43 0.63
44 0.69
45 0.73
46 0.75
47 0.68
48 0.62
49 0.6
50 0.54
51 0.51
52 0.48
53 0.48
54 0.44
55 0.45
56 0.41
57 0.34
58 0.33
59 0.29
60 0.25
61 0.18
62 0.14
63 0.1
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.05
80 0.04
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.08
87 0.1
88 0.12
89 0.17
90 0.19
91 0.21
92 0.28
93 0.3
94 0.35
95 0.43
96 0.48
97 0.47
98 0.5
99 0.5
100 0.52
101 0.52
102 0.45
103 0.44
104 0.39
105 0.4
106 0.37
107 0.37
108 0.34
109 0.33
110 0.33
111 0.26
112 0.27
113 0.22
114 0.22
115 0.22
116 0.16
117 0.19
118 0.18
119 0.18
120 0.15
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.08
126 0.08
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.05
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.13
137 0.16
138 0.23
139 0.23
140 0.24
141 0.26
142 0.31
143 0.34
144 0.31
145 0.29
146 0.25
147 0.23
148 0.21
149 0.21
150 0.16
151 0.16
152 0.18
153 0.18
154 0.21
155 0.23
156 0.24
157 0.23
158 0.24
159 0.26
160 0.25
161 0.3
162 0.33
163 0.36
164 0.44
165 0.51
166 0.6
167 0.66
168 0.71
169 0.72
170 0.69
171 0.66
172 0.6
173 0.55
174 0.46
175 0.41
176 0.34
177 0.28
178 0.28
179 0.27
180 0.28
181 0.26
182 0.31
183 0.3
184 0.33
185 0.34
186 0.31
187 0.3
188 0.28
189 0.29
190 0.24
191 0.2
192 0.15
193 0.13
194 0.11
195 0.11
196 0.08
197 0.07
198 0.06
199 0.08
200 0.09
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.16
207 0.15
208 0.15
209 0.16
210 0.16
211 0.18
212 0.18
213 0.15
214 0.11
215 0.11
216 0.12
217 0.1
218 0.1
219 0.13
220 0.16
221 0.19
222 0.19
223 0.19
224 0.18
225 0.18
226 0.17
227 0.16
228 0.16
229 0.16
230 0.17
231 0.24
232 0.25
233 0.25
234 0.28
235 0.25
236 0.23
237 0.21
238 0.2
239 0.13
240 0.12
241 0.13
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.12
256 0.12
257 0.13
258 0.16
259 0.21
260 0.21
261 0.22
262 0.23
263 0.23
264 0.23
265 0.22
266 0.23
267 0.25
268 0.25
269 0.25
270 0.23
271 0.22
272 0.22
273 0.22
274 0.19
275 0.14
276 0.15
277 0.14
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.1
283 0.08
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.06
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.13
294 0.13
295 0.16
296 0.19
297 0.18
298 0.17
299 0.17
300 0.17
301 0.17
302 0.17
303 0.16
304 0.14
305 0.13
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.09
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.08
320 0.09
321 0.11
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.14
326 0.19
327 0.26
328 0.3
329 0.39
330 0.44
331 0.54
332 0.64
333 0.7
334 0.77
335 0.78
336 0.83
337 0.83
338 0.87
339 0.82
340 0.81
341 0.8
342 0.76
343 0.69
344 0.6
345 0.5
346 0.42
347 0.39
348 0.32
349 0.27
350 0.2
351 0.17
352 0.16
353 0.22
354 0.23
355 0.25
356 0.33
357 0.36
358 0.4
359 0.41
360 0.43
361 0.4
362 0.41
363 0.41
364 0.35
365 0.37
366 0.34
367 0.36
368 0.34
369 0.31
370 0.28
371 0.24
372 0.2
373 0.15
374 0.18
375 0.16
376 0.14
377 0.14
378 0.13
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.08
386 0.09
387 0.1
388 0.11
389 0.1
390 0.14
391 0.12
392 0.12
393 0.17
394 0.22
395 0.22
396 0.24
397 0.26
398 0.25
399 0.3
400 0.3
401 0.33
402 0.34
403 0.38
404 0.39
405 0.42
406 0.41
407 0.41
408 0.46
409 0.4
410 0.32
411 0.29
412 0.3
413 0.34
414 0.37
415 0.35
416 0.36
417 0.37
418 0.43
419 0.44
420 0.42
421 0.33
422 0.29
423 0.27
424 0.22
425 0.21
426 0.16
427 0.15
428 0.14
429 0.14
430 0.14
431 0.15
432 0.15
433 0.17
434 0.16
435 0.16
436 0.17
437 0.19
438 0.22
439 0.28
440 0.31
441 0.34
442 0.38
443 0.38
444 0.38
445 0.39
446 0.39
447 0.34
448 0.35
449 0.36
450 0.33
451 0.39
452 0.39
453 0.35
454 0.33
455 0.35
456 0.34
457 0.27
458 0.26
459 0.19
460 0.18
461 0.2
462 0.2
463 0.15
464 0.12
465 0.13
466 0.17
467 0.19
468 0.18
469 0.21
470 0.24
471 0.3
472 0.36
473 0.37
474 0.33
475 0.33
476 0.33
477 0.3
478 0.33
479 0.28
480 0.21
481 0.22
482 0.21
483 0.23
484 0.23
485 0.21
486 0.2
487 0.22
488 0.24
489 0.23
490 0.24
491 0.2
492 0.25
493 0.24
494 0.21
495 0.23
496 0.24
497 0.23
498 0.26
499 0.28
500 0.23
501 0.23
502 0.22
503 0.17
504 0.17
505 0.19
506 0.17
507 0.15
508 0.15
509 0.15
510 0.21
511 0.2
512 0.16
513 0.14
514 0.14
515 0.16
516 0.16
517 0.15
518 0.12
519 0.15
520 0.16
521 0.17
522 0.17
523 0.19
524 0.21
525 0.25
526 0.28
527 0.3
528 0.33
529 0.34
530 0.39
531 0.38
532 0.4
533 0.37
534 0.37
535 0.4
536 0.45
537 0.48
538 0.5
539 0.54
540 0.53
541 0.58
542 0.63
543 0.64
544 0.61
545 0.67