Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53695

Protein Details
Accession P53695    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-103GGPLPCKASTEQKRKERRQEAFELGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 7, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR037315  EXO1_H3TH  
IPR008918  HhH2  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR044752  PIN-like_EXO1  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR019974  XPG_CS  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0072686  C:mitotic spindle  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0035861  C:site of double-strand break  
GO:0035312  F:5'-3' DNA exonuclease activity  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0051908  F:double-stranded DNA 5'-3' exodeoxyribonuclease activity  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000729  P:DNA double-strand break processing  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0043570  P:maintenance of DNA repeat elements  
GO:0000706  P:meiotic DNA double-strand break processing  
GO:0000710  P:meiotic mismatch repair  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0006312  P:mitotic recombination  
GO:1990426  P:mitotic recombination-dependent replication fork processing  
GO:0031297  P:replication fork processing  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
KEGG spo:SPBC29A10.05  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00841  XPG_1  
PS00842  XPG_2  
CDD cd09908  H3TH_EXO1  
cd09857  PIN_EXO1  
Amino Acid Sequences MGIKGLLGLLKPMQKSSHVEEFSGKTLGVDGYVWLHKAVFTCAHELAFNKETDKYLKYAIHQALMLQYYGVKPLIVFDGGPLPCKASTEQKRKERRQEAFELGKKLWDEGKKSQAIMQFSRCVDVTPEMAWKLIIALREHGIESIVAPYEADAQLVYLEKENIIDGIITEDSDMLVFGAQTVLFKMDGFGNCITIRRNDIANAQDLNLRLPIEKLRHMAIFSGCDYTDGVAGMGLKTALRYLQKYPEPRAAIRAMRLDKSLKVPVSFEKEFALADLAFRHQRVYCPKDKTLVHLSPPERELSVHEDAFIGSFFDNQLAIDIAEGRSNPITKCAFDIKDSSMQSFTKTTITISKRKGISKTDISNFFMKSIPPSKRPTKSTSLIDVTNVKVQRTHLANDISSEKQSIKSANEKAYVTPKSNSLKPGFGKSLSDISNSATKNENVPFLPPRTGVSKYFKLQKNTEKEIDEQVPSQSNNTTPTSAKSDSASPQNWFSSFSYQTPNSASPPFSSLSHTLPISALAKIGHDALNRKNHASLPSRRIVYKPPSSPSTPISMNPRPKGILSLQQYKFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.33
3 0.38
4 0.44
5 0.4
6 0.4
7 0.43
8 0.44
9 0.42
10 0.38
11 0.31
12 0.21
13 0.21
14 0.19
15 0.15
16 0.12
17 0.09
18 0.12
19 0.14
20 0.15
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.18
26 0.19
27 0.2
28 0.23
29 0.24
30 0.25
31 0.25
32 0.25
33 0.28
34 0.26
35 0.25
36 0.22
37 0.23
38 0.25
39 0.28
40 0.29
41 0.25
42 0.27
43 0.29
44 0.31
45 0.38
46 0.38
47 0.36
48 0.34
49 0.32
50 0.31
51 0.29
52 0.25
53 0.16
54 0.15
55 0.13
56 0.15
57 0.14
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.17
66 0.18
67 0.2
68 0.19
69 0.19
70 0.18
71 0.21
72 0.22
73 0.25
74 0.36
75 0.44
76 0.54
77 0.62
78 0.73
79 0.81
80 0.89
81 0.88
82 0.86
83 0.83
84 0.81
85 0.8
86 0.79
87 0.75
88 0.69
89 0.58
90 0.54
91 0.46
92 0.4
93 0.38
94 0.32
95 0.33
96 0.35
97 0.44
98 0.43
99 0.43
100 0.45
101 0.43
102 0.44
103 0.42
104 0.4
105 0.37
106 0.34
107 0.36
108 0.32
109 0.28
110 0.25
111 0.23
112 0.19
113 0.15
114 0.18
115 0.16
116 0.16
117 0.15
118 0.13
119 0.12
120 0.12
121 0.14
122 0.12
123 0.13
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.14
128 0.13
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.06
135 0.07
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.09
174 0.1
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.14
179 0.16
180 0.17
181 0.15
182 0.17
183 0.16
184 0.17
185 0.16
186 0.2
187 0.2
188 0.22
189 0.21
190 0.18
191 0.19
192 0.18
193 0.18
194 0.15
195 0.14
196 0.1
197 0.11
198 0.15
199 0.15
200 0.18
201 0.19
202 0.2
203 0.2
204 0.2
205 0.21
206 0.18
207 0.17
208 0.15
209 0.15
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.09
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.06
226 0.08
227 0.1
228 0.13
229 0.2
230 0.25
231 0.3
232 0.33
233 0.38
234 0.39
235 0.37
236 0.39
237 0.36
238 0.32
239 0.31
240 0.33
241 0.29
242 0.27
243 0.28
244 0.26
245 0.23
246 0.25
247 0.27
248 0.22
249 0.2
250 0.21
251 0.22
252 0.28
253 0.26
254 0.23
255 0.2
256 0.19
257 0.18
258 0.17
259 0.15
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.09
268 0.13
269 0.21
270 0.26
271 0.32
272 0.37
273 0.38
274 0.43
275 0.42
276 0.43
277 0.44
278 0.4
279 0.35
280 0.37
281 0.37
282 0.33
283 0.34
284 0.29
285 0.21
286 0.19
287 0.18
288 0.18
289 0.2
290 0.17
291 0.16
292 0.16
293 0.15
294 0.15
295 0.13
296 0.07
297 0.04
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.04
303 0.05
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.09
314 0.09
315 0.13
316 0.14
317 0.14
318 0.17
319 0.21
320 0.2
321 0.21
322 0.23
323 0.21
324 0.27
325 0.27
326 0.25
327 0.23
328 0.22
329 0.22
330 0.2
331 0.19
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.19
336 0.24
337 0.29
338 0.32
339 0.37
340 0.4
341 0.44
342 0.47
343 0.44
344 0.46
345 0.46
346 0.5
347 0.49
348 0.49
349 0.47
350 0.46
351 0.41
352 0.36
353 0.29
354 0.22
355 0.22
356 0.26
357 0.28
358 0.3
359 0.36
360 0.44
361 0.5
362 0.55
363 0.56
364 0.56
365 0.57
366 0.56
367 0.56
368 0.5
369 0.44
370 0.41
371 0.37
372 0.31
373 0.31
374 0.27
375 0.21
376 0.2
377 0.2
378 0.24
379 0.25
380 0.25
381 0.25
382 0.26
383 0.26
384 0.27
385 0.3
386 0.25
387 0.22
388 0.22
389 0.17
390 0.17
391 0.18
392 0.19
393 0.19
394 0.26
395 0.3
396 0.34
397 0.37
398 0.35
399 0.36
400 0.41
401 0.41
402 0.36
403 0.32
404 0.34
405 0.35
406 0.38
407 0.42
408 0.37
409 0.4
410 0.39
411 0.44
412 0.4
413 0.37
414 0.35
415 0.31
416 0.34
417 0.29
418 0.28
419 0.22
420 0.21
421 0.26
422 0.25
423 0.24
424 0.22
425 0.21
426 0.24
427 0.26
428 0.27
429 0.21
430 0.25
431 0.28
432 0.27
433 0.29
434 0.25
435 0.26
436 0.27
437 0.3
438 0.32
439 0.35
440 0.38
441 0.4
442 0.49
443 0.53
444 0.56
445 0.6
446 0.64
447 0.65
448 0.66
449 0.66
450 0.59
451 0.56
452 0.56
453 0.52
454 0.44
455 0.37
456 0.32
457 0.31
458 0.29
459 0.28
460 0.22
461 0.21
462 0.23
463 0.24
464 0.24
465 0.21
466 0.24
467 0.29
468 0.29
469 0.29
470 0.27
471 0.28
472 0.3
473 0.37
474 0.36
475 0.32
476 0.34
477 0.36
478 0.34
479 0.34
480 0.31
481 0.3
482 0.3
483 0.3
484 0.34
485 0.32
486 0.34
487 0.34
488 0.34
489 0.31
490 0.31
491 0.3
492 0.24
493 0.26
494 0.26
495 0.23
496 0.26
497 0.25
498 0.25
499 0.28
500 0.26
501 0.24
502 0.22
503 0.25
504 0.21
505 0.18
506 0.16
507 0.13
508 0.13
509 0.13
510 0.15
511 0.15
512 0.17
513 0.22
514 0.28
515 0.38
516 0.4
517 0.41
518 0.41
519 0.42
520 0.46
521 0.5
522 0.52
523 0.5
524 0.56
525 0.57
526 0.57
527 0.56
528 0.58
529 0.58
530 0.58
531 0.57
532 0.56
533 0.59
534 0.61
535 0.62
536 0.56
537 0.53
538 0.46
539 0.44
540 0.47
541 0.5
542 0.55
543 0.55
544 0.56
545 0.52
546 0.5
547 0.51
548 0.47
549 0.46
550 0.45
551 0.51