Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q9P7M1

Protein Details
Accession Q9P7M1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-43MNNLKSSPKNKDSEKRINNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-259PRKGGPRSGVGSRKRKRATVSRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0033698  C:Rpd3L complex  
GO:0070822  C:Sin3-type complex  
GO:0042826  F:histone deacetylase binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG spo:SPBC21C3.02c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MTENLQSESIPHEILPKEPFDLPMNNLKSSPKNKDSEKRINNSIAESEQVVDSALSNPETNANEDIIAPQLPSQNSEIIEKNSPVNKLNSSTSLTTHQLASLPKLEVTDHDNVSEAETVVLNEDEEKETSLVGSVSVTEDLGDSSAIGRTILVNNSVEPQMENTANITIVSPSLKESDFESEEKATNDNNGLIETNHNSKLEESSEHEEEEDEESNIERTEDSDHQIPQRGGTLEAPRKGGPRSGVGSRKRKRATVSRKWSTNSESKIKRVALETSQEESDREIADRRSASEQAHEADDEKAIKRKEAFDALLNIETEFTFLRNRLYGKKLLKLNEHEEMIQNETHERFNACIDLITERRDDRVRLATENLMKQLGNIKNVMDYVTKQRKYQLLFDKRRIRQALLTKIATKCFQLLNKQKSVHDPTYITQKTMSYRQSALLQKQRIEYEAAVLCELNSFAGFPTAPIIETASFDDIRNDLLEMGCLSENQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.25
3 0.24
4 0.25
5 0.26
6 0.29
7 0.27
8 0.3
9 0.3
10 0.36
11 0.38
12 0.36
13 0.37
14 0.39
15 0.43
16 0.48
17 0.54
18 0.52
19 0.56
20 0.64
21 0.72
22 0.78
23 0.8
24 0.81
25 0.78
26 0.77
27 0.76
28 0.68
29 0.62
30 0.55
31 0.45
32 0.37
33 0.31
34 0.25
35 0.18
36 0.16
37 0.13
38 0.1
39 0.09
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.12
45 0.16
46 0.17
47 0.19
48 0.19
49 0.18
50 0.17
51 0.17
52 0.17
53 0.14
54 0.13
55 0.11
56 0.11
57 0.16
58 0.15
59 0.18
60 0.19
61 0.2
62 0.21
63 0.24
64 0.25
65 0.24
66 0.27
67 0.26
68 0.3
69 0.31
70 0.32
71 0.32
72 0.32
73 0.32
74 0.32
75 0.34
76 0.32
77 0.32
78 0.31
79 0.3
80 0.3
81 0.3
82 0.27
83 0.25
84 0.22
85 0.21
86 0.21
87 0.22
88 0.21
89 0.2
90 0.19
91 0.19
92 0.18
93 0.17
94 0.2
95 0.23
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.19
100 0.2
101 0.19
102 0.14
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.11
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.06
127 0.05
128 0.06
129 0.05
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.09
138 0.09
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.13
143 0.14
144 0.12
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.09
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.07
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.15
165 0.17
166 0.17
167 0.18
168 0.18
169 0.19
170 0.19
171 0.19
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.12
182 0.14
183 0.15
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.17
188 0.16
189 0.15
190 0.16
191 0.19
192 0.2
193 0.19
194 0.19
195 0.17
196 0.17
197 0.17
198 0.14
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.05
206 0.05
207 0.09
208 0.1
209 0.13
210 0.15
211 0.16
212 0.18
213 0.22
214 0.21
215 0.17
216 0.19
217 0.17
218 0.16
219 0.17
220 0.23
221 0.23
222 0.25
223 0.27
224 0.24
225 0.26
226 0.25
227 0.25
228 0.19
229 0.18
230 0.19
231 0.23
232 0.3
233 0.37
234 0.47
235 0.5
236 0.57
237 0.56
238 0.56
239 0.56
240 0.59
241 0.62
242 0.62
243 0.67
244 0.65
245 0.67
246 0.66
247 0.63
248 0.57
249 0.53
250 0.47
251 0.46
252 0.42
253 0.4
254 0.43
255 0.41
256 0.38
257 0.33
258 0.3
259 0.24
260 0.26
261 0.26
262 0.23
263 0.23
264 0.22
265 0.2
266 0.18
267 0.16
268 0.12
269 0.1
270 0.11
271 0.11
272 0.14
273 0.14
274 0.16
275 0.17
276 0.19
277 0.19
278 0.19
279 0.2
280 0.18
281 0.18
282 0.16
283 0.14
284 0.13
285 0.14
286 0.13
287 0.13
288 0.17
289 0.16
290 0.18
291 0.19
292 0.21
293 0.23
294 0.26
295 0.26
296 0.23
297 0.26
298 0.26
299 0.25
300 0.23
301 0.19
302 0.15
303 0.14
304 0.12
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.1
310 0.12
311 0.14
312 0.18
313 0.23
314 0.29
315 0.32
316 0.38
317 0.42
318 0.44
319 0.49
320 0.49
321 0.5
322 0.47
323 0.44
324 0.38
325 0.35
326 0.32
327 0.28
328 0.22
329 0.18
330 0.16
331 0.16
332 0.16
333 0.15
334 0.14
335 0.12
336 0.13
337 0.14
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.14
342 0.15
343 0.17
344 0.18
345 0.17
346 0.21
347 0.23
348 0.23
349 0.23
350 0.29
351 0.29
352 0.29
353 0.32
354 0.34
355 0.37
356 0.38
357 0.35
358 0.28
359 0.25
360 0.24
361 0.3
362 0.28
363 0.24
364 0.23
365 0.22
366 0.22
367 0.22
368 0.23
369 0.16
370 0.15
371 0.24
372 0.33
373 0.35
374 0.34
375 0.4
376 0.44
377 0.46
378 0.53
379 0.53
380 0.54
381 0.61
382 0.7
383 0.74
384 0.73
385 0.79
386 0.73
387 0.65
388 0.62
389 0.63
390 0.63
391 0.59
392 0.59
393 0.55
394 0.54
395 0.54
396 0.48
397 0.39
398 0.33
399 0.3
400 0.32
401 0.36
402 0.44
403 0.49
404 0.55
405 0.57
406 0.57
407 0.61
408 0.65
409 0.58
410 0.53
411 0.47
412 0.42
413 0.5
414 0.49
415 0.41
416 0.34
417 0.33
418 0.33
419 0.38
420 0.39
421 0.33
422 0.33
423 0.35
424 0.41
425 0.46
426 0.5
427 0.52
428 0.53
429 0.52
430 0.55
431 0.54
432 0.48
433 0.44
434 0.36
435 0.33
436 0.31
437 0.28
438 0.24
439 0.22
440 0.2
441 0.17
442 0.17
443 0.11
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.09
448 0.09
449 0.08
450 0.11
451 0.11
452 0.11
453 0.11
454 0.14
455 0.12
456 0.14
457 0.16
458 0.18
459 0.18
460 0.18
461 0.2
462 0.18
463 0.19
464 0.18
465 0.16
466 0.13
467 0.12
468 0.13
469 0.11
470 0.13
471 0.12