Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12381

Protein Details
Accession Q12381    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
95-121SVEEHLSKRRKSQREKQEQLQKEKYEKHydrophilic
149-173PEPGDLTRKKRTKQPRRERFYATSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
157-164KKRTKQPR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.333, cyto 4, cyto_mito 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000244  P:spliceosomal tri-snRNP complex assembly  
KEGG spo:SPBC6B1.07  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13181  TPR_8  
Amino Acid Sequences MANFYPDFLNMQPPPNYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAQELPSQESIKAAIEQRKSEIEEEEDIDPRYQDPDNEVALFATAPYDHEDEEADKIYQSVEEHLSKRRKSQREKQEQLQKEKYEKENPKVSSQFADLKRGLSTLTDEDWNNIPEPGDLTRKKRTKQPRRERFYATSDFVLASARNENQAISNFAVDTQAGTETPDMNGTKTNFVEIGAARDKVLGIKLAQASSNLTSPSTIDPKGYLTSLNSMVPKNANDLGDIRKARKLLQSVIETNPKHASGWVAAARLEEVANKLSQAQSLILKGCENCSRSEDVWLEAIRLHPAAEAKVIIANAVKKLPKSVTLWLEAEKLENQAQHKKRIIKKALEFNPTSVSLWKEAVNLEEEVDNARILLARAVELIPMSIDLWLALARLETYENAKKVLNKARQTIRTSHEVWIAAARLEEQQGNVSRVEKIMARGVSELQATGGMLQRDQWLSEAEKCETEGAVITAQAIINTCLGVGLDEEDQFDTWLDDAQSFIARKCIDCARAVFAFSLRVYPKSEKLWLRAVELEKLYGTTESVCSILEKAVESCPKAEILWLLYAKERKNVNDIAGARNILGRAFEYNSNSEEIWLAAVRIEFVNNENERARKLLARARIESGTERIWTKSISLERILDEKDRALQLLENALKIYPHYDKLYMMKGQIFEDKEQIELARDAYLAGTKVCPYSIPLWLLLAKLEEKQSVIRARVVFDRAKVKNPKNEFLWLELIKMELRAGNISQVRAALAKALQECPSSGLLWTEAIWLEPRAQRKTRATDALRKCEGNAHLLCTIARMLWLEKKADKARSWFLKAVKADQDNGDVWCWFYKYSLEAGNEDQQKEVLTSFETADPHHGYFWPSITKDIKNSRKTPQELLHLAINVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.31
4 0.24
5 0.24
6 0.21
7 0.2
8 0.19
9 0.16
10 0.15
11 0.15
12 0.15
13 0.14
14 0.12
15 0.11
16 0.15
17 0.15
18 0.16
19 0.19
20 0.2
21 0.21
22 0.25
23 0.24
24 0.23
25 0.24
26 0.24
27 0.24
28 0.28
29 0.27
30 0.22
31 0.22
32 0.21
33 0.2
34 0.24
35 0.27
36 0.29
37 0.33
38 0.35
39 0.38
40 0.41
41 0.42
42 0.39
43 0.36
44 0.32
45 0.3
46 0.31
47 0.3
48 0.28
49 0.27
50 0.26
51 0.23
52 0.2
53 0.2
54 0.18
55 0.17
56 0.19
57 0.22
58 0.23
59 0.24
60 0.23
61 0.2
62 0.19
63 0.17
64 0.13
65 0.09
66 0.07
67 0.07
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.13
72 0.14
73 0.15
74 0.17
75 0.19
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.13
82 0.14
83 0.17
84 0.22
85 0.25
86 0.34
87 0.42
88 0.43
89 0.52
90 0.59
91 0.64
92 0.69
93 0.77
94 0.79
95 0.82
96 0.88
97 0.88
98 0.88
99 0.87
100 0.87
101 0.85
102 0.8
103 0.76
104 0.75
105 0.73
106 0.73
107 0.72
108 0.7
109 0.7
110 0.67
111 0.69
112 0.64
113 0.59
114 0.52
115 0.47
116 0.48
117 0.42
118 0.46
119 0.38
120 0.36
121 0.35
122 0.32
123 0.27
124 0.19
125 0.21
126 0.16
127 0.17
128 0.19
129 0.19
130 0.21
131 0.24
132 0.24
133 0.21
134 0.19
135 0.17
136 0.14
137 0.16
138 0.17
139 0.23
140 0.27
141 0.32
142 0.42
143 0.49
144 0.52
145 0.6
146 0.68
147 0.7
148 0.76
149 0.82
150 0.82
151 0.84
152 0.88
153 0.86
154 0.81
155 0.78
156 0.73
157 0.65
158 0.55
159 0.46
160 0.4
161 0.31
162 0.26
163 0.19
164 0.14
165 0.15
166 0.14
167 0.15
168 0.15
169 0.15
170 0.17
171 0.18
172 0.19
173 0.16
174 0.16
175 0.14
176 0.14
177 0.14
178 0.11
179 0.1
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.13
188 0.13
189 0.13
190 0.17
191 0.18
192 0.21
193 0.2
194 0.21
195 0.17
196 0.17
197 0.19
198 0.15
199 0.2
200 0.18
201 0.19
202 0.17
203 0.18
204 0.17
205 0.15
206 0.16
207 0.12
208 0.09
209 0.14
210 0.16
211 0.16
212 0.17
213 0.16
214 0.17
215 0.17
216 0.19
217 0.14
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.16
222 0.18
223 0.17
224 0.16
225 0.16
226 0.18
227 0.19
228 0.18
229 0.15
230 0.13
231 0.16
232 0.17
233 0.18
234 0.19
235 0.18
236 0.19
237 0.2
238 0.2
239 0.2
240 0.21
241 0.19
242 0.18
243 0.2
244 0.22
245 0.27
246 0.29
247 0.27
248 0.27
249 0.28
250 0.3
251 0.33
252 0.33
253 0.3
254 0.35
255 0.38
256 0.38
257 0.42
258 0.47
259 0.41
260 0.4
261 0.38
262 0.31
263 0.26
264 0.23
265 0.2
266 0.13
267 0.18
268 0.17
269 0.15
270 0.15
271 0.15
272 0.15
273 0.13
274 0.12
275 0.09
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.14
290 0.13
291 0.16
292 0.19
293 0.19
294 0.18
295 0.2
296 0.24
297 0.23
298 0.28
299 0.25
300 0.21
301 0.23
302 0.22
303 0.19
304 0.16
305 0.16
306 0.12
307 0.11
308 0.1
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.13
322 0.14
323 0.13
324 0.16
325 0.16
326 0.19
327 0.21
328 0.25
329 0.25
330 0.28
331 0.29
332 0.27
333 0.28
334 0.24
335 0.22
336 0.17
337 0.16
338 0.14
339 0.15
340 0.17
341 0.25
342 0.28
343 0.34
344 0.39
345 0.46
346 0.51
347 0.59
348 0.63
349 0.62
350 0.65
351 0.68
352 0.69
353 0.66
354 0.6
355 0.51
356 0.47
357 0.4
358 0.34
359 0.25
360 0.19
361 0.15
362 0.15
363 0.15
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.12
368 0.11
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.04
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.09
403 0.13
404 0.13
405 0.15
406 0.16
407 0.17
408 0.23
409 0.32
410 0.35
411 0.35
412 0.42
413 0.48
414 0.53
415 0.54
416 0.53
417 0.47
418 0.44
419 0.43
420 0.38
421 0.34
422 0.28
423 0.25
424 0.21
425 0.18
426 0.13
427 0.1
428 0.09
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.07
433 0.09
434 0.11
435 0.12
436 0.12
437 0.12
438 0.11
439 0.11
440 0.12
441 0.1
442 0.1
443 0.12
444 0.12
445 0.12
446 0.12
447 0.12
448 0.13
449 0.12
450 0.1
451 0.06
452 0.06
453 0.05
454 0.06
455 0.07
456 0.06
457 0.06
458 0.07
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.08
464 0.1
465 0.13
466 0.15
467 0.14
468 0.14
469 0.14
470 0.14
471 0.12
472 0.1
473 0.07
474 0.06
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.03
490 0.04
491 0.05
492 0.05
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.11
509 0.12
510 0.12
511 0.15
512 0.18
513 0.17
514 0.18
515 0.2
516 0.2
517 0.2
518 0.2
519 0.18
520 0.15
521 0.15
522 0.13
523 0.16
524 0.13
525 0.14
526 0.17
527 0.19
528 0.22
529 0.23
530 0.3
531 0.29
532 0.31
533 0.37
534 0.35
535 0.34
536 0.36
537 0.34
538 0.31
539 0.29
540 0.25
541 0.18
542 0.17
543 0.15
544 0.11
545 0.09
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.08
557 0.12
558 0.14
559 0.14
560 0.14
561 0.14
562 0.14
563 0.13
564 0.13
565 0.1
566 0.1
567 0.13
568 0.13
569 0.13
570 0.16
571 0.2
572 0.2
573 0.25
574 0.26
575 0.23
576 0.28
577 0.29
578 0.27
579 0.3
580 0.31
581 0.28
582 0.27
583 0.26
584 0.21
585 0.2
586 0.18
587 0.12
588 0.11
589 0.08
590 0.08
591 0.1
592 0.13
593 0.14
594 0.15
595 0.17
596 0.18
597 0.17
598 0.15
599 0.14
600 0.11
601 0.1
602 0.08
603 0.07
604 0.06
605 0.06
606 0.07
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.08
611 0.15
612 0.15
613 0.18
614 0.19
615 0.2
616 0.21
617 0.22
618 0.22
619 0.18
620 0.22
621 0.25
622 0.31
623 0.36
624 0.37
625 0.39
626 0.38
627 0.37
628 0.34
629 0.32
630 0.25
631 0.22
632 0.21
633 0.18
634 0.18
635 0.17
636 0.15
637 0.19
638 0.21
639 0.22
640 0.23
641 0.23
642 0.23
643 0.26
644 0.27
645 0.23
646 0.21
647 0.19
648 0.2
649 0.19
650 0.18
651 0.15
652 0.14
653 0.13
654 0.2
655 0.2
656 0.17
657 0.17
658 0.16
659 0.16
660 0.15
661 0.18
662 0.13
663 0.16
664 0.18
665 0.18
666 0.21
667 0.24
668 0.29
669 0.27
670 0.26
671 0.25
672 0.24
673 0.25
674 0.28
675 0.27
676 0.24
677 0.26
678 0.24
679 0.21
680 0.21
681 0.19
682 0.16
683 0.14
684 0.14
685 0.1
686 0.1
687 0.1
688 0.09
689 0.11
690 0.09
691 0.09
692 0.09
693 0.09
694 0.1
695 0.1
696 0.1
697 0.11
698 0.14
699 0.17
700 0.18
701 0.17
702 0.18
703 0.19
704 0.19
705 0.17
706 0.16
707 0.12
708 0.13
709 0.15
710 0.14
711 0.14
712 0.16
713 0.22
714 0.25
715 0.26
716 0.29
717 0.28
718 0.3
719 0.33
720 0.36
721 0.33
722 0.32
723 0.4
724 0.37
725 0.45
726 0.53
727 0.55
728 0.6
729 0.64
730 0.65
731 0.59
732 0.64
733 0.57
734 0.51
735 0.51
736 0.42
737 0.36
738 0.3
739 0.28
740 0.21
741 0.19
742 0.16
743 0.1
744 0.11
745 0.12
746 0.12
747 0.17
748 0.19
749 0.19
750 0.19
751 0.18
752 0.18
753 0.17
754 0.16
755 0.12
756 0.11
757 0.14
758 0.16
759 0.18
760 0.2
761 0.2
762 0.2
763 0.2
764 0.21
765 0.17
766 0.15
767 0.14
768 0.13
769 0.13
770 0.12
771 0.11
772 0.1
773 0.1
774 0.12
775 0.11
776 0.16
777 0.19
778 0.26
779 0.32
780 0.36
781 0.43
782 0.5
783 0.57
784 0.6
785 0.66
786 0.66
787 0.69
788 0.74
789 0.75
790 0.71
791 0.64
792 0.57
793 0.54
794 0.49
795 0.47
796 0.39
797 0.34
798 0.3
799 0.3
800 0.29
801 0.23
802 0.22
803 0.14
804 0.13
805 0.11
806 0.14
807 0.19
808 0.23
809 0.26
810 0.28
811 0.37
812 0.43
813 0.49
814 0.5
815 0.5
816 0.57
817 0.61
818 0.65
819 0.62
820 0.58
821 0.59
822 0.57
823 0.57
824 0.56
825 0.5
826 0.47
827 0.43
828 0.44
829 0.37
830 0.36
831 0.31
832 0.22
833 0.21
834 0.2
835 0.18
836 0.15
837 0.14
838 0.15
839 0.15
840 0.19
841 0.24
842 0.24
843 0.26
844 0.3
845 0.37
846 0.41
847 0.39
848 0.36
849 0.3
850 0.28
851 0.27
852 0.23
853 0.16
854 0.12
855 0.13
856 0.14
857 0.17
858 0.17
859 0.17
860 0.23
861 0.25
862 0.24
863 0.24
864 0.23
865 0.23
866 0.25
867 0.27
868 0.28
869 0.25
870 0.31
871 0.35
872 0.38
873 0.44
874 0.52
875 0.59
876 0.61
877 0.66
878 0.69
879 0.74
880 0.75
881 0.74
882 0.71
883 0.71
884 0.65
885 0.63
886 0.58