Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2AJF1

Protein Details
Accession A0A0D2AJF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-373PTSTTGEGLKKRRKSKAPITPGTMKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
356-365LKKRRKSKAP
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MSDEPLEDTLWVFPPEYYPWLDGINHEQHFPTPGINAENVHLVFNLSPFCTSESANKRFEMLVNRKPELLPRYFNREAFEQEIAEFPGDSFVIVAGPRKTPKNGEEPNLLWVVERRYTVLDRGAIEESEKKVVEVRGHYVIVADRIFAAPTLMDIVQSRWTASMLHLSTFYRTASSLPIYSIEKGYSYLAADQMKKPGKGGSFATSALGSARTSRAASPVAGDDTSSLPNTHHQTHRELNDDAQIAHSFNLTLSYSDEFMDENPLVGEPGSFKLTATGRSIREREAKERAAEEAREKARSEFTNKSEIGDSQRISVAPSSPSALGAKTNHLERKGTGLNSVVGKGKSPTSTTGEGLKKRRKSKAPITPGTMKSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.21
4 0.21
5 0.2
6 0.2
7 0.22
8 0.22
9 0.22
10 0.26
11 0.32
12 0.3
13 0.29
14 0.29
15 0.27
16 0.3
17 0.28
18 0.22
19 0.15
20 0.17
21 0.18
22 0.19
23 0.19
24 0.17
25 0.21
26 0.2
27 0.19
28 0.17
29 0.16
30 0.14
31 0.15
32 0.15
33 0.11
34 0.11
35 0.12
36 0.14
37 0.15
38 0.16
39 0.24
40 0.31
41 0.37
42 0.39
43 0.38
44 0.38
45 0.37
46 0.4
47 0.41
48 0.4
49 0.42
50 0.46
51 0.47
52 0.46
53 0.46
54 0.48
55 0.45
56 0.41
57 0.41
58 0.38
59 0.47
60 0.49
61 0.51
62 0.47
63 0.43
64 0.41
65 0.38
66 0.35
67 0.26
68 0.23
69 0.22
70 0.2
71 0.17
72 0.13
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.06
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.1
82 0.1
83 0.14
84 0.18
85 0.21
86 0.23
87 0.27
88 0.31
89 0.38
90 0.42
91 0.43
92 0.46
93 0.44
94 0.44
95 0.4
96 0.36
97 0.26
98 0.23
99 0.21
100 0.18
101 0.17
102 0.15
103 0.17
104 0.18
105 0.2
106 0.2
107 0.19
108 0.18
109 0.2
110 0.2
111 0.17
112 0.17
113 0.19
114 0.17
115 0.18
116 0.17
117 0.14
118 0.17
119 0.19
120 0.21
121 0.2
122 0.22
123 0.22
124 0.22
125 0.22
126 0.19
127 0.17
128 0.16
129 0.14
130 0.1
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.04
137 0.04
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.16
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.15
156 0.15
157 0.14
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.11
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.1
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.12
178 0.13
179 0.13
180 0.2
181 0.23
182 0.22
183 0.22
184 0.23
185 0.21
186 0.22
187 0.23
188 0.2
189 0.18
190 0.18
191 0.18
192 0.15
193 0.14
194 0.12
195 0.11
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.13
217 0.17
218 0.21
219 0.24
220 0.25
221 0.3
222 0.36
223 0.39
224 0.39
225 0.36
226 0.32
227 0.32
228 0.3
229 0.24
230 0.2
231 0.18
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.08
236 0.07
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.09
246 0.09
247 0.12
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.06
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.13
261 0.15
262 0.17
263 0.21
264 0.24
265 0.26
266 0.32
267 0.34
268 0.35
269 0.42
270 0.44
271 0.46
272 0.48
273 0.49
274 0.45
275 0.45
276 0.44
277 0.4
278 0.38
279 0.34
280 0.35
281 0.34
282 0.34
283 0.34
284 0.32
285 0.34
286 0.35
287 0.38
288 0.37
289 0.38
290 0.44
291 0.43
292 0.43
293 0.38
294 0.37
295 0.38
296 0.36
297 0.33
298 0.27
299 0.28
300 0.26
301 0.26
302 0.26
303 0.21
304 0.16
305 0.17
306 0.18
307 0.16
308 0.18
309 0.17
310 0.16
311 0.18
312 0.18
313 0.23
314 0.24
315 0.31
316 0.34
317 0.36
318 0.37
319 0.34
320 0.4
321 0.4
322 0.37
323 0.33
324 0.3
325 0.31
326 0.3
327 0.32
328 0.29
329 0.23
330 0.24
331 0.24
332 0.26
333 0.25
334 0.26
335 0.28
336 0.29
337 0.32
338 0.33
339 0.39
340 0.44
341 0.49
342 0.56
343 0.61
344 0.64
345 0.7
346 0.78
347 0.79
348 0.81
349 0.84
350 0.85
351 0.86
352 0.86
353 0.85
354 0.84