Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P52890

Protein Details
Accession P52890    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
479-505LERNRQAALKCRQRKKQWLSNLQAKVEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004827  bZIP  
IPR046347  bZIP_sf  
IPR021755  TF_Aft1_HRA  
IPR020956  TF_Aft1_OSM  
Gene Ontology GO:1990243  C:atf1-pcr1 complex  
GO:0000785  C:chromatin  
GO:0000792  C:heterochromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0010844  F:recombination hotspot binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0010846  P:activation of reciprocal meiotic recombination  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0110034  P:negative regulation of adenylate cyclase-activating glucose-activated G protein-coupled receptor signaling pathway  
GO:0060195  P:negative regulation of antisense RNA transcription  
GO:0045128  P:negative regulation of reciprocal meiotic recombination  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0007131  P:reciprocal meiotic recombination  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF11786  Aft1_HRA  
PF11785  Aft1_OSA  
PF00170  bZIP_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50217  BZIP  
CDD cd14687  bZIP_ATF2  
Amino Acid Sequences MSPSPVNTSTEPASVAAVSNGNATASSTQVPENNQSDSFAPPSNNSQQNQQSSTIAPNGGAGSVANANPADQSDGVTPSFVGSLKLDYEPNPFEHSFGSTASVGQGNPSLNRNPSLSNIPSGVPPAFARTLLPPVSSIASPDILSGAPGIASPLGYPAWSAFTRGTMHNPLSPAIYDATLRPDYLNNPSDASAAARFSSGTGFTPGVNEPFRSLLTPTGAGFPAPSPGTANLLGFHTFDSQFPDQYRFTPRDGKPPVVNGTNGDQSDYFGANAAVHGLCLLSQVPDQQQKLQQPISSENDQAASTTANNLLKQTQQQTFPDSIRPSFTQNTNPQAVTGTMNPQASRTQQQPMYFMGSQQFNGMPSVYGDTVNPADPSLTLRQTTDFSGQNAENGSTNLPQKTSNSDMPTANSMPVKLENGTDYSTSQEPSSNANNQSSPTSSINGKASSESANGTSYSKGSSRRNSKNETDEEKRKSFLERNRQAALKCRQRKKQWLSNLQAKVEFYGNENEILSAQVSALREEIVSLKTLLIAHKDCPVAKSNSAAVATSVIGSGDLAQRINLGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.14
4 0.13
5 0.12
6 0.12
7 0.12
8 0.11
9 0.1
10 0.11
11 0.1
12 0.11
13 0.12
14 0.12
15 0.14
16 0.18
17 0.21
18 0.27
19 0.28
20 0.3
21 0.29
22 0.29
23 0.28
24 0.29
25 0.29
26 0.25
27 0.24
28 0.23
29 0.3
30 0.37
31 0.42
32 0.4
33 0.46
34 0.5
35 0.55
36 0.56
37 0.51
38 0.45
39 0.4
40 0.42
41 0.37
42 0.29
43 0.22
44 0.2
45 0.18
46 0.16
47 0.14
48 0.1
49 0.09
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.12
58 0.1
59 0.12
60 0.12
61 0.15
62 0.15
63 0.14
64 0.14
65 0.12
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.09
70 0.11
71 0.13
72 0.14
73 0.16
74 0.16
75 0.21
76 0.22
77 0.23
78 0.28
79 0.26
80 0.25
81 0.25
82 0.25
83 0.21
84 0.19
85 0.2
86 0.14
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.13
91 0.12
92 0.15
93 0.13
94 0.15
95 0.19
96 0.21
97 0.21
98 0.24
99 0.24
100 0.23
101 0.25
102 0.3
103 0.28
104 0.26
105 0.26
106 0.24
107 0.23
108 0.24
109 0.21
110 0.16
111 0.14
112 0.16
113 0.16
114 0.15
115 0.16
116 0.15
117 0.2
118 0.19
119 0.2
120 0.16
121 0.17
122 0.18
123 0.17
124 0.16
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.1
146 0.1
147 0.12
148 0.11
149 0.13
150 0.16
151 0.17
152 0.21
153 0.22
154 0.24
155 0.24
156 0.25
157 0.23
158 0.22
159 0.2
160 0.17
161 0.13
162 0.12
163 0.1
164 0.1
165 0.15
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.16
171 0.22
172 0.24
173 0.19
174 0.2
175 0.2
176 0.19
177 0.18
178 0.17
179 0.12
180 0.11
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.14
194 0.14
195 0.14
196 0.12
197 0.13
198 0.14
199 0.13
200 0.13
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.12
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.11
209 0.09
210 0.11
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.12
216 0.12
217 0.12
218 0.1
219 0.11
220 0.12
221 0.1
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.17
230 0.2
231 0.18
232 0.2
233 0.25
234 0.22
235 0.24
236 0.32
237 0.32
238 0.39
239 0.41
240 0.42
241 0.39
242 0.4
243 0.41
244 0.33
245 0.32
246 0.23
247 0.23
248 0.23
249 0.21
250 0.18
251 0.15
252 0.13
253 0.14
254 0.13
255 0.1
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.03
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.06
271 0.09
272 0.13
273 0.14
274 0.16
275 0.21
276 0.23
277 0.26
278 0.26
279 0.25
280 0.22
281 0.26
282 0.28
283 0.26
284 0.24
285 0.2
286 0.2
287 0.18
288 0.16
289 0.12
290 0.08
291 0.06
292 0.07
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.16
300 0.2
301 0.2
302 0.22
303 0.23
304 0.25
305 0.27
306 0.27
307 0.28
308 0.26
309 0.23
310 0.23
311 0.23
312 0.24
313 0.24
314 0.26
315 0.28
316 0.31
317 0.35
318 0.34
319 0.33
320 0.29
321 0.27
322 0.25
323 0.19
324 0.16
325 0.14
326 0.15
327 0.16
328 0.16
329 0.16
330 0.17
331 0.18
332 0.2
333 0.2
334 0.22
335 0.25
336 0.26
337 0.26
338 0.26
339 0.29
340 0.26
341 0.25
342 0.23
343 0.21
344 0.2
345 0.19
346 0.18
347 0.12
348 0.13
349 0.12
350 0.08
351 0.08
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.1
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.12
364 0.13
365 0.14
366 0.14
367 0.14
368 0.16
369 0.17
370 0.19
371 0.2
372 0.18
373 0.17
374 0.2
375 0.2
376 0.19
377 0.19
378 0.17
379 0.14
380 0.13
381 0.14
382 0.13
383 0.16
384 0.15
385 0.15
386 0.16
387 0.17
388 0.22
389 0.26
390 0.28
391 0.29
392 0.31
393 0.31
394 0.32
395 0.35
396 0.3
397 0.27
398 0.22
399 0.19
400 0.17
401 0.18
402 0.18
403 0.14
404 0.14
405 0.13
406 0.15
407 0.16
408 0.15
409 0.14
410 0.15
411 0.16
412 0.16
413 0.15
414 0.15
415 0.15
416 0.18
417 0.23
418 0.26
419 0.28
420 0.3
421 0.3
422 0.29
423 0.3
424 0.28
425 0.27
426 0.23
427 0.23
428 0.21
429 0.24
430 0.26
431 0.25
432 0.24
433 0.21
434 0.2
435 0.2
436 0.2
437 0.17
438 0.15
439 0.15
440 0.15
441 0.15
442 0.15
443 0.13
444 0.15
445 0.16
446 0.22
447 0.29
448 0.38
449 0.47
450 0.56
451 0.63
452 0.68
453 0.72
454 0.74
455 0.75
456 0.73
457 0.72
458 0.71
459 0.71
460 0.67
461 0.61
462 0.54
463 0.52
464 0.52
465 0.53
466 0.55
467 0.55
468 0.59
469 0.62
470 0.65
471 0.6
472 0.62
473 0.62
474 0.62
475 0.64
476 0.67
477 0.72
478 0.78
479 0.87
480 0.87
481 0.87
482 0.87
483 0.87
484 0.87
485 0.87
486 0.83
487 0.75
488 0.68
489 0.59
490 0.5
491 0.42
492 0.34
493 0.26
494 0.26
495 0.23
496 0.22
497 0.21
498 0.19
499 0.17
500 0.17
501 0.15
502 0.09
503 0.08
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.11
508 0.1
509 0.1
510 0.1
511 0.13
512 0.11
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.13
517 0.15
518 0.16
519 0.2
520 0.21
521 0.21
522 0.26
523 0.3
524 0.29
525 0.31
526 0.36
527 0.34
528 0.34
529 0.36
530 0.33
531 0.35
532 0.34
533 0.31
534 0.25
535 0.22
536 0.2
537 0.16
538 0.14
539 0.09
540 0.08
541 0.08
542 0.09
543 0.11
544 0.13
545 0.13
546 0.12