FuNGI

P41891

Protein Details

Accession

P41891

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-90	IEKPSKSKKITKEAAKEIAKQSSKTDVSPKKSKKEAKRASSPEPSKKSVKKQKKSKKKEESSSESESE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-80	KTSVKKSVKETASKKGAIEKPSKSKKITKEAAKEIAKQSSKTDVSPKKSKKEAKRASSPEPSKKSVKKQKKSKKK
449-482	SRGGRGGFGGRGGFGGRGGFGGGRGRGRGGARSG

Subcellular Location(s)

nucl 24, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034276 Gar2_RRM2 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0001651 C:dense fibrillar component GO:0005730 C:nucleolus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0140713 F:histone chaperone activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0006338 P:chromatin remodeling GO:0048255 P:mRNA stabilization GO:0000381 P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome GO:0016072 P:rRNA metabolic process GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	spo:SPAC140.02 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12448 RRM2_gar2

Amino Acid Sequences

MAKKDKTSVKKSVKETASKKGAIEKPSKSKKITKEAAKEIAKQSSKTDVSPKKSKKEAKRASSPEPSKKSVKKQKKSKKKEESSSESESESSSSESESSSSESESSSSESESSSSESSSSESEEEVIVKTEEKKESSSESSSSSESEEEEEAVVKIEEKKESSSDSSSESSSSESESESSSSESEEEEEVVEKTEEKKEGSSESSSDSESSSDSSSESGDSDSSSDSESESSSEDEKKRKAEPASEERPAKITKPSQDSNETCTVFVGRLSWNVDDQWLGQEFEEYGTIVGARVIMDGQSGRSKGYGYVDFETPEAAKAAVAANGTKEIDGRMVNLDLSNPRPANPQPYAQQRAGNFGDQLSEPSDTVFVGNLSFNATEDDLSTAFGGCGDIQSIRLPTDPQSGRLKGFGYVTFSDIDSAKKCVEMNGHFIAGRPCRLDFSTPRTGGGSRGGRGGFGGRGGFGGRGGFGGGRGRGRGGARSGNPNRGSVAPFSGNKVTFD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.74
3	0.74
4	0.72
5	0.66
6	0.61
7	0.62
8	0.6
9	0.58
10	0.61
11	0.59
12	0.62
13	0.7
14	0.75
15	0.72
16	0.75
17	0.76
18	0.79
19	0.79
20	0.78
21	0.77
22	0.79
23	0.82
24	0.78
25	0.75
26	0.69
27	0.7
28	0.63
29	0.55
30	0.49
31	0.49
32	0.46
33	0.43
34	0.48
35	0.47
36	0.52
37	0.62
38	0.67
39	0.67
40	0.75
41	0.81
42	0.82
43	0.84
44	0.86
45	0.85
46	0.87
47	0.86
48	0.84
49	0.85
50	0.83
51	0.82
52	0.79
53	0.75
54	0.73
55	0.74
56	0.77
57	0.77
58	0.79
59	0.79
60	0.84
61	0.9
62	0.92
63	0.95
64	0.95
65	0.95
66	0.94
67	0.94
68	0.93
69	0.9
70	0.86
71	0.82
72	0.72
73	0.62
74	0.52
75	0.42
76	0.32
77	0.24
78	0.18
79	0.12
80	0.11
81	0.1
82	0.1
83	0.1
84	0.1
85	0.12
86	0.11
87	0.12
88	0.11
89	0.11
90	0.12
91	0.12
92	0.13
93	0.12
94	0.12
95	0.11
96	0.11
97	0.12
98	0.12
99	0.14
100	0.12
101	0.11
102	0.11
103	0.11
104	0.12
105	0.12
106	0.12
107	0.1
108	0.1
109	0.1
110	0.1
111	0.11
112	0.1
113	0.1
114	0.09
115	0.1
116	0.13
117	0.18
118	0.2
119	0.21
120	0.22
121	0.23
122	0.27
123	0.3
124	0.3
125	0.26
126	0.26
127	0.27
128	0.26
129	0.24
130	0.21
131	0.17
132	0.14
133	0.15
134	0.12
135	0.1
136	0.1
137	0.1
138	0.09
139	0.09
140	0.08
141	0.08
142	0.1
143	0.12
144	0.14
145	0.14
146	0.16
147	0.17
148	0.2
149	0.22
150	0.21
151	0.2
152	0.22
153	0.22
154	0.21
155	0.2
156	0.17
157	0.15
158	0.13
159	0.13
160	0.1
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.09
171	0.1
172	0.09
173	0.08
174	0.07
175	0.08
176	0.07
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.09
181	0.13
182	0.14
183	0.14
184	0.14
185	0.15
186	0.17
187	0.19
188	0.18
189	0.16
190	0.17
191	0.18
192	0.17
193	0.16
194	0.14
195	0.12
196	0.11
197	0.11
198	0.09
199	0.08
200	0.07
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.09
220	0.14
221	0.17
222	0.21
223	0.23
224	0.26
225	0.27
226	0.32
227	0.32
228	0.33
229	0.37
230	0.42
231	0.45
232	0.48
233	0.46
234	0.41
235	0.42
236	0.36
237	0.3
238	0.27
239	0.25
240	0.26
241	0.31
242	0.33
243	0.34
244	0.4
245	0.4
246	0.4
247	0.41
248	0.36
249	0.3
250	0.28
251	0.24
252	0.17
253	0.16
254	0.12
255	0.07
256	0.09
257	0.1
258	0.11
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.09
267	0.08
268	0.09
269	0.08
270	0.09
271	0.08
272	0.06
273	0.05
274	0.04
275	0.05
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.06
286	0.08
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.1
291	0.11
292	0.14
293	0.16
294	0.17
295	0.19
296	0.19
297	0.19
298	0.19
299	0.18
300	0.15
301	0.12
302	0.09
303	0.07
304	0.06
305	0.06
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.09
312	0.09
313	0.08
314	0.08
315	0.07
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.1
321	0.1
322	0.1
323	0.11
324	0.11
325	0.14
326	0.18
327	0.17
328	0.17
329	0.21
330	0.23
331	0.28
332	0.29
333	0.31
334	0.32
335	0.41
336	0.46
337	0.43
338	0.46
339	0.39
340	0.43
341	0.41
342	0.36
343	0.27
344	0.21
345	0.21
346	0.17
347	0.18
348	0.13
349	0.12
350	0.11
351	0.11
352	0.11
353	0.09
354	0.09
355	0.08
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.11
368	0.09
369	0.09
370	0.09
371	0.08
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.09
381	0.1
382	0.1
383	0.12
384	0.13
385	0.14
386	0.24
387	0.24
388	0.27
389	0.34
390	0.36
391	0.36
392	0.37
393	0.35
394	0.28
395	0.29
396	0.26
397	0.24
398	0.22
399	0.22
400	0.21
401	0.2
402	0.2
403	0.18
404	0.19
405	0.15
406	0.17
407	0.16
408	0.17
409	0.17
410	0.18
411	0.25
412	0.25
413	0.29
414	0.29
415	0.3
416	0.29
417	0.3
418	0.34
419	0.3
420	0.3
421	0.27
422	0.24
423	0.27
424	0.29
425	0.34
426	0.33
427	0.38
428	0.45
429	0.43
430	0.44
431	0.43
432	0.41
433	0.37
434	0.39
435	0.37
436	0.28
437	0.32
438	0.3
439	0.28
440	0.28
441	0.29
442	0.21
443	0.18
444	0.17
445	0.12
446	0.13
447	0.14
448	0.13
449	0.11
450	0.11
451	0.09
452	0.08
453	0.09
454	0.08
455	0.09
456	0.14
457	0.17
458	0.18
459	0.19
460	0.2
461	0.24
462	0.26
463	0.29
464	0.3
465	0.35
466	0.37
467	0.47
468	0.52
469	0.57
470	0.56
471	0.53
472	0.51
473	0.45
474	0.43
475	0.35
476	0.36
477	0.33
478	0.32
479	0.37
480	0.4

P41891

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer