Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O42913

Protein Details
Accession O42913    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
265-287VSLLQHKTPRRIRPKSLSKSNSTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013734  TF_Nrm1/Whi5  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0000083  P:regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle  
KEGG spo:SPBC16A3.07c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08528  Whi5  
Amino Acid Sequences MDRSMEPLTPSRLNTLGERPTNEVYEYGKGKNVQHLFPITPMQRPLGKENAAPGTISPIAVRSRNVRAVEIADENACEEPVLKIKSVSSTESEEEKESSTEIGEKQEKETHLEPKTPVQTNTNNNHLDDIQCCAKNLRLRLELAMYKVQVNQTFSPLQDLPIVAKTKLHNCPNSEPVTSIWNQRSLSSGKPPSLHLSGNRRLSMGSPTKSIYDQNGLTTPRPIGSDDLTHMYDPYTSPLRTPSRTLSRSSSHYLWVRHGKLTRSVSLLQHKTPRRIRPKSLSKSNSTPLKHLSAQKPNSNYYTGPPTPVSISNTPENIHPSSSEVRRIASHSKQFSDYGLIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.37
3 0.39
4 0.4
5 0.42
6 0.43
7 0.43
8 0.42
9 0.39
10 0.34
11 0.28
12 0.3
13 0.31
14 0.27
15 0.29
16 0.32
17 0.33
18 0.4
19 0.42
20 0.37
21 0.38
22 0.41
23 0.37
24 0.36
25 0.41
26 0.34
27 0.33
28 0.34
29 0.32
30 0.33
31 0.35
32 0.37
33 0.37
34 0.37
35 0.34
36 0.38
37 0.38
38 0.34
39 0.31
40 0.26
41 0.24
42 0.22
43 0.21
44 0.16
45 0.15
46 0.18
47 0.19
48 0.22
49 0.21
50 0.27
51 0.33
52 0.34
53 0.32
54 0.31
55 0.31
56 0.32
57 0.29
58 0.24
59 0.17
60 0.16
61 0.16
62 0.14
63 0.12
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.13
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.15
72 0.2
73 0.22
74 0.23
75 0.19
76 0.22
77 0.23
78 0.25
79 0.26
80 0.23
81 0.22
82 0.2
83 0.18
84 0.14
85 0.13
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.16
90 0.2
91 0.2
92 0.23
93 0.27
94 0.27
95 0.3
96 0.33
97 0.34
98 0.33
99 0.35
100 0.34
101 0.36
102 0.42
103 0.4
104 0.38
105 0.35
106 0.4
107 0.44
108 0.47
109 0.48
110 0.43
111 0.4
112 0.4
113 0.35
114 0.29
115 0.21
116 0.2
117 0.17
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.19
122 0.22
123 0.25
124 0.27
125 0.25
126 0.26
127 0.26
128 0.29
129 0.26
130 0.25
131 0.24
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.19
136 0.17
137 0.19
138 0.17
139 0.18
140 0.19
141 0.18
142 0.2
143 0.18
144 0.17
145 0.14
146 0.14
147 0.12
148 0.15
149 0.16
150 0.12
151 0.15
152 0.15
153 0.21
154 0.28
155 0.32
156 0.32
157 0.34
158 0.38
159 0.4
160 0.41
161 0.35
162 0.29
163 0.25
164 0.24
165 0.22
166 0.23
167 0.19
168 0.21
169 0.2
170 0.2
171 0.22
172 0.2
173 0.22
174 0.25
175 0.26
176 0.24
177 0.25
178 0.26
179 0.28
180 0.28
181 0.28
182 0.25
183 0.31
184 0.35
185 0.39
186 0.38
187 0.34
188 0.31
189 0.31
190 0.33
191 0.31
192 0.26
193 0.23
194 0.24
195 0.25
196 0.26
197 0.26
198 0.2
199 0.18
200 0.17
201 0.17
202 0.2
203 0.21
204 0.2
205 0.21
206 0.19
207 0.15
208 0.16
209 0.15
210 0.13
211 0.13
212 0.14
213 0.15
214 0.18
215 0.17
216 0.17
217 0.16
218 0.14
219 0.13
220 0.11
221 0.13
222 0.14
223 0.13
224 0.14
225 0.21
226 0.26
227 0.28
228 0.31
229 0.35
230 0.41
231 0.43
232 0.46
233 0.44
234 0.43
235 0.46
236 0.48
237 0.42
238 0.39
239 0.42
240 0.4
241 0.42
242 0.46
243 0.44
244 0.43
245 0.46
246 0.42
247 0.46
248 0.48
249 0.44
250 0.39
251 0.4
252 0.4
253 0.46
254 0.47
255 0.44
256 0.48
257 0.52
258 0.57
259 0.62
260 0.66
261 0.68
262 0.72
263 0.77
264 0.78
265 0.84
266 0.84
267 0.87
268 0.83
269 0.79
270 0.78
271 0.77
272 0.75
273 0.66
274 0.6
275 0.54
276 0.53
277 0.52
278 0.54
279 0.55
280 0.56
281 0.61
282 0.64
283 0.64
284 0.63
285 0.6
286 0.54
287 0.46
288 0.4
289 0.42
290 0.36
291 0.35
292 0.32
293 0.3
294 0.31
295 0.33
296 0.35
297 0.29
298 0.33
299 0.34
300 0.35
301 0.34
302 0.34
303 0.35
304 0.3
305 0.28
306 0.24
307 0.24
308 0.3
309 0.33
310 0.38
311 0.34
312 0.34
313 0.35
314 0.4
315 0.44
316 0.45
317 0.51
318 0.5
319 0.52
320 0.53
321 0.52
322 0.48