Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YR60

Protein Details
Accession A0A0D1YR60    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-130VDERMERRRKAQREAREKREREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-128RRRKAQREAREKRER
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto_mito 7, mito 6.5, cyto 6.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSGRKDFLSMPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEEQLKEALAKRAKQLELGTPTAYGVTEKNDEDDDDDRFRDPDDDQGLFAGGLYDKDDDEADRIYQAVDERMERRRKAQREAREKREREEYEAKNPKISQQFADAKRALSTISEEEWANLPEVGDLTGRNKRARTSRMQRFYAVPDSVLAAQRDAGQMDTSIDARESLPANGVANGDAADGTVTNFAQIGAAREKQLSLRLEQAEKAGTETMGGTSTSIDPKGYLTSLATSEVKATELNLGDISRTRLLLESVTNSNPTHAPGWISAARLEEHAGKHGAARSKIMQGCQRCPKSEDVWLEAIRLHMEGNNRNAKVIAADAIKENPRSIKLWIAASELETEPNSRKKVLRKAIDNNPKSVQLWKAAANLEEPKDAMLMLAKATQFVPSSVDLWLAYARLCTKEQAEQVLNQARRAIPTSHEIWVAATRLQEQGGNFDLARKVMSRGIKALAKESAMLKREEWIAEAEKVEAEGAVVTCQAIIENTLGWGLDEDDDRKDIWMDDAKESENRGRYHTARAIYAYALRVFANKASIWKAASELERRAGTTESLINLLEKAVEACPKSDDLWLSLAREKWQGGDIDGARLVLGRAFKQNASESIWLAAVKLEADAGFKDKAQALLAQARQAASTDRIWYKSVAFERQQGRDDEALDLVNQGLQIFPGNAKLWMQKGQIYEAKGNIPKAREAYNAGTRASPKSSPLWILAARLEEKQGILVKARSILDRARLAIPKNDVLWTESVRLERRNNNINAAQNLMARAQQELPKSALLWSERIMHLESRTARKARAIEAARLVGDDKFLFITFSRIFWAERKLDKAVTWFEKAIIVDPDWGDSWAWYYKFLIQHGTEEKKAEVLAQCAKAAPRHGEVWQRIAKDPANNGLKVEDILMRAVKEIDKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.25
3 0.2
4 0.17
5 0.13
6 0.1
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.09
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.33
36 0.33
37 0.36
38 0.41
39 0.49
40 0.48
41 0.47
42 0.46
43 0.46
44 0.46
45 0.45
46 0.39
47 0.32
48 0.31
49 0.27
50 0.24
51 0.17
52 0.12
53 0.14
54 0.17
55 0.17
56 0.19
57 0.19
58 0.2
59 0.22
60 0.23
61 0.23
62 0.22
63 0.23
64 0.22
65 0.22
66 0.22
67 0.21
68 0.19
69 0.23
70 0.24
71 0.24
72 0.23
73 0.23
74 0.23
75 0.2
76 0.19
77 0.13
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.1
86 0.12
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.14
95 0.14
96 0.18
97 0.22
98 0.31
99 0.39
100 0.39
101 0.47
102 0.54
103 0.59
104 0.65
105 0.71
106 0.72
107 0.76
108 0.84
109 0.86
110 0.87
111 0.82
112 0.77
113 0.78
114 0.7
115 0.67
116 0.67
117 0.62
118 0.62
119 0.69
120 0.65
121 0.6
122 0.58
123 0.57
124 0.54
125 0.52
126 0.43
127 0.42
128 0.5
129 0.47
130 0.55
131 0.49
132 0.42
133 0.41
134 0.39
135 0.3
136 0.21
137 0.22
138 0.16
139 0.16
140 0.17
141 0.16
142 0.17
143 0.19
144 0.18
145 0.16
146 0.13
147 0.12
148 0.1
149 0.11
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.13
154 0.18
155 0.23
156 0.26
157 0.27
158 0.32
159 0.41
160 0.47
161 0.53
162 0.58
163 0.64
164 0.7
165 0.71
166 0.68
167 0.63
168 0.61
169 0.57
170 0.47
171 0.37
172 0.28
173 0.27
174 0.26
175 0.26
176 0.21
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.16
181 0.15
182 0.13
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.11
193 0.12
194 0.11
195 0.12
196 0.13
197 0.13
198 0.14
199 0.14
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.04
208 0.05
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.1
217 0.13
218 0.14
219 0.16
220 0.16
221 0.17
222 0.17
223 0.23
224 0.21
225 0.19
226 0.25
227 0.27
228 0.28
229 0.28
230 0.28
231 0.24
232 0.22
233 0.21
234 0.15
235 0.12
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.12
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.1
254 0.11
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.14
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.15
280 0.16
281 0.18
282 0.17
283 0.18
284 0.17
285 0.17
286 0.15
287 0.13
288 0.13
289 0.11
290 0.16
291 0.16
292 0.17
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.15
297 0.16
298 0.14
299 0.13
300 0.15
301 0.15
302 0.14
303 0.15
304 0.19
305 0.22
306 0.19
307 0.21
308 0.21
309 0.27
310 0.29
311 0.3
312 0.32
313 0.32
314 0.4
315 0.47
316 0.48
317 0.43
318 0.44
319 0.45
320 0.42
321 0.45
322 0.4
323 0.34
324 0.35
325 0.32
326 0.3
327 0.26
328 0.24
329 0.17
330 0.14
331 0.11
332 0.08
333 0.12
334 0.15
335 0.22
336 0.28
337 0.28
338 0.28
339 0.28
340 0.25
341 0.22
342 0.19
343 0.15
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.13
348 0.15
349 0.15
350 0.15
351 0.14
352 0.15
353 0.16
354 0.16
355 0.18
356 0.18
357 0.19
358 0.2
359 0.2
360 0.18
361 0.17
362 0.18
363 0.14
364 0.13
365 0.11
366 0.12
367 0.13
368 0.18
369 0.19
370 0.19
371 0.23
372 0.29
373 0.39
374 0.46
375 0.5
376 0.53
377 0.6
378 0.68
379 0.75
380 0.68
381 0.62
382 0.55
383 0.49
384 0.42
385 0.37
386 0.29
387 0.22
388 0.22
389 0.2
390 0.21
391 0.21
392 0.2
393 0.19
394 0.2
395 0.18
396 0.16
397 0.14
398 0.11
399 0.1
400 0.1
401 0.08
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.1
413 0.09
414 0.1
415 0.09
416 0.1
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.08
425 0.09
426 0.09
427 0.11
428 0.14
429 0.15
430 0.19
431 0.19
432 0.17
433 0.22
434 0.28
435 0.27
436 0.23
437 0.24
438 0.2
439 0.2
440 0.22
441 0.18
442 0.13
443 0.16
444 0.18
445 0.17
446 0.17
447 0.16
448 0.14
449 0.14
450 0.13
451 0.11
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.09
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.1
462 0.11
463 0.11
464 0.1
465 0.1
466 0.08
467 0.09
468 0.12
469 0.14
470 0.14
471 0.15
472 0.18
473 0.19
474 0.19
475 0.2
476 0.17
477 0.15
478 0.15
479 0.16
480 0.17
481 0.17
482 0.17
483 0.16
484 0.16
485 0.17
486 0.16
487 0.15
488 0.13
489 0.13
490 0.13
491 0.13
492 0.12
493 0.1
494 0.1
495 0.09
496 0.06
497 0.04
498 0.04
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.05
517 0.05
518 0.06
519 0.07
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.09
526 0.13
527 0.14
528 0.15
529 0.16
530 0.17
531 0.18
532 0.19
533 0.21
534 0.22
535 0.21
536 0.23
537 0.27
538 0.27
539 0.32
540 0.35
541 0.32
542 0.28
543 0.28
544 0.25
545 0.21
546 0.21
547 0.17
548 0.13
549 0.12
550 0.11
551 0.11
552 0.1
553 0.1
554 0.11
555 0.1
556 0.11
557 0.13
558 0.14
559 0.14
560 0.13
561 0.14
562 0.15
563 0.19
564 0.2
565 0.19
566 0.21
567 0.21
568 0.21
569 0.21
570 0.19
571 0.16
572 0.14
573 0.14
574 0.11
575 0.11
576 0.11
577 0.1
578 0.09
579 0.09
580 0.07
581 0.05
582 0.06
583 0.06
584 0.09
585 0.09
586 0.1
587 0.11
588 0.12
589 0.13
590 0.14
591 0.14
592 0.12
593 0.15
594 0.15
595 0.16
596 0.18
597 0.19
598 0.19
599 0.2
600 0.19
601 0.16
602 0.18
603 0.16
604 0.14
605 0.19
606 0.17
607 0.16
608 0.16
609 0.15
610 0.12
611 0.12
612 0.11
613 0.07
614 0.08
615 0.08
616 0.12
617 0.14
618 0.14
619 0.17
620 0.19
621 0.19
622 0.23
623 0.22
624 0.19
625 0.18
626 0.19
627 0.16
628 0.14
629 0.12
630 0.08
631 0.07
632 0.06
633 0.05
634 0.05
635 0.06
636 0.06
637 0.08
638 0.09
639 0.09
640 0.11
641 0.11
642 0.12
643 0.12
644 0.13
645 0.13
646 0.19
647 0.2
648 0.2
649 0.2
650 0.19
651 0.18
652 0.18
653 0.17
654 0.13
655 0.14
656 0.17
657 0.19
658 0.21
659 0.22
660 0.22
661 0.22
662 0.25
663 0.28
664 0.29
665 0.29
666 0.34
667 0.39
668 0.42
669 0.44
670 0.39
671 0.39
672 0.34
673 0.33
674 0.27
675 0.22
676 0.18
677 0.15
678 0.13
679 0.09
680 0.08
681 0.07
682 0.06
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.06
687 0.06
688 0.09
689 0.1
690 0.1
691 0.12
692 0.15
693 0.17
694 0.21
695 0.22
696 0.23
697 0.24
698 0.29
699 0.31
700 0.31
701 0.31
702 0.28
703 0.32
704 0.32
705 0.34
706 0.32
707 0.3
708 0.3
709 0.3
710 0.31
711 0.27
712 0.29
713 0.32
714 0.36
715 0.36
716 0.34
717 0.34
718 0.33
719 0.34
720 0.33
721 0.27
722 0.23
723 0.24
724 0.26
725 0.26
726 0.26
727 0.27
728 0.24
729 0.25
730 0.24
731 0.24
732 0.23
733 0.21
734 0.21
735 0.17
736 0.16
737 0.17
738 0.19
739 0.17
740 0.19
741 0.19
742 0.19
743 0.23
744 0.24
745 0.22
746 0.22
747 0.23
748 0.26
749 0.27
750 0.29
751 0.3
752 0.32
753 0.34
754 0.36
755 0.37
756 0.34
757 0.33
758 0.32
759 0.27
760 0.26
761 0.26
762 0.23
763 0.22
764 0.22
765 0.25
766 0.27
767 0.32
768 0.36
769 0.4
770 0.45
771 0.52
772 0.51
773 0.54
774 0.55
775 0.54
776 0.49
777 0.45
778 0.4
779 0.31
780 0.3
781 0.25
782 0.21
783 0.16
784 0.17
785 0.18
786 0.2
787 0.22
788 0.23
789 0.24
790 0.23
791 0.24
792 0.23
793 0.23
794 0.21
795 0.21
796 0.2
797 0.23
798 0.23
799 0.25
800 0.25
801 0.23
802 0.23
803 0.28
804 0.31
805 0.33
806 0.4
807 0.41
808 0.4
809 0.43
810 0.45
811 0.42
812 0.46
813 0.43
814 0.41
815 0.43
816 0.43
817 0.38
818 0.35
819 0.32
820 0.23
821 0.21
822 0.16
823 0.12
824 0.11
825 0.11
826 0.12
827 0.11
828 0.17
829 0.16
830 0.16
831 0.18
832 0.18
833 0.2
834 0.22
835 0.3
836 0.3
837 0.34
838 0.38
839 0.39
840 0.4
841 0.4
842 0.42
843 0.43
844 0.41
845 0.41
846 0.37
847 0.34
848 0.35
849 0.33
850 0.31
851 0.26
852 0.22
853 0.21
854 0.21
855 0.22
856 0.19
857 0.2
858 0.17
859 0.14
860 0.16
861 0.18
862 0.18
863 0.17
864 0.19
865 0.23
866 0.27
867 0.28
868 0.32
869 0.28
870 0.34
871 0.42
872 0.46
873 0.43
874 0.41
875 0.4
876 0.35
877 0.33
878 0.31
879 0.26
880 0.26
881 0.3
882 0.3
883 0.3
884 0.31
885 0.34
886 0.32
887 0.35
888 0.34
889 0.31
890 0.32
891 0.36
892 0.43
893 0.44
894 0.5
895 0.5
896 0.48
897 0.46
898 0.49
899 0.48
900 0.45
901 0.45
902 0.46
903 0.47
904 0.44
905 0.43
906 0.38
907 0.35
908 0.29
909 0.27
910 0.2
911 0.15
912 0.18
913 0.19
914 0.18
915 0.18
916 0.2