Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P78814

Protein Details
Accession P78814    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-311DAYSRSPSPRRDREENRSPAYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-83ERRRRENFR
187-196RSPPARRRYR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0008143  F:poly(A) binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG spo:SPAC16.02c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12339  RRM2_SRSF1_4_like  
Amino Acid Sequences MSETRLFVGRIPPQATREDMMDFFKGYGQILDCKLMNGFGFVEVEDARDARDIVNDFQGKEFMGSRIVVEPARGERRRRENFRESAASKYPRPRRTGFRLIVENLSEDVSWQDLKDVMRKAGEPTFTDAHRENPGAGVVEFSTEEDMRNALTSLNGEVIKGQAVTLREDPDAANEPLPEVPSRFRSRSPPARRRYRDDYRRGGDYRRDAYRPGRDDERRYAPRGEYRRNNRDEYRRGGRDEYRRNSRSDYRRPHDDEYRRPRGDEYRPGRDEYRRSRDDGRPSHDDEYRRDAYSRSPSPRRDREENRSPAYEGSKSYSAAPEASMESSAPTESYDKPAASEEQQPLQNHSDVGNGSAEGQVAAEW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.37
4 0.33
5 0.29
6 0.28
7 0.28
8 0.26
9 0.24
10 0.2
11 0.21
12 0.19
13 0.16
14 0.17
15 0.15
16 0.19
17 0.2
18 0.23
19 0.2
20 0.21
21 0.2
22 0.19
23 0.17
24 0.14
25 0.13
26 0.11
27 0.11
28 0.1
29 0.12
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.09
38 0.14
39 0.15
40 0.16
41 0.24
42 0.26
43 0.25
44 0.26
45 0.26
46 0.22
47 0.21
48 0.21
49 0.13
50 0.14
51 0.13
52 0.14
53 0.15
54 0.16
55 0.15
56 0.14
57 0.15
58 0.2
59 0.3
60 0.33
61 0.36
62 0.43
63 0.54
64 0.64
65 0.7
66 0.72
67 0.72
68 0.73
69 0.75
70 0.74
71 0.65
72 0.61
73 0.6
74 0.56
75 0.52
76 0.56
77 0.59
78 0.57
79 0.61
80 0.6
81 0.62
82 0.66
83 0.71
84 0.66
85 0.63
86 0.62
87 0.58
88 0.55
89 0.47
90 0.39
91 0.29
92 0.24
93 0.17
94 0.12
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.09
101 0.1
102 0.16
103 0.18
104 0.18
105 0.19
106 0.2
107 0.22
108 0.23
109 0.25
110 0.2
111 0.23
112 0.24
113 0.23
114 0.26
115 0.23
116 0.23
117 0.24
118 0.23
119 0.18
120 0.16
121 0.16
122 0.14
123 0.13
124 0.1
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.07
151 0.1
152 0.11
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.17
159 0.14
160 0.13
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.11
166 0.08
167 0.09
168 0.14
169 0.19
170 0.2
171 0.22
172 0.27
173 0.36
174 0.45
175 0.54
176 0.58
177 0.63
178 0.72
179 0.75
180 0.77
181 0.77
182 0.78
183 0.77
184 0.76
185 0.75
186 0.67
187 0.69
188 0.63
189 0.58
190 0.53
191 0.49
192 0.45
193 0.41
194 0.39
195 0.35
196 0.4
197 0.44
198 0.41
199 0.39
200 0.42
201 0.43
202 0.47
203 0.5
204 0.54
205 0.49
206 0.49
207 0.48
208 0.43
209 0.47
210 0.5
211 0.52
212 0.52
213 0.58
214 0.65
215 0.66
216 0.69
217 0.68
218 0.7
219 0.67
220 0.65
221 0.65
222 0.59
223 0.57
224 0.56
225 0.56
226 0.57
227 0.61
228 0.61
229 0.62
230 0.61
231 0.6
232 0.61
233 0.63
234 0.63
235 0.64
236 0.66
237 0.62
238 0.69
239 0.72
240 0.72
241 0.73
242 0.72
243 0.72
244 0.71
245 0.76
246 0.67
247 0.62
248 0.6
249 0.58
250 0.57
251 0.57
252 0.55
253 0.55
254 0.56
255 0.58
256 0.59
257 0.57
258 0.59
259 0.58
260 0.6
261 0.53
262 0.55
263 0.6
264 0.63
265 0.67
266 0.65
267 0.62
268 0.58
269 0.6
270 0.6
271 0.57
272 0.54
273 0.48
274 0.48
275 0.44
276 0.4
277 0.36
278 0.33
279 0.35
280 0.41
281 0.45
282 0.46
283 0.51
284 0.58
285 0.67
286 0.76
287 0.77
288 0.78
289 0.79
290 0.79
291 0.82
292 0.82
293 0.77
294 0.7
295 0.64
296 0.57
297 0.53
298 0.46
299 0.37
300 0.34
301 0.31
302 0.29
303 0.29
304 0.28
305 0.24
306 0.22
307 0.21
308 0.17
309 0.17
310 0.17
311 0.15
312 0.13
313 0.12
314 0.12
315 0.12
316 0.1
317 0.1
318 0.13
319 0.14
320 0.2
321 0.22
322 0.21
323 0.22
324 0.25
325 0.27
326 0.27
327 0.33
328 0.32
329 0.34
330 0.4
331 0.4
332 0.42
333 0.43
334 0.41
335 0.34
336 0.3
337 0.28
338 0.23
339 0.23
340 0.19
341 0.15
342 0.15
343 0.15
344 0.14
345 0.1