Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YPS4

Protein Details
Accession A0A0D1YPS4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-106EGPRIFFKKKKGEDEKKKKKKYAVABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-62GRRIMRKKKV
70-102TRTHRNPREQEKEGPRIFFKKKKGEDEKKKKKK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito_nucl 11.833, mito 9.5, cyto_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR005574  Rpb4/RPC9  
IPR038324  Rpb4/RPC9_sf  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03874  RNA_pol_Rpb4  
Amino Acid Sequences MCLPVSDGNHTGRRPKSPYPLHPSIRHFLFFLFLFAFPSPSNPEVGGRGESSGRRIMRKKKVLLSSLVPTRTHRNPREQEKEGPRIFFKKKKGEDEKKKKKKYAVADGCTQVKTNLSRPPTVHPADQVAAGTIPKKRVVRLVQRLTGREFKLLPSEALMVVNHRPILREELSGLLEELEDRMSEEKQDRLLELVSKELGRVRADDGDGANGADDEDDEGEGEDEAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.54
3 0.59
4 0.62
5 0.7
6 0.72
7 0.77
8 0.76
9 0.77
10 0.75
11 0.72
12 0.65
13 0.57
14 0.48
15 0.38
16 0.34
17 0.27
18 0.23
19 0.17
20 0.14
21 0.15
22 0.15
23 0.16
24 0.13
25 0.16
26 0.18
27 0.17
28 0.19
29 0.17
30 0.18
31 0.18
32 0.21
33 0.2
34 0.16
35 0.16
36 0.18
37 0.18
38 0.19
39 0.24
40 0.24
41 0.29
42 0.36
43 0.45
44 0.52
45 0.6
46 0.64
47 0.66
48 0.7
49 0.67
50 0.64
51 0.58
52 0.54
53 0.51
54 0.47
55 0.4
56 0.35
57 0.38
58 0.42
59 0.48
60 0.46
61 0.51
62 0.56
63 0.65
64 0.71
65 0.69
66 0.7
67 0.68
68 0.73
69 0.64
70 0.58
71 0.51
72 0.49
73 0.51
74 0.49
75 0.49
76 0.49
77 0.53
78 0.61
79 0.69
80 0.73
81 0.78
82 0.83
83 0.87
84 0.88
85 0.9
86 0.85
87 0.81
88 0.77
89 0.74
90 0.74
91 0.72
92 0.65
93 0.61
94 0.58
95 0.54
96 0.47
97 0.38
98 0.27
99 0.19
100 0.18
101 0.17
102 0.19
103 0.2
104 0.22
105 0.23
106 0.27
107 0.32
108 0.32
109 0.29
110 0.25
111 0.25
112 0.23
113 0.22
114 0.17
115 0.11
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.09
120 0.1
121 0.15
122 0.16
123 0.16
124 0.23
125 0.31
126 0.39
127 0.47
128 0.52
129 0.54
130 0.56
131 0.57
132 0.54
133 0.53
134 0.44
135 0.36
136 0.3
137 0.26
138 0.27
139 0.26
140 0.22
141 0.17
142 0.17
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.11
147 0.11
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.2
154 0.19
155 0.19
156 0.18
157 0.19
158 0.19
159 0.18
160 0.17
161 0.11
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.06
166 0.05
167 0.06
168 0.08
169 0.08
170 0.11
171 0.14
172 0.16
173 0.19
174 0.2
175 0.2
176 0.2
177 0.21
178 0.22
179 0.2
180 0.2
181 0.18
182 0.17
183 0.18
184 0.2
185 0.22
186 0.19
187 0.2
188 0.2
189 0.22
190 0.23
191 0.24
192 0.21
193 0.2
194 0.19
195 0.17
196 0.15
197 0.11
198 0.1
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.08