Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P36629

Protein Details
Accession P36629    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-32SSRLSSGSSRIPKRHRDYRDEEPRRERGSBasic
37-84REDPRGHYGSERPRRRRRDESDFRRHRESRERSYREDERPRRERRYDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-80PKRHRDYRDEEPRRERGSGGIGREDPRGHYGSERPRRRRRDESDFRRHRESRERSYREDERPRRER
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR006529  U2AF_lg  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0008187  F:poly-pyrimidine tract binding  
GO:0030628  F:pre-mRNA 3'-splice site binding  
GO:0000348  P:mRNA branch site recognition  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000245  P:spliceosomal complex assembly  
KEGG spo:SPBC146.07  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MDLSSRLSSGSSRIPKRHRDYRDEEPRRERGSGGIGREDPRGHYGSERPRRRRRDESDFRRHRESRERSYREDERPRRERRYDDYEPRSLRYSSVGRSRSPPPSRERSVRSIEQELEQLRDVTPINQWKRKRSLWDIKPPGYELVTADQAKMSGVFPLPGAPRAAVTDPEKLLEFARSAEGSIIAPPPPLQPGASRQARRLVVTGIPNEFVEDAFVSFIEDLFISTTYHKPETKHFSSVNVCKEENFAILEVATPEDATFLWGLQSESYSNDVFLKFQRIQNYIVPQITPEVSQKRSDDYAKNDVLDSKDKIYISNLPLNLGEDQVVELLKPFGDLLSFQLIKNIADGSSKGFCFCEFKNPSDAEVAISGLDGKDTYGNKLHAQFACVGLNQAMIDKSNGMAILTELAKASSQSIPTRVLQLHNLITGDEIMDVQEYEDIYESVKTQFSNYGPLIDIKIPRSIGTRNSGLGTGKVFVRYSDIRSAEVAMEEMKGCKFNDRTIVIAFYGEDCYKANAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.66
3 0.74
4 0.8
5 0.8
6 0.8
7 0.8
8 0.81
9 0.84
10 0.83
11 0.83
12 0.82
13 0.82
14 0.77
15 0.71
16 0.6
17 0.53
18 0.52
19 0.49
20 0.44
21 0.42
22 0.41
23 0.41
24 0.44
25 0.41
26 0.35
27 0.34
28 0.32
29 0.27
30 0.27
31 0.34
32 0.41
33 0.51
34 0.58
35 0.64
36 0.73
37 0.81
38 0.86
39 0.88
40 0.87
41 0.87
42 0.88
43 0.89
44 0.9
45 0.9
46 0.87
47 0.86
48 0.8
49 0.76
50 0.76
51 0.74
52 0.74
53 0.75
54 0.75
55 0.72
56 0.77
57 0.78
58 0.77
59 0.79
60 0.77
61 0.77
62 0.81
63 0.83
64 0.84
65 0.82
66 0.79
67 0.76
68 0.76
69 0.76
70 0.77
71 0.75
72 0.75
73 0.7
74 0.66
75 0.61
76 0.52
77 0.43
78 0.38
79 0.35
80 0.33
81 0.39
82 0.4
83 0.38
84 0.42
85 0.48
86 0.52
87 0.54
88 0.54
89 0.54
90 0.59
91 0.64
92 0.68
93 0.68
94 0.65
95 0.66
96 0.65
97 0.62
98 0.58
99 0.53
100 0.46
101 0.45
102 0.38
103 0.33
104 0.28
105 0.23
106 0.18
107 0.19
108 0.18
109 0.14
110 0.19
111 0.26
112 0.33
113 0.4
114 0.44
115 0.5
116 0.57
117 0.61
118 0.64
119 0.65
120 0.68
121 0.7
122 0.77
123 0.77
124 0.74
125 0.71
126 0.64
127 0.55
128 0.45
129 0.36
130 0.26
131 0.2
132 0.21
133 0.19
134 0.18
135 0.16
136 0.15
137 0.15
138 0.14
139 0.11
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.12
149 0.12
150 0.14
151 0.15
152 0.15
153 0.16
154 0.19
155 0.18
156 0.19
157 0.19
158 0.18
159 0.17
160 0.15
161 0.13
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.15
180 0.23
181 0.3
182 0.31
183 0.32
184 0.38
185 0.39
186 0.38
187 0.35
188 0.28
189 0.24
190 0.26
191 0.27
192 0.21
193 0.2
194 0.19
195 0.18
196 0.16
197 0.12
198 0.09
199 0.07
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.09
214 0.12
215 0.15
216 0.17
217 0.17
218 0.24
219 0.32
220 0.33
221 0.37
222 0.34
223 0.36
224 0.41
225 0.45
226 0.44
227 0.38
228 0.35
229 0.3
230 0.31
231 0.27
232 0.21
233 0.16
234 0.11
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.15
263 0.16
264 0.18
265 0.23
266 0.24
267 0.26
268 0.29
269 0.31
270 0.29
271 0.27
272 0.24
273 0.19
274 0.18
275 0.16
276 0.14
277 0.14
278 0.16
279 0.17
280 0.2
281 0.21
282 0.22
283 0.25
284 0.28
285 0.28
286 0.3
287 0.35
288 0.33
289 0.33
290 0.3
291 0.29
292 0.28
293 0.27
294 0.23
295 0.18
296 0.2
297 0.19
298 0.19
299 0.2
300 0.22
301 0.23
302 0.26
303 0.24
304 0.22
305 0.22
306 0.23
307 0.21
308 0.16
309 0.12
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.06
324 0.12
325 0.13
326 0.13
327 0.15
328 0.16
329 0.16
330 0.16
331 0.15
332 0.09
333 0.09
334 0.1
335 0.11
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.13
340 0.14
341 0.16
342 0.17
343 0.24
344 0.24
345 0.26
346 0.32
347 0.32
348 0.33
349 0.31
350 0.3
351 0.21
352 0.18
353 0.16
354 0.1
355 0.09
356 0.08
357 0.06
358 0.06
359 0.04
360 0.04
361 0.09
362 0.09
363 0.12
364 0.16
365 0.18
366 0.21
367 0.24
368 0.3
369 0.26
370 0.27
371 0.26
372 0.24
373 0.24
374 0.21
375 0.19
376 0.13
377 0.13
378 0.11
379 0.11
380 0.09
381 0.08
382 0.09
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.06
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.11
398 0.11
399 0.14
400 0.16
401 0.19
402 0.22
403 0.23
404 0.27
405 0.27
406 0.27
407 0.26
408 0.29
409 0.27
410 0.26
411 0.25
412 0.2
413 0.19
414 0.16
415 0.13
416 0.09
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.06
424 0.07
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.1
430 0.1
431 0.12
432 0.12
433 0.13
434 0.18
435 0.18
436 0.24
437 0.23
438 0.24
439 0.23
440 0.25
441 0.26
442 0.25
443 0.28
444 0.23
445 0.27
446 0.25
447 0.26
448 0.28
449 0.29
450 0.3
451 0.32
452 0.33
453 0.31
454 0.32
455 0.33
456 0.3
457 0.28
458 0.24
459 0.2
460 0.19
461 0.21
462 0.19
463 0.17
464 0.23
465 0.24
466 0.27
467 0.33
468 0.33
469 0.31
470 0.32
471 0.33
472 0.28
473 0.25
474 0.21
475 0.14
476 0.14
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.15
481 0.15
482 0.23
483 0.25
484 0.28
485 0.36
486 0.36
487 0.38
488 0.38
489 0.4
490 0.32
491 0.3
492 0.26
493 0.19
494 0.21
495 0.18
496 0.16
497 0.15