Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1Z3M9

Protein Details
Accession A0A0D1Z3M9    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-31EDEAAPKVAKKHKPKKQKSKPEDTVVAAHydrophilic
44-72VEEAEPDEKQKKKKDKKRKREAIPEELEIBasic
74-100VSLPEPLSKKERRKAKKAKTTEGQGESHydrophilic
352-376DDADVKAKSKKKGRKWFVNRLLGREHydrophilic
418-446AQATLRSSHDRRREQRKAQKPKVDARTVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-23KVAKKHKPKKQKSK
52-64KQKKKKDKKRKRE
81-92SKKERRKAKKAK
357-371KAKSKKKGRKWFVNR
429-437RREQRKAQK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSEDEAAPKVAKKHKPKKQKSKPEDTVVAAAAAEVEDHVPASVEEAEPDEKQKKKKDKKRKREAIPEELEIDVSLPEPLSKKERRKAKKAKTTEGQGESETSPATNGEASVERRAPSGAKAGGGALKEEHKERRTEHSIWIGNLPWTATRQDLRDFLCDQASIRPSQIVRLHMPAPDKKVALDTRGRPPFANRGFAYVDFDGPEALFAALQLTETPFYRSGRNVLIKDAKSFEGRPEEHTAAAAAAAGSTTAVGSKAKGPAGNPQKPPSKRVFVGNLAFEITKEDLEQHFAQCGPVENVHMATFEDSGKCKGYAWVTFATLEAAEAAVRGWIFKEPEDGDENEVNGDDHADDADVKAKSKKKGRKWFVNRLLGREIKREYAEDASVRYKKRFGGAEKRRQDLTDAPITEVADGSSNAQATLRSSHDRRREQRKAQKPKVDARTVAPGAALARAQRTTGAITEAKGTKITFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.7
3 0.79
4 0.87
5 0.91
6 0.93
7 0.95
8 0.94
9 0.95
10 0.94
11 0.92
12 0.86
13 0.78
14 0.71
15 0.6
16 0.5
17 0.38
18 0.28
19 0.19
20 0.13
21 0.09
22 0.05
23 0.05
24 0.05
25 0.05
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.08
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.12
34 0.15
35 0.15
36 0.21
37 0.26
38 0.31
39 0.39
40 0.48
41 0.57
42 0.66
43 0.76
44 0.82
45 0.86
46 0.91
47 0.95
48 0.95
49 0.95
50 0.95
51 0.93
52 0.92
53 0.86
54 0.78
55 0.69
56 0.58
57 0.47
58 0.36
59 0.27
60 0.16
61 0.11
62 0.08
63 0.06
64 0.08
65 0.09
66 0.12
67 0.2
68 0.29
69 0.38
70 0.46
71 0.57
72 0.64
73 0.74
74 0.82
75 0.85
76 0.87
77 0.87
78 0.89
79 0.86
80 0.85
81 0.83
82 0.76
83 0.67
84 0.57
85 0.51
86 0.41
87 0.34
88 0.25
89 0.16
90 0.12
91 0.1
92 0.1
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.12
97 0.14
98 0.18
99 0.2
100 0.2
101 0.2
102 0.21
103 0.2
104 0.18
105 0.22
106 0.18
107 0.16
108 0.16
109 0.17
110 0.18
111 0.17
112 0.16
113 0.11
114 0.13
115 0.15
116 0.19
117 0.25
118 0.25
119 0.29
120 0.31
121 0.39
122 0.43
123 0.43
124 0.44
125 0.46
126 0.46
127 0.44
128 0.43
129 0.35
130 0.29
131 0.26
132 0.22
133 0.14
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.14
138 0.16
139 0.19
140 0.22
141 0.23
142 0.25
143 0.26
144 0.24
145 0.23
146 0.21
147 0.19
148 0.2
149 0.2
150 0.17
151 0.16
152 0.18
153 0.16
154 0.22
155 0.25
156 0.24
157 0.24
158 0.26
159 0.27
160 0.27
161 0.32
162 0.29
163 0.31
164 0.3
165 0.28
166 0.24
167 0.29
168 0.27
169 0.27
170 0.31
171 0.3
172 0.36
173 0.41
174 0.41
175 0.36
176 0.38
177 0.43
178 0.39
179 0.41
180 0.32
181 0.32
182 0.32
183 0.32
184 0.33
185 0.24
186 0.21
187 0.15
188 0.15
189 0.11
190 0.09
191 0.09
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.08
204 0.09
205 0.11
206 0.12
207 0.13
208 0.15
209 0.2
210 0.25
211 0.24
212 0.26
213 0.32
214 0.31
215 0.31
216 0.31
217 0.26
218 0.23
219 0.23
220 0.21
221 0.22
222 0.22
223 0.24
224 0.27
225 0.27
226 0.25
227 0.24
228 0.21
229 0.14
230 0.13
231 0.1
232 0.04
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.07
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.2
249 0.3
250 0.37
251 0.38
252 0.41
253 0.49
254 0.5
255 0.54
256 0.51
257 0.47
258 0.41
259 0.44
260 0.43
261 0.39
262 0.41
263 0.37
264 0.31
265 0.26
266 0.25
267 0.2
268 0.17
269 0.12
270 0.09
271 0.08
272 0.1
273 0.09
274 0.14
275 0.15
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.13
282 0.11
283 0.1
284 0.11
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.09
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.14
300 0.17
301 0.18
302 0.2
303 0.2
304 0.19
305 0.19
306 0.19
307 0.17
308 0.13
309 0.11
310 0.07
311 0.06
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.14
323 0.14
324 0.17
325 0.21
326 0.21
327 0.22
328 0.22
329 0.22
330 0.18
331 0.17
332 0.14
333 0.11
334 0.1
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.11
342 0.11
343 0.13
344 0.19
345 0.25
346 0.33
347 0.42
348 0.52
349 0.57
350 0.68
351 0.76
352 0.81
353 0.86
354 0.89
355 0.9
356 0.91
357 0.83
358 0.77
359 0.74
360 0.69
361 0.62
362 0.57
363 0.49
364 0.43
365 0.42
366 0.38
367 0.33
368 0.31
369 0.31
370 0.25
371 0.26
372 0.3
373 0.34
374 0.36
375 0.35
376 0.35
377 0.34
378 0.39
379 0.43
380 0.44
381 0.5
382 0.58
383 0.66
384 0.7
385 0.71
386 0.67
387 0.6
388 0.55
389 0.5
390 0.46
391 0.43
392 0.38
393 0.35
394 0.35
395 0.35
396 0.31
397 0.25
398 0.19
399 0.12
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.12
407 0.12
408 0.16
409 0.18
410 0.24
411 0.29
412 0.38
413 0.48
414 0.58
415 0.65
416 0.72
417 0.79
418 0.82
419 0.88
420 0.9
421 0.91
422 0.91
423 0.91
424 0.89
425 0.88
426 0.87
427 0.84
428 0.76
429 0.69
430 0.69
431 0.6
432 0.52
433 0.42
434 0.33
435 0.26
436 0.25
437 0.21
438 0.13
439 0.16
440 0.16
441 0.17
442 0.17
443 0.18
444 0.18
445 0.18
446 0.22
447 0.19
448 0.2
449 0.26
450 0.27
451 0.27
452 0.27