Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YDT3

Protein Details
Accession A0A0D1YDT3    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
149-178HRSSTDRSSSKSRKKTAKRGDKKEKVDVVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
155-173RSSSKSRKKTAKRGDKKEK
366-373RGGKGGGR
575-588GRGERGRGGGHRGG
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MSSSHVEAIKPASYAQAARGASHSTSAQPSKASSGAVTPARDQTGAPTLKPELHGARWADADDDDTRTSHSTASTAVENQPASNNKSHAATPAAQTNGVASPASVDFGGSSTSTLARDDGASPVSELPESAWDAKLKTAVDARSDAGRHRSSTDRSSSKSRKKTAKRGDKKEKVDVVDEKASKPAWSAPIKLVDAPAPTVNPWLARAQQAKPAVAPIPKPVALTNPTPSATSAAKSSGVDATKSASPAALTSLAQTSAQSKDSTAVGKPPALTEDAESKTKSTQQTERHVERSEQASKVAHTVVDDKAWPTPDTSKQEEPKGKHSQERSETDTHTTHESRGKQAWNKLEFTPTVVFQTALPGSARRGGKGGGRGGHDGRTRTPASSQNDRGNEAKSGTQAGEPTRRERSEATRSSSPGRAKRASNDDAPGRRQSRQESVTRDHPAKQQSDEPKFKPRDHVESASNVQRTKPVRKEAVVNGDKKSAEDNVSKDNATTSNGNTAATAASVNAAKDNKATATDATPAQATTSSTQAENQKKDVSPATSERKNSVVADFASRHHERKGSGTYSTFSGRGRGERGRGGGHRGGRGNGHTFHPNAHSFVNGQGAFNMQGYNAIPKSPTGFGHDPFFGQAPQNVQRYGRNYTGRASSIPDASYGRALNGFPVQSLQLNTGVQANGMFPSDFYMPATAVPYQSDPTSDLLAAVTRQMEYYFSIDNLLKDTYLRKHMDSQGFVLLTFIADFKRLKMMTQDLELIKYVCQQSPNIEHRVGSDGTDRLRAAKGWERWVLEKEERDPSAQHDGPESHHPPPRPNVQLPEHVHFARHSPLPIPQSAGPVLGAQPFQSLNSFAAPYNAYGPSTSSDAQPSISQFQASATAMAPGAVSVPQASAGPFGSPSAQPPLFSNAVEETEPDSFTDSEVEVLRVVLRDLPGETAGTTSSTSQRAQSNGLVEGVNGQRHPSGPNSSATPDESDRATSPTTSERFNRFLTSSGGNSVGGRLAGSRSGSRNGEAQPEGSTGVYYIKDKDSPSYNLPADVTSELYLAARDRAIQQRNFHPCPQDMMNMYQFWEHFLVRHFNARMYMEFRSFAMEDASTRNEFAGLNSLLRYYGKALAYADVPIRRSVAQDYVSLVRSEQPGSDRPAFKQLRAAWRDGALNMKNRKRIKDFLDEALEKELDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.24
4 0.22
5 0.23
6 0.25
7 0.25
8 0.23
9 0.25
10 0.24
11 0.2
12 0.27
13 0.29
14 0.28
15 0.27
16 0.28
17 0.3
18 0.3
19 0.27
20 0.2
21 0.2
22 0.25
23 0.28
24 0.28
25 0.27
26 0.3
27 0.31
28 0.31
29 0.28
30 0.26
31 0.31
32 0.31
33 0.28
34 0.28
35 0.29
36 0.31
37 0.33
38 0.34
39 0.3
40 0.31
41 0.37
42 0.35
43 0.35
44 0.33
45 0.32
46 0.28
47 0.23
48 0.23
49 0.19
50 0.2
51 0.18
52 0.17
53 0.19
54 0.2
55 0.2
56 0.18
57 0.17
58 0.14
59 0.15
60 0.17
61 0.18
62 0.19
63 0.21
64 0.24
65 0.23
66 0.23
67 0.28
68 0.3
69 0.32
70 0.34
71 0.33
72 0.31
73 0.33
74 0.33
75 0.3
76 0.3
77 0.28
78 0.27
79 0.31
80 0.31
81 0.28
82 0.27
83 0.26
84 0.22
85 0.2
86 0.17
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.12
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.1
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.12
105 0.12
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.13
113 0.12
114 0.11
115 0.13
116 0.15
117 0.16
118 0.17
119 0.18
120 0.19
121 0.2
122 0.23
123 0.2
124 0.2
125 0.24
126 0.24
127 0.26
128 0.27
129 0.27
130 0.29
131 0.29
132 0.3
133 0.32
134 0.33
135 0.31
136 0.33
137 0.39
138 0.39
139 0.45
140 0.5
141 0.48
142 0.5
143 0.59
144 0.66
145 0.69
146 0.74
147 0.76
148 0.77
149 0.82
150 0.88
151 0.89
152 0.9
153 0.9
154 0.92
155 0.94
156 0.93
157 0.9
158 0.89
159 0.84
160 0.76
161 0.72
162 0.65
163 0.6
164 0.59
165 0.53
166 0.44
167 0.41
168 0.38
169 0.31
170 0.28
171 0.26
172 0.26
173 0.28
174 0.3
175 0.31
176 0.37
177 0.38
178 0.37
179 0.33
180 0.28
181 0.26
182 0.25
183 0.22
184 0.17
185 0.16
186 0.17
187 0.17
188 0.15
189 0.16
190 0.17
191 0.18
192 0.23
193 0.28
194 0.28
195 0.34
196 0.37
197 0.36
198 0.33
199 0.34
200 0.31
201 0.3
202 0.29
203 0.26
204 0.28
205 0.28
206 0.29
207 0.26
208 0.28
209 0.28
210 0.3
211 0.29
212 0.28
213 0.27
214 0.27
215 0.27
216 0.25
217 0.23
218 0.2
219 0.18
220 0.16
221 0.17
222 0.16
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.17
227 0.16
228 0.18
229 0.18
230 0.18
231 0.17
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.13
236 0.11
237 0.1
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.15
246 0.14
247 0.13
248 0.14
249 0.16
250 0.18
251 0.16
252 0.18
253 0.19
254 0.2
255 0.2
256 0.19
257 0.19
258 0.19
259 0.18
260 0.15
261 0.2
262 0.21
263 0.24
264 0.23
265 0.23
266 0.23
267 0.28
268 0.3
269 0.29
270 0.34
271 0.4
272 0.49
273 0.58
274 0.61
275 0.6
276 0.58
277 0.54
278 0.5
279 0.49
280 0.44
281 0.36
282 0.33
283 0.3
284 0.28
285 0.28
286 0.25
287 0.18
288 0.14
289 0.16
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.14
294 0.16
295 0.18
296 0.17
297 0.16
298 0.2
299 0.27
300 0.32
301 0.37
302 0.42
303 0.45
304 0.53
305 0.58
306 0.56
307 0.57
308 0.61
309 0.59
310 0.58
311 0.59
312 0.59
313 0.6
314 0.61
315 0.59
316 0.53
317 0.51
318 0.48
319 0.44
320 0.37
321 0.34
322 0.3
323 0.28
324 0.3
325 0.31
326 0.31
327 0.35
328 0.4
329 0.41
330 0.46
331 0.52
332 0.49
333 0.5
334 0.46
335 0.44
336 0.37
337 0.35
338 0.31
339 0.23
340 0.21
341 0.18
342 0.17
343 0.14
344 0.18
345 0.14
346 0.13
347 0.13
348 0.11
349 0.12
350 0.18
351 0.19
352 0.15
353 0.16
354 0.17
355 0.2
356 0.24
357 0.27
358 0.24
359 0.27
360 0.29
361 0.29
362 0.34
363 0.33
364 0.3
365 0.28
366 0.3
367 0.28
368 0.26
369 0.28
370 0.3
371 0.33
372 0.4
373 0.44
374 0.45
375 0.46
376 0.48
377 0.46
378 0.4
379 0.35
380 0.28
381 0.24
382 0.18
383 0.17
384 0.15
385 0.15
386 0.15
387 0.17
388 0.23
389 0.24
390 0.27
391 0.32
392 0.32
393 0.33
394 0.34
395 0.38
396 0.41
397 0.44
398 0.46
399 0.44
400 0.45
401 0.47
402 0.49
403 0.48
404 0.44
405 0.46
406 0.44
407 0.42
408 0.46
409 0.51
410 0.49
411 0.45
412 0.44
413 0.43
414 0.43
415 0.44
416 0.45
417 0.4
418 0.39
419 0.4
420 0.4
421 0.41
422 0.42
423 0.44
424 0.43
425 0.45
426 0.5
427 0.51
428 0.48
429 0.44
430 0.44
431 0.44
432 0.4
433 0.38
434 0.38
435 0.42
436 0.49
437 0.52
438 0.5
439 0.54
440 0.57
441 0.56
442 0.57
443 0.53
444 0.52
445 0.51
446 0.52
447 0.44
448 0.44
449 0.46
450 0.42
451 0.39
452 0.32
453 0.26
454 0.28
455 0.31
456 0.35
457 0.38
458 0.39
459 0.41
460 0.42
461 0.47
462 0.47
463 0.53
464 0.5
465 0.46
466 0.4
467 0.4
468 0.38
469 0.33
470 0.29
471 0.21
472 0.19
473 0.19
474 0.2
475 0.21
476 0.23
477 0.22
478 0.21
479 0.2
480 0.17
481 0.16
482 0.15
483 0.11
484 0.14
485 0.15
486 0.15
487 0.13
488 0.13
489 0.11
490 0.09
491 0.09
492 0.04
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.1
504 0.08
505 0.1
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.1
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.07
515 0.09
516 0.09
517 0.09
518 0.12
519 0.2
520 0.26
521 0.26
522 0.27
523 0.29
524 0.28
525 0.3
526 0.3
527 0.24
528 0.21
529 0.25
530 0.3
531 0.31
532 0.32
533 0.31
534 0.3
535 0.3
536 0.27
537 0.21
538 0.17
539 0.14
540 0.16
541 0.16
542 0.15
543 0.21
544 0.21
545 0.22
546 0.21
547 0.23
548 0.2
549 0.24
550 0.28
551 0.23
552 0.23
553 0.23
554 0.22
555 0.22
556 0.23
557 0.19
558 0.14
559 0.16
560 0.15
561 0.15
562 0.18
563 0.19
564 0.2
565 0.2
566 0.22
567 0.22
568 0.22
569 0.25
570 0.24
571 0.24
572 0.25
573 0.24
574 0.23
575 0.21
576 0.22
577 0.21
578 0.19
579 0.18
580 0.17
581 0.17
582 0.17
583 0.2
584 0.19
585 0.17
586 0.16
587 0.14
588 0.13
589 0.13
590 0.17
591 0.14
592 0.13
593 0.11
594 0.12
595 0.12
596 0.11
597 0.1
598 0.05
599 0.06
600 0.06
601 0.09
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.08
606 0.11
607 0.11
608 0.11
609 0.16
610 0.18
611 0.19
612 0.21
613 0.21
614 0.19
615 0.18
616 0.18
617 0.12
618 0.1
619 0.1
620 0.12
621 0.17
622 0.18
623 0.19
624 0.19
625 0.22
626 0.25
627 0.28
628 0.3
629 0.28
630 0.27
631 0.29
632 0.3
633 0.28
634 0.25
635 0.24
636 0.19
637 0.18
638 0.17
639 0.16
640 0.14
641 0.13
642 0.15
643 0.11
644 0.1
645 0.1
646 0.1
647 0.09
648 0.1
649 0.1
650 0.08
651 0.08
652 0.09
653 0.09
654 0.09
655 0.09
656 0.09
657 0.09
658 0.1
659 0.11
660 0.1
661 0.09
662 0.09
663 0.08
664 0.06
665 0.07
666 0.06
667 0.05
668 0.07
669 0.08
670 0.07
671 0.08
672 0.08
673 0.07
674 0.08
675 0.09
676 0.08
677 0.08
678 0.08
679 0.09
680 0.09
681 0.09
682 0.1
683 0.1
684 0.1
685 0.11
686 0.1
687 0.09
688 0.08
689 0.09
690 0.08
691 0.07
692 0.06
693 0.05
694 0.06
695 0.06
696 0.06
697 0.07
698 0.09
699 0.09
700 0.09
701 0.11
702 0.11
703 0.11
704 0.13
705 0.12
706 0.1
707 0.1
708 0.13
709 0.14
710 0.21
711 0.22
712 0.22
713 0.28
714 0.35
715 0.39
716 0.37
717 0.35
718 0.31
719 0.3
720 0.28
721 0.22
722 0.15
723 0.1
724 0.09
725 0.07
726 0.04
727 0.07
728 0.07
729 0.07
730 0.14
731 0.14
732 0.14
733 0.17
734 0.22
735 0.21
736 0.22
737 0.26
738 0.21
739 0.22
740 0.22
741 0.18
742 0.14
743 0.17
744 0.17
745 0.14
746 0.15
747 0.15
748 0.19
749 0.27
750 0.31
751 0.31
752 0.3
753 0.28
754 0.28
755 0.31
756 0.27
757 0.2
758 0.18
759 0.16
760 0.17
761 0.19
762 0.18
763 0.16
764 0.16
765 0.16
766 0.17
767 0.23
768 0.26
769 0.29
770 0.33
771 0.33
772 0.35
773 0.37
774 0.39
775 0.35
776 0.34
777 0.32
778 0.34
779 0.33
780 0.32
781 0.3
782 0.28
783 0.33
784 0.31
785 0.28
786 0.25
787 0.25
788 0.26
789 0.33
790 0.33
791 0.29
792 0.32
793 0.33
794 0.35
795 0.39
796 0.45
797 0.43
798 0.43
799 0.45
800 0.45
801 0.53
802 0.54
803 0.52
804 0.48
805 0.41
806 0.39
807 0.32
808 0.3
809 0.25
810 0.22
811 0.19
812 0.16
813 0.22
814 0.24
815 0.24
816 0.25
817 0.22
818 0.23
819 0.23
820 0.22
821 0.17
822 0.14
823 0.14
824 0.13
825 0.12
826 0.09
827 0.1
828 0.09
829 0.1
830 0.1
831 0.1
832 0.09
833 0.11
834 0.12
835 0.1
836 0.12
837 0.12
838 0.12
839 0.14
840 0.14
841 0.12
842 0.11
843 0.13
844 0.12
845 0.15
846 0.15
847 0.13
848 0.15
849 0.15
850 0.16
851 0.16
852 0.17
853 0.17
854 0.16
855 0.15
856 0.13
857 0.14
858 0.16
859 0.15
860 0.13
861 0.1
862 0.1
863 0.1
864 0.1
865 0.09
866 0.06
867 0.06
868 0.05
869 0.05
870 0.04
871 0.05
872 0.05
873 0.06
874 0.06
875 0.07
876 0.07
877 0.07
878 0.07
879 0.08
880 0.1
881 0.1
882 0.11
883 0.18
884 0.17
885 0.18
886 0.19
887 0.24
888 0.23
889 0.23
890 0.23
891 0.17
892 0.19
893 0.18
894 0.17
895 0.14
896 0.14
897 0.15
898 0.13
899 0.14
900 0.12
901 0.12
902 0.13
903 0.1
904 0.11
905 0.11
906 0.12
907 0.09
908 0.1
909 0.1
910 0.09
911 0.09
912 0.09
913 0.09
914 0.1
915 0.1
916 0.11
917 0.11
918 0.11
919 0.11
920 0.09
921 0.09
922 0.09
923 0.09
924 0.1
925 0.13
926 0.15
927 0.16
928 0.19
929 0.22
930 0.23
931 0.26
932 0.27
933 0.26
934 0.24
935 0.25
936 0.21
937 0.17
938 0.2
939 0.2
940 0.19
941 0.16
942 0.17
943 0.16
944 0.17
945 0.2
946 0.19
947 0.22
948 0.23
949 0.25
950 0.27
951 0.28
952 0.29
953 0.28
954 0.28
955 0.23
956 0.23
957 0.21
958 0.21
959 0.2
960 0.21
961 0.2
962 0.17
963 0.17
964 0.23
965 0.24
966 0.26
967 0.31
968 0.33
969 0.36
970 0.38
971 0.4
972 0.33
973 0.34
974 0.34
975 0.31
976 0.27
977 0.25
978 0.24
979 0.21
980 0.2
981 0.18
982 0.15
983 0.11
984 0.1
985 0.09
986 0.09
987 0.1
988 0.12
989 0.15
990 0.18
991 0.23
992 0.25
993 0.25
994 0.29
995 0.29
996 0.33
997 0.3
998 0.28
999 0.24
1000 0.24
1001 0.23
1002 0.19
1003 0.16
1004 0.11
1005 0.13
1006 0.13
1007 0.13
1008 0.15
1009 0.17
1010 0.2
1011 0.21
1012 0.25
1013 0.28
1014 0.32
1015 0.35
1016 0.4
1017 0.37
1018 0.36
1019 0.36
1020 0.31
1021 0.28
1022 0.24
1023 0.22
1024 0.15
1025 0.14
1026 0.12
1027 0.12
1028 0.12
1029 0.1
1030 0.11
1031 0.09
1032 0.1
1033 0.16
1034 0.25
1035 0.32
1036 0.37
1037 0.42
1038 0.5
1039 0.59
1040 0.63
1041 0.62
1042 0.58
1043 0.52
1044 0.53
1045 0.5
1046 0.46
1047 0.39
1048 0.4
1049 0.39
1050 0.34
1051 0.34
1052 0.3
1053 0.27
1054 0.24
1055 0.24
1056 0.19
1057 0.17
1058 0.2
1059 0.26
1060 0.26
1061 0.34
1062 0.32
1063 0.31
1064 0.35
1065 0.36
1066 0.35
1067 0.32
1068 0.34
1069 0.29
1070 0.28
1071 0.26
1072 0.27
1073 0.25
1074 0.22
1075 0.2
1076 0.17
1077 0.16
1078 0.19
1079 0.23
1080 0.19
1081 0.19
1082 0.19
1083 0.17
1084 0.17
1085 0.17
1086 0.2
1087 0.17
1088 0.18
1089 0.18
1090 0.18
1091 0.18
1092 0.18
1093 0.19
1094 0.14
1095 0.19
1096 0.18
1097 0.2
1098 0.21
1099 0.21
1100 0.22
1101 0.23
1102 0.25
1103 0.23
1104 0.24
1105 0.23
1106 0.24
1107 0.23
1108 0.24
1109 0.25
1110 0.26
1111 0.25
1112 0.24
1113 0.27
1114 0.29
1115 0.3
1116 0.28
1117 0.25
1118 0.23
1119 0.24
1120 0.23
1121 0.22
1122 0.23
1123 0.26
1124 0.33
1125 0.41
1126 0.4
1127 0.4
1128 0.5
1129 0.5
1130 0.47
1131 0.51
1132 0.51
1133 0.53
1134 0.55
1135 0.56
1136 0.48
1137 0.49
1138 0.5
1139 0.43
1140 0.44
1141 0.39
1142 0.43
1143 0.49
1144 0.53
1145 0.59
1146 0.63
1147 0.7
1148 0.69
1149 0.72
1150 0.7
1151 0.71
1152 0.68
1153 0.67
1154 0.7
1155 0.62
1156 0.57
1157 0.53