Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YPY6

Protein Details
Accession A0A0D1YPY6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
371-400MGGTSRVGKKRKGDRHENRHEKNEKRSKSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
377-403VGKKRKGDRHENRHEKNEKRSKSGPSG
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.499, cyto 8, cyto_mito 6.166, cyto_pero 5.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR039328  WDR89  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
Amino Acid Sequences MKTYHSNAESVLGLPANSYIYNITSSVVQQDIRSQSFPILSGSDYLVVISSDDSIRSLDPERLKTVNVIKNAHKSITSIKRYAHPGSQCNSFMTCGRDGIVRGWDMRSGNKVVELSVPSSEPLSALDCNAEMQAVVAGTELEGNAPGDVSIFGWDMRMPGNIKMKYEESHNDTVTELRFLPAVGETNTLLLSAGTDGMVNIFNTAFIEEDEALFQVIKSASALQHAGMIDGDIFTLGTDETLAFYAFQNPDLDTKDPAPCSLGDVREQFSCEYVVNMYQAGSKPYLAVGNHTEKWLDLIRFKNKTSDPTDTRKWKAKSSEGSKIRLSGGHGEELVRDVLITDGAKVVYTCGEDGAVRVWKGQGDDDDDVEMGGTSRVGKKRKGDRHENRHEKNEKRSKSGPSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.12
4 0.11
5 0.11
6 0.1
7 0.11
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.13
13 0.15
14 0.16
15 0.15
16 0.15
17 0.21
18 0.27
19 0.28
20 0.29
21 0.27
22 0.27
23 0.27
24 0.28
25 0.22
26 0.18
27 0.15
28 0.16
29 0.16
30 0.14
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.09
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.12
44 0.14
45 0.19
46 0.24
47 0.27
48 0.31
49 0.32
50 0.32
51 0.35
52 0.42
53 0.41
54 0.41
55 0.43
56 0.44
57 0.51
58 0.53
59 0.49
60 0.4
61 0.36
62 0.4
63 0.45
64 0.46
65 0.41
66 0.41
67 0.46
68 0.51
69 0.53
70 0.5
71 0.46
72 0.46
73 0.46
74 0.5
75 0.45
76 0.41
77 0.38
78 0.33
79 0.29
80 0.27
81 0.24
82 0.19
83 0.18
84 0.18
85 0.18
86 0.19
87 0.19
88 0.16
89 0.17
90 0.17
91 0.19
92 0.19
93 0.2
94 0.22
95 0.2
96 0.19
97 0.2
98 0.2
99 0.17
100 0.19
101 0.18
102 0.16
103 0.15
104 0.15
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.09
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.03
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.09
145 0.09
146 0.13
147 0.22
148 0.23
149 0.23
150 0.26
151 0.27
152 0.25
153 0.28
154 0.27
155 0.25
156 0.28
157 0.27
158 0.25
159 0.24
160 0.25
161 0.21
162 0.19
163 0.13
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.07
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.1
233 0.1
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.14
238 0.16
239 0.17
240 0.14
241 0.17
242 0.19
243 0.19
244 0.18
245 0.18
246 0.15
247 0.18
248 0.2
249 0.18
250 0.19
251 0.2
252 0.22
253 0.21
254 0.23
255 0.19
256 0.16
257 0.16
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.15
273 0.12
274 0.15
275 0.18
276 0.24
277 0.25
278 0.25
279 0.24
280 0.21
281 0.24
282 0.25
283 0.21
284 0.21
285 0.27
286 0.35
287 0.4
288 0.41
289 0.45
290 0.43
291 0.48
292 0.48
293 0.5
294 0.48
295 0.51
296 0.6
297 0.61
298 0.64
299 0.67
300 0.64
301 0.62
302 0.63
303 0.64
304 0.65
305 0.65
306 0.7
307 0.66
308 0.67
309 0.61
310 0.56
311 0.49
312 0.4
313 0.35
314 0.32
315 0.29
316 0.27
317 0.26
318 0.23
319 0.22
320 0.22
321 0.2
322 0.12
323 0.09
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.09
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.1
337 0.09
338 0.1
339 0.09
340 0.1
341 0.14
342 0.16
343 0.15
344 0.16
345 0.17
346 0.18
347 0.2
348 0.22
349 0.21
350 0.23
351 0.25
352 0.25
353 0.25
354 0.23
355 0.21
356 0.18
357 0.14
358 0.08
359 0.07
360 0.06
361 0.08
362 0.16
363 0.23
364 0.28
365 0.35
366 0.44
367 0.55
368 0.65
369 0.72
370 0.76
371 0.8
372 0.86
373 0.92
374 0.93
375 0.9
376 0.9
377 0.9
378 0.86
379 0.86
380 0.86
381 0.81
382 0.78
383 0.77