Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O74443

Protein Details
Accession O74443    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-88ELIWLRRKRIHPIPKARRNNHVGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-83RRKRIHPIPKARR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:1990483  C:Clr6 histone deacetylase complex I''  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070210  C:Rpd3L-Expanded complex  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG spo:SPCC1682.13  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04433  SWIRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50934  SWIRM  
Amino Acid Sequences MQILKDQENLNPDGGSFVLITPPLSPPKQKSLSYTNISRRHGMRACMKGIVYEVYKNQPKLWLQQELIWLRRKRIHPIPKARRNNHVGRWANRHSNVSSSSGSRGRSSVSSRDSSPSYSGALRSAERSISSSPSTIEARRRKSARGNGLNGAIDVANLPFEELPNFCPDMSVLDNRTHPRTLKAEWKGPPLDLSDDPYRDLLHPAELHLASTLRLPCLIYLDNKKRIFAEWHHRRQQGLTFRKTDAQRASRVDVNKASRLWKAFHEVGFFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.15
3 0.11
4 0.09
5 0.09
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.14
10 0.19
11 0.21
12 0.27
13 0.31
14 0.4
15 0.46
16 0.47
17 0.5
18 0.52
19 0.57
20 0.58
21 0.62
22 0.62
23 0.64
24 0.64
25 0.64
26 0.58
27 0.58
28 0.56
29 0.54
30 0.53
31 0.51
32 0.5
33 0.47
34 0.45
35 0.36
36 0.34
37 0.3
38 0.23
39 0.2
40 0.21
41 0.26
42 0.32
43 0.32
44 0.32
45 0.35
46 0.35
47 0.4
48 0.42
49 0.41
50 0.36
51 0.39
52 0.45
53 0.44
54 0.46
55 0.48
56 0.44
57 0.41
58 0.47
59 0.47
60 0.47
61 0.53
62 0.59
63 0.6
64 0.7
65 0.77
66 0.8
67 0.88
68 0.84
69 0.82
70 0.8
71 0.77
72 0.73
73 0.72
74 0.68
75 0.63
76 0.67
77 0.64
78 0.63
79 0.58
80 0.54
81 0.44
82 0.41
83 0.37
84 0.33
85 0.28
86 0.23
87 0.24
88 0.24
89 0.24
90 0.22
91 0.2
92 0.18
93 0.19
94 0.22
95 0.23
96 0.24
97 0.25
98 0.26
99 0.28
100 0.27
101 0.26
102 0.24
103 0.19
104 0.16
105 0.15
106 0.14
107 0.13
108 0.14
109 0.12
110 0.13
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.13
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.14
121 0.15
122 0.16
123 0.24
124 0.28
125 0.32
126 0.38
127 0.4
128 0.41
129 0.47
130 0.53
131 0.55
132 0.55
133 0.53
134 0.48
135 0.49
136 0.45
137 0.36
138 0.29
139 0.18
140 0.11
141 0.08
142 0.06
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.07
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.12
157 0.14
158 0.15
159 0.15
160 0.16
161 0.2
162 0.23
163 0.26
164 0.25
165 0.24
166 0.26
167 0.28
168 0.29
169 0.35
170 0.38
171 0.42
172 0.43
173 0.49
174 0.45
175 0.42
176 0.39
177 0.32
178 0.3
179 0.24
180 0.26
181 0.24
182 0.24
183 0.24
184 0.23
185 0.22
186 0.19
187 0.2
188 0.16
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.19
193 0.17
194 0.17
195 0.16
196 0.15
197 0.12
198 0.16
199 0.16
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.11
204 0.15
205 0.17
206 0.19
207 0.28
208 0.36
209 0.45
210 0.46
211 0.47
212 0.44
213 0.45
214 0.46
215 0.44
216 0.47
217 0.48
218 0.58
219 0.65
220 0.67
221 0.65
222 0.62
223 0.62
224 0.61
225 0.6
226 0.57
227 0.52
228 0.53
229 0.59
230 0.57
231 0.57
232 0.56
233 0.52
234 0.52
235 0.53
236 0.56
237 0.54
238 0.54
239 0.52
240 0.51
241 0.5
242 0.49
243 0.46
244 0.45
245 0.45
246 0.46
247 0.42
248 0.39
249 0.42
250 0.41
251 0.41
252 0.4