Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O42954

Protein Details
Accession O42954    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
255-279RSSVRRSQSFKNRRNGKPRISRLHTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033897  MADS_SRF-like  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0097221  C:M/G1 phase-specific MADS box-forkhead transcription factor complex  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00350  MADS_BOX_1  
PS50066  MADS_BOX_2  
CDD cd00266  MADS_SRF_like  
Amino Acid Sequences MDINPPPSTAPSSPRRSIQRISDAKNKALTFNRRRLGLIKKAHELSVLCDAKVVVMIFDSKNACHVYSSEEPEEQRDALLQKFLNKDFVTVDPLRNINPNIPSDESLHNWRPKDKRIASVTTYSAQPSNNCSSATDSENDFQSFTIKSSTTYHTTPTTASENKKIESITIPDHASVYNDLPLSPTVKHSFVSPVSGDYSDSPLEPSSSSSFSVPPESLNPTLSFQHNDVPQTDNFIPFLTPKRQAYGQSSSRADRSSVRRSQSFKNRRNGKPRISRLHTSHASIDGLTDFIQSPSSGYLDPSSTPITPLDSAINQITPPFLPDNLGQENRGELYSHDNPTSMVYEHPKFDELPNGFIDTHELNILSRSFTASPNQILRESNMVNQDSFTDNPVDATWDALIGTTQIDLDLDYERSSIPSSTIPADQLKDGVPTNSVYRNNMVDHNLYPSLNIERNAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.61
3 0.62
4 0.65
5 0.66
6 0.67
7 0.68
8 0.7
9 0.73
10 0.69
11 0.67
12 0.67
13 0.59
14 0.55
15 0.55
16 0.6
17 0.59
18 0.64
19 0.64
20 0.59
21 0.61
22 0.6
23 0.6
24 0.59
25 0.59
26 0.56
27 0.58
28 0.58
29 0.56
30 0.54
31 0.45
32 0.4
33 0.4
34 0.36
35 0.28
36 0.26
37 0.25
38 0.22
39 0.24
40 0.2
41 0.09
42 0.09
43 0.12
44 0.11
45 0.16
46 0.17
47 0.14
48 0.18
49 0.2
50 0.19
51 0.17
52 0.18
53 0.21
54 0.26
55 0.32
56 0.31
57 0.32
58 0.32
59 0.34
60 0.36
61 0.29
62 0.23
63 0.2
64 0.2
65 0.18
66 0.22
67 0.2
68 0.23
69 0.28
70 0.29
71 0.32
72 0.3
73 0.3
74 0.28
75 0.29
76 0.3
77 0.27
78 0.28
79 0.26
80 0.27
81 0.27
82 0.29
83 0.28
84 0.26
85 0.27
86 0.27
87 0.27
88 0.29
89 0.29
90 0.28
91 0.3
92 0.29
93 0.32
94 0.38
95 0.39
96 0.39
97 0.44
98 0.47
99 0.51
100 0.59
101 0.56
102 0.57
103 0.58
104 0.62
105 0.58
106 0.56
107 0.52
108 0.43
109 0.4
110 0.32
111 0.28
112 0.23
113 0.21
114 0.22
115 0.24
116 0.24
117 0.23
118 0.22
119 0.25
120 0.26
121 0.27
122 0.23
123 0.21
124 0.21
125 0.23
126 0.22
127 0.18
128 0.15
129 0.15
130 0.13
131 0.12
132 0.13
133 0.11
134 0.12
135 0.16
136 0.2
137 0.21
138 0.22
139 0.24
140 0.23
141 0.24
142 0.22
143 0.22
144 0.23
145 0.25
146 0.27
147 0.32
148 0.32
149 0.32
150 0.33
151 0.3
152 0.26
153 0.23
154 0.23
155 0.18
156 0.19
157 0.19
158 0.18
159 0.18
160 0.17
161 0.15
162 0.14
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.11
171 0.14
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.18
177 0.17
178 0.19
179 0.15
180 0.14
181 0.15
182 0.15
183 0.15
184 0.11
185 0.13
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.13
201 0.11
202 0.12
203 0.15
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.16
209 0.17
210 0.16
211 0.13
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.16
216 0.18
217 0.16
218 0.2
219 0.2
220 0.16
221 0.15
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.17
226 0.15
227 0.19
228 0.19
229 0.21
230 0.23
231 0.25
232 0.29
233 0.33
234 0.33
235 0.35
236 0.37
237 0.35
238 0.35
239 0.33
240 0.29
241 0.27
242 0.3
243 0.33
244 0.36
245 0.39
246 0.42
247 0.46
248 0.53
249 0.58
250 0.62
251 0.62
252 0.66
253 0.72
254 0.76
255 0.82
256 0.81
257 0.8
258 0.8
259 0.81
260 0.81
261 0.77
262 0.75
263 0.69
264 0.7
265 0.62
266 0.53
267 0.46
268 0.38
269 0.32
270 0.25
271 0.21
272 0.12
273 0.11
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.06
278 0.07
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.12
289 0.13
290 0.12
291 0.13
292 0.12
293 0.14
294 0.13
295 0.14
296 0.13
297 0.11
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.08
305 0.11
306 0.1
307 0.09
308 0.11
309 0.12
310 0.17
311 0.22
312 0.23
313 0.21
314 0.2
315 0.21
316 0.2
317 0.19
318 0.14
319 0.09
320 0.16
321 0.21
322 0.23
323 0.23
324 0.22
325 0.22
326 0.23
327 0.25
328 0.17
329 0.15
330 0.19
331 0.21
332 0.22
333 0.23
334 0.23
335 0.22
336 0.23
337 0.28
338 0.24
339 0.24
340 0.24
341 0.25
342 0.23
343 0.22
344 0.24
345 0.16
346 0.15
347 0.13
348 0.12
349 0.1
350 0.12
351 0.13
352 0.1
353 0.1
354 0.12
355 0.13
356 0.15
357 0.19
358 0.2
359 0.24
360 0.27
361 0.3
362 0.29
363 0.29
364 0.29
365 0.31
366 0.29
367 0.28
368 0.31
369 0.3
370 0.27
371 0.26
372 0.27
373 0.24
374 0.23
375 0.21
376 0.16
377 0.15
378 0.16
379 0.15
380 0.17
381 0.13
382 0.14
383 0.12
384 0.1
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.1
400 0.1
401 0.11
402 0.13
403 0.12
404 0.12
405 0.13
406 0.16
407 0.18
408 0.19
409 0.21
410 0.24
411 0.25
412 0.24
413 0.24
414 0.22
415 0.22
416 0.22
417 0.2
418 0.17
419 0.18
420 0.21
421 0.27
422 0.29
423 0.29
424 0.31
425 0.33
426 0.35
427 0.37
428 0.37
429 0.33
430 0.31
431 0.34
432 0.33
433 0.29
434 0.27
435 0.26
436 0.28
437 0.29