FuNGI

P40848

Protein Details

Accession

P40848

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-125	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSSRE	Hydrophilic
401-421	QEDRRNENYRRRQQRESNQES	Hydrophilic
770-790	LVKQLYSKKRQGKPLKLSGKM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 8.5, cyto_mito 8, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0090730 C:Las1 complex GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000448 P:cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0071028 P:nuclear mRNA surveillance GO:0000956 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process GO:0051984 P:positive regulation of chromosome segregation GO:0106354 P:tRNA surveillance
KEGG	spo:SPAC26A3.12c -
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRLLSRKFAKVITPVIEAPTEKLPDGTEIEPDLSLPNPNGVECDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPAPETEDEMMVAVFEYTDRILAMVRPRQLLFIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSSREAALKEEELQAFIEEAKQQGIPIDENATKKKSWDSNCITPGTPFMDTLAKSLRYYIINKLNSDPCWRNVRFILSDASVPGEGEHKIMEFIRSQRVKPEYDPNTHHVVYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQQGSTKKTKEERLGIKRLDDVSETNKVPVKKPFIWLNVSILREYLEVELYVPNLPFPFDLERAIDDWVFFIFFVGNDFLPHLPSLDIRDGAVERLTEIWRASLPHMGGYLTLDGSVNLARAEVILSAVGNQEDDIFKRLKQQEDRRNENYRRRQQRESNQESESYVDNVVIQRSVETQSTEVVTSSKSTSVDTKPPKKTQKIDAPAPVDLVNLSEKTSNRSLGATNRELINNRAANRLGLSREAAAVSSVNKLAASALKAQLVSNETLQNVPLEDSIASSSAYEDTDSIESSTPVVHPIDTKVSNVGQKRKAPDSTEENENTDTVRLYEPGYRERYYEQKFHISPDEPEKIREAVKHYVHGLCWVLLYYYQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFKDLASIDVKFELNQPFKPYEQLLGVLPAASKNNLPEKLQTLMTDENSEIIDFYPENFTIDLNGKKFEWQGVALLPFIDENRLLNAVSKIYPQLTEEESKRNEDGSTLLFISEHHPMFSELVKQLYSKKRQGKPLKLSGKMAHGLFGKVNTNDSVIPNVSVQCPIDVTSADALQKYGSIDDNQSISLVFEVPKSHFVHKSMLLRGVKMPNRVLTPEDINQVRAERSFSSRRNNGNSYRGGHQSYGVRRSYQSQSYSSRQSYTGVTNGFANGGVQPPWSGNGNFPRSNASYNSRGGHEGYGGRSRGGGYSNGPPAGNHYSSNRGKGYGYQRESYNNNNRNGYY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.41
3	0.41
4	0.44
5	0.4
6	0.4
7	0.37
8	0.37
9	0.37
10	0.32
11	0.29
12	0.29
13	0.27
14	0.23
15	0.22
16	0.21
17	0.22
18	0.25
19	0.23
20	0.2
21	0.2
22	0.21
23	0.2
24	0.19
25	0.17
26	0.14
27	0.16
28	0.14
29	0.16
30	0.15
31	0.16
32	0.17
33	0.17
34	0.19
35	0.18
36	0.21
37	0.18
38	0.18
39	0.19
40	0.17
41	0.16
42	0.14
43	0.13
44	0.1
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.11
49	0.13
50	0.18
51	0.21
52	0.23
53	0.29
54	0.36
55	0.4
56	0.44
57	0.44
58	0.43
59	0.41
60	0.41
61	0.35
62	0.29
63	0.23
64	0.2
65	0.16
66	0.11
67	0.1
68	0.07
69	0.05
70	0.04
71	0.05
72	0.05
73	0.06
74	0.06
75	0.06
76	0.07
77	0.11
78	0.19
79	0.24
80	0.27
81	0.3
82	0.31
83	0.32
84	0.32
85	0.31
86	0.24
87	0.2
88	0.18
89	0.14
90	0.14
91	0.13
92	0.14
93	0.12
94	0.11
95	0.1
96	0.12
97	0.19
98	0.27
99	0.37
100	0.45
101	0.55
102	0.66
103	0.74
104	0.8
105	0.84
106	0.82
107	0.8
108	0.8
109	0.77
110	0.77
111	0.78
112	0.72
113	0.65
114	0.63
115	0.57
116	0.49
117	0.47
118	0.37
119	0.27
120	0.25
121	0.21
122	0.16
123	0.15
124	0.15
125	0.1
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.11
130	0.12
131	0.14
132	0.13
133	0.14
134	0.18
135	0.2
136	0.24
137	0.29
138	0.3
139	0.28
140	0.29
141	0.35
142	0.39
143	0.41
144	0.47
145	0.51
146	0.56
147	0.61
148	0.62
149	0.55
150	0.47
151	0.44
152	0.37
153	0.3
154	0.2
155	0.18
156	0.2
157	0.19
158	0.21
159	0.24
160	0.22
161	0.21
162	0.23
163	0.25
164	0.24
165	0.26
166	0.32
167	0.36
168	0.37
169	0.39
170	0.43
171	0.45
172	0.43
173	0.49
174	0.44
175	0.4
176	0.46
177	0.45
178	0.44
179	0.42
180	0.45
181	0.39
182	0.37
183	0.36
184	0.27
185	0.27
186	0.23
187	0.22
188	0.16
189	0.14
190	0.13
191	0.11
192	0.1
193	0.1
194	0.1
195	0.08
196	0.09
197	0.1
198	0.11
199	0.13
200	0.16
201	0.25
202	0.28
203	0.28
204	0.35
205	0.38
206	0.4
207	0.4
208	0.48
209	0.44
210	0.48
211	0.53
212	0.49
213	0.52
214	0.49
215	0.44
216	0.35
217	0.29
218	0.22
219	0.2
220	0.16
221	0.09
222	0.08
223	0.08
224	0.07
225	0.06
226	0.05
227	0.03
228	0.02
229	0.03
230	0.03
231	0.04
232	0.05
233	0.07
234	0.08
235	0.11
236	0.13
237	0.13
238	0.18
239	0.2
240	0.24
241	0.25
242	0.27
243	0.25
244	0.28
245	0.27
246	0.23
247	0.26
248	0.25
249	0.27
250	0.3
251	0.3
252	0.31
253	0.38
254	0.44
255	0.46
256	0.51
257	0.56
258	0.6
259	0.67
260	0.63
261	0.59
262	0.56
263	0.5
264	0.42
265	0.34
266	0.27
267	0.23
268	0.27
269	0.26
270	0.24
271	0.27
272	0.27
273	0.29
274	0.33
275	0.36
276	0.33
277	0.38
278	0.42
279	0.43
280	0.46
281	0.44
282	0.43
283	0.4
284	0.38
285	0.33
286	0.26
287	0.22
288	0.18
289	0.18
290	0.13
291	0.08
292	0.07
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.1
297	0.08
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.1
303	0.12
304	0.12
305	0.13
306	0.14
307	0.15
308	0.15
309	0.16
310	0.14
311	0.1
312	0.1
313	0.09
314	0.08
315	0.06
316	0.06
317	0.05
318	0.04
319	0.06
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.09
324	0.08
325	0.09
326	0.09
327	0.08
328	0.07
329	0.08
330	0.11
331	0.12
332	0.12
333	0.11
334	0.12
335	0.12
336	0.12
337	0.12
338	0.09
339	0.07
340	0.09
341	0.1
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.1
346	0.11
347	0.12
348	0.13
349	0.13
350	0.12
351	0.13
352	0.12
353	0.11
354	0.11
355	0.1
356	0.06
357	0.07
358	0.06
359	0.05
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.05
374	0.05
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.06
379	0.07
380	0.09
381	0.09
382	0.1
383	0.18
384	0.22
385	0.28
386	0.37
387	0.46
388	0.54
389	0.62
390	0.7
391	0.68
392	0.74
393	0.75
394	0.76
395	0.76
396	0.77
397	0.78
398	0.77
399	0.78
400	0.78
401	0.8
402	0.81
403	0.78
404	0.73
405	0.63
406	0.58
407	0.5
408	0.42
409	0.33
410	0.23
411	0.15
412	0.1
413	0.1
414	0.1
415	0.09
416	0.08
417	0.07
418	0.06
419	0.07
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.09
428	0.08
429	0.07
430	0.08
431	0.08
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.13
436	0.16
437	0.24
438	0.32
439	0.4
440	0.45
441	0.53
442	0.61
443	0.64
444	0.66
445	0.66
446	0.67
447	0.65
448	0.63
449	0.61
450	0.55
451	0.48
452	0.45
453	0.36
454	0.25
455	0.18
456	0.14
457	0.09
458	0.07
459	0.07
460	0.09
461	0.09
462	0.13
463	0.15
464	0.15
465	0.14
466	0.15
467	0.16
468	0.18
469	0.24
470	0.21
471	0.21
472	0.21
473	0.22
474	0.22
475	0.22
476	0.23
477	0.2
478	0.2
479	0.21
480	0.2
481	0.19
482	0.19
483	0.19
484	0.14
485	0.12
486	0.11
487	0.09
488	0.1
489	0.09
490	0.08
491	0.07
492	0.06
493	0.06
494	0.07
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.07
501	0.07
502	0.09
503	0.1
504	0.1
505	0.11
506	0.11
507	0.12
508	0.13
509	0.12
510	0.11
511	0.11
512	0.11
513	0.11
514	0.11
515	0.1
516	0.08
517	0.08
518	0.06
519	0.06
520	0.05
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.05
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.05
530	0.05
531	0.06
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.07
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.06
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.09
545	0.13
546	0.13
547	0.13
548	0.14
549	0.15
550	0.2
551	0.24
552	0.3
553	0.31
554	0.35
555	0.38
556	0.41
557	0.42
558	0.4
559	0.41
560	0.41
561	0.39
562	0.41
563	0.38
564	0.36
565	0.33
566	0.3
567	0.25
568	0.19
569	0.15
570	0.1
571	0.09
572	0.08
573	0.09
574	0.12
575	0.14
576	0.19
577	0.23
578	0.23
579	0.23
580	0.25
581	0.33
582	0.34
583	0.37
584	0.34
585	0.37
586	0.37
587	0.38
588	0.4
589	0.33
590	0.32
591	0.34
592	0.37
593	0.3
594	0.31
595	0.3
596	0.27
597	0.27
598	0.27
599	0.25
600	0.26
601	0.27
602	0.28
603	0.29
604	0.28
605	0.27
606	0.27
607	0.22
608	0.14
609	0.13
610	0.11
611	0.09
612	0.08
613	0.09
614	0.09
615	0.09
616	0.1
617	0.1
618	0.11
619	0.11
620	0.16
621	0.18
622	0.18
623	0.21
624	0.21
625	0.26
626	0.29
627	0.32
628	0.29
629	0.25
630	0.25
631	0.21
632	0.23
633	0.19
634	0.17
635	0.14
636	0.12
637	0.12
638	0.15
639	0.14
640	0.12
641	0.11
642	0.1
643	0.11
644	0.12
645	0.12
646	0.1
647	0.14
648	0.2
649	0.21
650	0.22
651	0.25
652	0.26
653	0.26
654	0.28
655	0.25
656	0.2
657	0.19
658	0.18
659	0.15
660	0.14
661	0.14
662	0.11
663	0.11
664	0.1
665	0.1
666	0.09
667	0.09
668	0.11
669	0.18
670	0.2
671	0.21
672	0.22
673	0.24
674	0.26
675	0.27
676	0.24
677	0.21
678	0.22
679	0.21
680	0.2
681	0.17
682	0.15
683	0.15
684	0.14
685	0.1
686	0.08
687	0.08
688	0.07
689	0.08
690	0.1
691	0.09
692	0.11
693	0.1
694	0.1
695	0.11
696	0.16
697	0.19
698	0.17
699	0.19
700	0.18
701	0.2
702	0.21
703	0.2
704	0.18
705	0.14
706	0.15
707	0.15
708	0.16
709	0.14
710	0.13
711	0.11
712	0.1
713	0.09
714	0.09
715	0.07
716	0.07
717	0.08
718	0.09
719	0.09
720	0.11
721	0.12
722	0.13
723	0.13
724	0.14
725	0.14
726	0.14
727	0.15
728	0.13
729	0.15
730	0.17
731	0.21
732	0.23
733	0.28
734	0.3
735	0.32
736	0.32
737	0.3
738	0.26
739	0.22
740	0.21
741	0.16
742	0.16
743	0.13
744	0.13
745	0.12
746	0.12
747	0.14
748	0.18
749	0.16
750	0.13
751	0.14
752	0.15
753	0.17
754	0.17
755	0.2
756	0.15
757	0.17
758	0.17
759	0.17
760	0.25
761	0.33
762	0.39
763	0.44
764	0.52
765	0.58
766	0.68
767	0.78
768	0.8
769	0.8
770	0.83
771	0.83
772	0.77
773	0.76
774	0.68
775	0.64
776	0.57
777	0.48
778	0.41
779	0.33
780	0.31
781	0.26
782	0.25
783	0.24
784	0.2
785	0.22
786	0.18
787	0.19
788	0.19
789	0.19
790	0.2
791	0.16
792	0.17
793	0.16
794	0.17
795	0.16
796	0.16
797	0.16
798	0.13
799	0.13
800	0.13
801	0.13
802	0.12
803	0.13
804	0.12
805	0.14
806	0.14
807	0.14
808	0.12
809	0.11
810	0.12
811	0.11
812	0.11
813	0.11
814	0.12
815	0.14
816	0.16
817	0.17
818	0.16
819	0.15
820	0.14
821	0.12
822	0.11
823	0.1
824	0.08
825	0.09
826	0.11
827	0.13
828	0.19
829	0.22
830	0.27
831	0.29
832	0.31
833	0.35
834	0.39
835	0.44
836	0.42
837	0.47
838	0.43
839	0.41
840	0.45
841	0.48
842	0.47
843	0.45
844	0.45
845	0.41
846	0.43
847	0.43
848	0.39
849	0.34
850	0.35
851	0.33
852	0.37
853	0.33
854	0.32
855	0.32
856	0.31
857	0.29
858	0.24
859	0.24
860	0.2
861	0.26
862	0.33
863	0.38
864	0.46
865	0.51
866	0.58
867	0.63
868	0.68
869	0.67
870	0.66
871	0.65
872	0.6
873	0.57
874	0.54
875	0.49
876	0.43
877	0.41
878	0.41
879	0.43
880	0.46
881	0.43
882	0.41
883	0.39
884	0.44
885	0.47
886	0.46
887	0.43
888	0.42
889	0.46
890	0.5
891	0.57
892	0.54
893	0.49
894	0.43
895	0.41
896	0.38
897	0.35
898	0.35
899	0.27
900	0.26
901	0.24
902	0.24
903	0.22
904	0.18
905	0.15
906	0.1
907	0.11
908	0.11
909	0.1
910	0.11
911	0.11
912	0.13
913	0.16
914	0.16
915	0.21
916	0.3
917	0.37
918	0.38
919	0.38
920	0.42
921	0.41
922	0.44
923	0.43
924	0.39
925	0.38
926	0.41
927	0.43
928	0.38
929	0.38
930	0.36
931	0.32
932	0.3
933	0.28
934	0.28
935	0.32
936	0.31
937	0.29
938	0.28
939	0.27
940	0.25
941	0.24
942	0.22
943	0.19
944	0.25
945	0.3
946	0.31
947	0.31
948	0.28
949	0.32
950	0.37
951	0.35
952	0.3
953	0.29
954	0.37
955	0.41
956	0.48
957	0.43
958	0.38
959	0.37
960	0.43
961	0.49
962	0.5
963	0.51
964	0.49
965	0.5
966	0.55
967	0.58
968	0.6
969	0.61
970	0.58
971	0.59

P40848

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer