FuNGI

O60126

Protein Details

Accession

O60126

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-42	GGGHVRRRDTRSKYVKNYDFSF	Hydrophilic
367-386	GDYRPPRKGKHNDRAHPPIH	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000380 Topo_IA IPR003601 Topo_IA_2 IPR023406 Topo_IA_AS IPR013497 Topo_IA_cen IPR013824 Topo_IA_cen_sub1 IPR013825 Topo_IA_cen_sub2 IPR013826 Topo_IA_cen_sub3 IPR023405 Topo_IA_core_domain IPR003602 Topo_IA_DNA-bd_dom IPR006171 TOPRIM_domain IPR034144 TOPRIM_TopoIII
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0031422 C:RecQ family helicase-topoisomerase III complex GO:0035861 C:site of double-strand break GO:0003677 F:DNA binding GO:0003917 F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity GO:0006265 P:DNA topological change GO:0043007 P:maintenance of rDNA GO:1902969 P:mitotic DNA replication GO:0006301 P:postreplication repair GO:0000712 P:resolution of meiotic recombination intermediates
KEGG	spo:SPBC16G5.12c -
Pfam	View protein in Pfam PF01131 Topoisom_bac PF01751 Toprim
PROSITE	View protein in PROSITE PS00396 TOPOISOMERASE_I_PROK PS50880 TOPRIM
CDD	cd00186 TOP1Ac cd03362 TOPRIM_TopoIA_TopoIII

Amino Acid Sequences

MRVLCVAEKNSIAKSVASILGGGHVRRRDTRSKYVKNYDFSFNFGGNVGSSDVTMTSVSGHLTEASFPSEYSSWSSVPQDVLFDAQIITSVSKNAEVLADNIKKEARNAQYLYIWTDCDREGEHIGVEISNVARASNPSIQVIRADFNNLERSHIISAAKRPRDVSKNAADAVDARIELDFRLGAIFTRLQTIQLQKSFDILQNKIISYGPCQFPTLGFVVDRWQRVEDFVPETYWHLRFVDKRQGKTIQFNWERAKVFDRLTTMIILENCLECKTAKVVNITQKPKTKYKPLPLSTVELTKLGPKHLRISAKKTLELAENLYTNGFVSYPRTETDQFDSSMNLHAIIQKLTGAQEWDSYAEGLLAGDYRPPRKGKHNDRAHPPIHPVQMVHRSALPSQDHWKVYELITRRFLACCSDNAKGAETLVQVKMEEELFSKKGLLVTEKNYLEVYPYEKWESSDQLPEYRLHEEFQPHILDMMDSSTSSPSYITEPELIALMDANGIGTDATMAEHIEKVQEREYVIKRKKRGQGVTEFVPSSLGVALAKGYDEIGLEWSLTKPFLRKEMEVQLKNIENGQLNRNVLVHMILTQFRDVFHLTKQRFDCLKNSCRVYLMSHNEPQT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.22
3	0.21
4	0.18
5	0.17
6	0.14
7	0.18
8	0.2
9	0.2
10	0.22
11	0.24
12	0.28
13	0.34
14	0.41
15	0.46
16	0.51
17	0.61
18	0.66
19	0.73
20	0.79
21	0.84
22	0.84
23	0.81
24	0.77
25	0.76
26	0.66
27	0.6
28	0.53
29	0.43
30	0.36
31	0.3
32	0.26
33	0.17
34	0.17
35	0.13
36	0.1
37	0.1
38	0.09
39	0.09
40	0.09
41	0.09
42	0.07
43	0.07
44	0.08
45	0.08
46	0.08
47	0.09
48	0.09
49	0.09
50	0.11
51	0.1
52	0.13
53	0.12
54	0.12
55	0.15
56	0.14
57	0.15
58	0.19
59	0.21
60	0.19
61	0.21
62	0.23
63	0.22
64	0.23
65	0.22
66	0.19
67	0.16
68	0.17
69	0.15
70	0.13
71	0.11
72	0.09
73	0.09
74	0.09
75	0.09
76	0.08
77	0.09
78	0.1
79	0.1
80	0.11
81	0.1
82	0.11
83	0.11
84	0.12
85	0.2
86	0.23
87	0.22
88	0.24
89	0.26
90	0.25
91	0.26
92	0.33
93	0.29
94	0.33
95	0.35
96	0.36
97	0.37
98	0.38
99	0.4
100	0.32
101	0.28
102	0.22
103	0.22
104	0.19
105	0.17
106	0.17
107	0.16
108	0.17
109	0.16
110	0.15
111	0.14
112	0.14
113	0.13
114	0.11
115	0.1
116	0.08
117	0.08
118	0.08
119	0.07
120	0.08
121	0.09
122	0.14
123	0.17
124	0.18
125	0.19
126	0.2
127	0.21
128	0.22
129	0.23
130	0.19
131	0.16
132	0.18
133	0.16
134	0.18
135	0.24
136	0.22
137	0.23
138	0.22
139	0.24
140	0.22
141	0.24
142	0.23
143	0.19
144	0.28
145	0.35
146	0.37
147	0.36
148	0.38
149	0.43
150	0.48
151	0.49
152	0.47
153	0.45
154	0.46
155	0.45
156	0.42
157	0.35
158	0.3
159	0.27
160	0.21
161	0.14
162	0.1
163	0.09
164	0.09
165	0.09
166	0.09
167	0.06
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.07
173	0.09
174	0.08
175	0.11
176	0.11
177	0.12
178	0.16
179	0.21
180	0.24
181	0.26
182	0.27
183	0.25
184	0.27
185	0.27
186	0.27
187	0.28
188	0.23
189	0.26
190	0.26
191	0.26
192	0.25
193	0.25
194	0.21
195	0.19
196	0.25
197	0.22
198	0.21
199	0.22
200	0.2
201	0.19
202	0.21
203	0.19
204	0.14
205	0.11
206	0.11
207	0.15
208	0.19
209	0.2
210	0.18
211	0.18
212	0.17
213	0.19
214	0.21
215	0.18
216	0.17
217	0.16
218	0.16
219	0.15
220	0.18
221	0.19
222	0.18
223	0.17
224	0.14
225	0.17
226	0.2
227	0.25
228	0.33
229	0.35
230	0.36
231	0.4
232	0.47
233	0.46
234	0.5
235	0.49
236	0.49
237	0.47
238	0.5
239	0.49
240	0.48
241	0.46
242	0.4
243	0.39
244	0.31
245	0.29
246	0.25
247	0.24
248	0.2
249	0.2
250	0.18
251	0.16
252	0.15
253	0.14
254	0.12
255	0.1
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.07
261	0.07
262	0.09
263	0.11
264	0.13
265	0.16
266	0.21
267	0.29
268	0.37
269	0.4
270	0.43
271	0.48
272	0.5
273	0.54
274	0.54
275	0.55
276	0.55
277	0.61
278	0.66
279	0.62
280	0.64
281	0.58
282	0.57
283	0.49
284	0.43
285	0.33
286	0.23
287	0.21
288	0.18
289	0.16
290	0.15
291	0.16
292	0.16
293	0.19
294	0.23
295	0.31
296	0.31
297	0.38
298	0.43
299	0.43
300	0.43
301	0.39
302	0.36
303	0.3
304	0.28
305	0.23
306	0.17
307	0.15
308	0.14
309	0.13
310	0.11
311	0.09
312	0.08
313	0.06
314	0.04
315	0.07
316	0.08
317	0.09
318	0.1
319	0.13
320	0.15
321	0.16
322	0.21
323	0.2
324	0.2
325	0.19
326	0.19
327	0.16
328	0.17
329	0.15
330	0.11
331	0.09
332	0.1
333	0.1
334	0.1
335	0.09
336	0.07
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.03
354	0.06
355	0.08
356	0.1
357	0.14
358	0.17
359	0.2
360	0.3
361	0.4
362	0.48
363	0.57
364	0.66
365	0.69
366	0.76
367	0.81
368	0.72
369	0.64
370	0.58
371	0.53
372	0.45
373	0.38
374	0.3
375	0.28
376	0.35
377	0.33
378	0.29
379	0.25
380	0.24
381	0.24
382	0.29
383	0.25
384	0.19
385	0.23
386	0.28
387	0.28
388	0.27
389	0.29
390	0.25
391	0.24
392	0.27
393	0.26
394	0.24
395	0.27
396	0.27
397	0.26
398	0.25
399	0.25
400	0.24
401	0.22
402	0.21
403	0.22
404	0.22
405	0.24
406	0.25
407	0.26
408	0.21
409	0.2
410	0.18
411	0.15
412	0.16
413	0.14
414	0.13
415	0.12
416	0.12
417	0.13
418	0.11
419	0.1
420	0.09
421	0.12
422	0.12
423	0.13
424	0.13
425	0.13
426	0.14
427	0.15
428	0.18
429	0.18
430	0.21
431	0.29
432	0.29
433	0.29
434	0.27
435	0.25
436	0.22
437	0.2
438	0.21
439	0.15
440	0.18
441	0.2
442	0.2
443	0.23
444	0.23
445	0.26
446	0.24
447	0.29
448	0.27
449	0.27
450	0.29
451	0.28
452	0.29
453	0.28
454	0.26
455	0.21
456	0.23
457	0.23
458	0.23
459	0.24
460	0.23
461	0.2
462	0.19
463	0.18
464	0.15
465	0.12
466	0.12
467	0.09
468	0.07
469	0.08
470	0.08
471	0.08
472	0.09
473	0.08
474	0.08
475	0.1
476	0.11
477	0.13
478	0.14
479	0.14
480	0.14
481	0.14
482	0.13
483	0.1
484	0.09
485	0.07
486	0.05
487	0.04
488	0.04
489	0.03
490	0.04
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.04
496	0.04
497	0.05
498	0.06
499	0.06
500	0.07
501	0.11
502	0.13
503	0.15
504	0.17
505	0.19
506	0.19
507	0.27
508	0.34
509	0.41
510	0.48
511	0.54
512	0.58
513	0.66
514	0.73
515	0.75
516	0.76
517	0.74
518	0.75
519	0.73
520	0.72
521	0.68
522	0.6
523	0.5
524	0.42
525	0.33
526	0.24
527	0.17
528	0.12
529	0.07
530	0.07
531	0.07
532	0.06
533	0.07
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.08
540	0.08
541	0.08
542	0.09
543	0.1
544	0.11
545	0.12
546	0.13
547	0.16
548	0.19
549	0.26
550	0.31
551	0.32
552	0.38
553	0.47
554	0.56
555	0.54
556	0.53
557	0.52
558	0.5
559	0.48
560	0.44
561	0.37
562	0.33
563	0.33
564	0.36
565	0.35
566	0.34
567	0.34
568	0.33
569	0.29
570	0.23
571	0.21
572	0.16
573	0.13
574	0.15
575	0.16
576	0.17
577	0.19
578	0.18
579	0.18
580	0.2
581	0.21
582	0.2
583	0.25
584	0.33
585	0.33
586	0.41
587	0.43
588	0.48
589	0.51
590	0.52
591	0.53
592	0.53
593	0.6
594	0.6
595	0.63
596	0.56
597	0.53
598	0.52
599	0.5
600	0.5
601	0.49
602	0.48

O60126

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer