Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O42668

Protein Details
Accession O42668    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
931-964LSDDEEKQSGKKKKKDRKKRKSKSKQESSDSGVSBasic
968-994EIPLSDARNKTKKRRVNRRVISEEYTFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
939-955SGKKKKKDRKKRKSKSK
978-982TKKRR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031101  Ctr9  
IPR036305  RGS_sf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006813  P:potassium ion transport  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0051569  P:regulation of histone H3-K4 methylation  
GO:0006362  P:transcription elongation by RNA polymerase I  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG spo:SPAC27D7.14c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50293  TPR_REGION  
Amino Acid Sequences MEGFTLETHASRIIEVPLLGQEDQSVEIDCSSLPSDATELCEILVNEQAPREFWTKFAHEYYIRGLREQAILILKSGLETLKDSESLCILNANIAAIYLSMAREAMLKKDTDLRDEQLRNVRTYLEAANNIDSKSEINVLLHGIYRILLNPTDKESLENAARCFDFVLQKSGGNILGFLGKARILYAKGNYRSALKLYQRALVSNPQFKPDPRIGIGLCFWNLDMKTDALSAWTRVQQLDPKNTVVDTYIGLYYYDLAFQNVNNDSFVQNYGKALQHIQRAFKTRNNDPVASSILERYVYSKKNYEGCIKLAENVIQNSFSSSLIADGYYWMGRAYHQMGNNEKAMASYQKAKAADDRHLLSSVGIGQIQILQNDLTSAKLTFERIAEQNQSCFEALVVLGCLHASDSKPDLTKARMLLDRAFNLVGSSKLPRVVDSDLYITQARLWEKEDTKKSLGFLTRALDFLESAHMSVGPELLNNIAVLQYHLGLIPEAHGNIIKAKSVLPDANPELSLLLDYNLARCEEELGNTSVASEAYVSILEKHPSFIDARIRKCLLQLSNPNEETFKEIRHIMNADSQNLEVRAFFGWYLSKQKRRPVEDPEVRHCSQTLRHWHDDIYSLVQLGNAYMRQAREFRVHNDREKLKRQKLYIKAIQSYDQAIKFDPKNAHAAQGIAIILAQNRQFSKALLILSKVREAIKDATTLINIGNCLAELKQFSRAIEVFETVYSSTGESDTYGVLSCLGRVWLQRGRESKNVDYLKESVRYATLALEKNPENPSLLFNVAFVQFQLCELIRQKPENSRTVEDLNFAMQQLDASIETFTKLVSVEHPPYSPTSIEQRAKMAKNTTKRQLERAIQAQIEYEKSVAAKLEDARIQREKEKARRLAEEEALLKEKQERERQLQEERQKMQEEVLEWRKSQQKASEDDMSLSDDEEKQSGKKKKKDRKKRKSKSKQESSDSGVSEDDEIPLSDARNKTKKRRVNRRVISEEYTFDQDSDAEGNQEEEVSRTIEEKQDNDITDNQDDNKELNLFSEEDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.15
4 0.15
5 0.18
6 0.18
7 0.16
8 0.14
9 0.14
10 0.15
11 0.15
12 0.13
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.1
17 0.11
18 0.11
19 0.11
20 0.1
21 0.1
22 0.12
23 0.12
24 0.16
25 0.15
26 0.14
27 0.14
28 0.17
29 0.16
30 0.15
31 0.19
32 0.16
33 0.16
34 0.18
35 0.18
36 0.16
37 0.21
38 0.23
39 0.19
40 0.21
41 0.27
42 0.29
43 0.33
44 0.34
45 0.37
46 0.35
47 0.37
48 0.42
49 0.43
50 0.4
51 0.36
52 0.36
53 0.32
54 0.32
55 0.3
56 0.27
57 0.24
58 0.23
59 0.23
60 0.22
61 0.19
62 0.17
63 0.17
64 0.14
65 0.1
66 0.11
67 0.14
68 0.15
69 0.17
70 0.17
71 0.17
72 0.18
73 0.17
74 0.15
75 0.14
76 0.11
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.06
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.1
91 0.12
92 0.15
93 0.17
94 0.17
95 0.19
96 0.28
97 0.29
98 0.31
99 0.34
100 0.34
101 0.41
102 0.42
103 0.47
104 0.47
105 0.49
106 0.46
107 0.43
108 0.39
109 0.31
110 0.32
111 0.3
112 0.26
113 0.26
114 0.26
115 0.3
116 0.3
117 0.29
118 0.26
119 0.23
120 0.18
121 0.16
122 0.17
123 0.14
124 0.12
125 0.13
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.12
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.11
135 0.13
136 0.14
137 0.16
138 0.2
139 0.23
140 0.23
141 0.24
142 0.23
143 0.26
144 0.29
145 0.31
146 0.27
147 0.28
148 0.28
149 0.25
150 0.25
151 0.23
152 0.24
153 0.22
154 0.27
155 0.24
156 0.25
157 0.26
158 0.26
159 0.25
160 0.18
161 0.16
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.11
171 0.11
172 0.15
173 0.21
174 0.29
175 0.32
176 0.35
177 0.35
178 0.36
179 0.36
180 0.36
181 0.37
182 0.33
183 0.37
184 0.36
185 0.41
186 0.38
187 0.38
188 0.38
189 0.38
190 0.4
191 0.42
192 0.41
193 0.39
194 0.41
195 0.41
196 0.45
197 0.41
198 0.4
199 0.33
200 0.37
201 0.33
202 0.33
203 0.34
204 0.3
205 0.25
206 0.2
207 0.18
208 0.18
209 0.17
210 0.17
211 0.16
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.14
220 0.17
221 0.18
222 0.18
223 0.21
224 0.25
225 0.31
226 0.37
227 0.37
228 0.35
229 0.35
230 0.34
231 0.32
232 0.26
233 0.2
234 0.13
235 0.12
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.1
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.14
248 0.15
249 0.15
250 0.14
251 0.15
252 0.14
253 0.15
254 0.17
255 0.14
256 0.12
257 0.13
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.19
262 0.21
263 0.27
264 0.3
265 0.34
266 0.36
267 0.41
268 0.44
269 0.45
270 0.47
271 0.45
272 0.51
273 0.52
274 0.48
275 0.43
276 0.42
277 0.4
278 0.34
279 0.29
280 0.2
281 0.16
282 0.15
283 0.14
284 0.15
285 0.19
286 0.21
287 0.24
288 0.27
289 0.3
290 0.35
291 0.39
292 0.42
293 0.38
294 0.37
295 0.39
296 0.36
297 0.33
298 0.29
299 0.29
300 0.25
301 0.23
302 0.22
303 0.17
304 0.16
305 0.16
306 0.15
307 0.12
308 0.1
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.06
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.1
322 0.13
323 0.16
324 0.2
325 0.24
326 0.28
327 0.3
328 0.31
329 0.28
330 0.24
331 0.2
332 0.18
333 0.16
334 0.14
335 0.18
336 0.19
337 0.23
338 0.24
339 0.24
340 0.28
341 0.29
342 0.33
343 0.3
344 0.31
345 0.28
346 0.28
347 0.27
348 0.22
349 0.19
350 0.15
351 0.11
352 0.09
353 0.07
354 0.06
355 0.09
356 0.1
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.1
370 0.11
371 0.13
372 0.14
373 0.17
374 0.21
375 0.21
376 0.21
377 0.21
378 0.22
379 0.19
380 0.17
381 0.14
382 0.09
383 0.08
384 0.07
385 0.06
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.07
394 0.09
395 0.11
396 0.12
397 0.13
398 0.15
399 0.16
400 0.19
401 0.19
402 0.21
403 0.22
404 0.23
405 0.25
406 0.26
407 0.25
408 0.23
409 0.22
410 0.17
411 0.15
412 0.14
413 0.11
414 0.09
415 0.1
416 0.09
417 0.12
418 0.12
419 0.12
420 0.15
421 0.16
422 0.16
423 0.15
424 0.17
425 0.15
426 0.17
427 0.16
428 0.13
429 0.12
430 0.14
431 0.13
432 0.12
433 0.14
434 0.17
435 0.2
436 0.28
437 0.32
438 0.33
439 0.34
440 0.34
441 0.33
442 0.32
443 0.31
444 0.24
445 0.22
446 0.19
447 0.18
448 0.17
449 0.17
450 0.12
451 0.1
452 0.09
453 0.1
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.06
460 0.07
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.05
475 0.05
476 0.04
477 0.04
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.09
490 0.11
491 0.12
492 0.1
493 0.13
494 0.14
495 0.15
496 0.14
497 0.13
498 0.11
499 0.1
500 0.1
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.07
509 0.06
510 0.09
511 0.08
512 0.09
513 0.1
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.08
519 0.08
520 0.07
521 0.05
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.05
527 0.07
528 0.08
529 0.08
530 0.09
531 0.08
532 0.09
533 0.1
534 0.12
535 0.2
536 0.24
537 0.26
538 0.3
539 0.31
540 0.3
541 0.3
542 0.33
543 0.26
544 0.27
545 0.33
546 0.34
547 0.39
548 0.39
549 0.38
550 0.34
551 0.32
552 0.3
553 0.24
554 0.19
555 0.15
556 0.17
557 0.16
558 0.18
559 0.19
560 0.14
561 0.2
562 0.21
563 0.2
564 0.18
565 0.18
566 0.17
567 0.16
568 0.15
569 0.08
570 0.08
571 0.07
572 0.07
573 0.06
574 0.06
575 0.07
576 0.08
577 0.18
578 0.23
579 0.31
580 0.34
581 0.41
582 0.48
583 0.54
584 0.58
585 0.57
586 0.62
587 0.62
588 0.64
589 0.64
590 0.64
591 0.58
592 0.53
593 0.45
594 0.36
595 0.32
596 0.34
597 0.37
598 0.37
599 0.39
600 0.4
601 0.39
602 0.38
603 0.36
604 0.3
605 0.23
606 0.15
607 0.13
608 0.12
609 0.12
610 0.11
611 0.09
612 0.08
613 0.06
614 0.06
615 0.08
616 0.08
617 0.1
618 0.11
619 0.14
620 0.18
621 0.2
622 0.25
623 0.33
624 0.37
625 0.41
626 0.47
627 0.52
628 0.54
629 0.62
630 0.67
631 0.65
632 0.66
633 0.66
634 0.67
635 0.68
636 0.7
637 0.67
638 0.62
639 0.58
640 0.54
641 0.51
642 0.42
643 0.37
644 0.32
645 0.26
646 0.21
647 0.18
648 0.22
649 0.2
650 0.25
651 0.24
652 0.22
653 0.27
654 0.27
655 0.29
656 0.24
657 0.24
658 0.19
659 0.18
660 0.16
661 0.09
662 0.09
663 0.07
664 0.06
665 0.08
666 0.08
667 0.09
668 0.1
669 0.12
670 0.13
671 0.13
672 0.15
673 0.15
674 0.16
675 0.15
676 0.17
677 0.18
678 0.19
679 0.2
680 0.2
681 0.17
682 0.16
683 0.19
684 0.2
685 0.18
686 0.18
687 0.17
688 0.16
689 0.16
690 0.16
691 0.13
692 0.1
693 0.09
694 0.08
695 0.07
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.07
700 0.08
701 0.09
702 0.15
703 0.17
704 0.17
705 0.2
706 0.21
707 0.22
708 0.21
709 0.21
710 0.15
711 0.14
712 0.15
713 0.11
714 0.11
715 0.09
716 0.08
717 0.07
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.07
722 0.06
723 0.07
724 0.06
725 0.06
726 0.07
727 0.07
728 0.06
729 0.06
730 0.07
731 0.08
732 0.08
733 0.14
734 0.17
735 0.19
736 0.26
737 0.31
738 0.35
739 0.41
740 0.46
741 0.43
742 0.49
743 0.49
744 0.43
745 0.41
746 0.39
747 0.37
748 0.34
749 0.31
750 0.23
751 0.21
752 0.2
753 0.17
754 0.17
755 0.19
756 0.18
757 0.19
758 0.23
759 0.23
760 0.28
761 0.29
762 0.27
763 0.23
764 0.21
765 0.22
766 0.2
767 0.21
768 0.16
769 0.14
770 0.16
771 0.14
772 0.13
773 0.12
774 0.1
775 0.08
776 0.08
777 0.11
778 0.09
779 0.12
780 0.14
781 0.21
782 0.24
783 0.27
784 0.31
785 0.38
786 0.43
787 0.47
788 0.49
789 0.46
790 0.46
791 0.47
792 0.44
793 0.37
794 0.32
795 0.27
796 0.22
797 0.19
798 0.15
799 0.1
800 0.09
801 0.08
802 0.08
803 0.06
804 0.06
805 0.07
806 0.07
807 0.07
808 0.07
809 0.07
810 0.06
811 0.06
812 0.07
813 0.09
814 0.16
815 0.19
816 0.21
817 0.22
818 0.23
819 0.25
820 0.26
821 0.24
822 0.2
823 0.24
824 0.31
825 0.34
826 0.34
827 0.39
828 0.44
829 0.46
830 0.48
831 0.5
832 0.49
833 0.55
834 0.61
835 0.65
836 0.67
837 0.67
838 0.69
839 0.69
840 0.68
841 0.66
842 0.63
843 0.59
844 0.49
845 0.47
846 0.42
847 0.35
848 0.3
849 0.23
850 0.18
851 0.13
852 0.13
853 0.13
854 0.12
855 0.11
856 0.13
857 0.14
858 0.19
859 0.22
860 0.24
861 0.29
862 0.34
863 0.36
864 0.38
865 0.44
866 0.49
867 0.55
868 0.63
869 0.65
870 0.64
871 0.68
872 0.68
873 0.66
874 0.6
875 0.55
876 0.47
877 0.43
878 0.41
879 0.34
880 0.3
881 0.29
882 0.32
883 0.35
884 0.42
885 0.45
886 0.5
887 0.59
888 0.64
889 0.68
890 0.71
891 0.72
892 0.72
893 0.69
894 0.66
895 0.6
896 0.55
897 0.48
898 0.41
899 0.34
900 0.34
901 0.39
902 0.37
903 0.34
904 0.4
905 0.45
906 0.44
907 0.47
908 0.46
909 0.44
910 0.46
911 0.52
912 0.54
913 0.47
914 0.46
915 0.42
916 0.37
917 0.31
918 0.26
919 0.22
920 0.16
921 0.16
922 0.16
923 0.16
924 0.17
925 0.27
926 0.36
927 0.43
928 0.51
929 0.61
930 0.71
931 0.8
932 0.88
933 0.9
934 0.93
935 0.94
936 0.96
937 0.97
938 0.97
939 0.98
940 0.97
941 0.97
942 0.96
943 0.92
944 0.87
945 0.83
946 0.78
947 0.67
948 0.57
949 0.46
950 0.37
951 0.32
952 0.25
953 0.19
954 0.13
955 0.12
956 0.13
957 0.13
958 0.14
959 0.18
960 0.22
961 0.3
962 0.39
963 0.47
964 0.56
965 0.65
966 0.73
967 0.78
968 0.86
969 0.88
970 0.89
971 0.91
972 0.91
973 0.89
974 0.86
975 0.81
976 0.72
977 0.65
978 0.57
979 0.52
980 0.41
981 0.33
982 0.27
983 0.21
984 0.2
985 0.19
986 0.16
987 0.12
988 0.12
989 0.13
990 0.12
991 0.13
992 0.11
993 0.1
994 0.11
995 0.11
996 0.12
997 0.12
998 0.15
999 0.21
1000 0.24
1001 0.24
1002 0.29
1003 0.33
1004 0.34
1005 0.37
1006 0.39
1007 0.37
1008 0.37
1009 0.38
1010 0.34
1011 0.31
1012 0.31
1013 0.28
1014 0.27
1015 0.24
1016 0.21
1017 0.2
1018 0.2
1019 0.18