Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3SBT9

Protein Details
Accession A0A0C3SBT9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-29LDTPVENEKKRGKRKATNATQGEGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-20KKRGKRK
176-207GKGRRKRDASGASHHRAKEKGRAPSAGPKNRG
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036882  Alba-like_dom_sf  
IPR014612  Pop7/Rpp20  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004526  F:ribonuclease P activity  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF12328  Rpp20  
Amino Acid Sequences MPVDKLDTPVENEKKRGKRKATNATQGEGDAPKAQYRKLAPSRPFPTVPTSVSATGPRSAHIEGKNYICITRKTPLGAYLRRCKDAVIKAGHKTLHLHAMGAAIPHLLQLSLSLPEILPYAADEIRTEVLTGTVDVQDEVIPEDEDEDISLRTRGKSTLSIVLTIGDGKDEGAHTGKGRRKRDASGASHHRAKEKGRAPSAGPKNRGHQSKQAVAEKLIYRAEDMEM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.7
3 0.75
4 0.75
5 0.76
6 0.83
7 0.87
8 0.88
9 0.88
10 0.82
11 0.75
12 0.66
13 0.56
14 0.49
15 0.38
16 0.3
17 0.23
18 0.2
19 0.22
20 0.22
21 0.22
22 0.25
23 0.27
24 0.36
25 0.41
26 0.49
27 0.5
28 0.59
29 0.63
30 0.63
31 0.61
32 0.53
33 0.5
34 0.45
35 0.41
36 0.34
37 0.32
38 0.28
39 0.28
40 0.28
41 0.25
42 0.25
43 0.23
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.25
48 0.25
49 0.27
50 0.25
51 0.27
52 0.3
53 0.27
54 0.27
55 0.25
56 0.25
57 0.24
58 0.24
59 0.24
60 0.23
61 0.23
62 0.28
63 0.32
64 0.35
65 0.39
66 0.45
67 0.47
68 0.47
69 0.46
70 0.41
71 0.4
72 0.4
73 0.4
74 0.37
75 0.38
76 0.38
77 0.41
78 0.41
79 0.35
80 0.32
81 0.26
82 0.25
83 0.21
84 0.19
85 0.15
86 0.16
87 0.15
88 0.13
89 0.11
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.03
95 0.03
96 0.03
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.06
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.13
143 0.15
144 0.18
145 0.24
146 0.23
147 0.23
148 0.22
149 0.22
150 0.2
151 0.17
152 0.14
153 0.07
154 0.06
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.09
160 0.1
161 0.12
162 0.2
163 0.25
164 0.33
165 0.38
166 0.45
167 0.48
168 0.51
169 0.59
170 0.61
171 0.61
172 0.62
173 0.66
174 0.65
175 0.66
176 0.64
177 0.58
178 0.53
179 0.52
180 0.51
181 0.5
182 0.53
183 0.52
184 0.53
185 0.53
186 0.59
187 0.65
188 0.64
189 0.63
190 0.58
191 0.61
192 0.66
193 0.69
194 0.64
195 0.63
196 0.62
197 0.64
198 0.68
199 0.67
200 0.62
201 0.56
202 0.58
203 0.51
204 0.47
205 0.41
206 0.33
207 0.27