Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3SF12

Protein Details
Accession A0A0C3SF12    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
294-316DPKAGKGRKGKTKKGSGEKKGPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-314PKAGKGRKGKTKKGSGEKKG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.333, cyto 9, mito_nucl 7.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18024  DEXHc_Mtr4-like  
cd13154  KOW_Mtr4  
cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MASPAPMVTDEVEIEAKREVAASAGLQGSVEAGSRLELRHQVRHQVAVPPGYPYVPIANHVPPAKPAREYKFTLDPFQQVSVHAIQRNESVLVSAHTSAGKTVVAEYAIAQCLQNKQRVIYTSPIKALSNQKYREMLAEFGDVGLMTGDVTINPSATCLVMTTEILRSMLYRGSEIMREVAWVIFDEIHYMRDKERGVVWEETIILLPHTVRYVFLSATIPNAMQFAEWICKSHEQPCHIVYTDFRPTPLQHYLFPAGGEGIYLVVNEKGEFREDNFTKAMGMLQEKQGDDPADPKAGKGRKGKTKKGSGEKKGPSDIQKIVRMIMLKNYNPVIVFAFSKRECEALALMMNKFEFNTTDEQDLVTNIFNNAIENLAPDDRQLPQISNLLPLLKRGIGIHHGGLLPILKEVIEILFQEGLIKVLFATETFSIGLNMPAKTVVFTAARKFDGREFRTLSSGEYIQMSGRAGRRGLDDRGVVIMMCDEKLEPVAAKEMIKGQADRLDSAFHLGYNMVLNLMKVEGISPEFMLERCFLQFQSNAGIPMLENELHREEEKKAAIAVPDEELVSEYYEYRQQLDQMANDFREVITHPNYSLPFLQPGRLVKIKYKNLDFGWGIIINYQKRLPPKNKSVPVLDSLPPHEQYVVDVLLNCARGSSLPKDRATTTPTPAGILPCPTGEKGDPQVVPVLLSTLESISHLRVHLPKDIRSSQARETVWKTILEVNKRFPDGIPLLDPVQNMQITDDKFKSLVKKIEIMEQKMFSSSLHKDPRLPELYTLYKRKVESQERIREFKKRIQATHDVLQMEELKARKRVLRRLGFTTSADIVDMKGRVACEISTGDELLLTELVFNGVFNPLSPEQCAGLLSCFVFTEKSEQVTKLKEELAAPLRTMQEYARRIAKVSQESKLPLVEEEYVQSFKVELMDAVVQWCRGASFSEICKLTDQFEGSLIRVFRRLQELIRQMSQAAKVIGNSELQEKFDKASEMLERPNSVIFCSSLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.14
4 0.13
5 0.13
6 0.11
7 0.09
8 0.11
9 0.1
10 0.12
11 0.13
12 0.12
13 0.12
14 0.11
15 0.11
16 0.1
17 0.1
18 0.06
19 0.06
20 0.08
21 0.1
22 0.1
23 0.14
24 0.22
25 0.26
26 0.35
27 0.39
28 0.47
29 0.48
30 0.53
31 0.52
32 0.51
33 0.51
34 0.46
35 0.43
36 0.37
37 0.35
38 0.3
39 0.28
40 0.22
41 0.22
42 0.18
43 0.2
44 0.22
45 0.23
46 0.29
47 0.31
48 0.3
49 0.31
50 0.37
51 0.38
52 0.39
53 0.45
54 0.47
55 0.51
56 0.54
57 0.55
58 0.58
59 0.57
60 0.57
61 0.53
62 0.49
63 0.45
64 0.44
65 0.38
66 0.29
67 0.31
68 0.31
69 0.32
70 0.31
71 0.29
72 0.28
73 0.29
74 0.3
75 0.27
76 0.21
77 0.17
78 0.14
79 0.15
80 0.16
81 0.14
82 0.14
83 0.13
84 0.14
85 0.13
86 0.13
87 0.12
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.13
95 0.14
96 0.14
97 0.13
98 0.14
99 0.22
100 0.27
101 0.31
102 0.3
103 0.31
104 0.35
105 0.38
106 0.4
107 0.4
108 0.42
109 0.41
110 0.42
111 0.43
112 0.39
113 0.41
114 0.47
115 0.48
116 0.51
117 0.5
118 0.52
119 0.52
120 0.52
121 0.51
122 0.43
123 0.35
124 0.28
125 0.27
126 0.21
127 0.18
128 0.18
129 0.12
130 0.1
131 0.08
132 0.06
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.06
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.14
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.16
162 0.16
163 0.16
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.1
169 0.09
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.11
174 0.11
175 0.13
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.19
180 0.2
181 0.19
182 0.22
183 0.24
184 0.26
185 0.27
186 0.27
187 0.23
188 0.23
189 0.21
190 0.18
191 0.15
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.1
200 0.12
201 0.11
202 0.13
203 0.14
204 0.13
205 0.14
206 0.15
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.09
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.15
218 0.2
219 0.22
220 0.29
221 0.33
222 0.32
223 0.36
224 0.36
225 0.38
226 0.34
227 0.33
228 0.28
229 0.29
230 0.33
231 0.29
232 0.28
233 0.27
234 0.27
235 0.32
236 0.38
237 0.33
238 0.27
239 0.32
240 0.33
241 0.31
242 0.3
243 0.24
244 0.17
245 0.14
246 0.13
247 0.07
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.21
261 0.22
262 0.25
263 0.24
264 0.24
265 0.22
266 0.21
267 0.2
268 0.13
269 0.15
270 0.14
271 0.17
272 0.2
273 0.2
274 0.21
275 0.22
276 0.2
277 0.17
278 0.17
279 0.16
280 0.18
281 0.17
282 0.17
283 0.23
284 0.26
285 0.33
286 0.4
287 0.46
288 0.52
289 0.61
290 0.7
291 0.72
292 0.78
293 0.8
294 0.82
295 0.84
296 0.82
297 0.83
298 0.79
299 0.74
300 0.68
301 0.64
302 0.58
303 0.53
304 0.5
305 0.46
306 0.45
307 0.4
308 0.37
309 0.34
310 0.31
311 0.26
312 0.27
313 0.27
314 0.23
315 0.25
316 0.25
317 0.24
318 0.23
319 0.23
320 0.17
321 0.13
322 0.14
323 0.12
324 0.17
325 0.17
326 0.19
327 0.18
328 0.17
329 0.16
330 0.16
331 0.16
332 0.11
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.08
342 0.09
343 0.13
344 0.13
345 0.14
346 0.14
347 0.15
348 0.14
349 0.14
350 0.12
351 0.09
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.09
366 0.09
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.13
371 0.16
372 0.16
373 0.17
374 0.16
375 0.16
376 0.15
377 0.15
378 0.15
379 0.12
380 0.12
381 0.1
382 0.12
383 0.12
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.13
388 0.12
389 0.12
390 0.11
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.06
413 0.05
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.1
430 0.13
431 0.15
432 0.16
433 0.16
434 0.17
435 0.21
436 0.28
437 0.29
438 0.32
439 0.32
440 0.32
441 0.33
442 0.33
443 0.28
444 0.21
445 0.19
446 0.14
447 0.11
448 0.11
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.11
454 0.12
455 0.11
456 0.12
457 0.15
458 0.18
459 0.19
460 0.18
461 0.17
462 0.16
463 0.16
464 0.15
465 0.11
466 0.08
467 0.07
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.05
475 0.04
476 0.04
477 0.06
478 0.07
479 0.07
480 0.08
481 0.1
482 0.12
483 0.13
484 0.13
485 0.12
486 0.15
487 0.15
488 0.15
489 0.13
490 0.12
491 0.11
492 0.13
493 0.12
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.06
499 0.06
500 0.05
501 0.05
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.03
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.08
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.12
525 0.12
526 0.12
527 0.11
528 0.11
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.07
533 0.07
534 0.09
535 0.1
536 0.11
537 0.12
538 0.13
539 0.13
540 0.16
541 0.16
542 0.14
543 0.13
544 0.14
545 0.14
546 0.13
547 0.12
548 0.09
549 0.09
550 0.08
551 0.08
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.09
559 0.1
560 0.11
561 0.11
562 0.11
563 0.15
564 0.16
565 0.16
566 0.17
567 0.19
568 0.17
569 0.17
570 0.16
571 0.12
572 0.12
573 0.11
574 0.12
575 0.13
576 0.13
577 0.13
578 0.16
579 0.17
580 0.17
581 0.18
582 0.15
583 0.17
584 0.17
585 0.18
586 0.18
587 0.19
588 0.22
589 0.24
590 0.25
591 0.26
592 0.35
593 0.4
594 0.42
595 0.43
596 0.43
597 0.4
598 0.44
599 0.37
600 0.29
601 0.25
602 0.21
603 0.18
604 0.15
605 0.19
606 0.14
607 0.16
608 0.16
609 0.16
610 0.21
611 0.3
612 0.36
613 0.4
614 0.5
615 0.59
616 0.63
617 0.64
618 0.63
619 0.57
620 0.53
621 0.48
622 0.4
623 0.32
624 0.29
625 0.29
626 0.26
627 0.24
628 0.2
629 0.16
630 0.15
631 0.15
632 0.12
633 0.09
634 0.09
635 0.09
636 0.11
637 0.11
638 0.1
639 0.08
640 0.07
641 0.08
642 0.11
643 0.17
644 0.23
645 0.28
646 0.3
647 0.32
648 0.34
649 0.37
650 0.4
651 0.37
652 0.33
653 0.31
654 0.3
655 0.29
656 0.28
657 0.27
658 0.21
659 0.19
660 0.16
661 0.13
662 0.14
663 0.13
664 0.15
665 0.13
666 0.15
667 0.17
668 0.22
669 0.21
670 0.2
671 0.22
672 0.2
673 0.2
674 0.16
675 0.13
676 0.08
677 0.08
678 0.08
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.07
683 0.08
684 0.09
685 0.09
686 0.12
687 0.16
688 0.18
689 0.24
690 0.27
691 0.29
692 0.35
693 0.37
694 0.39
695 0.4
696 0.42
697 0.39
698 0.43
699 0.41
700 0.39
701 0.4
702 0.4
703 0.37
704 0.33
705 0.3
706 0.29
707 0.33
708 0.36
709 0.36
710 0.38
711 0.4
712 0.4
713 0.39
714 0.33
715 0.35
716 0.29
717 0.27
718 0.23
719 0.21
720 0.22
721 0.23
722 0.23
723 0.16
724 0.18
725 0.16
726 0.14
727 0.14
728 0.17
729 0.16
730 0.21
731 0.21
732 0.19
733 0.19
734 0.22
735 0.26
736 0.28
737 0.33
738 0.31
739 0.36
740 0.36
741 0.44
742 0.47
743 0.46
744 0.43
745 0.39
746 0.37
747 0.32
748 0.31
749 0.23
750 0.23
751 0.22
752 0.27
753 0.33
754 0.33
755 0.37
756 0.39
757 0.47
758 0.46
759 0.44
760 0.37
761 0.36
762 0.43
763 0.46
764 0.49
765 0.44
766 0.44
767 0.44
768 0.49
769 0.53
770 0.54
771 0.56
772 0.61
773 0.68
774 0.69
775 0.75
776 0.7
777 0.69
778 0.65
779 0.62
780 0.62
781 0.58
782 0.56
783 0.57
784 0.63
785 0.6
786 0.62
787 0.59
788 0.49
789 0.42
790 0.41
791 0.35
792 0.27
793 0.25
794 0.21
795 0.19
796 0.23
797 0.26
798 0.3
799 0.35
800 0.44
801 0.51
802 0.58
803 0.6
804 0.63
805 0.65
806 0.63
807 0.56
808 0.51
809 0.42
810 0.32
811 0.27
812 0.2
813 0.16
814 0.16
815 0.15
816 0.11
817 0.11
818 0.11
819 0.12
820 0.13
821 0.12
822 0.11
823 0.12
824 0.14
825 0.13
826 0.14
827 0.13
828 0.12
829 0.12
830 0.1
831 0.1
832 0.07
833 0.05
834 0.05
835 0.06
836 0.06
837 0.05
838 0.05
839 0.07
840 0.07
841 0.07
842 0.13
843 0.14
844 0.16
845 0.17
846 0.18
847 0.17
848 0.18
849 0.18
850 0.13
851 0.12
852 0.12
853 0.11
854 0.11
855 0.1
856 0.1
857 0.11
858 0.1
859 0.15
860 0.16
861 0.19
862 0.22
863 0.24
864 0.28
865 0.32
866 0.34
867 0.31
868 0.31
869 0.29
870 0.27
871 0.32
872 0.35
873 0.32
874 0.29
875 0.3
876 0.3
877 0.28
878 0.28
879 0.24
880 0.26
881 0.28
882 0.31
883 0.34
884 0.33
885 0.34
886 0.38
887 0.44
888 0.44
889 0.47
890 0.46
891 0.44
892 0.46
893 0.47
894 0.44
895 0.36
896 0.27
897 0.25
898 0.24
899 0.19
900 0.19
901 0.2
902 0.19
903 0.18
904 0.18
905 0.15
906 0.13
907 0.14
908 0.12
909 0.08
910 0.11
911 0.12
912 0.12
913 0.14
914 0.15
915 0.13
916 0.13
917 0.13
918 0.1
919 0.09
920 0.11
921 0.13
922 0.17
923 0.2
924 0.28
925 0.29
926 0.3
927 0.32
928 0.31
929 0.29
930 0.28
931 0.27
932 0.21
933 0.23
934 0.24
935 0.22
936 0.26
937 0.25
938 0.22
939 0.24
940 0.24
941 0.25
942 0.3
943 0.32
944 0.31
945 0.39
946 0.45
947 0.48
948 0.5
949 0.46
950 0.4
951 0.42
952 0.4
953 0.34
954 0.29
955 0.24
956 0.21
957 0.22
958 0.23
959 0.2
960 0.19
961 0.22
962 0.21
963 0.22
964 0.25
965 0.24
966 0.25
967 0.25
968 0.26
969 0.21
970 0.25
971 0.29
972 0.3
973 0.35
974 0.37
975 0.36
976 0.35
977 0.39
978 0.34
979 0.29
980 0.27
981 0.21