Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O42953

Protein Details
Accession O42953    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
313-333LKENSKRLRKLHPHITHKELMBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR006640  SprT-like_domain  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005819  C:spindle  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0106300  P:protein-DNA covalent cross-linking repair  
KEGG spo:SPBC19G7.04  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF10263  SprT-like  
Amino Acid Sequences MQVSNSMSLNDEEDDIEFINYIPLLASPINSSTCSTSIHDKCPFKQHISENGQNFGSAISSNISQRNFKTLRASHLSQYRDCNRENNTEDKNVISTGIAVNEKYQSVLKLKEKAPQISSAAKRKSFIKERGMLAKCFLARLEDEVFQGRLTSSLEKKEIGIVWSKSFSTTAGRANLKRNNKDAPLGKKTYAYIELSDKVIVTKERLYNTLAHEVCHLACWIIDNEMQNPHGACFKAWGKRIMNNMPYIEITSKHNYDIDFKYKWLCINEKCNKLYGRHSKSINPQKQVCRLCKSQIKQICPKIKQPNAFQIFLKENSKRLRKLHPHITHKELMKKLSDEYHRTKDAKQNVSKSVSLISSSDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.12
4 0.1
5 0.09
6 0.09
7 0.08
8 0.08
9 0.07
10 0.06
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.1
15 0.13
16 0.15
17 0.16
18 0.17
19 0.18
20 0.19
21 0.21
22 0.22
23 0.29
24 0.32
25 0.39
26 0.46
27 0.48
28 0.51
29 0.58
30 0.61
31 0.57
32 0.6
33 0.59
34 0.61
35 0.64
36 0.67
37 0.6
38 0.58
39 0.53
40 0.45
41 0.38
42 0.27
43 0.19
44 0.12
45 0.1
46 0.08
47 0.09
48 0.13
49 0.17
50 0.19
51 0.22
52 0.23
53 0.32
54 0.32
55 0.33
56 0.39
57 0.38
58 0.43
59 0.47
60 0.49
61 0.46
62 0.51
63 0.53
64 0.47
65 0.52
66 0.52
67 0.49
68 0.48
69 0.47
70 0.45
71 0.5
72 0.5
73 0.49
74 0.46
75 0.45
76 0.44
77 0.39
78 0.35
79 0.27
80 0.23
81 0.15
82 0.12
83 0.1
84 0.12
85 0.12
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.12
93 0.15
94 0.21
95 0.25
96 0.31
97 0.33
98 0.38
99 0.42
100 0.44
101 0.42
102 0.4
103 0.38
104 0.39
105 0.44
106 0.47
107 0.47
108 0.44
109 0.44
110 0.44
111 0.5
112 0.5
113 0.51
114 0.51
115 0.51
116 0.53
117 0.61
118 0.59
119 0.51
120 0.43
121 0.39
122 0.31
123 0.26
124 0.22
125 0.14
126 0.12
127 0.14
128 0.15
129 0.13
130 0.14
131 0.15
132 0.15
133 0.13
134 0.13
135 0.1
136 0.08
137 0.09
138 0.12
139 0.12
140 0.15
141 0.16
142 0.16
143 0.17
144 0.18
145 0.17
146 0.15
147 0.18
148 0.16
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.11
156 0.13
157 0.15
158 0.19
159 0.22
160 0.24
161 0.31
162 0.37
163 0.42
164 0.43
165 0.44
166 0.42
167 0.4
168 0.43
169 0.43
170 0.44
171 0.43
172 0.42
173 0.39
174 0.36
175 0.35
176 0.32
177 0.29
178 0.22
179 0.17
180 0.17
181 0.17
182 0.16
183 0.16
184 0.14
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.13
190 0.16
191 0.17
192 0.18
193 0.2
194 0.21
195 0.24
196 0.3
197 0.26
198 0.23
199 0.23
200 0.22
201 0.2
202 0.18
203 0.15
204 0.07
205 0.06
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.1
210 0.1
211 0.12
212 0.14
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.14
221 0.19
222 0.24
223 0.27
224 0.33
225 0.33
226 0.38
227 0.45
228 0.47
229 0.45
230 0.43
231 0.4
232 0.35
233 0.32
234 0.29
235 0.23
236 0.17
237 0.19
238 0.2
239 0.21
240 0.2
241 0.22
242 0.2
243 0.25
244 0.29
245 0.3
246 0.26
247 0.26
248 0.28
249 0.28
250 0.31
251 0.3
252 0.32
253 0.32
254 0.42
255 0.5
256 0.54
257 0.53
258 0.56
259 0.54
260 0.51
261 0.56
262 0.56
263 0.56
264 0.55
265 0.57
266 0.58
267 0.65
268 0.73
269 0.7
270 0.67
271 0.66
272 0.67
273 0.73
274 0.75
275 0.71
276 0.67
277 0.63
278 0.64
279 0.66
280 0.63
281 0.63
282 0.63
283 0.64
284 0.67
285 0.72
286 0.74
287 0.69
288 0.75
289 0.75
290 0.76
291 0.75
292 0.72
293 0.73
294 0.68
295 0.66
296 0.57
297 0.52
298 0.49
299 0.46
300 0.47
301 0.39
302 0.4
303 0.47
304 0.55
305 0.56
306 0.56
307 0.63
308 0.66
309 0.73
310 0.77
311 0.78
312 0.8
313 0.8
314 0.82
315 0.78
316 0.74
317 0.74
318 0.67
319 0.61
320 0.56
321 0.51
322 0.47
323 0.49
324 0.5
325 0.5
326 0.53
327 0.57
328 0.6
329 0.6
330 0.63
331 0.63
332 0.65
333 0.67
334 0.68
335 0.67
336 0.67
337 0.7
338 0.64
339 0.57
340 0.51
341 0.42
342 0.35