Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3PB28

Protein Details
Accession A0A0C3PB28    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
664-688ESAPAGRAPKRSRKPWEPPRVKVLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
255-292GRGKRGRGRGGRGDRGDRGRGGRGGRHGRPGQREDKRK
670-680RAPKRSRKPWE
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.5, nucl 10.5, cyto 9.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001656  PsdUridine_synth_TruD  
IPR020119  PsdUridine_synth_TruD_CS  
IPR011760  PsdUridine_synth_TruD_insert  
IPR042214  TruD_catalytic  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01142  TruD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50984  TRUD  
PS01268  UPF0024  
CDD cd02576  PseudoU_synth_ScPUS7  
Amino Acid Sequences MSTARPREEDDQAAAPSPKRTKLDEEAKTGEDVEMADALQSAEAVPAPEKAVESLLPPSHSLLNAPNPVYTPDGSMQRIMETDVGISEYVGHDVPQINGIIKQRFTDFLVFEVDLDGKVIHVKSLDSPEPTKKDADSTPAESADTENKEALSKPEDSEAPSTSNASVVSNEPAKTEVAQDQTIQDDEPWPERLTESLKPFLSEEVIAQVKGLYLEGPEPPFVSDSGWGSRQSKDGETVDSSTATAAPQEEPEESGRGKRGRGRGGRGDRGDRGRGGRGGRHGRPGQREDKRKVLSDPISSKETRTGLHQAVRTLFGGKLETETDTTTPATDEGSRIVIKWSRSGGSGGRGGGRDRGGERGGYPPYIHFTLQKTNRDTQDALAHLSRSLHCNVKDLSVAGTKDKRGVTVQRVSLRRANKTVEDVWKMANGFGGRRTIEEILSKRGERGIRVADFNYRRASLELGMLKGNAFVITLRNVQVDSQDTIDRAMNTIKTKGFINYYGMQRFGTAAIPTHSIGLALLKSEWQKAVSLILRVRPGEHPDVTAARNAWLIDGDLDRALALMPRRVVAERCILESFKKQGGDTRNAMGALSTIPRNLRLMYVHAYQSYVWNAIVSERIRMHGAERPAVGDLVFDTDAAANDDGEAAVEGPDDDLVAEENKDDESAPAGRAPKRSRKPWEPPRVKVLGEADLDAHTIFDVIMPLPGRDVSFPGSTLGERYKAFLRADGLDPENFERKQKEYSLGGSYRKILHLPRELSWSVLRYTDPDVALAQADEDALLGFDAPAPDAGGRFTALQVRLTLGTAAYATMALREVTKTETSAHFQSGLTLASEDQKFRAGAEADADAEAEGEGVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.34
3 0.36
4 0.37
5 0.4
6 0.4
7 0.43
8 0.46
9 0.54
10 0.62
11 0.6
12 0.63
13 0.6
14 0.58
15 0.55
16 0.48
17 0.38
18 0.28
19 0.21
20 0.15
21 0.11
22 0.09
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.07
27 0.06
28 0.05
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.08
33 0.09
34 0.11
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.13
39 0.13
40 0.14
41 0.19
42 0.2
43 0.21
44 0.21
45 0.23
46 0.23
47 0.23
48 0.23
49 0.22
50 0.27
51 0.31
52 0.31
53 0.3
54 0.29
55 0.31
56 0.32
57 0.27
58 0.23
59 0.22
60 0.27
61 0.27
62 0.29
63 0.27
64 0.25
65 0.25
66 0.22
67 0.19
68 0.14
69 0.12
70 0.1
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.14
84 0.13
85 0.17
86 0.23
87 0.25
88 0.24
89 0.25
90 0.25
91 0.26
92 0.28
93 0.29
94 0.24
95 0.21
96 0.24
97 0.23
98 0.21
99 0.2
100 0.17
101 0.12
102 0.13
103 0.11
104 0.07
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.15
111 0.22
112 0.25
113 0.26
114 0.3
115 0.37
116 0.41
117 0.42
118 0.41
119 0.35
120 0.36
121 0.34
122 0.36
123 0.34
124 0.34
125 0.35
126 0.33
127 0.32
128 0.28
129 0.28
130 0.28
131 0.25
132 0.22
133 0.2
134 0.2
135 0.21
136 0.21
137 0.23
138 0.19
139 0.18
140 0.18
141 0.21
142 0.22
143 0.24
144 0.26
145 0.25
146 0.23
147 0.22
148 0.22
149 0.19
150 0.19
151 0.16
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.16
156 0.18
157 0.18
158 0.17
159 0.18
160 0.18
161 0.17
162 0.18
163 0.19
164 0.19
165 0.2
166 0.2
167 0.2
168 0.21
169 0.2
170 0.18
171 0.14
172 0.13
173 0.15
174 0.17
175 0.19
176 0.18
177 0.18
178 0.18
179 0.2
180 0.21
181 0.25
182 0.27
183 0.3
184 0.29
185 0.3
186 0.3
187 0.29
188 0.26
189 0.2
190 0.16
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.05
200 0.05
201 0.07
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.15
213 0.16
214 0.18
215 0.19
216 0.21
217 0.24
218 0.24
219 0.23
220 0.25
221 0.24
222 0.25
223 0.25
224 0.26
225 0.23
226 0.2
227 0.19
228 0.14
229 0.13
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.11
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.16
242 0.21
243 0.21
244 0.24
245 0.29
246 0.34
247 0.41
248 0.47
249 0.52
250 0.56
251 0.63
252 0.68
253 0.66
254 0.64
255 0.6
256 0.58
257 0.53
258 0.46
259 0.4
260 0.36
261 0.35
262 0.33
263 0.31
264 0.35
265 0.4
266 0.4
267 0.45
268 0.47
269 0.49
270 0.54
271 0.57
272 0.58
273 0.59
274 0.66
275 0.63
276 0.67
277 0.64
278 0.6
279 0.56
280 0.54
281 0.49
282 0.48
283 0.47
284 0.41
285 0.42
286 0.39
287 0.38
288 0.34
289 0.31
290 0.24
291 0.24
292 0.26
293 0.25
294 0.3
295 0.31
296 0.28
297 0.28
298 0.29
299 0.25
300 0.21
301 0.18
302 0.14
303 0.13
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.11
308 0.1
309 0.11
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.12
324 0.14
325 0.14
326 0.17
327 0.17
328 0.16
329 0.17
330 0.18
331 0.17
332 0.17
333 0.19
334 0.17
335 0.17
336 0.17
337 0.17
338 0.18
339 0.17
340 0.15
341 0.14
342 0.16
343 0.15
344 0.14
345 0.15
346 0.16
347 0.17
348 0.16
349 0.15
350 0.13
351 0.15
352 0.17
353 0.16
354 0.14
355 0.16
356 0.24
357 0.3
358 0.36
359 0.37
360 0.4
361 0.41
362 0.42
363 0.4
364 0.33
365 0.31
366 0.26
367 0.24
368 0.2
369 0.18
370 0.15
371 0.16
372 0.15
373 0.13
374 0.14
375 0.17
376 0.16
377 0.19
378 0.2
379 0.19
380 0.19
381 0.17
382 0.17
383 0.15
384 0.16
385 0.16
386 0.17
387 0.16
388 0.2
389 0.2
390 0.19
391 0.18
392 0.23
393 0.26
394 0.29
395 0.33
396 0.36
397 0.38
398 0.4
399 0.42
400 0.41
401 0.38
402 0.36
403 0.33
404 0.28
405 0.3
406 0.31
407 0.31
408 0.3
409 0.27
410 0.24
411 0.24
412 0.23
413 0.19
414 0.16
415 0.11
416 0.09
417 0.1
418 0.12
419 0.1
420 0.11
421 0.13
422 0.12
423 0.12
424 0.16
425 0.16
426 0.19
427 0.2
428 0.2
429 0.18
430 0.21
431 0.21
432 0.18
433 0.2
434 0.2
435 0.19
436 0.21
437 0.21
438 0.25
439 0.26
440 0.27
441 0.26
442 0.21
443 0.2
444 0.2
445 0.2
446 0.13
447 0.16
448 0.15
449 0.14
450 0.13
451 0.13
452 0.12
453 0.11
454 0.1
455 0.06
456 0.05
457 0.04
458 0.05
459 0.07
460 0.08
461 0.09
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.12
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.11
471 0.12
472 0.13
473 0.12
474 0.1
475 0.11
476 0.12
477 0.13
478 0.16
479 0.15
480 0.15
481 0.16
482 0.16
483 0.17
484 0.15
485 0.19
486 0.2
487 0.24
488 0.24
489 0.24
490 0.22
491 0.21
492 0.2
493 0.16
494 0.13
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.11
499 0.11
500 0.1
501 0.09
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.07
506 0.05
507 0.05
508 0.07
509 0.08
510 0.09
511 0.1
512 0.1
513 0.1
514 0.1
515 0.15
516 0.14
517 0.17
518 0.18
519 0.2
520 0.22
521 0.22
522 0.24
523 0.21
524 0.24
525 0.25
526 0.24
527 0.22
528 0.21
529 0.23
530 0.22
531 0.22
532 0.17
533 0.14
534 0.14
535 0.13
536 0.11
537 0.09
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.07
543 0.07
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.07
549 0.09
550 0.09
551 0.1
552 0.12
553 0.13
554 0.14
555 0.15
556 0.21
557 0.2
558 0.22
559 0.23
560 0.23
561 0.23
562 0.26
563 0.28
564 0.24
565 0.24
566 0.22
567 0.27
568 0.32
569 0.36
570 0.34
571 0.32
572 0.3
573 0.29
574 0.28
575 0.22
576 0.16
577 0.11
578 0.11
579 0.09
580 0.09
581 0.1
582 0.11
583 0.13
584 0.13
585 0.13
586 0.12
587 0.16
588 0.18
589 0.21
590 0.21
591 0.2
592 0.21
593 0.19
594 0.2
595 0.18
596 0.15
597 0.12
598 0.11
599 0.1
600 0.1
601 0.15
602 0.13
603 0.16
604 0.15
605 0.17
606 0.17
607 0.18
608 0.19
609 0.19
610 0.22
611 0.2
612 0.2
613 0.2
614 0.19
615 0.19
616 0.17
617 0.12
618 0.09
619 0.1
620 0.09
621 0.08
622 0.08
623 0.08
624 0.09
625 0.11
626 0.1
627 0.07
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.06
632 0.06
633 0.04
634 0.04
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.07
649 0.07
650 0.06
651 0.09
652 0.1
653 0.11
654 0.14
655 0.19
656 0.22
657 0.3
658 0.37
659 0.45
660 0.53
661 0.61
662 0.68
663 0.73
664 0.81
665 0.84
666 0.88
667 0.87
668 0.83
669 0.82
670 0.76
671 0.66
672 0.6
673 0.52
674 0.46
675 0.38
676 0.33
677 0.25
678 0.21
679 0.21
680 0.16
681 0.13
682 0.07
683 0.06
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.08
689 0.09
690 0.09
691 0.1
692 0.1
693 0.11
694 0.11
695 0.13
696 0.14
697 0.14
698 0.15
699 0.15
700 0.16
701 0.15
702 0.18
703 0.19
704 0.18
705 0.18
706 0.2
707 0.22
708 0.26
709 0.27
710 0.26
711 0.27
712 0.27
713 0.29
714 0.31
715 0.3
716 0.25
717 0.27
718 0.28
719 0.31
720 0.28
721 0.3
722 0.29
723 0.29
724 0.34
725 0.35
726 0.37
727 0.34
728 0.38
729 0.42
730 0.44
731 0.45
732 0.42
733 0.42
734 0.39
735 0.37
736 0.36
737 0.33
738 0.35
739 0.41
740 0.42
741 0.4
742 0.45
743 0.43
744 0.43
745 0.41
746 0.35
747 0.28
748 0.26
749 0.24
750 0.2
751 0.24
752 0.25
753 0.22
754 0.21
755 0.2
756 0.19
757 0.19
758 0.17
759 0.12
760 0.08
761 0.07
762 0.06
763 0.06
764 0.05
765 0.04
766 0.04
767 0.04
768 0.04
769 0.05
770 0.06
771 0.06
772 0.07
773 0.07
774 0.08
775 0.08
776 0.09
777 0.09
778 0.09
779 0.1
780 0.11
781 0.16
782 0.17
783 0.19
784 0.19
785 0.2
786 0.2
787 0.2
788 0.19
789 0.13
790 0.12
791 0.11
792 0.1
793 0.08
794 0.07
795 0.06
796 0.07
797 0.08
798 0.07
799 0.08
800 0.09
801 0.1
802 0.14
803 0.16
804 0.16
805 0.19
806 0.23
807 0.27
808 0.29
809 0.3
810 0.28
811 0.26
812 0.27
813 0.25
814 0.22
815 0.17
816 0.15
817 0.14
818 0.19
819 0.21
820 0.2
821 0.2
822 0.22
823 0.21
824 0.21
825 0.27
826 0.21
827 0.2
828 0.22
829 0.22
830 0.2
831 0.2
832 0.19
833 0.12
834 0.11
835 0.1