Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q9URV0

Protein Details
Accession Q9URV0    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-49NERTNGFDHKHSRRRGSQNRISKKSRLTYKFKRASKEHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-44HSRRRGSQNRISKKSRLTYKFKR
177-193KPSRSSRSNRGFNRSSK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000445  C:THO complex part of transcription export complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0034243  P:regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG spo:SPBC106.12c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSLEKSLDEIINERTNGFDHKHSRRRGSQNRISKKSRLTYKFKRASKEHNSSPDDGPWQHDLDQEQDAHPRTTHLQKRQHSENRFGVRVENLHYQVLEKDVLSLFENFHPIRVIMNYDRAGRSEGSCDVYFETSQDAEDAQKTLQSTNLKGSEIQISKKSPPSLFDRISDMPHSARKPSRSSRSNRGFNRSSKKDDRSFRSSSKKSSNNSISHEDLDKELDEYAMSFHAASTVSSHSSQDFTPSIANAHEKNEPVAPSKDSNLTEEMDLQMEAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.25
4 0.26
5 0.29
6 0.33
7 0.43
8 0.52
9 0.59
10 0.67
11 0.73
12 0.81
13 0.83
14 0.84
15 0.84
16 0.86
17 0.88
18 0.88
19 0.84
20 0.8
21 0.78
22 0.76
23 0.77
24 0.74
25 0.74
26 0.76
27 0.81
28 0.84
29 0.8
30 0.8
31 0.76
32 0.78
33 0.78
34 0.77
35 0.73
36 0.73
37 0.72
38 0.68
39 0.63
40 0.57
41 0.51
42 0.42
43 0.38
44 0.31
45 0.29
46 0.26
47 0.26
48 0.23
49 0.21
50 0.23
51 0.21
52 0.19
53 0.22
54 0.23
55 0.22
56 0.21
57 0.2
58 0.22
59 0.31
60 0.38
61 0.42
62 0.49
63 0.54
64 0.61
65 0.69
66 0.74
67 0.69
68 0.68
69 0.68
70 0.65
71 0.6
72 0.53
73 0.45
74 0.38
75 0.35
76 0.31
77 0.27
78 0.23
79 0.22
80 0.21
81 0.2
82 0.18
83 0.19
84 0.15
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.1
92 0.1
93 0.15
94 0.13
95 0.14
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.14
101 0.11
102 0.16
103 0.17
104 0.18
105 0.18
106 0.18
107 0.19
108 0.16
109 0.16
110 0.14
111 0.13
112 0.15
113 0.15
114 0.15
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.17
135 0.18
136 0.18
137 0.17
138 0.19
139 0.21
140 0.22
141 0.23
142 0.22
143 0.23
144 0.25
145 0.29
146 0.31
147 0.25
148 0.26
149 0.31
150 0.35
151 0.34
152 0.33
153 0.34
154 0.32
155 0.33
156 0.31
157 0.26
158 0.21
159 0.24
160 0.24
161 0.24
162 0.28
163 0.3
164 0.36
165 0.43
166 0.51
167 0.54
168 0.6
169 0.65
170 0.7
171 0.76
172 0.74
173 0.73
174 0.69
175 0.69
176 0.73
177 0.68
178 0.67
179 0.66
180 0.68
181 0.68
182 0.71
183 0.7
184 0.67
185 0.67
186 0.66
187 0.68
188 0.65
189 0.64
190 0.65
191 0.65
192 0.61
193 0.65
194 0.66
195 0.6
196 0.61
197 0.59
198 0.52
199 0.47
200 0.46
201 0.37
202 0.29
203 0.26
204 0.21
205 0.16
206 0.13
207 0.11
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.09
219 0.11
220 0.13
221 0.14
222 0.15
223 0.15
224 0.16
225 0.16
226 0.19
227 0.17
228 0.16
229 0.17
230 0.16
231 0.16
232 0.17
233 0.22
234 0.19
235 0.21
236 0.24
237 0.24
238 0.25
239 0.28
240 0.28
241 0.28
242 0.3
243 0.31
244 0.3
245 0.33
246 0.37
247 0.34
248 0.35
249 0.33
250 0.31
251 0.28
252 0.27
253 0.24
254 0.19