Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P55877

Protein Details
Accession P55877    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MPKNKGKGGKNRRRGKNENENEKRELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-16KNKGKGGKNRRRGK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR006196  RNA-binding_domain_S1_IF1  
IPR001253  TIF_eIF-1A  
IPR018104  TIF_eIF-1A_CS  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
GO:0033592  F:RNA strand annealing activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0002183  P:cytoplasmic translational initiation  
GO:0006413  P:translational initiation  
KEGG spo:SPBC25H2.07  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01176  eIF-1a  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01262  IF1A  
PS50832  S1_IF1_TYPE  
CDD cd05793  S1_IF1A  
Amino Acid Sequences MPKNKGKGGKNRRRGKNENENEKRELTYAEEGQMYAQVTKMLGNGRIEAACFDGVKRLGHIRGKLRKKVWINQGDIILLSLREFQDEKGDVILKYTADEARTLKNQGELPETAKINETDTFGAEGEDDLDFEFDVDAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.88
3 0.88
4 0.87
5 0.88
6 0.87
7 0.82
8 0.76
9 0.69
10 0.6
11 0.5
12 0.4
13 0.33
14 0.29
15 0.25
16 0.22
17 0.21
18 0.19
19 0.18
20 0.19
21 0.15
22 0.1
23 0.09
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.1
28 0.1
29 0.12
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.12
36 0.12
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.13
45 0.17
46 0.2
47 0.24
48 0.3
49 0.38
50 0.45
51 0.51
52 0.5
53 0.54
54 0.55
55 0.58
56 0.59
57 0.57
58 0.53
59 0.48
60 0.47
61 0.39
62 0.34
63 0.27
64 0.17
65 0.1
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.15
77 0.14
78 0.15
79 0.16
80 0.11
81 0.1
82 0.12
83 0.11
84 0.1
85 0.12
86 0.13
87 0.16
88 0.19
89 0.2
90 0.19
91 0.22
92 0.24
93 0.24
94 0.27
95 0.24
96 0.24
97 0.28
98 0.27
99 0.24
100 0.23
101 0.22
102 0.2
103 0.21
104 0.2
105 0.16
106 0.16
107 0.17
108 0.15
109 0.14
110 0.12
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.07
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.07