Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3PDQ8

Protein Details
Accession A0A0C3PDQ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-67GPTPSNSVPRKKTKGKGKAAQRSDPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-61KHRRAEPSGPTPSNSVPRKKTKGKGKAA
Subcellular Location(s) cyto 15.5, nucl 10, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047545  BRcat_RBR_RNF216  
IPR002867  IBR_dom  
IPR047546  Rcat_RBR_RNF216  
IPR047544  RING-HC_RBR_RNF216  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
CDD cd20339  BRcat_RBR_RNF216  
cd20353  Rcat_RBR_RNF216  
cd16630  RING-HC_RBR_RNF216  
Amino Acid Sequences LSNDFPEIPYQILLIEFGLHNRLYAPTFLTLRAKHRRAEPSGPTPSNSVPRKKTKGKGKAAQRSDPEFEKERAWLVRKLQDEVAAGMNSAMEDEGEGFECGCCFSSYPFSKMTQCPDAHLFCVDCVTHYASTLLGEHNPAIACMDQSGCKLLFTPSALRQILSPKLLALYERVSQRKELEAAGLENLEECPFCEYQVVIENEHEKLFRCEREDCGAVSCRKCKKLDHLPKSCEEADVDKKLDARHAVEEAMTAALMRNCPKCNKAFIKESGCNKMVCPHCHTLSCYVCRKIIHGYEHFNQAPPYNTAKDPKKCQLWDSSVEQRHADEVGHGCSVAHMFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.09
4 0.1
5 0.13
6 0.12
7 0.12
8 0.12
9 0.14
10 0.14
11 0.15
12 0.16
13 0.18
14 0.19
15 0.22
16 0.28
17 0.3
18 0.38
19 0.47
20 0.48
21 0.49
22 0.56
23 0.62
24 0.62
25 0.67
26 0.66
27 0.65
28 0.71
29 0.68
30 0.61
31 0.55
32 0.53
33 0.53
34 0.52
35 0.52
36 0.51
37 0.59
38 0.67
39 0.72
40 0.77
41 0.78
42 0.82
43 0.84
44 0.84
45 0.85
46 0.86
47 0.84
48 0.82
49 0.78
50 0.73
51 0.67
52 0.62
53 0.56
54 0.5
55 0.45
56 0.39
57 0.34
58 0.32
59 0.33
60 0.34
61 0.33
62 0.34
63 0.39
64 0.39
65 0.41
66 0.38
67 0.35
68 0.32
69 0.29
70 0.26
71 0.2
72 0.18
73 0.14
74 0.13
75 0.09
76 0.08
77 0.06
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.08
92 0.17
93 0.19
94 0.22
95 0.24
96 0.25
97 0.3
98 0.32
99 0.36
100 0.34
101 0.32
102 0.33
103 0.35
104 0.34
105 0.3
106 0.28
107 0.23
108 0.16
109 0.17
110 0.14
111 0.1
112 0.1
113 0.12
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.07
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.13
142 0.14
143 0.2
144 0.2
145 0.2
146 0.2
147 0.23
148 0.23
149 0.21
150 0.18
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.09
156 0.09
157 0.12
158 0.16
159 0.18
160 0.19
161 0.2
162 0.21
163 0.21
164 0.2
165 0.16
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.04
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.15
184 0.16
185 0.14
186 0.15
187 0.16
188 0.17
189 0.17
190 0.17
191 0.11
192 0.14
193 0.17
194 0.18
195 0.2
196 0.22
197 0.24
198 0.28
199 0.29
200 0.25
201 0.25
202 0.28
203 0.29
204 0.31
205 0.35
206 0.37
207 0.4
208 0.42
209 0.42
210 0.46
211 0.53
212 0.61
213 0.64
214 0.68
215 0.67
216 0.68
217 0.7
218 0.6
219 0.5
220 0.4
221 0.35
222 0.32
223 0.31
224 0.3
225 0.25
226 0.27
227 0.26
228 0.28
229 0.25
230 0.21
231 0.2
232 0.2
233 0.19
234 0.17
235 0.17
236 0.14
237 0.11
238 0.09
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.09
243 0.13
244 0.17
245 0.2
246 0.24
247 0.28
248 0.3
249 0.39
250 0.45
251 0.48
252 0.51
253 0.55
254 0.61
255 0.64
256 0.66
257 0.64
258 0.58
259 0.52
260 0.45
261 0.45
262 0.44
263 0.41
264 0.42
265 0.41
266 0.42
267 0.44
268 0.46
269 0.47
270 0.47
271 0.5
272 0.5
273 0.47
274 0.47
275 0.45
276 0.45
277 0.44
278 0.43
279 0.43
280 0.42
281 0.46
282 0.46
283 0.54
284 0.52
285 0.46
286 0.41
287 0.36
288 0.34
289 0.31
290 0.33
291 0.29
292 0.32
293 0.39
294 0.47
295 0.53
296 0.58
297 0.63
298 0.67
299 0.66
300 0.67
301 0.68
302 0.64
303 0.61
304 0.6
305 0.61
306 0.58
307 0.57
308 0.54
309 0.45
310 0.4
311 0.35
312 0.28
313 0.23
314 0.2
315 0.21
316 0.2
317 0.19
318 0.17
319 0.17