Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O42941

Protein Details
Accession O42941    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
335-355LEKYKKSKKVVLGKRKNLENDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
338-349YKKSKKVVLGKR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029000  Cyclophilin-like_dom_sf  
IPR020892  Cyclophilin-type_PPIase_CS  
IPR002130  Cyclophilin-type_PPIase_dom  
IPR044666  Cyclophilin_A-like  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0003755  F:peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006457  P:protein folding  
GO:0000413  P:protein peptidyl-prolyl isomerization  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00160  Pro_isomerase  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00170  CSA_PPIASE_1  
PS50072  CSA_PPIASE_2  
CDD cd01925  cyclophilin_CeCYP16-like  
Amino Acid Sequences MATLTNLEPLATGTVILKTTRGDIQIELWCKEVPKACRNFIQLCLEGYYDGTIVHRVVPEFLIQGGDPTGTGMGGESIYGEPFAVETHPRLRFIRRGLVGMACTENEGNNSQFFITLGPTPEWNGKQTLFGRVVGDTIYNVVRISELELDANQRPVFPPKIISTEVIDNYFTDIKPRSTKEEREKIANELAHQEKQKERNKLLKSGRRNKAVLSFGDEVDMPIVKKPLRQKTPVSRSSDTTTELSKDLISSSSSIHSTYSSAQTGLTSAKVSSDEYARQVDTLDTKLNSSSKSKVQEEISRLKSELRDLEKSGGSSNSKPVVVRPKKRNILTEELEKYKKSKKVVLGKRKNLENDEESTLRALSSFQSKIRNAEDEDVMDSQYGSKIEDTPCSLHNVPGCFSCFDRLGEKNITETNSNWFAHRLVAENDPTRRTEELRIQRAEELKDVPSARPKKLLMKRDII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.13
4 0.13
5 0.12
6 0.15
7 0.19
8 0.2
9 0.19
10 0.19
11 0.24
12 0.3
13 0.34
14 0.31
15 0.3
16 0.29
17 0.28
18 0.32
19 0.34
20 0.34
21 0.4
22 0.46
23 0.49
24 0.55
25 0.6
26 0.59
27 0.58
28 0.57
29 0.5
30 0.44
31 0.41
32 0.35
33 0.29
34 0.25
35 0.2
36 0.13
37 0.11
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.13
43 0.12
44 0.14
45 0.14
46 0.15
47 0.14
48 0.14
49 0.13
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.08
73 0.11
74 0.19
75 0.21
76 0.25
77 0.27
78 0.32
79 0.37
80 0.4
81 0.46
82 0.41
83 0.41
84 0.39
85 0.39
86 0.35
87 0.3
88 0.26
89 0.17
90 0.16
91 0.14
92 0.13
93 0.12
94 0.14
95 0.13
96 0.12
97 0.13
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.1
104 0.12
105 0.12
106 0.13
107 0.15
108 0.2
109 0.2
110 0.21
111 0.21
112 0.19
113 0.25
114 0.26
115 0.3
116 0.27
117 0.27
118 0.26
119 0.23
120 0.23
121 0.17
122 0.15
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.09
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.13
137 0.14
138 0.16
139 0.14
140 0.13
141 0.14
142 0.18
143 0.2
144 0.17
145 0.2
146 0.19
147 0.24
148 0.25
149 0.25
150 0.22
151 0.24
152 0.25
153 0.22
154 0.2
155 0.16
156 0.17
157 0.17
158 0.15
159 0.14
160 0.14
161 0.17
162 0.22
163 0.24
164 0.29
165 0.34
166 0.43
167 0.49
168 0.57
169 0.56
170 0.57
171 0.57
172 0.52
173 0.51
174 0.43
175 0.33
176 0.3
177 0.31
178 0.28
179 0.28
180 0.27
181 0.28
182 0.37
183 0.43
184 0.44
185 0.46
186 0.51
187 0.53
188 0.6
189 0.64
190 0.63
191 0.67
192 0.7
193 0.73
194 0.7
195 0.67
196 0.6
197 0.57
198 0.52
199 0.41
200 0.37
201 0.31
202 0.25
203 0.25
204 0.23
205 0.16
206 0.13
207 0.13
208 0.07
209 0.06
210 0.08
211 0.08
212 0.12
213 0.2
214 0.28
215 0.33
216 0.38
217 0.44
218 0.53
219 0.62
220 0.65
221 0.65
222 0.57
223 0.55
224 0.53
225 0.47
226 0.39
227 0.31
228 0.25
229 0.19
230 0.18
231 0.15
232 0.12
233 0.11
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.11
246 0.12
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.11
252 0.1
253 0.09
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.14
274 0.15
275 0.16
276 0.17
277 0.19
278 0.22
279 0.28
280 0.29
281 0.32
282 0.34
283 0.38
284 0.41
285 0.46
286 0.45
287 0.4
288 0.39
289 0.37
290 0.34
291 0.31
292 0.32
293 0.29
294 0.28
295 0.29
296 0.32
297 0.3
298 0.3
299 0.28
300 0.25
301 0.23
302 0.21
303 0.24
304 0.23
305 0.22
306 0.22
307 0.25
308 0.33
309 0.4
310 0.48
311 0.53
312 0.61
313 0.68
314 0.72
315 0.74
316 0.69
317 0.68
318 0.63
319 0.62
320 0.57
321 0.54
322 0.53
323 0.46
324 0.44
325 0.43
326 0.44
327 0.4
328 0.41
329 0.45
330 0.53
331 0.63
332 0.71
333 0.74
334 0.78
335 0.81
336 0.81
337 0.77
338 0.7
339 0.65
340 0.58
341 0.51
342 0.47
343 0.4
344 0.34
345 0.3
346 0.26
347 0.2
348 0.16
349 0.12
350 0.09
351 0.15
352 0.17
353 0.19
354 0.27
355 0.29
356 0.33
357 0.36
358 0.38
359 0.35
360 0.36
361 0.34
362 0.28
363 0.29
364 0.25
365 0.22
366 0.17
367 0.15
368 0.12
369 0.12
370 0.11
371 0.09
372 0.1
373 0.14
374 0.16
375 0.19
376 0.22
377 0.22
378 0.23
379 0.29
380 0.29
381 0.28
382 0.3
383 0.29
384 0.27
385 0.27
386 0.29
387 0.24
388 0.24
389 0.25
390 0.23
391 0.23
392 0.27
393 0.26
394 0.29
395 0.33
396 0.32
397 0.32
398 0.33
399 0.33
400 0.3
401 0.29
402 0.3
403 0.31
404 0.31
405 0.29
406 0.27
407 0.25
408 0.27
409 0.27
410 0.24
411 0.21
412 0.25
413 0.31
414 0.35
415 0.39
416 0.38
417 0.38
418 0.38
419 0.38
420 0.36
421 0.37
422 0.41
423 0.48
424 0.54
425 0.56
426 0.55
427 0.58
428 0.6
429 0.55
430 0.48
431 0.41
432 0.33
433 0.36
434 0.36
435 0.34
436 0.39
437 0.42
438 0.42
439 0.47
440 0.49
441 0.53
442 0.61
443 0.67