Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3PDY8

Protein Details
Accession A0A0C3PDY8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
384-403TPLFNKPPPLPPQNRRKRGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
397-402NRRKRG
Subcellular Location(s) nucl 9.5cyto_nucl 9.5, cyto 8.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
CDD cd02557  PseudoU_synth_ScRIB2  
Amino Acid Sequences MARPIAQAVAAVPKIEVTITKTGLRKISPYWYNYTTMAKGRWLGREILEVVSTEFRDRSMEYYRYALDSGVTTVNGDVAKPDTIIRNGDRIENIVHRHEPPVTAVPVRVIHHDKEREFVVVDKPGGMPVHAVGRYYHQTLIQILKTDFGFDKLYAVNRIDRPTSGLLIIPLSPKLANTLASEFISGGVQKEYVARCSGRFPEEEVICEQPLLTVDRQMGLNIVHPEGKHAKTIFNRLHYDPETDTSVLHSHQIRVHLQYLGHSIANDPIYSSVDIWGEDLGKGGVDIVPSDERAAPAPPPDFDFAEGDNPESLAIQSAAASGDASADGRKLLPRETGHDIGMGSPVPLSNQVVQVITNLRNQKDKDEDWGRWRDVVFRTKGKLTPLFNKPPPLPPQNRRKRGGPSTPEREAPLPTPPQLPVEEALEKATEYTEPNVDIEMFPGTDQPKYCPECYLPLYPDQKPEKLYIFLHALRYTTSLGRFETELPAWAAKGFKWDRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.15
4 0.13
5 0.18
6 0.21
7 0.27
8 0.3
9 0.34
10 0.39
11 0.39
12 0.38
13 0.36
14 0.43
15 0.44
16 0.46
17 0.48
18 0.46
19 0.48
20 0.47
21 0.47
22 0.42
23 0.4
24 0.38
25 0.34
26 0.36
27 0.37
28 0.4
29 0.38
30 0.37
31 0.33
32 0.36
33 0.35
34 0.31
35 0.27
36 0.21
37 0.21
38 0.21
39 0.2
40 0.17
41 0.15
42 0.14
43 0.16
44 0.16
45 0.19
46 0.23
47 0.25
48 0.25
49 0.29
50 0.29
51 0.29
52 0.28
53 0.24
54 0.17
55 0.15
56 0.16
57 0.14
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.13
62 0.11
63 0.1
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.13
69 0.15
70 0.17
71 0.22
72 0.22
73 0.26
74 0.26
75 0.29
76 0.28
77 0.26
78 0.27
79 0.27
80 0.29
81 0.28
82 0.3
83 0.28
84 0.3
85 0.3
86 0.27
87 0.26
88 0.28
89 0.26
90 0.24
91 0.23
92 0.23
93 0.26
94 0.26
95 0.28
96 0.27
97 0.27
98 0.35
99 0.41
100 0.38
101 0.37
102 0.37
103 0.32
104 0.29
105 0.29
106 0.24
107 0.22
108 0.21
109 0.2
110 0.19
111 0.2
112 0.19
113 0.16
114 0.13
115 0.1
116 0.15
117 0.14
118 0.15
119 0.13
120 0.18
121 0.21
122 0.22
123 0.23
124 0.18
125 0.18
126 0.2
127 0.24
128 0.21
129 0.21
130 0.19
131 0.2
132 0.19
133 0.2
134 0.18
135 0.16
136 0.16
137 0.13
138 0.15
139 0.14
140 0.16
141 0.17
142 0.18
143 0.21
144 0.22
145 0.25
146 0.24
147 0.23
148 0.24
149 0.23
150 0.23
151 0.18
152 0.15
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.11
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.11
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.14
181 0.14
182 0.14
183 0.18
184 0.2
185 0.19
186 0.19
187 0.2
188 0.24
189 0.24
190 0.25
191 0.23
192 0.22
193 0.2
194 0.19
195 0.16
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.08
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.15
213 0.19
214 0.19
215 0.19
216 0.18
217 0.23
218 0.24
219 0.33
220 0.33
221 0.33
222 0.36
223 0.34
224 0.39
225 0.35
226 0.35
227 0.27
228 0.25
229 0.22
230 0.19
231 0.18
232 0.14
233 0.13
234 0.11
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.13
239 0.17
240 0.17
241 0.18
242 0.19
243 0.18
244 0.17
245 0.16
246 0.17
247 0.15
248 0.14
249 0.11
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.1
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.09
281 0.1
282 0.09
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.14
287 0.15
288 0.15
289 0.15
290 0.16
291 0.13
292 0.16
293 0.16
294 0.14
295 0.12
296 0.12
297 0.1
298 0.09
299 0.08
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.06
316 0.08
317 0.09
318 0.11
319 0.16
320 0.17
321 0.22
322 0.28
323 0.3
324 0.28
325 0.28
326 0.26
327 0.21
328 0.2
329 0.15
330 0.09
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.07
335 0.09
336 0.09
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.13
342 0.16
343 0.16
344 0.2
345 0.23
346 0.24
347 0.3
348 0.31
349 0.34
350 0.37
351 0.36
352 0.4
353 0.42
354 0.45
355 0.46
356 0.52
357 0.48
358 0.44
359 0.43
360 0.4
361 0.4
362 0.44
363 0.42
364 0.4
365 0.43
366 0.45
367 0.47
368 0.47
369 0.48
370 0.45
371 0.48
372 0.52
373 0.57
374 0.56
375 0.6
376 0.57
377 0.58
378 0.6
379 0.61
380 0.61
381 0.61
382 0.69
383 0.74
384 0.8
385 0.78
386 0.77
387 0.77
388 0.77
389 0.78
390 0.77
391 0.75
392 0.74
393 0.73
394 0.69
395 0.62
396 0.54
397 0.47
398 0.39
399 0.36
400 0.32
401 0.31
402 0.31
403 0.29
404 0.3
405 0.28
406 0.28
407 0.22
408 0.23
409 0.22
410 0.2
411 0.2
412 0.18
413 0.16
414 0.15
415 0.14
416 0.1
417 0.11
418 0.13
419 0.14
420 0.15
421 0.15
422 0.16
423 0.16
424 0.15
425 0.14
426 0.12
427 0.11
428 0.1
429 0.14
430 0.14
431 0.16
432 0.17
433 0.2
434 0.27
435 0.32
436 0.33
437 0.33
438 0.34
439 0.38
440 0.42
441 0.45
442 0.4
443 0.43
444 0.48
445 0.47
446 0.53
447 0.52
448 0.51
449 0.47
450 0.49
451 0.45
452 0.43
453 0.42
454 0.37
455 0.39
456 0.38
457 0.41
458 0.37
459 0.34
460 0.3
461 0.31
462 0.29
463 0.26
464 0.26
465 0.23
466 0.24
467 0.25
468 0.26
469 0.25
470 0.28
471 0.25
472 0.24
473 0.24
474 0.24
475 0.22
476 0.22
477 0.21
478 0.16
479 0.26